Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
CPLMVKVLDAVRGSPAINVAVHVFRKAADDTWEPFASGKTSESGELHGLTTEEEFVEGIYKVEIDTKSYWKALGISPFHE
HAEVVFTANDSGPRRYTIAALLSPYSYSTTAVVT

The query sequence (length=114) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1eta:1 127 114 0.9912 0.8898 0.9912 2.31e-81 5a6i:A, 4abq:A, 4abq:B, 4abu:A, 4abu:B, 4abv:A, 4abv:B, 4abw:A, 4abw:B, 4ac2:A, 4ac2:B, 4ac4:A, 4ac4:B, 4act:A, 4act:B, 7acu:A, 7acu:B, 5aks:A, 5aks:B, 5akt:B, 5akt:A, 5akv:A, 5akv:B, 5al0:A, 5al0:B, 5al8:A, 5al8:B, 8aww:A, 8aww:B, 5ayt:A, 5ayt:B, 2b14:A, 2b14:B, 2b15:A, 2b15:B, 2b16:A, 2b16:B, 3b56:A, 3b56:B, 2b77:B, 2b9a:A, 2b9a:B, 1bm7:A, 1bm7:B, 5boj:A, 5boj:B, 8c85:B, 8c85:A, 8c86:B, 8c86:A, 3cfn:A, 3cfn:B, 3cfq:A, 3cfq:B, 3cft:A, 3cft:B, 3cn0:A, 3cn0:B, 3cn1:A, 3cn1:B, 3cn2:A, 3cn2:B, 3cn3:A, 3cn4:A, 3cn4:B, 5cr1:A, 5cr1:B, 6d0w:A, 6d0w:B, 3d2t:A, 3d2t:B, 4d7b:B, 4d7b:A, 4der:A, 4der:B, 4des:A, 4des:B, 4det:B, 4deu:A, 4deu:B, 4dew:A, 4dew:B, 5dej:A, 3dgd:A, 3dgd:B, 3dgd:C, 3dgd:D, 3did:A, 3did:B, 3did:C, 3did:D, 7dt3:A, 7dt3:B, 7dt5:A, 7dt5:B, 7dt6:B, 7dt8:A, 7dt8:B, 1dvs:A, 1dvt:A, 1dvu:A, 1dvx:A, 1dvy:A, 1dvz:A, 8dw5:A, 5e23:A, 1e4h:B, 1e4h:A, 5e4a:A, 5e4o:A, 5e4o:B, 1e5a:A, 1e5a:B, 6e6z:A, 6e6z:B, 6e70:A, 6e70:B, 6e72:A, 6e72:B, 6e73:A, 6e73:B, 6e74:A, 6e74:B, 6e77:A, 6e77:B, 6e78:A, 6e78:B, 7ejq:A, 7ejq:B, 7ejr:A, 7ejr:B, 5en3:A, 5en3:B, 6eoy:A, 6eoy:B, 6ep1:A, 6ep1:B, 7erh:A, 7erh:B, 7eri:A, 7eri:B, 7erj:A, 7erj:B, 7erk:A, 7erk:B, 3esn:A, 3esn:B, 3eso:A, 3eso:B, 3esp:A, 3esp:B, 1eta:2, 1etb:1, 1etb:2, 5ezp:A, 5ezp:D, 5ezp:C, 5ezp:H, 5ezp:G, 2f7i:A, 2f7i:B, 1f86:A, 1f86:B, 2f8i:A, 2f8i:B, 2fbr:A, 2fbr:B, 3fc8:A, 3fc8:B, 3fcb:A, 3fcb:B, 6fft:A, 6fft:B, 4fi6:A, 4fi6:B, 4fi7:A, 4fi7:B, 4fi8:A, 4fi8:B, 2flm:A, 2flm:B, 2g5u:A, 2g5u:B, 2g9k:A, 2g9k:B, 2gab:A, 2gab:B, 3glz:A, 3gps:A, 3gps:B, 3gps:C, 3gps:D, 3grb:A, 3grb:B, 3grb:D, 3grb:C, 3grg:A, 3grg:B, 3grg:D, 3grg:C, 6gr7:A, 6gr7:B, 