Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
DAALKKAKELASSAPVVVFSKTYCGYCNRVKQLLTQVGASYKVVELDELSDGSQLQSALAHWTGRGTVPNVFIGGKQIGG
CDTVVEKHQRNELLPLLQDAA

The query sequence (length=101) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2e7p:C 115 101 1.0000 0.8783 1.0000 2.29e-72 2e7p:A, 2e7p:B, 2e7p:D
2 5kqa:A 110 97 0.5941 0.5455 0.6186 1.21e-43
3 3uiw:A 110 91 0.4554 0.4182 0.5055 1.22e-26 3uiw:B
4 3fz9:A 106 94 0.4653 0.4434 0.5000 4.77e-26 3fza:A
5 2ht9:B 111 97 0.4158 0.3784 0.4330 1.16e-22 2fls:A, 2ht9:A
6 3rhc:A 103 93 0.3960 0.3883 0.4301 7.83e-21 3rhb:A, 3rhc:B
7 8a1r:A 593 93 0.3465 0.0590 0.3763 4.88e-17 8a1r:B, 7b02:A, 6fmu:A, 6fmz:A, 6fp4:A, 6ftc:A, 3h4k:A, 4la1:A, 4la1:B, 7npx:A, 7npx:B, 8pdd:A, 8pdd:B, 8pl0:A, 8pl0:B, 8pl1:A, 8pl1:B, 8pl2:A, 8pl2:B, 8pl3:A, 8pl3:B, 8pl4:A, 8pl4:B, 8pl5:A, 8pl5:B, 8pl6:A, 8pl7:A, 8pl7:B, 8pl8:A, 8pl9:A, 8pl9:B, 8pla:A, 8pla:B, 8plb:A, 8plb:B, 8plc:A, 8plc:B, 8pld:A, 8pld:B, 8ple:A, 8ple:B, 8plf:A, 8plf:B, 8plg:A, 8plh:A, 8pli:A, 8pli:B, 8plj:A, 8plj:B, 8plk:A, 8plk:B, 8pll:A, 8plm:A, 8pln:A, 8plo:A, 8plo:B, 8plp:A, 8plp:B, 8plq:A, 8plq:B, 8plr:A, 8plr:B, 8pls:A, 8pls:B, 8plt:A, 8plt:B, 8plu:A, 8plu:B, 8plv:A, 8plv:B, 8plw:A, 8plw:B, 8plx:A, 8plx:B, 8ply:A, 8ply:B, 6rtj:A, 6rtm:A, 6rto:A, 2v6o:A, 2x8c:A, 2x8c:B, 2x8g:A, 2x8h:A, 2x99:A, 6zlb:A, 6zlp:A, 6zp3:A, 6zst:A
8 5j3r:A 114 88 0.3267 0.2895 0.3750 8.32e-16 3l4n:A
9 5w1j:A 584 82 0.3069 0.0531 0.3780 2.75e-14 5w1j:B, 5w1l:A, 5w1l:B
10 3d5j:A 112 77 0.3465 0.3125 0.4545 4.40e-14 3d5j:B
11 4i2u:A 109 101 0.3861 0.3578 0.3861 4.98e-14
12 2jac:A 108 83 0.2970 0.2778 0.3614 5.49e-13 3c1s:A
13 4rqr:A 107 86 0.3267 0.3084 0.3837 6.51e-13 1b4q:A
14 4n11:A 108 100 0.2772 0.2593 0.2800 7.83e-11 7din:A, 7dio:A, 7dip:A, 7diq:A
15 4tr0:A 92 69 0.2376 0.2609 0.3478 2.51e-10 4tr0:B, 4tr1:A, 4tr1:B
16 3grx:A 82 85 0.2772 0.3415 0.3294 3.18e-10
17 2yan:B 105 99 0.2772 0.2667 0.2828 1.03e-09
18 2wci:A 113 103 0.2574 0.2301 0.2524 3.44e-09 2wci:B
19 2wul:A 109 103 0.3267 0.3028 0.3204 4.57e-09 2wul:B, 2wul:C, 2wul:D
20 3msz:B 87 70 0.1683 0.1954 0.2429 0.005 3msz:A
