BioLiP

>protein
DIDLIKRLGPSAMDQIMLYLAFSAMRTSGHRHGAFLDAAATAAKCAIYMTYLEQGQNLRMTGHLHHLEPKRVKIIVEEVR
QALMEGKLLKTLGSQEPRYLIQFPYVWMEQYPSEEKRQIEHKLPSNLPDAQLVTSFEFLELIEFLHKRSQEDLPPEHRME
LSEALAEHIKRRLLYSGTVTRIDSPWGMPFYALTRPFYERTYIMVEDTARYFRMMKDWAEKRPNAMRALEELDVPPERWD
EAMQELDEIIRTWADKYHQVPMILQMVFGRKE

The query sequence (length=272) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4yrv:A	288	287	0.9963	0.9410	0.9443	0.0	4hri:B, 4hri:A, 4ynl:B, 4ynl:A, 4ynl:N, 4ynl:M
2	4j00:A	297	295	0.9007	0.8249	0.8305	4.05e-169	4izz:A, 4izz:B, 4j00:B, 4j01:A, 4j01:B, 4j01:E, 4j01:F, 4yrv:B
3	7d21:A	328	59	0.0588	0.0488	0.2712	1.0	7d1h:A, 7d1n:A, 7d1y:A, 7d2d:A, 7d2i:A, 7d2j:A, 4mhn:A, 4mhy:A, 4mhz:A
4	1k26:A	150	49	0.0625	0.1133	0.3469	2.0
5	7kdx:B	664	43	0.0478	0.0196	0.3023	2.5	7kdx:A, 7kdy:A, 7kdy:B
6	2amx:A	364	83	0.0809	0.0604	0.2651	4.8	2amx:B
7	1sza:B	140	40	0.0478	0.0929	0.3250	6.6	2bf0:X
8	8wus:E	453	76	0.0772	0.0464	0.2763	7.5	6b1q:A, 6b1r:A, 6b1s:A, 6b1s:B, 8cs0:A, 1d0e:A, 1d1u:A, 8dw1:A, 8dw8:A, 8dwm:A, 2fjv:A, 2fjw:A, 2fjx:A, 3fsi:A, 2fvp:A, 2fvq:A, 2fvr:A, 2fvs:A, 4hkq:A, 1i6j:A, 4m94:A, 4m95:A, 6mig:A, 6mih:A, 6mik:A, 1n4l:A, 1qai:A, 1qai:B, 1qaj:A, 2r2r:A, 2r2s:A, 2r2t:A, 2r2u:A, 7uyn:A, 7uyo:A, 7uyp:A, 5vbs:A, 8wut:E, 8wuv:E, 4xo0:A, 4xpc:A, 4xpe:A, 8ygj:E, 1ztt:A, 1ztw:A
9	5hpz:A	175	36	0.0478	0.0743	0.3611	8.5	5hpz:B, 6s2z:A
10	5ini:F	511	32	0.0404	0.0215	0.3438	9.5	5inf:B, 5inf:F, 5ini:A, 5ini:D, 5ini:B, 5ini:C, 5ini:E

[Back]