6grp:A, 6grp:B, 3gs0:A, 3gs0:B, 3gs4:A, 3gs7:A, 3gs7:B, 8hej:A, 8hej:B, 4hiq:A, 4hiq:B, 4his:A, 3hj0:A, 3hj0:B, 4hjs:A, 4hjs:B, 4hjt:A, 4hjt:B, 4hju:A, 4hju:B, 5hjg:A, 5hjg:B, 4i85:A, 4i85:B, 4i87:A, 4i87:B, 4i89:A, 4i89:B, 1ict:A, 1ict:C, 1ict:B, 1ict:D, 8ig1:A, 8ig1:B, 5ihh:A, 5ihh:B, 1iii:A, 1iii:B, 1iik:A, 1iik:B, 4iiz:A, 4iiz:B, 8ii1:A, 8ii1:B, 8ii2:A, 8ii2:B, 8ii3:A, 8ii3:B, 8ii4:A, 8ii4:B, 4ik6:A, 4ik6:B, 4ik7:A, 4ik7:B, 4iki:A, 4iki:B, 4ikj:A, 4ikj:B, 4ikk:A, 4ikk:B, 4ikl:A, 4ikl:B, 3imr:A, 3imr:B, 3ims:A, 3ims:B, 3imt:A, 3imt:B, 3imu:A, 3imu:B, 3imv:A, 3imv:B, 3imw:A, 3imw:B, 6imx:A, 6imx:B, 6imy:A, 6imy:B, 3ipb:A, 3ipb:B, 3ipe:A, 3ipe:B, 5jid:A, 5jid:B, 5jim:A, 5jim:B, 5jiq:A, 5jiq:B, 5k1n:A, 5k1n:B, 3kgt:A, 3kgt:B, 3kgu:A, 3kgu:B, 6kgb:A, 4ky2:A, 4ky2:B, 4l1s:A, 4l1s:B, 4l1t:A, 4l1t:B, 5l4f:B, 5l4i:A, 5l4i:B, 5l4j:A, 5l4m:A, 5l4m:B, 3m1o:A, 3m1o:B, 4mas:A, 4mas:B, 4mrb:A, 4mrc:A, 4mrc:B, 5n62:A, 5n62:B, 5n7c:A, 5n7c:B, 4n85:A, 4n85:B, 4n86:A, 4n86:B, 4n87:A, 4n87:B, 3neo:A, 3neo:B, 3nes:A, 3nes:B, 3nex:A, 3nex:B, 3ng5:A, 3ng5:B, 3ozk:A, 3ozk:B, 3ozl:A, 3ozl:B, 3p3r:A, 3p3r:B, 3p3s:A, 3p3s:B, 3p3t:A, 3p3t:B, 3p3u:A, 3p3u:B, 4pm1:A, 4pm1:B, 4pme:A, 4pme:B, 4pmf:A, 4pmf:B, 8pm8:A, 8pm8:B, 8pm9:A, 8pm9:B, 8pma:A, 8pma:B, 8pmo:A, 8pmo:B, 4pwf:A, 4pwf:B, 4pwg:A, 4pwg:B, 4pwh:A, 4pwh:B, 4pwi:A, 4pwi:B, 4pwj:A, 4pwj:B, 4pwk:A, 4pwk:B, 7q9l:A, 7q9l:B, 7q9n:A, 7q9n:B, 7q9o:A, 7q9o:B, 7qc5:A, 7qc5:B, 2qgc:A, 2qgc:B, 2qgd:A, 2qgd:B, 2qge:B, 4qrf:A, 4qrf:B, 4qxv:A, 4qxv:B, 4qya:A, 4qya:B, 6r66:A, 6r66:B, 6r67:A, 6r68:A, 6r68:B, 6r6i:A, 6r6i:B, 2rox:A, 2rox:B, 2roy:A, 2roy:B, 3ssg:A, 6sug:A, 6sug:B, 6suh:A, 6suh:B, 3tct:A, 3tct:B, 1tha:A, 1tha:B, 1thc:A, 1thc:B, 6ti9:A, 6ti9:B, 1tlm:A, 1tlm:B, 4tlt:A, 4tq8:A, 4tq8:B, 4tqh:A, 4tqh:B, 4tqi:A, 4tqi:B, 4tqp:A, 4tqp:B, 1tt6:A, 1tt6:B, 6txv:A, 6txv:B, 6txw:A, 6txw:B, 1tyr:A, 1tyr:B, 1tz8:A, 1tz8:B, 1tz8:C, 1tz8:D, 5tzl:A, 5tzl:B, 6u0q:A, 