Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
CRLTRLFIEFPIIQAPMAGVQGSALAIAVSEAGGLGSLPCAMLSLEALEAELTAIRSQTAKPINVNFFCHREPVQAKQAA
WLEQLAPYFAEFNLDPNRTPYSKAQAEVLAKFKPEVVSFHFGLPDEELLLEIKSWGSKVISTATTVEEALWLEARGADAI
IAQGLEAGGHRGHFLSEDLTEQLGTFSLLPQIIAAVEIPVIAAGGIVDATTVRAAMTMGASAVQVGTAYLLCPECNTSAI
HREALQSDAAQHTALTNLFSGRPARGIVNRFMAEMGPMNEAVPDFPLASSAVAGLRTAAERLGFWDFSPLWCGQNASGCR
AIPAADLTRSFV

The query sequence (length=332) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5lsm:A 339 335 0.9970 0.9764 0.9881 0.0 5lsm:B, 5lsm:C, 5lsm:D, 5lsm:E, 5lsm:F, 5lsm:G, 5lsm:H
2 4q4k:A 351 344 0.4759 0.4501 0.4593 2.84e-81 4q4k:B, 4qis:A, 4qis:B, 4qit:A, 4qit:B, 4qiu:A, 4qiu:B
3 3bw2:A 347 333 0.4096 0.3919 0.4084 2.73e-58 3bw3:A, 3bw4:A
4 6bka:A 374 328 0.3072 0.2727 0.3110 1.96e-43
5 7l00:C 315 335 0.3072 0.3238 0.3045 5.97e-35 7l00:A, 7l00:B, 7l00:D
6 5gvh:A 311 266 0.2590 0.2765 0.3233 1.73e-27
7 2z6i:B 321 322 0.2952 0.3053 0.3043 1.82e-25 2z6i:A, 2z6j:A, 2z6j:B
8 4iql:A 313 275 0.2651 0.2812 0.3200 2.06e-21 4iql:B
9 6e2a:A 326 238 0.2229 0.2270 0.3109 1.10e-15 2gjl:A, 2gjn:A
10 7e1q:A 366 114 0.1114 0.1011 0.3246 6.47e-11 7e1r:A, 7e1r:C, 7e1s:C, 7e1s:A
11 6gmb:A 362 157 0.1295 0.1188 0.2739 2.58e-04 6gmc:A, 2nzl:A, 5qib:A, 5qic:A, 5qid:A, 5qie:A, 5qif:A, 5qig:A, 5qih:A, 7r4n:A, 7r4o:A, 2rdu:A, 2rdw:A
12 7r4p:A 337 105 0.0994 0.0979 0.3143 0.001 7m2o:A, 2rdt:A, 2w0u:A, 2w0u:B, 2w0u:C, 2w0u:D, 6w44:A, 6w45:A, 6w4c:A
13 4jej:A 241 34 0.0512 0.0705 0.5000 0.002
14 1zfj:A 476 64 0.0723 0.0504 0.3750 0.006
15 1ep3:A 311 53 0.0633 0.0675 0.3962 0.007 1ep1:A, 1ep2:A, 5ksw:A, 5ksw:C, 5ue9:A, 5ue9:C
16 5dn1:A 240 60 0.0693 0.0958 0.3833 0.013
17 5dn1:A 240 40 0.0422 0.0583 0.3500 9.8
18 1eep:A 314 244 0.1687 0.1783 0.2295 0.052
19 4fo4:A 348 298 0.2108 0.2011 0.2349 0.065 4fo4:B, 4ix2:A, 4ix2:B, 4ix2:C, 4ix2:D, 4qne:A, 4qne:B, 4x3z:A, 4x3z:B
