Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
CETSPCQNQGKCKDEYTCTCLEGFEGKNCELFTRKLCSLDNGDCDQFCHEEQNSVVCSCARGYTLADNGKACIPTGPYPC
GKQTLE

The query sequence (length=86) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1xkb:A 91 89 1.0000 0.9451 0.9663 1.01e-56 3k9x:A
2 1p0s:L 99 53 0.6047 0.5253 0.9811 5.84e-34 2y80:B
3 8eph:A 91 89 0.5349 0.5055 0.5169 6.13e-23 1edm:B, 1edm:C, 8eph:C
4 2vwn:L 44 51 0.5116 1.0000 0.8627 8.16e-23 2vwo:L
5 6r2w:L 143 88 0.4651 0.2797 0.4545 9.09e-18 2a2q:L, 2aei:L, 2aer:L, 2b8o:L, 2c4f:L, 8cn9:D, 8cn9:I, 8cn9:S, 1dan:L, 1dva:L, 1dva:M, 2ec9:L, 3ela:L, 1fak:L, 1ff7:A, 1ffm:A, 2fir:L, 4ibl:L, 1j9c:L, 5l0s:B, 5par:A, 2puq:L, 1qfk:L, 3th2:L, 3th3:L, 3th4:L, 1w0y:L, 1w2k:L, 1wqv:L, 1wss:L, 1wtg:L, 1wun:L, 1wv7:L, 4ylq:L, 1z6j:L, 4z6a:L, 4zma:L, 2zp0:L, 2zwl:L, 2zzu:L
6 3h5c:B 312 90 0.4535 0.1250 0.4333 3.72e-13
7 7alj:A 115 69 0.3256 0.2435 0.4058 5.76e-08
8 7alj:A 115 34 0.1512 0.1130 0.3824 0.15
9 5vyg:B 43 35 0.2442 0.4884 0.6000 1.80e-06 5vyg:A, 5vyg:C
10 4bxw:B 287 48 0.2326 0.0697 0.4167 2.13e-06 4bxw:A
11 4xlw:C 118 70 0.2907 0.2119 0.3571 3.80e-05 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
12 4xlw:C 118 64 0.2209 0.1610 0.2969 0.17 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
13 4xlw:C 118 33 0.1628 0.1186 0.4242 0.27 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
14 4d0f:A 125 70 0.3023 0.2080 0.3714 5.15e-05 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
15 4d0f:A 125 64 0.2209 0.1520 0.2969 0.15 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
16 4d0f:A 125 39 0.1628 0.1120 0.3590 0.26 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
17 5ky2:B 40 33 0.2093 0.4500 0.5455 5.83e-05 5ky3:B
18 5mwb:A 118 70 0.2907 0.2119 0.3571 1.65e-04
19 5mwb:A 118 64 0.2209 0.1610 0.2969 0.050
20 5mwb:A 118 34 0.1512 0.1102 0.3824 0.30
21 5f1a:A 553 42 0.2209 0.0344 0.4524 2.61e-04 5f19:A, 5f19:B, 5f1a:B, 5ikq:A, 5ikq:B, 5ikr:A, 5ikr:B, 5ikt:A, 5ikt:B, 5ikv:A, 5ikv:B, 5kir:A, 5kir:B
22 4xbm:B 401 34 0.2209 0.0474 0.5588 6.38e-04
23 4xbm:B 401 34 0.1744 0.0374 0.4412 0.26
24 4xbm:B 401 63 0.2326 0.0499 0.3175 0.51
25 5l0t:B 40 33 0.1977 0.4250 0.5152 0.001 5ky7:B, 5l0u:B, 5l0v:B
26 5fm9:A 154 85 0.3023 0.1688 0.3059 0.007 5fma:A, 5fma:B
27 5fm9:A 154 34 0.1977 0.1104 0.5000 0.007 5fma:A, 5fma:B
28 6l6r:A 610 38 0.1628 0.0230 0.3684 0.008 6l6r:B, 7nam:A, 3sob:B, 3soq:A, 3sov:A
29 6l6r:A 610 37 0.1395 0.0197 0.3243 0.010 6l6r:B, 7nam:A, 3sob:B, 3soq:A, 3sov:A
