Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
CDVFDIYAICACCKVESKNEGKKNEVFNNYTFRGLGNKGVLPWKCISLDMKYFRAVTTYVNESKYEKLKYKRCKYLNKNS
KKLQNVVVMGRTNWESIPKKFKPLSNRINVILSRTLKKEDFDEDVYIINKVEDLIVLLGKLNYYKCFILGGSVVYQEFLE
KKLIKKIYFTRINSTYECDVFFPEINENEYQIISVSDVYTSNNTTLDFIIYKKTDDEEEDDFVYFNFNKENKNSIHPNDF
QIYNSLKYKYHPEYQYLNIIYDIMMNGNKQSDRTGVGVLSKFGYIMKFDLSQYFPLLTTKKLFLRGIIEELLWFIRGETN
GNTLLNKNVRIWEANGTREFLDNRKLFHREVNDLGPIYGFQWRHFGAEYTNMYDNYENKGVDQLKNIINLIKNDPTSRRI
LLCAWNVKDLDQMALPPCHILCQFYVFDGKLSCIMYQRSCDLGLGVPFNIASYSIFTHMIAQVCNLQPAQFIHVLGNAHV
YNNHIDSLKIQLNRIPYPFPTLKLNPDIKNIEDFTISDFTIQNYVHHEKISMD

The query sequence (length=533) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6a2p:B 551 543 1.0000 0.9673 0.9816 0.0 6a2k:A, 6a2k:B, 6a2l:A, 6a2m:A, 6a2m:B, 6a2n:A, 6a2n:B, 6a2o:A, 6a2o:B, 6a2p:A, 7ctw:A, 7ctw:B, 7cty:A, 7cty:B, 7ctz:A, 7ctz:B, 3dg8:A, 3dg8:B, 3dg8:C, 3dg8:D, 3dga:A, 3dga:B, 3dga:C, 3dga:D, 4dp3:A, 4dp3:B, 4dpd:A, 4dpd:B, 4dph:A, 4dph:B, 7f3y:A, 7f3y:B, 7f3z:A, 7f3z:B, 1j3i:A, 1j3i:B, 1j3i:C, 1j3i:D, 1j3j:A, 1j3j:B, 1j3j:C, 1j3j:D, 1j3k:A, 1j3k:B, 1j3k:C, 1j3k:D, 8jfb:A, 8jfb:B, 8jfc:A, 8jfc:B, 8jfd:A, 8jfd:B, 3jsu:A, 3jsu:B, 6kot:A, 6kot:B, 6kp2:B, 6kp7:A, 6kp7:B, 6kpr:A, 6kpr:B, 6leu:A, 6leu:B, 6lev:A, 6lev:B, 6lez:A, 6lez:B, 6lh9:A, 6lh9:B, 6lhi:A, 6lhi:B, 6lhj:A, 6lhj:B, 3qg2:A, 3qg2:B, 3qgt:A, 3qgt:B, 3um5:A, 3um5:B, 3um6:A, 3um6:B, 3um8:A, 3um8:B, 8wgm:A, 8wgm:B, 8yq8:A, 8yq9:A, 8yq9:B
2 6a2l:B 521 535 0.9644 0.9866 0.9607 0.0 6kp2:A, 8yq8:B
3 3k2h:A 503 502 0.4690 0.4970 0.4980 4.46e-172 3k2h:B, 3kjr:A, 3kjr:B, 3nrr:A, 3nrr:B
4 6aog:A 511 523 0.4447 0.4638 0.4532 1.60e-164 6aog:B, 6aoh:A, 6aoh:B, 6aoi:A, 6aoi:B, 4eck:A, 4eck:B, 4eil:A, 4eil:B, 4eil:C, 4eil:D, 4eil:E, 4eil:F, 4eil:G, 4eil:H, 4ky4:A, 4ky4:B, 4ky4:C, 4ky4:D, 4ky4:E, 4ky4:F, 4ky4:G, 4ky4:H, 4kya:A, 4kya:B, 4kya:C, 4kya:D, 4kya:E, 4kya:F, 4kya:G, 4kya:H, 6n1s:A, 6n1s:B, 6n1t:A, 6n1t:B, 5t0l:A, 5t0l:B