20 2y88:A 244 50 0.0512 0.0697 0.3400 0.071 2y85:A, 2y85:B, 2y85:C, 2y85:D, 3zs4:A
21 1f76:A 336 125 0.0994 0.0982 0.2640 0.13 1f76:B, 1f76:D, 1f76:E, 7t5k:A, 7t5k:B, 7t5y:A, 7t5y:B, 7t6c:A, 7t6c:B, 7t6h:A, 7t6h:B
22 1me7:A 365 75 0.0633 0.0575 0.2800 0.14 1lrt:D, 1me8:A, 1me9:A, 1meh:A, 1mei:A, 1mew:A, 1pvn:A, 1pvn:B, 1pvn:C, 1pvn:D
23 4n6f:A 242 40 0.0542 0.0744 0.4500 0.18 4n6f:B
24 3iiv:B 262 78 0.0663 0.0840 0.2821 0.30 7ac8:A, 7ac8:C, 7ac8:E, 6ct3:A, 5d2t:A, 5d2w:A, 6dc1:A, 6dc1:B, 6dc1:H, 6dc1:K, 6dkv:A, 6dnj:A, 1gpw:C, 1gpw:E, 6rtz:A, 6ru0:A, 6ru0:C, 6ru0:E, 2wjz:A, 2wjz:C
25 4utu:A 229 103 0.0783 0.1135 0.2524 0.30 4utu:B, 4utw:A, 4utw:B, 4utw:C, 4utw:D
26 3usb:B 401 235 0.1717 0.1421 0.2426 0.34
27 9c4m:A 335 58 0.0602 0.0597 0.3448 0.38 9c4m:B, 9c4m:C, 9c4m:D, 9c4m:E, 9c4m:F, 9c4m:G, 9c4m:H
28 4z38:B 439 260 0.1657 0.1253 0.2115 0.38 4z38:A
29 6b8s:B 336 114 0.0904 0.0893 0.2632 0.45 6b8s:A
30 4af0:A 395 313 0.2199 0.1848 0.2332 0.47 4af0:B
31 6uy4:A 354 90 0.0873 0.0819 0.3222 0.47
32 4qq3:A 302 242 0.1807 0.1987 0.2479 0.92
33 5ahn:A 297 60 0.0602 0.0673 0.3333 0.94
34 7oj1:B 425 69 0.0693 0.0541 0.3333 0.98
35 6dvh:A 394 42 0.0512 0.0431 0.4048 1.0 6dvh:B, 6dvh:C, 6dvh:D, 6dvh:E, 6dvh:F, 6dvi:A, 6dvi:B, 6dvi:C, 6dvi:E, 6dvi:F
36 6dvi:D 338 48 0.0542 0.0533 0.3750 1.2
37 7oj1:A 401 69 0.0693 0.0574 0.3333 1.3
38 5ahm:A 354 63 0.0663 0.0621 0.3492 1.3 5ahm:B
39 8dow:D 217 72 0.0602 0.0922 0.2778 1.3 8dow:H, 8dow:L, 8dp1:M, 8dp1:F, 8dp1:O
40 3b4p:B 158 26 0.0361 0.0759 0.4615 1.6 3b4p:A, 3cnm:A, 3cnm:B, 3dzl:A, 3dzl:B, 3jum:A, 3jum:B, 3jun:A, 3jun:B, 3juo:A, 3juo:B, 3jup:A, 3jup:B, 3juq:A, 3juq:B
41 3hws:D 316 47 0.0482 0.0506 0.3404 1.7 3hws:B, 3hws:E, 4i4l:A, 4i81:A, 4i81:B
42 1b3o:A 304 48 0.0512 0.0559 0.3542 1.8
43 4a2r:A 247 40 0.0361 0.0486 0.3000 1.8 5an7:A, 4pa8:A, 8xyn:A, 8xyn:B
