BioLiP

>protein
DDRELAILATAENLLEDRPLADISVDDLAKGAGISRPTFYFYFPSKEAVLLTLLDRVVNQADMALQTLAENPADTDRENM
WRTGINVFFETFGSHKAVTRAGQAARATSVEVAELWSTFMQKWIAYTAAVIDAERDRGAAPRTLPAHELATALNLMNERT
LFASFAGEQPSVPEARVLDTLVHIWVTSIYGEN

The query sequence (length=193) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5mym:C	205	192	0.9948	0.9366	1.0000	1.13e-140	4dw6:A, 5eyr:A, 5ezg:A, 5ezh:A, 5f04:A, 5f08:A, 5f0c:A, 5f0f:A, 5f0h:A, 5f1j:A, 5f27:A, 3g1l:A, 3g1m:A, 3g1o:A, 6hnx:A, 6hnz:A, 6ho0:A, 6ho1:A, 6ho2:A, 6ho3:A, 6ho4:A, 6ho5:A, 6ho6:A, 6ho7:A, 6ho8:A, 6ho9:A, 6hoa:A, 6hob:A, 6hoc:A, 6hod:A, 6hoe:A, 6hof:A, 5ioy:A, 5ioz:A, 5ip6:A, 5ipa:A, 5j1r:A, 5j1u:A, 5j1y:A, 5j3l:A, 4m3b:A, 4m3d:A, 4m3e:A, 4m3f:A, 4m3g:A, 5mwo:A, 5mxk:A, 5mxv:A, 5myl:A, 5mym:B, 5myn:A, 5myr:A, 5mys:A, 5myt:A, 5myw:A, 7ngd:A, 7ngg:C, 7ngi:A, 7ngj:A, 7ngk:A, 7ngm:A, 7ngn:A, 7ngo:A, 7ngr:A, 7ngs:A, 7ngt:A, 7ngu:A, 7ngw:A, 7ngx:A, 7ngy:A, 5nim:A, 5nio:A, 5niz:A, 5nj0:A, 5nz0:A, 5nz1:A, 5nz1:C, 5nz1:D, 3o8g:A, 3o8h:A, 3q0u:A, 3q0v:A, 3q0v:B, 3q0w:A, 3q3s:A, 6r1p:A, 6r1s:A, 3sdg:A, 3sfi:A, 3tp0:A, 1u9n:A, 1u9o:A, 1u9o:B
2	6yl2:B	192	53	0.1088	0.1094	0.3962	3.10e-07	6yl2:A
3	6en8:C	191	180	0.2124	0.2147	0.2278	5.30e-06	6el2:A, 6el2:B, 6en8:D, 6en8:F, 6en8:A, 6en8:B, 6en8:E
4	2zoz:B	181	68	0.1088	0.1160	0.3088	4.01e-05	2yve:A, 2yve:B, 2yvh:A, 2yvh:D, 2yvh:B, 2yvh:C, 2zoz:A
5	6o6n:A	195	91	0.1399	0.1385	0.2967	4.07e-05	6o6p:A, 6o6p:B
6	6g8g:A	195	48	0.0984	0.0974	0.3958	1.45e-04	6g8g:B, 6g8g:C, 6g8g:D, 6g8h:CCC, 6g8h:BBB
7	3ang:C	201	45	0.0984	0.0945	0.4222	4.17e-04	3ang:D, 3ang:A, 3ang:B, 3anp:C, 3anp:D, 3anp:A, 3anp:B
8	2eh3:A	171	72	0.1036	0.1170	0.2778	7.55e-04
9	3aqt:B	196	72	0.0984	0.0969	0.2639	0.001	3aqt:A
10	6srn:A	187	49	0.0829	0.0856	0.3265	0.002
11	7ju3:B	203	94	0.1244	0.1182	0.2553	0.002	8fw0:A, 8fw0:B, 8fw0:C, 8fw0:D, 8fw3:C, 8fw3:D, 8fw3:A, 8fw3:B, 8fw8:B, 8fw8:C, 8fw8:D, 7jnp:A, 7jnp:B, 7ju3:A, 8ssh:C, 8ssh:D, 8ssh:A, 8ssh:B
12	5dy0:A	220	63	0.0984	0.0864	0.3016	0.005	5dy0:B, 5dy0:C, 5dy0:D, 5dy1:A, 5dy1:B, 6gy3:A, 6gy3:B
13	6z1b:B	202	57	0.0829	0.0792	0.2807	0.009	4jyk:A, 4jyk:B, 3loc:A, 3loc:B, 3loc:C, 3loc:D, 4xk4:A, 4xk4:B, 4xk4:C, 4xk4:D, 6z1b:A
14	5gpc:A	190	98	0.1347	0.1368	0.2653	0.009	5gpc:B, 5gpc:C, 5gpc:D
15	3whc:A	190	37	0.0725	0.0737	0.3784	0.016	1vi0:A, 1vi0:B, 3whb:A, 3whb:B, 3whc:B, 3whc:C, 3whc:D, 3whc:E, 3whc:F
16	5yej:C	169	122	0.1451	0.1657	0.2295	0.018	5yej:B, 5yej:A
17	5d1w:D	196	64	0.1140	0.1122	0.3438	0.019	5d1w:A, 5d1w:B, 5d1w:C
18	4l62:A	190	55	0.0777	0.0789	0.2727	0.020	4l62:B, 4l62:C, 4l62:D, 4l62:E, 4l62:F, 4l62:G, 4l62:H, 4l62:I, 4l62:J, 4l62:K, 4l62:L, 4l62:M, 4l62:N, 4l62:O, 4l62:P
