Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
DDPAARFQVQKHSWDGLRSIIHGSRKPHDFQFVQKTDESGPHSHRLYYLGLLYSEIPKKVRKEALLLLSWKQMLITSYDF
HSESGLFLFQASNSLFHCRDGGKNGFMVSPMKPLEIKTQCSGPRMDPKICPADPAFFSFINNSDLWVANIETGEERRLTF
CHQGLSNVLDDPKSAGVATFVIQEEFDRFTGYWWCPTASWEGSEGLKTLRILYEEVDESEVEVIHVPSPALEERKTDSYR
YPRTGSKNPKIALKLAEFQTDSQGKIVSTQEKELVQPFSSLFPKVEYIARAGWTRDGKYAWAMFLDRPQQWLQLVLLPPA
LFIPSTENEEQRLASARAVPRNVQPYVVYEEVTNVWINVHDIFYPFPQSEGEDELCFLRANECKTGFCHLYKVTAVLKSQ
GYDWSEPFSPGEDEFKCPIKEEIALTSGEWEVLARHGSKIWVNEETKLVYFQGTKDTPLEHHLYVVSYEAAGEIVRLTTP
GFSHSCSMSQNFDMFVSHYSSVSTPPCVHVYKLSGPDDDPLHKQPRFWASMMEAASCPPDYVPPEIFHFHTRSDVRLYGM
IYKPHALQPGKKHPTVLFVYGGPQVQLVNNSFKGIKYLRLNTLASLGYAVVVIDGRGSCQRGLRFEGALKNQMGQVEIED
QVEGLQFVAEKYGFIDLSRVAIHGWSYGGFLSLMGLIHKPQVFKVAIAGAPVTVWMAYDTGYTERYMDVPENNQHGYEAG
SVALHVEKLPNEPNRLLILHGFLDENVHFFHTNFLVSQLIRAGKPYQLQIYPNERHSIRCPESGEHYEVTLLHFLQEYL

The query sequence (length=799) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7jn7:A 846 846 1.0000 0.9444 0.9444 0.0 6eor:A, 6eor:C, 6eor:D, 7jn7:D, 6qzv:A, 6qzv:C, 6qzv:D, 7svl:A, 7svl:B, 7svl:C, 7svl:D, 7svn:A, 7svn:B, 7svn:C, 7svn:D, 6x6c:A, 6x6c:D, 7zxs:A, 7zxs:B, 7zxs:C, 7zxs:D
2 6eor:B 805 834 0.9612 0.9540 0.9209 0.0 6qzv:B
3 7svm:A 852 840 0.6108 0.5728 0.5810 0.0 7a3g:B, 7a3g:A, 7a3i:B, 7a3i:C, 7a3j:C, 7a3j:A, 7a3j:B, 7a3k:C, 7a3k:A, 7a3k:B, 7a3l:A, 7a3l:B, 7a3l:C, 7ayq:B, 7ayr:A, 7ayr:B, 6eop:A, 6eop:B, 6eop:C, 6eot:A, 6eot:B, 6eot:D, 6eot:G, 6eot:I, 6eot:K, 6hp8:A, 6hp8:B, 6hp8:C, 7or4:B, 7or4:A, 7oz7:A, 7oz7:B, 6qzw:A, 6qzw:B, 6qzw:C, 7svm:B, 7svm:C, 7svo:A, 7svo:B, 7svo:C, 6trw:A, 6trw:B, 6trw:C, 6trx:B, 6trx:C, 6trx:A
4 7ayq:A 808 813 0.5982 0.5916 0.5879 0.0 7a3i:A
5 5yp2:A 724 685 0.2541 0.2804 0.2964 4.82e-83 5yp2:B, 5yp3:A, 5yp3:B, 5yp3:C, 5yp3:D, 5yp4:A, 5yp4:B, 5yp4:C, 5yp4:D
6 7y4g:A 715 684 0.2278 0.2545 0.2661 1.74e-52 8hay:A, 8hay:B, 8hay:C, 7y4g:B, 7y4g:C
7 2dcm:A 662 662 0.1952 0.2356 0.2356 7.40e-48 2eep:A, 2z3z:A
8 2aj8:A 728 673 0.2115 0.2321 0.2511 7.81e-43 2aj8:B, 2aj8:C, 2aj8:D, 2ajb:A, 2ajb:B, 2ajb:C, 2ajb:D, 2ajc:A, 2ajc:B, 2ajc:C, 2ajc:D, 2ajd:A, 2ajd:B, 2ajd:C, 2ajd:D, 2bua:A, 2bua:B, 2bua:C, 2bua:D, 2buc:A, 2buc:B, 2buc:C, 2buc:D, 5lls:A, 5lls:B, 5lls:D, 5lls:C, 1orw:A, 1orw:B, 1orw:C, 1orw:D, 7xnm:B, 7xnm:A
