Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DGLNGTMMQYYEWHLENDGQHWNRLHDDAAALSDAGITAIWIPPAYKGNSQADVGYGAYDLYDLGEFNQKGTVRTKYGTK
AQLERAIGSLKSNDINVYGDVVMNHKMGADFTEAVQAVQVNPTNRWQDISGAYTIDAWTGFDFSGRNNAYSDFKWRWFHF
NGVDWDQRYQENHIFRFANTNWNWRVDEENGNYDYLLGSNIDFSHPEVQDELKDWGSWFTDELDLDGYRLDAIKHIPFWY
TSDWVRHQRNEADQDLFVVGEYWKDDVGALEFYLDEMNWEMSLFDVPLNYNFYRASQQGGSYDMRNILRGSLVEAHPMHA
VTFVDNHDTQPGESLESWVADWFKPLAYATILTREGGYPNVFYGDYYGIPNDNISAKKDMIDELLDARQNYAYGTQHDYF
DHWDVVGWTREGSSSRPNSGLATIMSNGPGGSKWMYVGRQNAGQTWTDLTGNNGASVTINGDGWGEFFTNGGSVSVYVNQ

The query sequence (length=480) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1ud2:A 480 480 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 1ud3:A, 1ud4:A, 1ud5:A, 1ud8:A
2 2gjp:A 481 480 0.6687 0.6674 0.6687 0.0 2gjr:A, 1w9x:A
3 2die:A 481 480 0.6708 0.6694 0.6708 0.0
4 2d3l:A 481 480 0.6417 0.6403 0.6417 0.0 2d3n:A, 1wp6:A, 1wpc:A
5 1bli:A 481 481 0.6271 0.6258 0.6258 0.0 1ob0:A, 6toy:A, 6toz:A, 6tp0:A, 6tp1:A, 6tp2:A
6 6gxv:A 481 481 0.6167 0.6154 0.6154 0.0 6gxv:B, 6gya:A, 6gya:B, 6gya:C, 6gya:D
7 3bh4:A 483 483 0.6000 0.5963 0.5963 0.0 3bh4:B, 1e3x:A, 1e3z:A, 1e40:A, 1e43:A
8 6ag0:C 483 480 0.5896 0.5859 0.5896 0.0 6ag0:A, 1hvx:A, 4uzu:A
9 8jjm:A 484 484 0.5250 0.5207 0.5207 1.95e-173 8jjm:B
10 3bc9:A 585 483 0.4021 0.3299 0.3996 3.29e-98 3bcd:A, 3bcf:A
11 1mxd:A 435 472 0.3000 0.3310 0.3051 8.32e-36 1mwo:A, 1mxg:A
12 3qgv:A 435 467 0.2917 0.3218 0.2998 1.26e-35
13 1amy:A 403 408 0.2083 0.2481 0.2451 6.78e-15 1ava:A, 1ava:B, 1bg9:A
14 5a2a:A 452 343 0.1792 0.1903 0.2507 1.34e-13 5a2b:A, 5a2c:A
15 6sau:B 442 475 0.2250 0.2443 0.2274 2.90e-10 6sau:A
16 7zc0:AAA 710 122 0.0854 0.0577 0.3361 3.93e-10
17 7zc0:AAA 710 346 0.1667 0.1127 0.2312 1.98e-09
18 3wn6:A 404 386 0.1896 0.2252 0.2358 4.63e-10 3wn6:B, 3wn6:C, 3wn6:D
19 3bsg:A 404 227 0.1167 0.1386 0.2467 2.47e-09 3bsh:A, 1ht6:A, 1p6w:A, 2qps:A, 2qpu:B, 2qpu:A, 2qpu:C, 1rp8:A, 1rp9:A, 1rpk:A
20 3bsg:A 404 51 0.0437 0.0520 0.4118 0.050 3bsh:A, 1ht6:A, 1p6w:A, 2qps:A, 2qpu:B, 2qpu:A, 2qpu:C, 1rp8:A, 1rp9:A, 1rpk:A
21 4e2o:A 445 308 0.1542 0.1663 0.2403 3.60e-09
22 5jbd:B 855 110 0.0813 0.0456 0.3545 8.55e-09 5jbd:A, 5jbe:A, 5jbe:B, 5jbf:A, 5jbf:B
23 5jbd:B 855 135 0.0729 0.0409 0.2593 0.13 5jbd:A, 5jbe:A, 5jbe:B, 5jbf:A, 5jbf:B
24 1qho:A 686 490 0.2500 0.1749 0.2449 1.08e-08 1qhp:A
