Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
DGTREFLTFEVPLSAGLGVSVKGNRSKENHADLGIFVKSIINGGAASKDGRLRVNDQLIAVNGESLLGKANQEAMETLRR
SMSTMIQLIVARRIS

The query sequence (length=95) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2koh:A 111 105 1.0000 0.8559 0.9048 2.28e-59 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
2 2exg:A 101 89 0.3579 0.3366 0.3820 1.00e-13 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
3 4xhv:A 94 79 0.3474 0.3511 0.4177 2.73e-12
4 8cn1:H 101 81 0.3368 0.3168 0.3951 1.05e-10 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
5 4wyu:A 201 94 0.3579 0.1692 0.3617 3.96e-10 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
6 4wyu:A 201 94 0.2842 0.1343 0.2872 2.93e-06 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
7 2ka9:A 189 81 0.3368 0.1693 0.3951 9.01e-10 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
8 2ka9:A 189 78 0.3053 0.1534 0.3718 1.92e-08 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
9 2m0z:A 97 84 0.3474 0.3402 0.3929 1.00e-09 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
10 8bq8:C 93 78 0.3263 0.3333 0.3974 2.13e-09 8bq8:A, 8bq8:B
11 8b82:A 108 81 0.3158 0.2778 0.3704 7.13e-09 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
12 8c1t:A 90 80 0.2947 0.3111 0.3500 7.21e-09 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
13 7pc3:A 405 81 0.3368 0.0790 0.3951 1.35e-08 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
14 3jxt:A 96 73 0.2842 0.2812 0.3699 1.30e-07 3jxt:B
15 5zys:A 90 61 0.2211 0.2333 0.3443 1.69e-07
16 2kaw:A 90 78 0.2947 0.3111 0.3590 1.94e-07 6lcb:A, 2mx6:A
17 6xa7:B 96 79 0.2842 0.2812 0.3418 2.06e-07 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
18 1l6o:A 95 63 0.2421 0.2421 0.3651 1.30e-06 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
19 7p73:A 420 66 0.2526 0.0571 0.3636 1.51e-06 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
20 2pdz:A 86 68 0.2632 0.2907 0.3676 1.60e-06
21 3vqg:A 85 60 0.2000 0.2235 0.3167 3.70e-06
22 5heb:A 119 72 0.2632 0.2101 0.3472 3.83e-06 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
23 8bv7:A 95 62 0.2211 0.2211 0.3387 6.80e-06 8buw:A, 8buw:B
24 7weg:B 96 65 0.2526 0.2500 0.3692 1.01e-05 7weg:A
25 7p70:A 407 66 0.2632 0.0614 0.3788 1.35e-05 7pc4:A, 7qql:A
26 7qct:A 90 59 0.2105 0.2222 0.3390 1.82e-05 7qct:B
27 4xh7:A 110 80 0.2211 0.1909 0.2625 2.71e-05
28 1n7f:A 86 69 0.2105 0.2326 0.2899 3.71e-05 1n7f:B
29 6zbq:A 89 64 0.2316 0.2472 0.3438 5.76e-05 6zc4:A
30 2qt5:A 194 79 0.2316 0.1134 0.2785 6.40e-05 2qt5:B
31 2qt5:A 194 63 0.2000 0.0979 0.3016 8.4 2qt5:B
32 1rzx:A 98 53 0.2000 0.1939 0.3585 1.10e-04 5i7z:A, 1x8s:A
33 1zub:A 109 61 0.2105 0.1835 0.3279 1.60e-04
34 7pc5:A 405 70 0.2421 0.0568 0.3286 1.94e-04
35 1u38:A 89 34 0.1368 0.1461 0.3824 2.32e-04
36 8bp4:A 93 77 0.2316 0.2366 0.2857 2.73e-04 8bp4:C, 8bp4:B
37 1b8q:A 127 64 0.2316 0.1732 0.3438 3.99e-04
38 2l4t:A 124 70 0.2105 0.1613 0.2857 7.48e-04 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
39 1ihj:B 95 57 0.1579 0.1579 0.2632 7.71e-04 1ihj:A
40 5oak:A 90 51 0.1789 0.1889 0.3333 8.32e-04 5oak:C
41 2i0i:A 81 49 0.2105 0.2469 0.4082 0.002 2i0i:B, 2i0i:C
42 2m0u:A 117 75 0.2211 0.1795 0.2800 0.004
43 7d6f:A 87 51 0.1474 0.1609 0.2745 0.004
44 4wsi:A 372 56 0.1684 0.0430 0.2857 0.005 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
45 8blu:B 195 62 0.2105 0.1026 0.3226 0.005 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
46 2kpl:A 129 66 0.1789 0.1318 0.2576 0.008
47 2m0v:A 128 79 0.2211 0.1641 0.2658 0.014
48 6kz1:A 97 73 0.2316 0.2268 0.3014 0.016 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
49 7x2e:A 163 78 0.2421 0.1411 0.2949 0.025 2kbs:A
50 3r0h:D 199 50 0.1579 0.0754 0.3000 0.044 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
51 4c2c:A 433 61 0.2000 0.0439 0.3115 0.053 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
52 6nid:B 88 78 0.2105 0.2273 0.2564 0.060 6nid:A, 6nid:C
53 5n7d:A 423 66 0.1789 0.0402 0.2576 0.066 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
54 2ejy:A 85 77 0.1789 0.2000 0.2208 0.17
55 5v0t:E 457 80 0.2421 0.0503 0.2875 0.18 5v0t:A, 5v0t:B, 5v0t:C, 5v0t:D, 5v0t:F, 5v0t:G, 5v0t:H
56 3nk3:A 284 68 0.2105 0.0704 0.2941 0.57 3nk3:B, 3nk4:A, 3nk4:B
57 6ar4:B 87 46 0.1158 0.1264 0.2391 0.72 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
58 6cu5:A 314 31 0.1474 0.0446 0.4516 0.90 6cu5:B, 8ft7:A, 8ft7:B
59 3tsz:A 341 44 0.1579 0.0440 0.3409 1.0 3shw:A
60 5f67:A 98 63 0.2316 0.2245 0.3492 1.9 5f67:B
61 3cyy:B 81 29 0.1158 0.1358 0.3793 2.4 3cyy:A
62 5eyw:A 244 46 0.1368 0.0533 0.2826 2.4 5eyw:B
63 7w6z:A 414 48 0.1579 0.0362 0.3125 2.9 7w6y:A
64 8uo8:A 574 31 0.1474 0.0244 0.4516 4.4
65 4xru:C 424 18 0.1053 0.0236 0.5556 5.2 4xru:F
66 7y7b:8 173 59 0.1895 0.1040 0.3051 6.4 7y8a:8
67 9bh5:Ch 122 53 0.1895 0.1475 0.3396 6.7 9cai:Ch
68 3tgw:B 441 47 0.1474 0.0317 0.2979 7.7 3b2q:A, 3b2q:B, 3dsr:A, 3dsr:B, 3eiu:A, 3eiu:B, 3tiv:B
69 5ybb:A 487 28 0.1158 0.0226 0.3929 7.8 5ybb:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218