BioLiP

>protein
DDLLTRYRANPAMMKNLKLSDIRGALLKFAKDQVGSRFIQQELASSKDRFEKDSIFDEVVSNADELVDDIFGNYVVQKFF
EYGEERHWARLVDAIIDRVPEYAFQMYACRVLQKALEKINEPLQIKILSQIRHVIHRCMKDQNGNHVVQKAIEKVSPQYV
QFIVDTLLESSNTIYEMSVDPYGCRVVQRCLEHCSPSQTKPVIGQIHKRFDEIANNQYGNYVVQHVIEHGSEEDRMVIVT
RVSNNLFEFATHKYSSNVIEKCLEQGAVYHKSMIVGAACHHQEGSVPIVVQMMKDQYANYVVQKMFDQVTSEQRRELILT
VRPHIPVLRQFPHGKHILAKLEKY

The query sequence (length=344) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7cgm:A	349	344	0.9942	0.9799	0.9942	0.0	7cgf:A, 7cgg:A, 7cgh:A, 7cgi:A, 7cgj:A, 7cgk:A, 7cgl:A, 6nod:A, 6nod:B, 6nod:C
2	3q0q:A	343	344	0.4419	0.4431	0.4419	1.26e-104	3bsb:B, 3bsx:A, 3bsx:B, 1m8w:A, 1m8w:B, 1m8x:A, 1m8x:B, 1m8y:A, 1m8y:B, 3q0l:A, 3q0l:B, 3q0m:A, 3q0m:B, 3q0n:A, 3q0n:B, 3q0o:A, 3q0o:B, 3q0p:A, 3q0p:B, 3q0r:A, 3q0s:A, 2yjy:A, 2yjy:B
3	5kla:A	337	328	0.4128	0.4214	0.4329	3.77e-99	5kl1:A, 5kl8:A
4	5kla:A	337	251	0.1686	0.1721	0.2311	5.88e-15	5kl1:A, 5kl8:A
5	5yki:A	383	382	0.4012	0.3603	0.3613	4.57e-77
6	3k49:A	353	354	0.3895	0.3796	0.3785	1.78e-75	3k49:C, 3k49:E, 3k4e:A, 3k4e:C, 3k4e:E
7	3k49:A	353	169	0.1279	0.1246	0.2604	1.09e-12	3k49:C, 3k49:E, 3k4e:A, 3k4e:C, 3k4e:E
8	3bx2:A	328	329	0.2965	0.3110	0.3100	5.15e-41	3bx2:B, 3bx3:A, 3bx3:B, 4dzs:A, 4dzs:B
9	3bx2:A	328	215	0.1512	0.1585	0.2419	1.85e-15	3bx2:B, 3bx3:A, 3bx3:B, 4dzs:A, 4dzs:B
10	5bz1:A	371	356	0.2733	0.2534	0.2640	2.88e-36	5bym:A, 5bz5:A, 5bzu:A, 5bzv:A
11	8sj7:A	404	335	0.2733	0.2327	0.2806	1.35e-32	3k5q:A, 3k5y:A, 3k5z:A, 3k61:A, 3k62:A, 3k64:A, 6noc:A, 6nof:A, 6noh:A, 6pun:A, 6pun:C, 3qg9:A, 3qgb:A, 3qgc:A, 7rzz:A, 7s02:A, 3v6y:A, 3v74:A
12	3v71:A	364	312	0.2297	0.2170	0.2532	8.73e-19
13	3v71:A	364	247	0.1657	0.1566	0.2308	2.65e-07
14	6ny5:A	386	258	0.1657	0.1477	0.2209	1.31e-06	6ny5:B
15	6ny5:A	386	92	0.0610	0.0544	0.2283	1.7	6ny5:B
16	4wzw:A	505	113	0.0872	0.0594	0.2655	0.020
17	4wzw:A	505	41	0.0378	0.0257	0.3171	0.15
18	4wzw:A	505	252	0.1453	0.0990	0.1984	0.46
19	5d6s:A	370	87	0.0610	0.0568	0.2414	1.4	5d6s:B, 5d6s:C, 5d6s:D, 5d6s:E
20	2b30:A	284	141	0.0843	0.1021	0.2057	1.7	2b30:B, 2b30:C, 2b30:D
21	5g0f:A	110	41	0.0349	0.1091	0.2927	1.9
22	5wzk:A	513	157	0.1105	0.0741	0.2420	2.7
23	3b7w:A	537	45	0.0378	0.0242	0.2889	3.9	3c5e:A, 3day:A, 3eq6:A, 3eq6:B, 3gpc:A, 3gpc:B, 2vze:A, 2vze:B, 2vze:C, 2wd9:A, 2wd9:B, 2wd9:C
24	5wzg:A	534	127	0.0843	0.0543	0.2283	5.5	5wzh:A, 5wzi:A, 5wzj:A
25	3dls:A	285	87	0.0785	0.0947	0.3103	6.5	3dls:C, 3dls:B, 3dls:D, 3dls:E, 3dls:F
26	6ks6:z	538	59	0.0465	0.0297	0.2712	6.6	6ks6:Z, 4v81:F, 4v81:N, 4v81:f, 4v81:n, 4v8r:AZ, 4v8r:Az, 4v8r:BZ, 4v8r:Bz, 4v94:F, 4v94:N, 4v94:f, 4v94:n, 7ylw:Z, 7ylw:z, 7ylx:Z, 7ylx:z, 7yly:Z, 7yly:z
27	7x6s:A	1453	62	0.0465	0.0110	0.2581	9.1	5ltf:A, 5ltn:A, 5ltn:B, 5t2t:A
28	7x6v:A	1381	62	0.0465	0.0116	0.2581	9.7

[Back]