25 7jjt:A 513 362 0.1771 0.1657 0.2348 2.09e-07
26 7dt1:A 846 102 0.0750 0.0426 0.3529 2.41e-07 7dt1:B
27 7dt1:A 846 124 0.0708 0.0402 0.2742 0.054 7dt1:B
28 7dt1:A 846 178 0.0833 0.0473 0.2247 6.6 7dt1:B
29 1cyg:A 680 382 0.1979 0.1397 0.2487 9.64e-07
30 7p38:A 832 101 0.0688 0.0397 0.3267 9.96e-07 8hw3:A, 8hw3:B, 8hwk:A, 8hwk:B, 7p38:B, 7p39:A, 7p39:B
31 7p38:A 832 353 0.1708 0.0986 0.2323 7.90e-05 8hw3:A, 8hw3:B, 8hwk:A, 8hwk:B, 7p38:B, 7p39:A, 7p39:B
32 3tto:A 1055 407 0.1875 0.0853 0.2211 1.07e-06 3tto:B, 3tto:C, 3tto:D, 3ttq:A, 4ttu:A, 4tvc:A, 4tvd:A
33 3tto:A 1055 113 0.0792 0.0360 0.3363 0.001 3tto:B, 3tto:C, 3tto:D, 3ttq:A, 4ttu:A, 4tvc:A, 4tvd:A
34 1cdg:A 686 364 0.1917 0.1341 0.2527 1.63e-06 1cgv:A, 1cgw:A, 1cgx:A, 1cgy:A, 1cxe:A, 1cxf:A, 1cxh:A, 1cxi:A, 1cxk:A, 1cxl:A, 2cxg:A, 1d3c:A, 2dij:A, 1dtu:A, 1eo5:A, 1eo7:A, 1kck:A, 1kcl:A, 1ot1:A, 1ot2:A, 1pez:A, 1pj9:A, 1tcm:A, 1tcm:B
35 6sao:A 438 339 0.1646 0.1804 0.2330 1.79e-06
36 1j0h:A 588 369 0.1896 0.1548 0.2466 2.44e-06 1j0h:B, 1j0i:A, 1j0i:B, 1j0j:B, 1j0j:A, 1j0k:A, 1j0k:B
37 4jcm:A 669 355 0.1792 0.1286 0.2423 4.18e-06
38 1d7f:A 686 425 0.2188 0.1531 0.2471 5.46e-06 1d7f:B, 1ded:A, 1ded:B, 1i75:A, 1i75:B, 1pam:A, 1pam:B, 1ukq:A, 1ukq:B, 1uks:A, 1uks:B, 1ukt:A, 1ukt:B, 1v3j:A, 1v3j:B, 1v3k:A, 1v3k:B, 1v3l:A, 1v3l:B, 1v3m:A, 1v3m:B
39 5x7u:A 546 318 0.1437 0.1264 0.2170 8.67e-06
40 6wni:A 494 362 0.1917 0.1862 0.2541 1.22e-05 6wni:B, 6wnu:A
41 1gvi:B 588 361 0.1729 0.1412 0.2299 1.63e-05 1gvi:A
42 6y9t:A 536 381 0.1708 0.1530 0.2152 5.37e-05 6y9t:B
43 2taa:A 478 489 0.2417 0.2427 0.2372 5.75e-05 2guy:A, 2gvy:A, 2gvy:B, 3kwx:A, 7p4w:A, 2taa:B, 2taa:C, 6taa:A, 7taa:A, 3vx0:A, 3vx1:A, 6xsj:A, 6xsj:B, 6xsv:A, 6yq7:A, 6yq7:B, 6yq9:AAA, 6yq9:BBB, 6yqa:AAA, 6yqa:BBB, 6yqb:AAA, 6yqb:BBB, 6yqc:AAA, 6yqc:BBB
44 1cgt:A 684 361 0.1896 0.1330 0.2521 8.83e-05 1cgu:A, 3cgt:A, 4cgt:A, 5cgt:A, 6cgt:A, 7cgt:A, 8cgt:A, 9cgt:A
45 1lwh:A 441 359 0.1625 0.1769 0.2173 1.04e-04 1lwh:B, 1lwj:A, 1lwj:B
46 5ngy:A 1265 324 0.1417 0.0538 0.2099 1.63e-04 6htv:A, 5lfc:A, 5lfc:B, 5ngy:B, 5o8l:A
47 5m99:A 506 319 0.1542 0.1462 0.2320 2.16e-04 5m99:B
48 7d9b:A 588 356 0.1667 0.1361 0.2247 2.21e-04 7d9c:A, 7dcg:A, 7dch:A, 7ehh:A, 7ehi:A
49 1jda:A 418 103 0.0646 0.0742 0.3010 2.80e-04 2amg:A, 1gcy:A, 6iwk:A, 6iyg:A, 6j3x:A, 1jdc:A, 1jdd:A, 6jqb:A, 1qi3:A, 1qi4:A, 1qi5:A, 1qpk:A