9 4n8e:B 734 678 0.2115 0.2302 0.2493 6.27e-39 4a5s:A, 4a5s:B, 2ajl:I, 2ajl:J, 6b1e:A, 6b1e:B, 6b1o:A, 6b1o:B, 2bgn:A, 2bgn:B, 2bgn:C, 2bgn:D, 2bgr:A, 2bgr:B, 3bjm:A, 3bjm:B, 2bub:A, 2bub:B, 3c43:A, 3c43:B, 3c45:A, 3c45:B, 3ccb:A, 3ccb:B, 3ccb:C, 3ccb:D, 3ccc:A, 3ccc:B, 3ccc:C, 3ccc:D, 3d4l:A, 3d4l:B, 4dsa:A, 4dsz:A, 4dsz:B, 4dtc:A, 4dtc:B, 3eio:A, 3eio:B, 3f8s:A, 3f8s:B, 2fjp:A, 2fjp:B, 3g0b:A, 3g0b:B, 3g0b:C, 3g0b:D, 3g0c:A, 3g0c:B, 3g0c:C, 3g0c:D, 3g0d:A, 3g0d:B, 3g0d:C, 3g0d:D, 3g0g:A, 3g0g:B, 3g0g:C, 3g0g:D, 4g1f:A, 4g1f:B, 4g1f:C, 4g1f:D, 2g5p:A, 2g5t:A, 2g63:B, 3h0c:A, 3h0c:B, 3hab:A, 3hab:B, 3hac:A, 3hac:B, 2hha:A, 2hha:B, 2i03:B, 2i78:B, 5i7u:A, 5i7u:B, 2iit:A, 2iit:B, 2iiv:A, 2iiv:B, 5ism:A, 5ism:B, 4j3j:A, 4j3j:B, 5j3j:A, 5j3j:B, 4jh0:A, 4jh0:B, 2jid:A, 2jid:B, 5kby:A, 5kby:B, 5kby:C, 5kby:D, 3kwf:A, 3kwf:B, 3kwj:A, 3kwj:B, 4lko:A, 4lko:B, 1n1m:A, 1n1m:B, 4n8d:A, 4n8d:B, 4n8e:A, 3nox:A, 3nox:B, 1nu8:B, 3o95:A, 3o95:B, 3o95:C, 3o95:D, 3o9v:A, 3o9v:B, 3o9v:C, 3o9v:D, 2oag:B, 3oc0:A, 3oc0:B, 2ogz:A, 2ogz:B, 2ole:A, 2ole:B, 2onc:A, 2onc:B, 2onc:C, 2onc:D, 2oph:A, 2oph:B, 3opm:A, 3opm:B, 3opm:C, 3opm:D, 2oqi:B, 2oqv:A, 2p8s:A, 2p8s:B, 4pnz:A, 4pnz:B, 4pv7:A, 4pv7:B, 3q0t:A, 3q0t:B, 3q8w:A, 3q8w:B, 3qbj:A, 3qbj:B, 2qjr:A, 2qjr:B, 2qky:A, 2qky:B, 2qky:C, 2qky:D, 2qoe:A, 2qoe:B, 2qt9:A, 2qt9:B, 2qtb:A, 2qtb:B, 1r9n:A, 1r9n:B, 1r9n:C, 1r9n:D, 2rgu:A, 2rgu:B, 2rip:A, 1rwq:A, 1rwq:B, 3sww:A, 3sww:B, 3sx4:A, 3sx4:B, 5t4b:A, 5t4b:B, 5t4e:A, 5t4e:B, 5t4f:A, 5t4f:B, 5t4h:A, 5t4h:B, 1tkr:A, 1tkr:B, 3vjk:A, 3vjk:B, 3vjl:A, 3vjl:B, 3vjm:A, 3vjm:B, 3w2t:A, 3w2t:B, 1wcy:A, 1wcy:B, 3wqh:A, 3wqh:B, 1x70:A, 1x70:B, 5y7h:A, 5y7h:B, 5y7j:A, 5y7j:B, 5y7j:C, 5y7j:D, 5y7k:A, 5y7k:B, 5y7k:C, 5y7k:D, 5zid:A, 5zid:B
10 4q1v:A 707 639 0.1927 0.2178 0.2410 5.07e-38 4q1v:B
11 2gbf:A 730 264 0.1239 0.1356 0.3750 1.64e-37 4ffw:A, 4ffw:B, 2gbg:A, 2gbi:A, 2i3z:A, 2oae:A, 5vta:A, 5vta:B, 5vta:C, 5vta:D
12 6y0f:C 722 638 0.1927 0.2133 0.2414 1.08e-32 6y0f:A, 6y0f:B, 6y0f:D
13 8wt1:C 651 246 0.0889 0.1091 0.2886 3.95e-17 8wt1:A, 8wt1:B, 8wt1:D, 8wt1:E, 8wt1:F, 8wt1:G, 8wt1:H
14 7qun:A 694 357 0.1076 0.1239 0.2409 5.92e-12 7qun:B, 7qun:C, 7qun:D