5 7fgx:D 563 563 0.4540 0.4298 0.4298 1.66e-160 7fgw:A, 7fgw:B, 7fgw:C, 7fgw:D, 7fgx:A, 7fgx:B, 7fgx:C, 7fgy:A, 7fgy:B, 7fgy:C, 7fgy:D
6 1qzf:A 519 524 0.4090 0.4200 0.4160 8.77e-138 3dl5:A, 3dl5:B, 3dl5:C, 3dl5:D, 3dl5:E, 3dl6:A, 3dl6:B, 3dl6:C, 3dl6:D, 3dl6:E, 3hj3:A, 3hj3:B, 3hj3:C, 3hj3:D, 4ky8:A, 4ky8:B, 4ky8:C, 4ky8:D, 4ky8:E, 2oip:A, 2oip:B, 2oip:C, 2oip:D, 2oip:E, 6ojs:A, 6ojs:C, 6ojs:B, 6ojs:E, 6ojs:D, 6pf7:A, 6pf7:B, 6pf7:C, 6pf7:D, 6pf7:E, 6pf8:A, 6pf8:B, 6pf8:C, 6pf8:D, 6pf8:E, 6pf9:A, 6pf9:B, 6pf9:C, 6pf9:D, 6pf9:E, 6pfa:A, 6pfa:B, 6pfa:C, 6pfa:D, 6pfa:E, 6pfb:A, 6pfb:B, 6pfb:C, 6pfb:D, 6pfb:E, 6pfc:A, 6pfc:B, 6pfc:D, 6pfc:C, 6pfc:E, 6pfd:A, 6pfd:B, 6pfd:C, 6pfd:D, 6pfd:E, 6pfe:A, 6pfe:B, 6pfe:C, 6pfe:E, 6pfe:D, 6pff:A, 6pff:B, 6pff:C, 6pff:D, 6pff:E, 6pfg:A, 6pfg:B, 6pfg:C, 6pfg:D, 6pfg:E, 6pfh:A, 6pfh:B, 6pfh:C, 6pfh:D, 6pfh:E, 6pfi:A, 6pfi:B, 6pfi:C, 6pfi:D, 6pfi:E, 4q0d:E, 4q0d:A, 4q0d:B, 4q0d:C, 4q0d:D, 4q0e:A, 4q0e:C, 4q0e:B, 4q0e:D, 4q0e:E, 1qzf:B, 1qzf:C, 1qzf:D, 1qzf:E, 1sej:A, 1sej:B, 1sej:C, 1sej:D, 1sej:E, 6wep:A, 6wep:B
7 3irm:A 520 529 0.4053 0.4154 0.4083 1.33e-129 3cl9:A, 3clb:A, 3clb:B, 3clb:C, 3clb:D, 2h2q:A, 2h2q:B, 3hbb:A, 3hbb:B, 3hbb:C, 3hbb:D, 3inv:A, 3inv:B, 3irm:B, 3irm:C, 3irm:D, 3irn:A, 3irn:B, 3irn:C, 3irn:D, 3iro:A, 3iro:B, 3iro:C, 3iro:D, 3kjs:A, 3kjs:B, 3kjs:C, 3kjs:D, 5t7o:A, 5t7o:B, 5t7o:C, 5t7o:D
8 4eb4:B 301 283 0.3002 0.5316 0.5654 8.79e-122 4e5o:A, 4e5o:B, 4e5o:C, 4e5o:D, 4e5o:E, 4e5o:F, 4eb4:A, 4eb4:C, 4eb4:D, 4ein:A, 4ein:B, 3ejl:C, 3ejl:D, 4ez8:A, 6f6z:A, 6f6z:B, 5fct:A, 5fct:B, 4fgt:A, 4g2o:X, 4g6w:X, 4gd7:A, 6gko:A, 6gko:B, 6gyj:A, 3h9k:A, 3h9k:B, 3h9k:D, 3h9k:E, 3hb8:A, 3hb8:B, 3hb8:C, 3hb8:D, 3hb8:E, 5hs3:A, 5hs3:B, 5hs3:C, 5hs3:D, 5hs3:E, 5hs3:F, 1hvy:A, 1hvy:B, 1hvy:C, 1hvy:D, 1i00:A, 1i00:B, 1ju6:A, 1ju6:B, 1ju6:C, 1ju6:D, 