50 1jda:A 418 210 0.1187 0.1364 0.2714 3.83e-04 2amg:A, 1gcy:A, 6iwk:A, 6iyg:A, 6j3x:A, 1jdc:A, 1jdd:A, 6jqb:A, 1qi3:A, 1qi4:A, 1qi5:A, 1qpk:A
51 4aie:A 537 391 0.1812 0.1620 0.2225 3.50e-04
52 6sav:A 438 358 0.1812 0.1986 0.2430 7.11e-04 6sav:B
53 3aib:G 844 278 0.1271 0.0723 0.2194 0.001 3aib:A, 3aib:B, 3aib:C, 3aib:D, 3aib:E, 3aib:F, 3aib:H, 3aic:A, 3aic:B, 3aic:C, 3aic:D, 3aic:E, 3aic:F, 3aic:G, 3aic:H, 3aie:A, 3aie:B, 3aie:C, 3aie:D, 3aie:E, 3aie:F, 3aie:G, 3aie:H, 8fg8:A, 8fg8:B, 8fj9:A, 8fj9:B, 8fjc:A, 8fjc:B, 8fk4:A, 8fk4:B, 8fk4:C, 8fk4:D, 8fk4:E, 8fk4:F, 8fk4:G, 8fk4:H, 8uf5:A, 8uf5:B
54 1a47:A 683 523 0.2583 0.1816 0.2371 0.001 3bmv:A, 3bmw:A, 1ciu:A
55 5jy7:B 571 312 0.1396 0.1173 0.2147 0.003 5jy7:A, 5jy7:C, 5jy7:D, 5jy7:E, 5jy7:F, 5jy7:G, 5jy7:H, 3zo9:A, 3zo9:B, 3zoa:B, 3zoa:A
56 4amc:A 1019 269 0.1313 0.0618 0.2342 0.006
57 4amc:A 1019 113 0.0646 0.0304 0.2743 1.1
58 4h8v:A 557 74 0.0521 0.0449 0.3378 0.008 4gi6:A, 4gi6:B, 4gi8:A, 4gi8:B, 4gi9:A, 4gi9:B, 4gia:A, 4gia:B, 4gin:A, 4go8:A, 4go8:B, 4go9:A, 4go9:B, 4h2c:A, 4h7v:A, 4h7v:B, 4h8h:A, 4h8h:B, 4h8u:A, 4h8u:B, 4h8v:B, 4ha1:A, 4ha1:B, 2pwd:A, 2pwd:B, 2pwe:A, 2pwe:B, 2pwf:A, 2pwf:B, 2pwf:C, 2pwf:D, 2pwg:A, 2pwg:B, 2pwh:A, 2pwh:B, 1zja:A, 1zja:B, 1zjb:A, 1zjb:B
59 1wza:A 488 361 0.1604 0.1578 0.2133 0.009
60 6a0k:A 450 172 0.0875 0.0933 0.2442 0.009 6a0j:A, 6a0k:B, 6a0l:A, 5zxg:A
61 4how:A 559 74 0.0479 0.0411 0.3108 0.010 4hox:A, 4hoz:A, 4hp5:A, 4hph:A
62 8ibk:A 546 210 0.1146 0.1007 0.2619 0.011 8ids:A, 5zcb:A, 5zcc:A, 5zcd:A, 5zce:A
63 2ze0:A 531 390 0.1771 0.1601 0.2179 0.011
64 3gbe:A 558 74 0.0500 0.0430 0.3243 0.013
65 4lxf:B 546 358 0.1521 0.1337 0.2039 0.015
66 9ezl:A 548 185 0.0854 0.0748 0.2216 0.020 9ezl:B, 9ezl:C, 9ezl:D, 9ezl:E, 9ezl:F, 9ezl:G, 9ezl:H, 5gtw:A, 5gtw:B, 5gtw:C, 5gtw:D, 4tvu:A, 4tvu:B, 4tvu:C, 4tvu:D, 4tvu:E, 4tvu:F, 4tvu:G, 4tvu:H, 4wf7:A, 4wf7:B, 4wf7:C, 4wf7:D, 5ykb:A, 5ykb:C
67 3k8k:A 650 90 0.0542 0.0400 0.2889 0.025 6bs6:A, 6bs6:B, 3k8k:B, 3k8l:A, 3k8l:B, 3k8m:A, 3k8m:B
68 3k8k:A 650 171 0.1000 0.0738 0.2807 0.47 6bs6:A, 6bs6:B, 3k8k:B, 3k8l:A, 3k8l:B, 3k8m:A, 3k8m:B
69 6aij:A 687 258 0.1313 0.0917 0.2442 0.031 4jcl:A, 6l2h:A, 3wms:A
70 6lga:A 570 258 0.1125 0.0947 0.2093 0.040 6lga:B, 6lgb:A, 6lgb:B, 6lgc:A, 6lgc:B, 6lgd:A, 6lgd:B, 6lge:A, 6lge:B, 6lgf:A, 6lgf:B, 6lgg:A, 6lgg:B, 6lgh:A, 6lgh:B, 6lgi:A, 6lgi:B