19	4w97:A	196	54	0.0984	0.0969	0.3519	0.036
20	7eqf:A	184	47	0.0725	0.0761	0.2979	0.038	7eqf:B, 7eqf:C, 7eqf:D
21	4jl3:C	182	50	0.0777	0.0824	0.3000	0.077	4jl3:A, 4jl3:B, 4jl3:D
22	5k7z:A	185	101	0.1451	0.1514	0.2772	0.092	5k7h:A, 5k7h:B, 5k7z:B, 5k7z:C, 5k7z:D
23	7k1c:B	208	49	0.0829	0.0769	0.3265	0.097	7k1a:A, 7k1a:B, 7k1c:A, 7kd8:A, 7kd8:B, 7kd8:D, 7kd8:C, 2uxh:A, 2uxh:B, 2uxi:A, 2uxi:B, 2uxo:B, 2uxp:A, 2uxp:B, 2uxu:A, 2uxu:B
24	6ayh:A	192	108	0.1503	0.1510	0.2685	0.20
25	3p9t:A	213	85	0.1088	0.0986	0.2471	0.20
26	2i10:B	182	65	0.1036	0.1099	0.3077	0.25	2i10:A
27	4gct:C	190	55	0.0933	0.0947	0.3273	0.41	4gct:A, 4gct:B, 4gct:D, 5haw:A, 5haw:B
28	8svd:T	197	49	0.0725	0.0711	0.2857	0.55	8sua:A, 8svd:A, 8svd:G, 8svd:F, 8svd:E, 8svd:I, 8svd:J, 8svd:K
29	5d9b:A	307	43	0.0674	0.0423	0.3023	0.59	5d9c:A, 5d9d:A, 5gtq:A, 5gx1:A, 5gx2:A, 5gx3:A, 5gx4:A, 5gx5:A, 5xfe:A
30	8sva:A	200	47	0.0725	0.0700	0.2979	0.63	8suk:D, 8suk:C, 8sva:F, 8sva:G, 8sva:T, 8t5y:A
31	3pvl:A	597	35	0.0725	0.0235	0.4000	0.73
32	7xxn:A	198	58	0.0881	0.0859	0.2931	0.79	7xxt:A
33	5h58:B	204	49	0.0622	0.0588	0.2449	0.97	5h58:A, 5h58:C, 5h58:D, 4pxi:A, 4pxi:B, 4pxi:C, 4pxi:D
34	3hgy:A	202	97	0.1347	0.1287	0.2680	1.1	2qco:A, 3qqa:A
35	5x3r:A	203	34	0.0674	0.0640	0.3824	1.3	7amn:B, 7amn:A, 7amt:B, 7amt:A, 5x3r:B, 5x3r:C, 5x3r:D
36	6ayi:A	183	48	0.0725	0.0765	0.2917	1.3	6ayi:B, 6ayi:C, 6ayi:D
37	6w4x:C	375	66	0.1088	0.0560	0.3182	3.6	7ai8:A, 7ai9:A, 2alx:A, 1av8:A, 1av8:B, 2av8:A, 2av8:B, 7bet:A, 1biq:A, 1biq:B, 5ci0:A, 5ci1:A, 5ci2:A, 5ci3:A, 5ci4:A, 5cns:E, 5cns:F, 5cns:G, 5cns:H, 5cnt:E, 5cnt:F, 5cnt:G, 5cnt:H, 5cnu:E, 5cnu:F, 5cnu:G, 5cnu:H, 5cnv:E, 5cnv:F, 5cnv:G, 5cnv:H, 4erm:E, 4erm:F, 4erm:G, 4erm:H, 4erp:E, 4erp:F, 4erp:G, 4erp:H, 1jpr:A, 1jpr:B, 1jqc:A, 1jqc:B, 1mrr:A, 1mrr:B, 1mxr:A, 1mxr:B, 1pfr:A, 1pfr:B, 1pim:A, 1pim:B, 1piu:A, 1piu:B, 1piy:A, 1piy:B, 1piz:A, 1piz:B, 1pj0:A, 1pj0:B, 1pj1:A, 1pj1:B, 1pm2:A, 1pm2:B, 1r65:A, 1r65:B, 1rib:A, 1rib:B, 1rnr:A, 1rnr:B, 1rsr:A, 1rsr:B, 1rsv:A, 1rsv:B, 3uus:E, 3uus:F, 3uus:G, 3uus:H, 6w4x:D, 1xik:A, 1xik:B, 2xof:A, 2xof:B, 1yfd:A, 1yfd:B
38	3lsj:A	205	93	0.0984	0.0927	0.2043	3.7	3lsj:B, 3lsp:A, 3lsr:A
39	6wp9:E	218	41	0.0570	0.0505	0.2683	3.7	6wp9:A, 6wp9:B, 6wp9:C, 6wp9:D, 6wp9:F, 6wp9:G, 6wp9:H, 6wpa:A, 6wpa:B
40	5f8f:B	361	44	0.0777	0.0416	0.3409	5.4	5f8e:A, 5f8e:B, 5f8f:A, 5f8f:C
41	7mdi:E	353	66	0.1140	0.0623	0.3333	6.1	7mdi:G, 7mdi:F, 7mdi:H
42	4za6:A	188	178	0.2124	0.2181	0.2303	7.6
43	5fmp:A	184	35	0.0674	0.0707	0.3714	9.6	5aqc:A, 5aqc:B, 5cw8:A, 5cw8:B, 5cxi:A, 5cxi:B, 5fmp:B, 5ua1:B, 5ua1:A, 5ua2:A

[Back]