15 4re6:A 577 228 0.0751 0.1040 0.2632 9.73e-10 2hu5:A, 2hu5:B, 2hu7:A, 2hu7:B, 2hu8:A, 2hu8:B, 4re5:A, 4re5:B, 4re6:C, 1ve7:A, 1ve7:B
16 4hxg:F 614 248 0.0826 0.1075 0.2661 2.64e-09 4hxe:B, 4hxf:B, 4hxg:A, 4hxg:B, 4hxg:C, 4hxg:D, 4hxg:E, 4hxg:G, 4hxg:H, 4hxg:I, 4hxg:L
17 3muo:A 684 182 0.0588 0.0687 0.2582 2.17e-06 3iuq:A, 3iur:A, 3ivm:A
18 6ikg:A 644 216 0.0601 0.0745 0.2222 1.05e-04 6ikg:B
19 4amy:A 710 174 0.0513 0.0577 0.2356 0.001 4amz:A, 4an0:A, 4an1:A, 4bcb:A, 4bcc:A, 4bcd:A, 3ddu:A, 1e8m:A, 1e8n:A, 3eq7:A, 3eq8:A, 3eq9:A, 1h2y:A, 1h2z:A, 1o6f:A, 1o6g:A, 1qfm:A, 1qfs:A, 1uoo:A, 1uop:A, 1uoq:A, 2xdw:A
20 7vgb:A 681 203 0.0601 0.0705 0.2365 0.002 7vgb:B, 7vgc:A
21 6gud:A 282 48 0.0238 0.0674 0.3958 0.002 6gur:A, 6gur:B
22 6jci:A 704 144 0.0451 0.0511 0.2500 0.007
23 2bkl:B 677 288 0.0688 0.0812 0.1910 0.008 2bkl:A
24 3azq:A 661 130 0.0426 0.0514 0.2615 0.022 3azq:B
25 5uw3:D 698 120 0.0388 0.0444 0.2583 0.046 5uw5:D, 5uw6:D, 5uw7:A, 5uw7:B, 5uzw:D
26 5o3w:B 717 126 0.0375 0.0418 0.2381 0.086 5o3u:A, 5o3u:B, 5o3u:C, 5o3u:D, 5o3v:B, 5o3v:A, 5o3w:A, 5o3w:C, 5o3w:D, 5uw3:A, 5uw3:B, 5uw3:C, 5uw5:A, 5uw5:B, 5uw5:C, 5uw6:A, 5uw6:B, 5uw6:C, 5uzw:A, 5uzw:B, 5uzw:C
27 6can:A 616 230 0.0701 0.0909 0.2435 0.33 6can:B, 5t88:A, 5t88:B
28 7zaz:AAA 727 204 0.0588 0.0646 0.2304 0.35 7zaz:BBB, 7zaz:DDD, 7zb0:A, 7zb0:B, 7zb0:C, 7zb0:D, 7zb1:A, 7zb1:B, 7zb1:C, 7zb1:D, 7zb2:CCC, 7zb2:FFF
29 7zaz:CCC 690 204 0.0588 0.0681 0.2304 0.35
30 2xe4:A 721 34 0.0200 0.0222 0.4706 1.0
31 1mpx:A 614 180 0.0538 0.0700 0.2389 1.2 1mpx:B, 1mpx:C, 1mpx:D
32 3fcy:A 317 155 0.0501 0.1262 0.2581 1.8 3fcy:C
33 7vhv:A 485 65 0.0225 0.0371 0.2769 2.7 7vhv:D, 7vhv:C, 7vhv:B
34 8y9c:B 1609 123 0.0375 0.0186 0.2439 2.8
35 3q6d:A 355 229 0.0651 0.1465 0.2271 5.6 3q6d:B, 3q6d:C, 3q6d:D
36 3e4d:A 278 77 0.0263 0.0755 0.2727 7.9 3e4d:B, 3e4d:C, 3e4d:E, 3e4d:D, 3e4d:F
37 2cww:B 382 105 0.0300 0.0628 0.2286 8.3 2cww:A
38 3qdq:A 447 71 0.0238 0.0425 0.2676 8.4
39 4xt2:A 116 26 0.0100 0.0690 0.3077 8.4
40 6oq5:A 2346 57 0.0263 0.0090 0.3684 8.8 6oq7:A, 7s0z:B, 7s0z:A
41 4fai:B 305 24 0.0138 0.0361 0.4583 9.0 4fai:A, 4fbe:A, 4fbe:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218