BioLiP

>protein
CRLPPLPTIREIIKLLRLQAAKQLSQNFLLDLRLTDKIVRKAGNLTNAYVYEVGPGPGGITRSILNADVAELLVVEKDTR
FIPGLQMLSDAAPGKLRIVHGDVLTFKVEKAFSESLKRPWEDDPPNVHIIGNLPFSVSTPLIIKWLENISCRDGPFVYGR
TQMTLTFQKEVAERLAANTGSKQRSRLSVMAQYLCNVRHIFTIPGQAFVPKPEVDVGVVHFTPLIQPKIEQPFKLVEKVV
QNVFQFRRKYCHRGLRMLFPEAQRLESTGRLLELADIDPTLRPRQLSISHFKSLCDVYRKMCDEDPQLFAYNFREELKR

The query sequence (length=319) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8csp:5	319	319	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	6aax:A, 6aax:C, 6ajk:A, 8csq:5, 8csr:5, 8csu:5
2	4gc9:A	318	317	0.8715	0.8742	0.8770	0.0	7pnt:c
3	6ift:A	292	291	0.2727	0.2979	0.2990	2.78e-31	7v2l:W, 7v2m:U, 7v2m:W, 7v2n:U, 7v2o:U, 7v2p:U, 7v2q:U, 7v2q:W
4	8eyt:W	254	274	0.2571	0.3228	0.2993	6.10e-29	4adv:V, 7afo:Y, 7o5h:V
5	3fux:C	265	289	0.2759	0.3321	0.3045	2.97e-25	3fuu:A, 3fuw:A, 3fux:A, 3fux:B
6	8x3w:A	270	233	0.2132	0.2519	0.2918	1.75e-19	8x3w:B, 8x41:A, 8x41:B, 8x44:A, 8x44:B, 8x45:A, 8x45:B, 8x46:A, 8x46:B, 8x47:A, 8x4i:A, 8x4l:A, 8x4l:B, 8x4o:A, 8x4o:B, 8x4p:A, 8x4p:B
7	3grr:A	263	231	0.1881	0.2281	0.2597	3.76e-15	3gru:A, 3grv:A, 3gry:A
8	7mqa:NL	278	200	0.1881	0.2158	0.3000	7.19e-15	7wts:3, 1zq9:A, 1zq9:B
9	3ftf:A	246	289	0.2508	0.3252	0.2768	7.57e-13	3fte:A, 3r9x:B
10	7aju:JL	283	198	0.1944	0.2191	0.3131	6.46e-11	8cbj:y, 6rbd:y, 7wtl:JL, 7wtm:JL, 6zqd:JL, 6zqe:JL, 6zqf:JL, 6zqg:JL
11	7f8b:A	245	280	0.2382	0.3102	0.2714	7.67e-09	7f8c:A
12	6erp:F	288	187	0.1505	0.1667	0.2567	1.44e-08	6erp:J, 6erq:F, 6erq:J
13	1qan:A	236	284	0.2006	0.2712	0.2254	2.85e-04	1qao:A, 1qaq:A
14	8att:B	340	71	0.0596	0.0559	0.2676	0.011	8ap1:B, 8atv:B, 8atw:B, 8c5s:B, 8c5u:B, 8q63:B, 6ymv:B, 6ymw:B
15	5vgm:B	342	142	0.1191	0.1111	0.2676	0.083	5vgm:A
16	6sbq:A	891	102	0.0752	0.0269	0.2353	0.62	6ea1:A, 6ea2:A, 6eaa:A, 6eab:A, 3ebg:A, 3ebh:A, 3ebi:A, 6ee3:A, 6ee4:A, 6ee6:A, 6eed:A, 8ewz:A, 8ex3:A, 8eyd:A, 8eye:A, 8eyf:A, 8ez2:A, 4j3b:A, 4k5l:A, 4k5m:A, 4k5n:A, 4k5o:A, 4k5p:A, 3q43:A, 3q44:A, 4r5t:A, 4r5v:A, 4r5x:A, 6sbr:A, 8slo:A, 8svl:A, 8t6h:A, 8t7p:A, 3t8v:A, 8t83:A, 4x2u:A, 5xm7:A, 5y19:A, 5y1h:A, 5y1k:A, 5y1q:A, 5y1r:A, 5y1s:A, 5y1t:A, 5y1v:A, 5y1w:A, 5y1x:A, 5y3i:A, 4zqt:A, 4zw3:A, 4zw5:A, 4zw6:A, 4zw7:A, 4zw8:A, 4zx3:A, 4zx4:A, 4zx5:A, 4zx6:A
17	5lmx:B	1115	37	0.0376	0.0108	0.3243	0.98
18	6gie:A	218	56	0.0533	0.0780	0.3036	2.0
19	6k2l:A	248	35	0.0376	0.0484	0.3429	3.1	6k2l:B
20	7r0w:K	279	112	0.1003	0.1147	0.2857	7.0	7r0w:C, 7zxy:C, 7zxy:K
21	5m5w:B	1183	42	0.0439	0.0118	0.3333	7.1	4c2m:B, 4c2m:Q, 4c3h:B, 4c3i:B, 4c3j:B, 5g5l:B, 6h67:B, 6h68:B, 6hko:B, 6hlq:B, 6hlr:B, 5m3f:B, 5m3m:B, 5m5x:B, 5m5y:B, 5m64:B, 5n5y:B, 5n5z:B, 5n60:B, 5n61:B, 5oa1:B, 6rqh:B, 6rql:B, 6rqt:B, 6rrd:B, 6rui:B, 6ruo:B, 6rwe:B, 6tps:B, 5w5y:B, 5w64:B, 5w65:B, 5w66:B, 4ym7:AB, 4ym7:BB, 4ym7:CB, 4ym7:DB, 4ym7:EB, 4ym7:FB
22	7arh:E	409	27	0.0408	0.0318	0.4815	7.4	7arl:E, 7mdx:B, 7v8l:E
23	6l7v:A	180	33	0.0439	0.0778	0.4242	7.9	6l7w:B
24	8jff:A	274	88	0.0690	0.0803	0.2500	8.1	8jff:B, 8jfv:A, 8jfv:B

[Back]