6u0q:B, 1u21:A, 1u21:B, 5u48:A, 5u48:B, 5u4a:A, 5u4a:B, 5u4b:A, 5u4b:B, 5u4c:A, 5u4c:B, 5u4d:A, 5u4d:B, 5u4e:A, 5u4e:B, 5u4f:A, 5u4f:B, 5u4g:A, 5u4g:B, 8ve0:B, 8ve0:D, 8ve0:A, 8ve0:C, 8ve1:B, 8ve1:D, 8ve1:A, 8ve1:C, 8ve5:B, 8ve5:D, 8ve6:B, 8ve6:D, 8w42:A, 8w42:B, 8w43:A, 8w43:B, 8w44:A, 8w44:B, 8w45:A, 8w45:B, 8w46:A, 8w46:B, 8w47:A, 8w47:B, 8w48:A, 8w48:B, 7w9q:A, 7w9q:B, 7w9r:A, 7w9r:B, 8wgs:A, 8wgs:B, 8wgt:A, 8wgt:B, 8wgu:A, 8wgu:B, 4wnj:B, 4wns:B, 4wo0:A, 4wo0:B, 6xtk:A, 6xtk:B, 1y1d:A, 4y9b:A, 4y9b:B, 4y9c:A, 4y9c:B, 4y9e:A, 4y9e:B, 4y9f:A, 4y9f:B, 4y9g:A, 4y9g:B, 7ybr:A, 7ybr:B, 7ycq:A, 7ycq:B, 4ydm:A, 4ydm:B, 4ydn:A, 4ydn:B, 7z60:B, 1z7j:A, 1z7j:B, 1zcr:B
2 1kgj:A 123 114 0.8421 0.7805 0.8421 7.33e-70 1ie4:A, 1ie4:C, 1ie4:B, 1ie4:D, 1kgi:A, 1kgi:C, 1kgi:B, 1kgi:D, 1kgj:B, 1kgj:D, 1kgj:C
3 7rlk:D 117 114 0.7193 0.7009 0.7193 1.39e-59 7rlk:A, 7rlk:C, 7rlk:E, 7rlk:F
4 7kjj:A 115 114 0.6667 0.6609 0.6667 5.89e-55 7kjj:B
5 1sn0:A 118 114 0.5789 0.5593 0.5789 1.64e-44 6gnm:D, 6gnm:C, 6gno:A, 6gno:B, 6gnr:A, 6gnr:B, 6gnw:A, 6gnw:C, 6gnw:B, 6gnw:D, 6gon:A, 6gon:C, 6gon:B, 6gon:D, 6goo:A, 6goo:B, 1sn0:B, 1sn0:D, 1sn0:C, 1sn5:C, 1sn5:B, 1sn5:D
6 3q1e:D 116 110 0.3596 0.3534 0.3727 2.32e-21 3q1e:A, 3q1e:C, 3q1e:B
7 2g2n:C 112 107 0.3070 0.3125 0.3271 3.10e-10 2g2n:A, 2g2n:B, 2g2n:D, 2g2p:A, 2g2p:B, 2g2p:C, 2g2p:D
8 5cm2:M 124 80 0.2018 0.1855 0.2875 0.095
9 7b7z:A 340 72 0.1842 0.0618 0.2917 0.59 7b80:A, 6i7g:A, 6i7g:B, 6i7i:A, 6i7k:A, 6i7l:A, 4u07:A, 4u07:B, 4u0s:A, 4u0s:B, 4u0u:A, 4u0u:B, 4u0z:A, 4u0z:B, 4u0z:C, 4u0z:D, 4u0z:E, 4u0z:F, 4u0z:G, 4u0z:H, 6zmd:B
10 5z3g:X 202 26 0.1140 0.0644 0.5000 2.5
11 8hib:V 216 42 0.1140 0.0602 0.3095 4.8
12 4em6:B 546 87 0.2105 0.0440 0.2759 6.6 4em6:C
13 4r3a:A 318 53 0.1228 0.0440 0.2642 8.6 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
14 1m2v:A 705 49 0.1228 0.0199 0.2857 9.0

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218