BioLiP

>protein
DAQIIIPNGNYDVTGAGFYSPLNLEIPVGTTVTWTNDDSVPHNIQSIDVNGKVIQLFNSPPLNTGDRFEHVFEEEGVYKY
YCSFHPWRVGLVTVS

The query sequence (length=95) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5fc9:A	95	95	1.0000	1.0000	1.0000	1.69e-67	5fc9:B, 5fc9:C, 5fc9:D
2	6hbe:C	427	92	0.3684	0.0820	0.3804	1.88e-10	6hbe:A, 6hbe:B
3	1aac:A	105	84	0.2842	0.2571	0.3214	1.79e-09	1aan:A, 1bxa:A, 2gb2:A, 2gba:A, 2gc4:C, 2gc4:G, 2gc4:K, 2gc4:O, 2idq:A, 2ids:A, 2idt:A, 2idu:A, 3ie9:A, 3iea:A, 2j55:A, 2j55:B, 2j56:A, 2j56:B, 2j57:A, 2j57:B, 2j57:C, 2j57:D, 3l45:A, 1mda:A, 1mda:B, 1mg2:C, 1mg2:G, 1mg2:K, 1mg2:O, 1mg3:C, 1mg3:G, 1mg3:K, 1mg3:O, 2mta:A, 2ov0:A, 4p5r:A, 4p5s:A, 3ply:A, 3ply:B, 3ply:C, 3ply:D, 2qdv:A, 2qdw:A, 2rac:A, 3rym:A, 3rym:C, 3rym:B, 3rym:D, 1sf3:A, 1sf5:A, 1sfd:A, 1sfd:B, 1sfh:A, 1sfh:B, 1t5k:A, 1t5k:B, 1t5k:C, 1t5k:D
4	1bxu:A	91	67	0.2526	0.2637	0.3582	4.50e-08	1bxv:A
5	1j5c:A	98	76	0.2421	0.2347	0.3026	7.90e-07	1j5d:A, 1jxd:A, 1jxf:A, 1pcs:A
6	6yez:P	99	85	0.2737	0.2626	0.3059	2.43e-05	6zoo:P
7	3c75:A	106	71	0.2316	0.2075	0.3099	2.80e-05	3c75:B, 1id2:A, 1id2:B, 1id2:C
8	1byo:A	99	89	0.2842	0.2727	0.3034	1.13e-04	1byo:B, 1byp:A
9	1pla:A	97	72	0.2526	0.2474	0.3333	2.44e-04	1plb:A
10	4dp0:X	99	91	0.2737	0.2626	0.2857	2.96e-04	4dp1:X, 4dp2:X, 4dp4:X, 4dp5:X, 4dp6:X
11	4r0o:A	106	92	0.3158	0.2830	0.3261	5.93e-04	1baw:A, 1baw:B, 1baw:C, 3bqv:A, 3cvb:A, 3cvb:B, 3cvc:A, 3cvd:A, 3cvd:B, 3cvd:C, 2q5b:A, 2q5b:B, 2q5b:C, 4r0o:B, 4r0o:C, 4r0o:D, 2w88:A, 2w88:B, 2w88:C, 2w8c:A, 2w8c:B
12	1ag6:A	99	89	0.2632	0.2525	0.2809	6.94e-04	1oow:A, 2pcf:A, 1tef:A, 1tef:B, 1teg:A, 1teg:B, 1ylb:B
13	9pcy:A	99	93	0.2421	0.2323	0.2473	0.001
14	1jxg:A	100	89	0.2947	0.2800	0.3146	0.002	4dp7:X, 4dp8:X, 4dp9:X, 4dpa:X, 4dpb:X, 4dpc:X, 1jxg:B, 3pcy:A, 4pcy:A, 5pcy:A, 6pcy:A, 1plc:A, 1pnc:A, 1pnd:A, 1tkw:A
15	2plt:A	98	81	0.2737	0.2653	0.3210	0.038	7zqe:M
16	1b3i:A	97	84	0.2421	0.2371	0.2738	0.12	2b3i:A, 2jxm:A
17	6zk8:A	410	38	0.1263	0.0293	0.3158	0.70	6frm:A, 6frm:B, 6frm:C, 6frm:D, 6frm:E, 6frm:H, 6frm:F, 6frm:G, 6frn:A, 6frn:B, 6frn:C, 6frn:D, 6zk8:O, 6zlf:A, 6zlf:F, 6zlf:G, 6zlf:H, 6zlf:I, 6zlf:J, 6zlf:K, 6zlf:L
18	1dth:A	202	30	0.1263	0.0594	0.4000	0.86	1atl:A, 1atl:B, 1dth:B, 1htd:A, 1htd:B
19	1g4u:S	360	44	0.1368	0.0361	0.2955	3.2
20	5xla:A	490	36	0.1158	0.0224	0.3056	6.1	3eyk:B, 5xl3:B, 5xl3:A, 5xl4:A, 5xl4:B, 5xl6:A, 5xl7:A, 5xl7:B, 5xl9:A, 5xla:B, 5xlc:A, 5xlc:B, 5xld:A, 5xld:B
21	5w3d:B	313	42	0.1684	0.0511	0.3810	7.5

[Back]