1juj:A, 1juj:B, 1juj:C, 1juj:D, 3ob7:A, 3ob7:B, 3ob7:D, 3ob7:E, 6oju:B, 6oju:A, 6oju:C, 6oju:D, 6ojv:B, 6ojv:A, 6ojv:D, 6ojv:C, 6pf3:A, 6pf3:B, 6pf3:C, 6pf3:D, 6pf4:B, 6pf4:D, 6pf4:A, 6pf4:C, 6pf5:A, 6pf5:B, 6pf5:C, 6pf5:D, 6pf6:B, 6pf6:A, 6pf6:C, 6pf6:D, 6qxg:A, 6qxg:B, 6qxg:C, 6qxh:A, 6qxh:B, 6qxh:C, 6qyq:B, 6qyq:D, 6r2e:A, 6r2e:C, 6r2e:D, 6r2e:B, 6r2e:F, 6r2e:H, 6r2e:E, 6r2e:G, 2rd8:B, 2rda:C, 2rda:D, 2rda:E, 1rts:A, 1rts:B, 2tsr:A, 2tsr:B, 2tsr:C, 2tsr:D, 4up1:A, 4up1:B, 4up1:D, 4up1:C, 5wrn:B, 5wrn:A, 5wrn:C, 5wrn:D, 5wrn:E, 5wrn:F, 5x5d:A, 5x5d:D, 5x5d:B, 5x5d:E, 5x5d:C, 5x5d:F, 5x5q:A, 5x5q:D, 5x5q:B, 5x5q:E, 5x5q:C, 5x5q:F, 5x66:A, 5x66:D, 5x66:B, 5x66:E, 5x66:C, 5x66:F, 5x67:A, 5x67:B, 5x69:A, 5x69:D, 5x69:B, 5x69:E, 5x69:C, 5x69:F, 6y08:A, 6y08:B, 6zxo:A, 6zxo:B, 6zxo:C, 6zxo:D, 6zxo:E, 6zxo:F
9 5h39:A 285 283 0.2852 0.5333 0.5371 6.25e-119 5h38:B, 5h39:B, 5h3a:A, 5h3a:B
10 6k7s:B 286 284 0.2908 0.5420 0.5458 6.60e-118 6k7r:A, 6k7r:B, 6k7s:A
11 1f28:A 295 288 0.3133 0.5661 0.5799 2.39e-117 1ci7:A, 1ci7:B, 1f28:B, 1f28:C, 1f28:D
12 4irr:A 290 282 0.2889 0.5310 0.5461 4.25e-117 4irr:B, 4isw:A, 4isw:B, 5noo:A, 5noo:B, 5noo:C, 5noo:D, 4psg:A, 4psg:B
13 5by6:B 288 281 0.2927 0.5417 0.5552 1.82e-114 5by6:A, 5by6:C, 5by6:D, 5m4z:A, 5m4z:B
14 7xyk:A 290 276 0.2852 0.5241 0.5507 9.21e-113 7cca:A, 7cca:B, 7xyj:A, 7xyj:B, 7xyj:C, 7xyj:D, 7xyk:B, 7xyk:C, 7xyk:D
15 7dp4:A 287 281 0.2927 0.5436 0.5552 9.88e-111 7dp5:A, 7dp6:A
16 2aaz:A 305 296 0.2889 0.5049 0.5203 2.86e-106 2aaz:B, 2aaz:C, 2aaz:D, 2aaz:E, 2aaz:F, 2aaz:G, 2aaz:H, 2aaz:I, 2aaz:J, 2aaz:K, 2aaz:L, 2aaz:M, 2aaz:N, 2aaz:O, 2aaz:P
17 4xsc:B 284 279 0.2720 0.5106 0.5197 2.85e-105 4xsc:A, 4xsc:C, 4xsc:D, 4xsd:A, 4xsd:B, 4xsd:C, 4xsd:D
18 2onb:A 264 283 0.2739 0.5530 0.5159 3.44e-105 4e28:A, 3n5e:A, 3n5e:B
19 2bla:A 217 212 0.2739 0.6728 0.6887 2.68e-96 2bl9:A, 2blb:A, 2blc:A