21 3ic4:A 92 69 0.1683 0.1848 0.2464 0.037
22 7pwe:A 194 60 0.1485 0.0773 0.2500 0.038 7pwe:B
23 8awz:A 241 86 0.1881 0.0788 0.2209 0.10 8awz:B, 8ax0:A, 8ax0:B, 8ax1:A, 8ax1:B, 8ax2:A, 8ax2:B, 6f4b:A, 6f4b:B, 6f4f:A, 6f4f:B, 6f4k:A, 6f4k:B, 6f51:A, 6f51:B, 6f66:A, 6f66:B, 6f67:A, 6f67:B, 6f68:A, 6f68:B, 6f69:A, 6f69:B, 6f6a:A, 6f6a:B, 6hpe:A, 6hpe:B
24 8ui7:B 319 60 0.1980 0.0627 0.3333 0.10 8ui8:B, 8ui9:B, 8uii:B, 8umt:B, 8umu:B, 8umv:B, 8umw:B, 8umy:B, 8un0:B, 8unj:B, 6vvo:B, 7z6h:F
25 6zb6:C 227 34 0.1485 0.0661 0.4412 0.14 7obo:AAA, 7odm:AAA, 6riv:B, 6riv:A, 6tk8:AAA, 6zb6:A, 6zb6:E, 6zb6:B, 6zb6:F, 6zb6:D
26 5z1x:A 495 53 0.1881 0.0384 0.3585 0.15 5z1x:B, 5z22:A
27 5cax:A 96 36 0.1089 0.1146 0.3056 0.16 5cax:B, 5cax:C, 5cax:D
28 7lui:A 180 58 0.1683 0.0944 0.2931 0.45
29 8qa8:B 202 36 0.1386 0.0693 0.3889 0.60 8qa8:A, 8qa8:C, 8qa8:D, 8qa8:E, 8qa8:F, 1r71:A, 1r71:B, 1r71:C, 1r71:D
30 6to3:AAA 190 34 0.1485 0.0789 0.4412 0.75
31 4jbg:A 333 23 0.0990 0.0300 0.4348 1.0 4jbg:B, 4jbg:C, 4jbg:D, 4jbh:A, 4jbh:B, 4jbh:C, 4jbh:D, 4jbi:A, 4jbi:B, 4jbi:C, 4jbi:D, 4jbi:E, 4jbi:F, 4jbi:G, 4jbi:H, 4jbi:I, 4jbi:J, 4jbi:K, 4jbi:L, 4jbi:M, 4jbi:N, 4jbi:O, 4jbi:P
32 6vv5:A 1097 34 0.1584 0.0146 0.4706 1.2 6vv5:B, 6vv5:C
33 7w6m:A 1224 34 0.1584 0.0131 0.4706 1.3 7w6m:C, 7w6m:B, 7w73:C, 7w73:A, 7y6t:B, 7y6u:A
34 4pom:A 107 40 0.1485 0.1402 0.3750 1.5 1cqg:A, 1cqh:A, 1mdi:A, 1mdj:A, 1mdk:A, 4pol:A, 4pol:B
35 3f3q:A 109 44 0.1287 0.1193 0.2955 1.9 3f3r:A, 3f3r:B
36 1grx:A 85 69 0.1881 0.2235 0.2754 3.4 1qfn:A
37 4ax3:D 457 51 0.1683 0.0372 0.3333 5.3 4ax3:A, 4ax3:B, 4ax3:C, 6f1q:A, 6fja:A, 5obo:A, 5ocb:A, 5ocf:A, 8qgf:A, 6qpt:A, 6qpt:B, 6qpt:C, 6qpt:D, 6qpt:E, 6qpt:F, 6qpu:A, 6qpu:B, 6qpu:C, 6qpu:D, 6qpu:E, 6qpu:F, 6qpv:A, 6qpv:I, 6qpx:A, 6qpx:I, 6qpz:A, 6qpz:I, 6qq0:A, 6qq1:A, 6qq2:A, 7qq2:A, 7r2u:A, 2yqb:A, 3zbm:A, 3ziy:A
38 7y6t:C 1098 34 0.1584 0.0146 0.4706 6.3
39 7y6t:A 1124 34 0.1584 0.0142 0.4706 6.5
40 6u7k:A 1064 34 0.1584 0.0150 0.4706 7.5
41 3x1b:A 500 27 0.0891 0.0180 0.3333 7.8 3x1b:B
42 4npb:A 215 48 0.1485 0.0698 0.3125 9.3

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218