30 7lyu:B 371 33 0.1395 0.0323 0.3636 0.049 7lyu:A
31 5uk5:B 308 30 0.1744 0.0487 0.5000 0.057 4cbz:A, 4cc0:A, 4cc0:B, 4cc1:A, 4cc1:B
32 5uk5:A 194 33 0.1744 0.0773 0.4545 0.075 2rqz:A, 2rr2:A
33 5uk5:A 194 64 0.2209 0.0979 0.2969 0.31 2rqz:A, 2rr2:A
34 5uk5:A 194 75 0.2791 0.1237 0.3200 1.3 2rqz:A, 2rr2:A
35 4d90:A 127 29 0.1395 0.0945 0.4138 0.13 4d90:B
36 4d90:A 127 34 0.1744 0.1181 0.4412 0.19 4d90:B
37 5ckn:A 278 33 0.1512 0.0468 0.3939 0.13 5cis:A, 5ckm:A, 5ckn:D, 1nt0:A, 1nt0:G
38 4rs0:A 557 40 0.2093 0.0323 0.4500 0.14 6bl3:A, 6bl3:B, 6bl3:C, 6bl3:D, 6bl4:A, 6bl4:B, 6bl4:C, 6bl4:D, 4cox:A, 4cox:B, 4cox:C, 4cox:D, 5cox:A, 5cox:B, 5cox:C, 5cox:D, 6cox:A, 6cox:B, 1cvu:B, 1cvu:A, 1cx2:A, 1cx2:B, 1cx2:C, 1cx2:D, 1ddx:A, 1ddx:B, 1ddx:C, 1ddx:D, 4e1g:A, 4e1g:B, 8et0:A, 8et0:B, 5fdq:A, 5fdq:B, 4fm5:A, 4fm5:B, 4fm5:C, 4fm5:D, 3hs5:A, 3hs5:B, 3hs6:A, 3hs6:B, 3hs7:A, 3hs7:B, 5jvy:A, 5jvy:B, 5jvz:A, 5jvz:B, 5jw1:A, 5jw1:B, 3krk:A, 3krk:B, 3ln0:A, 3ln0:B, 3ln0:C, 3ln0:D, 3ln1:A, 3ln1:B, 3ln1:C, 3ln1:D, 4m10:A, 4m10:B, 4m10:C, 4m10:D, 4m11:A, 4m11:B, 4m11:C, 4m11:D, 3mdl:A, 3mdl:B, 3mqe:A, 3mqe:B, 3mqe:C, 3mqe:D, 3nt1:A, 3nt1:B, 3ntb:A, 3ntb:B, 3ntb:C, 3ntb:D, 3ntg:A, 3ntg:B, 3ntg:C, 3ntg:D, 6ofy:A, 6ofy:B, 3olt:A, 3olt:B, 3olu:A, 3olu:B, 4otj:A, 4otj:B, 4otj:C, 4otj:D, 4oty:A, 4oty:B, 3pgh:A, 3pgh:B, 3pgh:C, 3pgh:D, 4ph9:A, 4ph9:B, 1pxx:A, 1pxx:B, 1pxx:C, 1pxx:D, 3q7d:A, 3q7d:B, 3qh0:A, 3qh0:B, 3qmo:A, 3qmo:B, 3rr3:A, 3rr3:B, 3rr3:C, 3rr3:D, 4rrw:A, 4rrw:B, 4rrw:C, 4rrw:D, 4rrx:A, 4rrx:B, 4rrz:A, 4rrz:B, 4rrz:C, 4rrz:D, 4rut:A, 4rut:B, 4rut:C, 4rut:D, 3tzi:A, 3tzi:B, 6v3r:A, 6v3r:B, 6v3r:C, 6v3r:D, 5w58:A, 4z0l:A, 4z0l:B, 4z0l:C, 4z0l:D
39 1szb:A 167 29 0.1395 0.0719 0.4138 0.23 1szb:B
40 3v64:C 338 36 0.1628 0.0414 0.3889 0.29 3v64:D
41 3v64:C 338 69 0.2093 0.0533 0.2609 2.8 3v64:D
42 3poy:A 1005 34 0.1628 0.0139 0.4118 0.76 3asi:A, 3b3q:E, 3b3q:F, 3biw:E, 3biw:F, 3biw:G, 3bod:A, 2h0b:A, 2h0b:B, 2h0b:C, 2h0b:D, 2r16:A, 2r1d:H, 2r1d:B, 2r1d:D, 2r1d:I, 3vkf:C, 3vkf:D, 2wqz:C, 2wqz:D, 2xb6:C, 2xb6:D, 5z8y:B, 5z8y:D, 5z8y:F, 5z8y:H
43 4aqb:A 345 29 0.1279 0.0319 0.3793 0.82 5ckq:A, 3dem:A, 3dem:B
44 2ygq:A 241 33 0.1512 0.0539 0.3939 1.1
45 1lmj:A 86 67 0.2326 0.2326 0.2985 1.3
46 1g1q:A 160 34 0.1628 0.0875 0.4118 1.4 1g1q:B, 1g1q:C, 1g1q:D, 1g1r:A, 1g1r:B, 1g1r:D, 1g1r:C, 1g1s:B, 1g1s:A
47 7nx4:A 348 28 0.1395 0.0345 0.4286 1.9
48 1ktg:A 137 32 0.1395 0.0876 0.3750 2.0 1ktg:B
