Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
DGTREFLTFEVPLNSAGLGVSVKGNADLGIFVKSIINGGAASKDGRLRVNDQLIAVNGESLLGKANQEAMETLRRSMMIQ
LIVARRIS

The query sequence (length=88) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2koh:A 111 105 1.0000 0.7928 0.8381 7.68e-51 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
2 2exg:A 101 76 0.3750 0.3267 0.4342 1.14e-12 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
3 4xhv:A 94 68 0.3750 0.3511 0.4853 2.87e-12
4 2m0z:A 97 85 0.3750 0.3402 0.3882 3.13e-11 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
5 8cn1:H 101 94 0.3750 0.3267 0.3511 3.82e-11 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
6 2ka9:A 189 90 0.3636 0.1693 0.3556 2.49e-09 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
7 2ka9:A 189 77 0.3295 0.1534 0.3766 6.36e-08 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
8 4wyu:A 201 84 0.3750 0.1642 0.3929 2.96e-09 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
9 4wyu:A 201 96 0.3068 0.1343 0.2812 3.11e-06 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
10 8bq8:C 93 77 0.3523 0.3333 0.4026 3.94e-09 8bq8:A, 8bq8:B
11 3jxt:A 96 87 0.3409 0.3125 0.3448 7.04e-09 3jxt:B
12 8c1t:A 90 79 0.2841 0.2778 0.3165 2.17e-08 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
13 5zys:A 90 79 0.2955 0.2889 0.3291 2.63e-08
14 8b82:A 108 90 0.3636 0.2963 0.3556 3.44e-08 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
15 7pc3:A 405 80 0.3636 0.0790 0.4000 5.61e-08 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
16 5heb:A 119 72 0.2955 0.2185 0.3611 7.39e-07 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
17 3vqg:A 85 85 0.2955 0.3059 0.3059 8.69e-07
18 8bv7:A 95 60 0.2273 0.2105 0.3333 1.21e-06 8buw:A, 8buw:B
19 7p73:A 420 95 0.3409 0.0714 0.3158 1.25e-06 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
20 2kaw:A 90 62 0.2614 0.2556 0.3710 1.87e-06 6lcb:A, 2mx6:A
21 1l6o:A 95 61 0.2614 0.2421 0.3770 2.32e-06 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
22 2pdz:A 86 65 0.2500 0.2558 0.3385 3.87e-06
23 6zbq:A 89 58 0.2500 0.2472 0.3793 4.37e-06 6zc4:A
24 4xh7:A 110 73 0.2386 0.1909 0.2877 1.06e-05
25 1n7f:A 86 71 0.2386 0.2442 0.2958 1.33e-05 1n7f:B
26 7qct:A 90 70 0.2614 0.2556 0.3286 1.50e-05 7qct:B
27 6xa7:B 96 78 0.3068 0.2812 0.3462 2.04e-05 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
28 2qt5:A 194 79 0.2727 0.1237 0.3038 2.94e-05 2qt5:B
29 7p70:A 407 62 0.2500 0.0541 0.3548 3.42e-05 7pc4:A, 7qql:A
30 7weg:B 96 63 0.2614 0.2396 0.3651 3.92e-05 7weg:A
31 1u38:A 89 59 0.1932 0.1910 0.2881 1.14e-04
32 4wsi:A 372 56 0.2159 0.0511 0.3393 2.44e-04 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
33 1rzx:A 98 37 0.1932 0.1735 0.4595 4.41e-04 5i7z:A, 1x8s:A
34 8bp4:A 93 75 0.2955 0.2796 0.3467 4.48e-04 8bp4:C, 8bp4:B
35 7pc5:A 405 65 0.2500 0.0543 0.3385 6.13e-04
36 2i0i:A 81 44 0.2273 0.2469 0.4545 0.001 2i0i:B, 2i0i:C
37 5oak:A 90 49 0.1932 0.1889 0.3469 0.001 5oak:C
38 1zub:A 109 61 0.2159 0.1743 0.3115 0.001
39 6kz1:A 97 62 0.2386 0.2165 0.3387 0.001 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
40 1ihj:B 95 48 0.1591 0.1474 0.2917 0.001 1ihj:A
41 2kpl:A 129 63 0.1932 0.1318 0.2698 0.003
42 1b8q:A 127 59 0.2273 0.1575 0.3390 0.003
43 7d6f:A 87 40 0.1364 0.1379 0.3000 0.005
44 5n7d:A 423 72 0.2045 0.0426 0.2500 0.011 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
45 2ejy:A 85 72 0.1932 0.2000 0.2361 0.012
46 6nid:B 88 57 0.1818 0.1818 0.2807 0.014 6nid:A, 6nid:C
47 4c2c:A 433 58 0.2500 0.0508 0.3793 0.014 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
48 7x2e:A 163 74 0.2614 0.1411 0.3108 0.022 2kbs:A
49 8blu:B 195 51 0.2045 0.0923 0.3529 0.023 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
50 3tsz:A 341 53 0.1932 0.0499 0.3208 0.028 3shw:A
51 2m0u:A 117 69 0.2273 0.1709 0.2899 0.049
52 6ar4:B 87 60 0.1705 0.1724 0.2500 0.053 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
53 7w6z:A 414 74 0.2614 0.0556 0.3108 0.21 7w6y:A
54 4bos:A 164 69 0.2273 0.1220 0.2899 2.0
55 2dyk:A 150 36 0.1477 0.0867 0.3611 2.5 2dyk:B
56 3cyy:B 81 29 0.1250 0.1358 0.3793 2.8 3cyy:A
57 8rke:B 279 22 0.1136 0.0358 0.4545 3.6
58 8uo8:A 574 31 0.1591 0.0244 0.4516 3.6
59 3r0h:D 199 83 0.1818 0.0804 0.1928 3.6 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218