44 7pji:A 445 95 0.0723 0.0539 0.2526 2.2 4dqw:A, 4dqw:B, 6gk9:A, 6gk9:D, 7pji:B
45 1b3o:B 410 48 0.0512 0.0415 0.3542 2.3
46 3sgz:A 336 97 0.0813 0.0804 0.2784 2.4 3sgz:B, 3sgz:C, 1tb3:A, 1tb3:B, 1tb3:C, 1tb3:D, 1tb3:E, 1tb3:F, 1tb3:G, 1tb3:H
47 4ke8:C 249 61 0.0753 0.1004 0.4098 2.4 4ke6:A, 4ke7:A, 4ke7:B, 4ke8:A, 4ke8:B, 4ke8:D, 4ke9:A, 4ke9:B, 4ke9:C, 4ke9:D
48 7oj2:A 353 37 0.0482 0.0453 0.4324 2.4
49 3kzh:A 316 67 0.0633 0.0665 0.3134 2.5 3kzh:B
50 6uc2:A 453 30 0.0392 0.0287 0.4333 3.5 6i0m:B, 6i0o:A, 6uc2:B, 6uc2:C, 6uc2:D, 6uc2:E, 6uc2:F, 6uc2:G, 6uc2:H
51 1nf7:A 454 30 0.0392 0.0286 0.4333 3.5 1jr1:A, 1nf7:B
52 8g8f:A 491 30 0.0392 0.0265 0.4333 3.6 8g8f:B, 8g8f:C, 8g8f:D, 8g8f:E, 8g8f:F, 8g8f:G, 8g8f:H, 8g9b:A, 8g9b:B, 8g9b:C, 8g9b:D, 8g9b:E, 8g9b:F, 8g9b:G, 8g9b:H, 6i0m:A, 6i0o:B, 6u8n:A, 6u8n:B, 6u8n:C, 6u8n:D, 6u8n:E, 6u8n:F, 6u8n:G, 6u8n:H, 6u8r:D, 6u8r:A, 6u8r:B, 6u8r:C, 6u8r:H, 6u8r:E, 6u8r:F, 6u8r:G, 6u9o:A, 6u9o:B, 6u9o:C, 6u9o:D, 6u9o:E, 6u9o:F, 6u9o:G, 6u9o:H, 6ua2:B, 6ua2:A, 6ua2:D, 6ua2:C, 6ua2:F, 6ua2:E, 6ua2:H, 6ua2:G, 6ua4:B, 6ua4:A, 6ua4:D, 6ua4:C, 6ua4:F, 6ua4:E, 6ua4:H, 6ua4:G, 6uaj:A, 6uaj:B, 6uaj:C, 6uaj:D, 6uaj:E, 6uaj:F, 6uaj:G, 6uaj:H, 6udo:A, 6udo:B, 6udo:C, 6udo:D, 6udo:E, 6udo:F, 6udo:G, 6udo:H, 6udq:A, 6udq:B, 6udq:C, 6udq:D, 6udq:E, 6udq:F, 6udq:G, 6udq:H
53 8p4q:E 390 262 0.1867 0.1590 0.2366 3.8 8p37:A, 8p4q:A, 8p4q:B, 8p4q:C, 8p4q:D, 8p4q:F, 8p4q:G, 8p4q:H
54 4fxs:A 467 143 0.1175 0.0835 0.2727 3.8
55 4fxs:A 467 57 0.0542 0.0385 0.3158 6.3
56 8fuz:A 390 30 0.0392 0.0333 0.4333 3.9 8foz:A, 8foz:B, 8foz:C, 8foz:D, 8foz:E, 8foz:F, 8foz:G, 8foz:H, 8fuz:B, 8fuz:C, 8fuz:D, 8fuz:E, 8fuz:F, 8fuz:G, 8fuz:H, 1jr1:B, 6u8e:A, 6u8e:B, 6u8e:C, 6u8e:D, 6u8e:E, 6u8e:F, 6u8e:G, 6u8e:H, 6u8s:A, 6u8s:B, 6u8s:C, 6u8s:D, 6u8s:E, 6u8s:F, 6u8s:G, 6u8s:H, 6ua5:A, 6ua5:B, 6ua5:C, 6ua5:D, 6ua5:E, 6ua5:F, 6ua5:G, 6ua5:H, 6udp:A, 6udp:B, 6udp:C, 6udp:D, 6udp:E, 6udp:F, 6udp:G, 6udp:H
