BioLiP

>protein
DEFEMIKRNTSEIISEEELREVLKKDEKSALIGFEPSGKIHLGHYLQIKKMIDLQNAGFDIIIILADLHAYLNQKGELDE
IRKIGDYNKKVFEAMGLKAKYVYGSEFMLDKDYTLNVYRLALKTTLKRARRSMELIAREDENPKVAEVIYPIMQVNGIHY
VGGDVAVGGMEQRKIHMLARELLPKKVVCIHNPVLTGLDGEGKMSSSKGNFIAVDDSPEEIRAKIKKAYCPAGVVEGNPI
MEIAKYFLEYPLTIKRPEKFGGDLTVNSYEELESLFKNKELHPMDLKNAVAEELIKILEPIRKRL

The query sequence (length=305) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4nx2:A	313	305	0.9770	0.9521	0.9770	0.0	2ag6:A, 7ckg:B, 3d6u:A, 3d6v:A, 2hgz:A, 4hjx:A, 4hjx:B, 4hpw:A, 1j1u:A, 5l7p:B, 3n2y:A, 3n2y:B, 5n5u:A, 4nda:A, 5nsf:B, 5nsf:A, 5nsf:C, 5nsf:D, 4pbr:A, 4pbs:A, 4pbt:A, 2pxh:A, 3qe4:A, 3qe4:B, 6wrk:A, 6wrn:A, 6wrq:A, 6wrt:A, 7ynw:A, 7ynw:B, 1zh0:A, 1zh6:A, 2zp1:A
2	2cyb:A	319	317	0.5672	0.5423	0.5457	4.47e-119	2cyb:B
3	2cyc:A	371	347	0.4361	0.3585	0.3833	1.17e-59	2cyc:B
4	7sc6:A	349	329	0.3803	0.3324	0.3526	1.39e-51	7scq:A, 7scq:B
5	7rou:A	335	322	0.3672	0.3343	0.3478	2.00e-51	1q11:A, 4q93:A, 4qbt:A, 5thh:A
6	2dlc:X	339	330	0.3443	0.3097	0.3182	3.85e-51
7	7ror:B	362	315	0.3672	0.3094	0.3556	6.21e-48	7ror:A, 7ros:A, 7ros:B, 7rot:A, 7rot:B, 3vgj:A, 3vgj:B
8	5usf:A	682	340	0.3279	0.1466	0.2941	4.36e-33	3p0h:A, 3p0i:A, 3p0j:C, 3p0j:D, 5usf:B
9	5usf:A	682	250	0.2262	0.1012	0.2760	1.70e-10	3p0h:A, 3p0i:A, 3p0j:C, 3p0j:D, 5usf:B
10	3p0j:A	657	343	0.3344	0.1553	0.2974	1.59e-31	3p0h:B, 3p0i:B, 3p0j:B
11	3p0j:A	657	247	0.2197	0.1020	0.2713	1.23e-10	3p0h:B, 3p0i:B, 3p0j:B
12	2j5b:A	321	295	0.2787	0.2648	0.2881	5.71e-23	2j5b:B
13	1h3f:B	406	249	0.2262	0.1700	0.2771	6.27e-16	1h3f:A
14	1h3e:A	427	258	0.2262	0.1616	0.2674	7.54e-15
15	6bqz:A	215	209	0.1803	0.2558	0.2632	5.68e-13	6bqz:B
16	2a4m:C	331	301	0.2492	0.2296	0.2525	8.30e-12	1yi8:C, 1yia:B, 1yid:B
17	6ncr:A	342	310	0.2557	0.2281	0.2516	1.59e-11	6ncr:B
18	3a04:A	367	218	0.2098	0.1744	0.2936	1.30e-09	3a05:A
19	2yy5:B	346	326	0.2623	0.2312	0.2454	1.84e-08	2yy5:A, 2yy5:C, 2yy5:D
20	2g36:A	322	235	0.2033	0.1925	0.2638	1.74e-07
21	4j75:A	374	245	0.2164	0.1765	0.2694	5.34e-07	4j75:B, 4jfa:A, 4jfa:B, 4jfa:D
22	3tzl:B	320	247	0.2000	0.1906	0.2470	5.19e-05	3tzl:A
23	4jfa:C	348	232	0.1869	0.1638	0.2457	5.53e-05
24	5ekd:A	327	238	0.1967	0.1835	0.2521	1.22e-04	5ekd:B
25	3jxe:B	363	203	0.1508	0.1267	0.2266	3.99e-04	3jxe:A
26	3sz3:A	341	300	0.2131	0.1906	0.2167	0.055
27	6dfu:A	332	298	0.2164	0.1988	0.2215	0.072	6dfu:B
28	8i1w:B	333	219	0.1541	0.1411	0.2146	0.18	8i1y:A, 8i1y:B, 8i1z:A, 8i1z:B, 8i27:A, 8i27:B, 8i2a:B, 8i2a:A, 8i2c:A, 8i2c:B, 8i2j:A, 8i2j:B, 8i2l:B, 8i2l:A, 8i2m:A, 8i2m:B, 8i4i:A, 8i4i:B, 5v0i:A, 5v0i:B
29	7cms:A	328	298	0.2164	0.2012	0.2215	0.47	7cki:A, 7cms:B, 5dk4:A, 7eer:A, 7eer:B, 7eer:C, 7eer:D, 1i6k:A, 1i6l:A, 1i6m:A, 1m83:A, 1mau:A, 1maw:A, 1maw:B, 1maw:C, 1maw:D, 1maw:E, 1maw:F, 1mb2:A, 1mb2:B, 1mb2:C, 1mb2:D, 1mb2:E, 1mb2:F, 2ov4:A
30	3ct4:A	318	45	0.0525	0.0503	0.3556	1.4	3ct4:B, 3ct4:C
31	6tm0:A	811	65	0.0590	0.0222	0.2769	1.5	6tlz:A, 6tlz:B, 6tm0:B
32	3kws:A	265	62	0.0689	0.0792	0.3387	1.9	3kws:B
33	4v6w:Ch	123	31	0.0393	0.0976	0.3871	3.4	6xu6:Ch, 6xu7:Ch, 6xu8:Ch
34	4nv0:B	300	55	0.0656	0.0667	0.3636	3.4	4nv0:A, 4nwi:A, 4nwi:B
35	3fhj:D	286	215	0.1508	0.1608	0.2140	4.4	3fhj:C
36	5ko7:B	200	77	0.0656	0.1000	0.2597	5.7
37	4dbe:A	213	103	0.0754	0.1080	0.2233	7.7	4dbe:B
38	5tgc:D	428	99	0.0820	0.0584	0.2525	8.8	5tgc:A

[Back]