BioLiP

>protein
DEITFSDYLGLMTCVYEWADSYDSKDWDRLRKVIAPTLRIDYRSFLDKLWEAMPAEEFVGMVSSKQVLGDPTLRTQHFIG
GTRWEKVSEDEVIGYHQLRVPHQRYKDTTMKEVTMKGHAHSANLHWYKKIDGVWKFAGLKPDIRWGEFDFDRIFEDGRET
FG

The query sequence (length=162) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4std:A	164	161	0.9938	0.9817	1.0000	7.92e-120	1std:A, 2std:A, 3std:A, 3std:B, 3std:C, 4std:B, 4std:C, 5std:A, 5std:B, 5std:C, 6std:A, 6std:B, 6std:C, 7std:A, 7std:B, 7std:C
2	1xx6:A	178	53	0.1173	0.1067	0.3585	0.25	1xx6:B
3	2r2i:A	184	46	0.1049	0.0924	0.3696	0.38
4	8pfh:D	291	84	0.1543	0.0859	0.2976	0.98
5	7n7r:B	348	35	0.0741	0.0345	0.3429	1.4	7k0r:A, 7k0r:B, 7k0r:C, 7k0r:D, 7k0r:E, 7k0r:F, 7k1l:A, 7k1l:B, 7k1o:A, 7k1o:B, 7k1o:C, 7n06:A, 7n06:B, 7n06:C, 7n06:D, 7n06:E, 7n06:F, 7n33:A, 7n33:B, 7n33:C, 7n33:D, 7n33:E, 7n33:F, 7n7u:A, 7n7u:B, 7n7w:B, 7n7y:A, 7n7y:B, 7n83:A, 7n83:B, 5s6x:A, 5s6x:B, 5s6y:A, 5s6y:B, 5s6z:A, 5s6z:B, 5s71:B, 5s72:A, 5sa4:B, 5sa5:B, 5sa6:A, 5sa6:B, 5sa7:A, 5sa8:A, 5sa8:B, 5sa9:B, 5saa:A, 5saa:B, 5sab:B, 5sac:B, 5sad:B, 5sae:A, 5sae:B, 5saf:A, 5saf:B, 5sag:B, 5sah:A, 5sah:B, 5sai:B, 7tj2:A, 7tj2:E, 7tqv:A, 7tqv:C, 7tqv:E, 8ud3:B, 8ud3:A, 8ud4:B, 8ud4:A, 8ud5:D, 8ud5:B, 8ud5:A, 6vww:A, 6wlc:A, 6wlc:B, 6wxc:A, 6wxc:B, 6x1b:A, 6x1b:B, 6x4i:A, 6x4i:B
6	2ref:A	203	58	0.1235	0.0985	0.3448	1.5	2ref:B
7	1bs4:A	168	40	0.0802	0.0774	0.3250	2.7	2ai8:A, 2ai8:B, 2ai8:C, 4al2:B, 4al3:A, 4az4:A, 1bs4:B, 1bs4:C, 1bs5:A, 1bs5:B, 1bs5:C, 1bs6:A, 1bs6:B, 1bs6:C, 1bs8:A, 1bs8:B, 1bs8:C, 1bsj:A, 1bsk:A, 1bsz:A, 1bsz:B, 1bsz:C, 7d6z:g, 1def:A, 2def:A, 1dff:A, 1g27:A, 1g27:B, 1g27:C, 1g2a:A, 1g2a:B, 1g2a:C, 3k6l:A, 3k6l:B, 2kmn:A, 1lru:A, 1lru:B, 1lru:C, 8ofe:A, 8rhr:A, 2w3t:A, 2w3u:A, 1xem:A, 1xen:A, 1xeo:A
8	5koh:A	483	85	0.1420	0.0476	0.2706	2.9	5koh:C, 5koj:A, 5koj:C
9	4kh6:B	596	21	0.0556	0.0151	0.4286	3.2	4a59:A, 4a59:B, 4a59:C, 4a59:D, 4a5a:A, 4a5a:B, 4a5a:C, 4a5a:D, 4kh4:A, 4kh4:B, 4kh5:A, 4kh5:B, 4kh6:A
10	6r7x:A	629	41	0.0926	0.0238	0.3659	4.8	5oc9:A, 5oc9:B, 6r65:A, 6r65:B, 6r7x:B, 6r7y:A, 6r7y:B
11	7b9p:A	899	59	0.1111	0.0200	0.3051	5.8
12	8iwh:7	165	67	0.1235	0.1212	0.2985	8.4	8iwh:0

[Back]