49 8em7:A 4378 64 0.2209 0.0043 0.2969 2.3 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
50 8em7:A 4378 30 0.1279 0.0025 0.3667 5.7 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
51 8em4:A 3818 64 0.2209 0.0050 0.2969 2.6 8em4:B
52 8em4:A 3818 30 0.1279 0.0029 0.3667 6.2 8em4:B
53 7nxd:B 690 42 0.1744 0.0217 0.3571 3.0 7ceb:B, 7cec:B, 9ckv:B, 7nwl:B, 3vi3:B, 3vi3:D, 3vi4:D, 3vi4:B, 4wjk:B, 4wk0:B, 4wk2:B, 4wk4:B
54 6a48:A 651 29 0.1163 0.0154 0.3448 3.7
55 4c16:A 280 65 0.2326 0.0714 0.3077 4.2 4c16:B, 4csy:A, 4csy:B, 1esl:A, 6eyi:A, 6eyj:A, 6eyj:B, 6eyk:A, 1g1t:A
56 1n7d:A 639 66 0.2209 0.0297 0.2879 5.5 1ajj:A, 3bps:E, 1d2j:A, 1f8z:A, 2fcw:B, 3gcw:E, 3gcx:E, 1hj7:A, 1hz8:A, 1i0u:A, 2kri:B, 2lgp:A, 3m0c:C, 3p5b:L, 3p5c:L, 1xfe:A
57 6zwm:B 2185 19 0.0930 0.0037 0.4211 5.8 6zwm:A
58 6jd0:A 314 61 0.2209 0.0605 0.3115 5.9 8a4u:A, 8a4u:B, 8a4u:C, 8a4u:D, 8a4v:A, 8a4v:B, 8a4v:C, 8a4v:D, 8a4w:A, 8a4w:B, 8a4w:C, 8a4w:D, 8a4x:A, 8a4x:B, 8a4x:C, 8a4x:D, 8a5b:A, 8a5b:B, 8a5b:C, 8a5b:D, 8ahv:A, 8ahv:B, 8ahv:C, 8ahv:D, 4axl:A, 4axm:A, 4axm:B, 4axm:F, 4axm:I, 4axm:L, 4axm:O, 8b4f:A, 8b4f:B, 8b4f:C, 8b4f:D, 3bc3:A, 3bc3:B, 8c77:A, 8c77:B, 8c77:C, 8c77:D, 6ezp:A, 6ezx:A, 6ezx:B, 5f02:A, 6f06:A, 6f06:B, 8gx2:A, 8gx2:B, 3h89:A, 3h89:B, 3h89:C, 3h89:D, 3h89:E, 3h89:F, 3h8b:A, 3h8b:B, 3h8b:C, 3h8b:F, 3h8b:D, 3h8b:E, 3h8c:A, 3h8c:B, 8het:A, 8hfv:A, 8hfv:B, 8hfv:C, 8hfv:D, 3hha:A, 3hha:B, 3hha:C, 3hha:D, 3hwn:A, 3hwn:B, 3hwn:C, 3hwn:D, 3k24:B, 3k24:A, 5mae:A, 5maj:A, 1mhw:A, 1mhw:B, 1mhw:C, 1mhw:D, 5mqy:A, 3of8:A, 3of9:A, 8ofa:A, 8ofa:B, 8ofa:C, 8ofa:D, 8oza:A, 8oza:B, 8oza:C, 8oza:D, 8prx:A, 8prx:B, 8prx:C, 8prx:D, 7qkb:A, 7qkb:B, 7qkb:C, 7qkb:D, 7qkc:A, 7qkc:B, 7qkc:C, 7qkc:D, 7qkd:A, 7qkd:B, 7qkd:C, 7qkd:D, 8qkb:A, 8qkb:B, 8qkb:C, 8qkb:D, 8uac:A, 8uac:B, 7w33:A, 7w34:A, 2xu1:A, 2xu1:B, 2xu1:C, 2xu1:D, 2xu3:A, 2xu4:A, 2xu5:A, 2yj2:A, 2yj8:A, 2yj9:A, 2yjb:A, 2yjc:A, 7z58:A, 7z58:B, 7z58:C, 7z58:D, 7zs7:A, 7zs7:B, 7zs7:C, 7zs7:D, 7zvf:A, 7zvf:B, 7zvf:C, 7zvf:D, 7zxa:A, 7zxa:B, 7zxa:C, 7zxa:D
59 5kjh:B 807 84 0.2558 0.0273 0.2619 7.0 5m5g:B
60 5ms9:A 177 89 0.2907 0.1412 0.2809 7.2
61 5wf7:B 765 84 0.2558 0.0288 0.2619 7.7 5kji:B
62 4fdi:A 494 26 0.1395 0.0243 0.4615 8.8 4fdi:B, 4fdj:A, 4fdj:B
63 5es4:B 674 42 0.1744 0.0223 0.3571 9.5 5e6r:B, 5e6s:B, 5e6s:D, 5e6s:F, 5e6u:B, 5es4:D, 5es4:F, 5es4:H, 3k6s:B, 3k6s:D, 3k6s:F, 3k6s:H, 3k71:B, 3k71:D, 3k71:F, 3k71:H, 3k72:B, 3k72:D, 4neh:B, 4nen:B, 7usl:B, 7usm:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218