BioLiP

>protein
CDVYLWGAGRHGQLAEAGRNVMVPAAAPSFSQAQQVICGQNCTFVIQANGTVLACGEGSYGRLGQGNSDDLHVLTVISAL
QGFVVTQLVTSCGSDGHSMALTESGEVFSWGDGDYGKLGHGNSDRQRRPRQIEALQGEEVVQMSCGFKHSAVVTSDGKLF
TFGNGDYGRLGLGNTSNKKLPERVTALEGYQIGQVACGLNHTLAVSADGSMVWAFGDGDYGKLGLGNSTAKSSPQKIDVL
CGIGIKKVACGTQFSVALTKDGHVYTFGQDRLIGLPEGRARNHNRPQQIPVLAGVIIEDVAVGAEHTLALASNGDVYAWG
SNSEGQLGLGHTNHVREPTLVTGLQGKNVRQISAGRCHSAAWTA

The query sequence (length=364) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4o2w:A	365	364	1.0000	0.9973	1.0000	0.0	4o2w:B, 4o2w:D
2	7q41:A	369	367	0.4286	0.4228	0.4251	6.82e-86	7q41:C, 7q41:E, 7q42:C, 7q42:A, 7q42:E, 7q43:A, 7q43:C, 7q43:E, 7q44:C, 7q44:A, 7q44:E, 7q45:A, 7q45:C, 7q45:E, 7q46:C, 7q46:E, 7q46:A
3	7q41:A	369	263	0.2555	0.2520	0.3536	1.09e-33	7q41:C, 7q41:E, 7q42:C, 7q42:A, 7q42:E, 7q43:A, 7q43:C, 7q43:E, 7q44:C, 7q44:A, 7q44:E, 7q45:A, 7q45:C, 7q45:E, 7q46:C, 7q46:E, 7q46:A
4	7q41:A	369	208	0.1978	0.1951	0.3462	6.65e-33	7q41:C, 7q41:E, 7q42:C, 7q42:A, 7q42:E, 7q43:A, 7q43:C, 7q43:E, 7q44:C, 7q44:A, 7q44:E, 7q45:A, 7q45:C, 7q45:E, 7q46:C, 7q46:E, 7q46:A
5	7q41:A	369	156	0.1236	0.1220	0.2885	2.53e-17	7q41:C, 7q41:E, 7q42:C, 7q42:A, 7q42:E, 7q43:A, 7q43:C, 7q43:E, 7q44:C, 7q44:A, 7q44:E, 7q45:A, 7q45:C, 7q45:E, 7q46:C, 7q46:E, 7q46:A
6	7q41:A	369	160	0.1401	0.1382	0.3187	5.18e-14	7q41:C, 7q41:E, 7q42:C, 7q42:A, 7q42:E, 7q43:A, 7q43:C, 7q43:E, 7q44:C, 7q44:A, 7q44:E, 7q45:A, 7q45:C, 7q45:E, 7q46:C, 7q46:E, 7q46:A
7	4nbm:C	369	327	0.3187	0.3144	0.3547	5.80e-62	4nbm:D, 4nc4:A, 4nc4:C
8	4nbm:C	369	343	0.3297	0.3252	0.3499	5.96e-60	4nbm:D, 4nc4:A, 4nc4:C
9	4nbm:C	369	278	0.2802	0.2764	0.3669	5.50e-49	4nbm:D, 4nc4:A, 4nc4:C
10	4nbm:C	369	295	0.2335	0.2304	0.2881	4.91e-41	4nbm:D, 4nc4:A, 4nc4:C
11	4nbm:C	369	224	0.2253	0.2222	0.3661	9.36e-41	4nbm:D, 4nc4:A, 4nc4:C
12	3mvd:L	394	322	0.2473	0.2284	0.2795	4.01e-14	3mvd:K
13	3mvd:L	394	381	0.2610	0.2411	0.2493	3.06e-13	3mvd:K
14	3mvd:L	394	277	0.2115	0.1954	0.2780	1.88e-10	3mvd:K
15	4d4o:A	414	200	0.1456	0.1280	0.2650	1.18e-09	4d4o:C, 4d4p:A, 4d4p:C, 4d4p:G, 4d4p:H, 4x33:A, 4x33:B, 1yop:A, 1yws:A
16	4d4o:A	414	211	0.1456	0.1280	0.2512	2.45e-07	4d4o:C, 4d4p:A, 4d4p:C, 4d4p:G, 4d4p:H, 4x33:A, 4x33:B, 1yop:A, 1yws:A
17	4d4o:A	414	49	0.0632	0.0556	0.4694	0.013	4d4o:C, 4d4p:A, 4d4p:C, 4d4p:G, 4d4p:H, 4x33:A, 4x33:B, 1yop:A, 1yws:A
18	5j14:A	450	43	0.0412	0.0333	0.3488	0.72	5j14:B, 5j7z:A
19	1szn:A	417	157	0.0989	0.0863	0.2293	0.97	1t0o:A
20	1jtd:B	273	180	0.1319	0.1758	0.2667	2.2
21	1jtd:B	273	212	0.1346	0.1795	0.2311	5.1
22	8hku:L15P	94	60	0.0549	0.2128	0.3333	7.3	8hkv:L15P, 8hky:L15P, 8hkz:L15P, 8hl1:L15P, 8hl2:L15P, 8hl3:L15P, 8hl4:L15P, 8hl5:L15P

[Back]