BioLiP

>protein
DFPSYDSGYHNYNEMVNKINTVASNYPNIVKKFSIGKSYEGRELWAVKISDNVGTDENEPEVLYTALHHAREHLTVEMAL
YTLDLFTQNYNLDSRITNLVNNREIYIVFNINPDGGEYDISSGSYKSWRKNRQPNSGSSYVGTDLNRNYGYKWGCCGGSS
GSPSSETYRGRSAFSAPETAAMRDFINSRVVGGKQQIKTLITFHTYSELILYPYGYTYTDVPSDMTQDDFNVFKTMANTM
AQTNGYTPQQASDNYITDGDMTDWAYGQHKIFAFTFEMYPTSYNPGFYPPDEVIGRETSRNKEAVLYVAEKADCPYSVIG
KSC

The query sequence (length=323) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7aqp:A	323	323	0.9876	0.9876	0.9876	0.0	7aru:A, 4djl:A, 4duk:A, 6f6q:A, 6f75:A, 6f79:A, 4f8z:A, 4gm5:A, 6go2:A, 4iav:A, 4ihm:A, 4ik2:A, 1obr:A, 3prt:A, 7q87:A, 3qnv:A, 8qvo:A, 6sn6:A, 6t9y:A, 6tnk:A, 3v38:A, 3v7z:A, 6z28:A
2	1pyt:B	309	289	0.2848	0.2977	0.3183	8.29e-41	2abz:A, 2abz:B, 1arm:A, 1bav:A, 1bav:B, 1bav:C, 1bav:D, 1cbx:A, 1cps:A, 1cpx:A, 3cpa:A, 4cpa:A, 4cpa:B, 5cpa:A, 6cpa:A, 7cpa:A, 8cpa:A, 2ctb:A, 2ctc:A, 1ee3:P, 1ell:P, 1elm:P, 1f57:A, 3fvl:A, 3fvl:C, 3fvl:E, 3fx6:A, 3fx6:C, 3fx6:E, 1hdq:A, 1hdu:A, 1hdu:B, 1hdu:D, 1hdu:E, 1hee:A, 1hee:B, 1hee:D, 1hee:E, 3hlp:A, 3hlp:B, 3huv:A, 3i1u:A, 1iy7:A, 3kgq:A, 1m4l:A, 2rfh:A, 1yme:A, 1zlh:A
3	2boa:A	404	290	0.2755	0.2203	0.3069	3.82e-39	4a94:A, 4a94:B, 4bd9:A, 2bo9:A, 2bo9:C, 2boa:B, 2pcu:A
4	1pca:A	402	289	0.2724	0.2189	0.3045	1.88e-38
5	1aye:A	401	308	0.3034	0.2444	0.3182	2.27e-38	1dtd:A
6	5om9:A	396	290	0.2755	0.2247	0.3069	2.49e-37	3fju:A, 6i6z:A, 6i6z:B, 5om9:B, 4uee:A, 4uee:B, 4uez:A, 4uez:B, 2v77:A, 2v77:B
7	1kwm:A	402	303	0.2817	0.2264	0.3003	8.01e-37	1kwm:B, 1zli:A
8	3dgv:A	401	314	0.3003	0.2419	0.3089	4.15e-35	3d4u:A, 3dgv:B, 3dgv:C, 3osl:A, 3osl:C
9	3glj:A	395	304	0.2848	0.2329	0.3026	9.88e-35	5j1q:A, 5jc6:A, 2jew:A, 5lrg:A, 5lrg:B, 5lrg:C, 5lrj:A, 5lrj:B, 5lrj:C, 5lrk:A, 5lrk:B, 5lrk:C, 5lyd:A, 5lyf:A, 5lyi:A, 5lyl:A, 1nsa:A, 2piy:A, 2piy:B, 2piy:C, 2piz:A, 2piz:B, 2piz:C, 2pj0:A, 2pj0:B, 2pj0:C, 2pj1:A, 2pj1:B, 2pj1:C, 2pj2:A, 2pj2:B, 2pj2:C, 2pj3:A, 2pj3:B, 2pj3:C, 2pj4:A, 2pj4:B, 2pj5:A, 2pj5:B, 2pj5:C, 2pj6:A, 2pj7:A, 2pj7:B, 2pj7:C, 2pj8:A, 2pj8:B, 2pj8:C, 2pj9:A, 2pja:A, 2pja:B, 2pja:C, 2pjb:A, 2pjb:B, 2pjb:C, 2pjc:A, 2pjc:B, 2pjc:C, 4uia:A, 4uib:A, 3wab:A, 3wc5:A, 3wc6:A, 3wc7:A, 1z5r:A, 1z5r:B, 1z5r:C, 4z65:A, 5zeq:A, 1zg7:A, 1zg7:B, 1zg7:C, 1zg8:A, 1zg8:B, 1zg8:C, 1zg9:A, 1zg9:B, 1zg9:C
10	4p10:A	402	307	0.2972	0.2388	0.3127	1.31e-34	3d66:A, 3d66:B, 3d66:C, 3d67:A, 3d67:B, 3d67:C, 3d68:A, 3d68:B, 3d68:C, 5hvg:A, 5hvg:C, 5hvh:A, 3lms:A, 7nee:A, 7neu:A
11	5mrv:A	307	306	0.2879	0.3029	0.3039	1.24e-33	5mrv:B
12	1jqg:A	409	281	0.2693	0.2127	0.3096	2.20e-33
13	7eqx:C	299	276	0.2755	0.2977	0.3225	2.02e-32	7eqx:D, 7eqz:A
14	5hvf:A	372	308	0.2693	0.2339	0.2825	3.44e-27
15	2c1c:A	312	322	0.2539	0.2628	0.2547	4.64e-23	2c1c:B
16	1h8l:A	380	320	0.2477	0.2105	0.2500	8.74e-17	1qmu:A
17	1uwy:A	393	311	0.2539	0.2087	0.2637	6.50e-14
18	3mn8:B	386	310	0.2570	0.2150	0.2677	7.90e-14	3mn8:A, 3mn8:C, 3mn8:D
19	4a37:B	376	122	0.0805	0.0691	0.2131	0.032	4a37:A, 4a38:A, 4a38:B, 4a39:A, 4a39:B
20	3l2n:A	376	121	0.0991	0.0851	0.2645	0.046	3l2n:B
21	6ojb:A	251	87	0.0774	0.0996	0.2874	5.5
22	3poy:A	1005	99	0.0836	0.0269	0.2727	7.1	3asi:A, 3b3q:E, 3b3q:F, 3biw:E, 3biw:F, 3biw:G, 3bod:A, 2h0b:A, 2h0b:B, 2h0b:C, 2h0b:D, 2r16:A, 2r1d:H, 2r1d:B, 2r1d:D, 2r1d:I, 3vkf:C, 3vkf:D, 2wqz:C, 2wqz:D, 2xb6:C, 2xb6:D, 5z8y:B, 5z8y:D, 5z8y:F, 5z8y:H
23	2f6r:A	230	79	0.0774	0.1087	0.3165	9.7

[Back]