57 6bfg:A 373 83 0.0783 0.0697 0.3133 4.0 2a7n:A, 2a7p:A, 2a85:A, 6bfg:B, 3giy:A, 1p4c:A, 1p5b:A
58 1nfb:A 396 30 0.0392 0.0328 0.4333 4.4 1nfb:B
59 6mgr:C 369 48 0.0542 0.0488 0.3750 4.6 6mgr:A, 6mgr:B, 6mgr:D, 4mz1:A, 4mz1:B, 4mz1:C, 4mz8:A, 4mz8:B, 4mz8:C, 4mz8:D, 4r7j:A, 5uqf:A, 5uqf:B, 5uqf:C, 5uqg:A, 5uqg:B, 5uqg:H, 5uqg:C, 5uqg:G, 5uqg:D, 5uqg:E, 5uqg:F, 5uqh:A, 5uqh:B, 5uqh:C, 5uqh:D, 5uqh:E, 5uqh:F, 5uqh:G, 5uqh:H, 5urq:A, 5urq:D, 5urq:B, 5urq:C, 5urq:E, 5urq:H, 5urq:F, 5urq:G
60 7qc8:A 250 52 0.0452 0.0600 0.2885 4.7 4ewn:D, 2wjz:E, 3zr4:E
61 1huv:A 349 83 0.0783 0.0745 0.3133 4.7
62 3tsb:A 490 63 0.0572 0.0388 0.3016 5.0 3tsd:A, 3usb:A
63 6ei9:A 306 34 0.0482 0.0523 0.4706 5.3 6ei9:B
64 8qqp:A 464 34 0.0392 0.0280 0.3824 5.3 8q65:A, 8q65:E, 8qqp:B, 8qqp:C, 8qqp:D, 8qqp:E, 8qqp:F, 8qqp:G, 8qqp:H, 8qqq:A, 8qqq:B, 8qqq:C, 8qqq:D, 8qqq:E, 8qqq:F, 8qqq:G, 8qqq:H, 8qqr:A, 8qqr:B, 8qqr:C, 8qqr:D, 8qqr:E, 8qqr:F, 8qqr:G, 8qqr:H, 8qqt:A, 8qqt:B, 8qqt:C, 8qqt:D, 8qqt:E, 8qqt:F, 8qqt:G, 8qqt:H
65 1lrt:A 338 74 0.0633 0.0621 0.2838 5.8 1lrt:B, 1lrt:C
66 4tx9:A 246 60 0.0693 0.0935 0.3833 5.8
67 8qqv:A 356 34 0.0392 0.0365 0.3824 7.1 8qqv:B, 8qqv:D, 8qqv:C, 8qqv:E, 8qqv:F, 8qqv:G, 8qqv:H, 8qqx:A, 8qqx:B, 8qqx:C, 8qqx:D, 8qqx:E, 8qqx:F, 8qqx:G, 8qqx:H
68 3khj:A 302 30 0.0392 0.0430 0.4333 7.1 3khj:E, 3khj:F, 3khj:G
69 4qj1:D 346 30 0.0392 0.0376 0.4333 7.1 4ixh:A, 4ixh:D, 4ixh:B, 4ixh:C, 3khj:B, 3khj:C, 3khj:D, 3khj:H, 4qj1:A, 4qj1:B, 4qj1:C, 4rv8:A, 4rv8:D, 4rv8:B, 4rv8:C
70 1kbi:A 504 51 0.0452 0.0298 0.2941 9.2 1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
71 1ldc:B 382 51 0.0452 0.0393 0.2941 9.3
72 4nic:A 117 40 0.0361 0.1026 0.3000 9.8 4nic:B, 4nic:C, 4nic:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218