71 5ykb:D 523 166 0.0792 0.0727 0.2289 0.056 5ykb:B
72 6k5p:A 531 212 0.1083 0.0979 0.2453 0.068 6k5p:B, 6k5p:C, 6k5p:D
73 5brp:A 555 74 0.0458 0.0396 0.2973 0.088 5brp:B, 5brp:C, 5brp:D, 5brq:A, 5brq:B, 5brq:C, 5brq:D
74 5do8:B 553 217 0.1000 0.0868 0.2212 0.094 5do8:A, 5do8:C
75 8uzh:B 626 207 0.0958 0.0735 0.2222 0.11 4lxf:A, 8uqv:A, 8uqv:B, 8uqv:C, 8uqv:D, 8uzh:A
76 6hvg:A 1278 126 0.0750 0.0282 0.2857 0.12 6hvg:B, 6syq:A, 6syq:B, 6szi:A, 6szi:B, 6t16:B, 6t16:A, 6t18:A, 6t18:B, 6t1p:A, 6t1p:B
77 6hvg:A 1278 52 0.0333 0.0125 0.3077 4.2 6hvg:B, 6syq:A, 6syq:B, 6szi:A, 6szi:B, 6t16:B, 6t16:A, 6t18:A, 6t18:B, 6t1p:A, 6t1p:B
78 1bag:A 425 143 0.0833 0.0941 0.2797 0.40 3dc0:A, 1ua7:A
79 4ayg:A 1028 165 0.0771 0.0360 0.2242 0.43 4ayg:B, 3hz3:A, 3klk:A, 3kll:A
80 4ayg:A 1028 55 0.0354 0.0165 0.3091 7.2 4ayg:B, 3hz3:A, 3klk:A, 3kll:A
81 6li9:A 623 240 0.0979 0.0754 0.1958 1.2 6li9:C, 6lid:A, 6lid:C, 6yup:A, 6yup:C, 6yuz:A, 6yuz:C
82 8yif:A 537 75 0.0437 0.0391 0.2800 1.4 8yie:A, 8yie:B
83 5h06:B 499 117 0.0604 0.0581 0.2479 1.4 5h05:A, 5h05:B, 5h05:C, 5h05:D, 5h06:A, 5h06:C, 5h06:D
84 5nfg:A 333 88 0.0563 0.0811 0.3068 1.7
85 6l1q:C 267 67 0.0354 0.0637 0.2537 2.1 6l1q:A, 6l1q:B
86 3a47:A 586 153 0.0792 0.0648 0.2484 3.3 3a4a:A, 3aj7:A, 3axh:A, 3axi:A
87 3vgf:A 555 74 0.0479 0.0414 0.3108 3.5 3vgg:A, 3vgh:A
88 3a6o:A 585 191 0.1000 0.0821 0.2513 4.7 3a6o:B, 2d2o:A, 2d2o:B, 1g1y:A, 1g1y:B, 1jf5:A, 1jf5:B, 1jf6:A, 1jf6:B, 1ji2:A, 1ji2:B, 1jib:A, 1jib:B, 1jl8:A, 1jl8:B, 1vb9:A, 1vb9:B, 1vfm:A, 1vfm:B, 1vfo:A, 1vfo:B, 1vfu:A, 1vfu:B, 1wzk:A, 1wzk:B, 1wzl:A, 1wzl:B, 1wzm:A, 1wzm:B
89 8im8:A 557 383 0.1562 0.1346 0.1958 4.9 8im8:B, 8im8:C, 8im8:D
90 3vvb:A 270 56 0.0354 0.0630 0.3036 5.5
91 5ot1:A 572 74 0.0458 0.0385 0.2973 5.5
92 2oai:A 80 44 0.0354 0.2125 0.3864 6.1 2r8d:A
93 4wlc:A 536 74 0.0396 0.0354 0.2568 6.2 4xb3:A, 2zic:A, 2zid:A
94 1mcp:H 222 46 0.0333 0.0721 0.3478 7.4 2mcp:H
95 3ueq:A 632 162 0.0750 0.0570 0.2222 9.1 4fls:A, 1jg9:A, 1jgi:A, 1mvy:A, 1mw0:A, 1mw1:A, 1mw2:A, 1mw3:A, 5n6v:A, 5n7j:A, 1s46:A, 1zs2:A
96 3a43:A 139 39 0.0250 0.0863 0.3077 9.7 3a44:A, 3a44:B, 3a44:D, 5aun:A, 5auo:A, 5aup:A, 5aup:H, 5yxy:D, 5yxy:E, 5yxy:F, 5yy0:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218