20 2a9w:A 264 276 0.2383 0.4811 0.4601 1.24e-83 2a9w:B, 2a9w:C, 2a9w:D, 1aiq:A, 1aiq:B, 1aob:A, 1axw:A, 1axw:B, 3b5b:A, 3b5b:B, 3b9h:A, 2bbq:A, 2bbq:B, 1bdu:A, 3bfi:A, 3bgx:A, 3bhl:A, 3bhl:B, 3bhr:A, 1bid:A, 1bjg:A, 1bq1:A, 1bq1:B, 6cdz:A, 6cdz:B, 1ddu:A, 1ddu:B, 1dna:A, 1dna:B, 1f4c:A, 1f4c:B, 1f4d:A, 1f4d:B, 1f4e:A, 1f4f:A, 1f4f:B, 1f4g:A, 1f4g:B, 2fto:X, 1fwm:A, 1fwm:B, 2g8x:A, 2g8x:B, 4gev:A, 4gev:B, 4isk:A, 4isk:B, 4isk:C, 4isk:F, 4isk:D, 4isk:E, 4isk:G, 4isk:H, 1jg0:A, 1jg0:B, 1jtq:A, 1jtq:B, 1jtu:A, 1jtu:B, 1jut:A, 1jut:B, 7jx1:A, 7jx1:B, 7jxf:A, 7jxf:B, 1kce:A, 1kce:B, 2kce:A, 2kce:B, 1kzi:A, 1kzi:B, 1kzj:A, 1kzj:B, 1kzj:C, 1kzj:D, 1kzj:E, 1kzj:F, 4lrr:A, 1nce:A, 1nce:B, 6nnr:A, 6nnr:B, 1syn:A, 1syn:B, 1tdu:A, 1tdu:B, 1tlc:A, 1tlc:B, 1tls:A, 1tls:B, 1trg:A, 1tsd:A, 1tsd:B, 1tsn:A, 2tsc:A, 2tsc:B, 1tys:A, 2vet:A, 2vf0:A, 2vf0:B, 1zpr:A, 1zpr:B
21 6qxs:A 292 295 0.2420 0.4418 0.4373 7.17e-82 6qxs:C, 6qya:A, 6qya:C
22 5j7w:C 315 316 0.2420 0.4095 0.4082 2.39e-78 5j7w:D, 4o7u:B, 4o7u:D, 6qxs:B, 6qxs:D, 6qya:B, 6qya:D, 3uwl:B, 3uwl:D
23 4fog:D 263 275 0.2214 0.4487 0.4291 2.42e-78 4foa:A, 4foa:B, 4foa:C, 4foa:D, 4fog:A, 4fog:B, 4fog:C, 4fox:A, 4fox:B, 4fox:C, 4fox:D, 4fox:E, 4fox:F, 4fox:G, 4fox:H, 4fqs:A, 4fqs:B, 3qj7:A, 3qj7:C, 3qj7:B, 3qj7:D
24 4dq1:A 312 325 0.2552 0.4359 0.4185 1.63e-76 4dq1:B
25 1bo7:A 316 310 0.2495 0.4209 0.4290 3.71e-75 3bnz:A, 1bo8:A, 1bp0:A, 1bp6:A, 1bpj:A, 3byx:A, 3bz0:A, 3c06:A, 2g86:A, 2g89:A, 2g8a:A, 2g8d:A, 3ijz:A, 3ik0:A, 3ik1:A, 1jmf:A, 1jmg:A, 1jmh:A, 1jmi:A, 1lca:A, 1lcb:A, 1lce:A, 1nja:A, 1njb:A, 1njc:A, 1njd:A, 1nje:A, 1tdb:A, 1tdc:A, 2tdd:A, 2tdm:A, 1thy:A, 1tsl:A, 1tsm:A, 1tsv:A, 1tsx:A, 1tsy:A, 1tsz:A, 1tvu:A, 1tvv:A, 1tvw:A, 1vza:A, 1vzb:A, 1vzc:A, 1vzd:A, 1vze:A
26 3c0a:A 289 290 0.2420 0.4464 0.4448 1.38e-74
27 4h0u:A 260 269 0.2083 0.4269 0.4126 8.66e-70 4h0u:B, 4h0u:C, 4h0u:D
28 1b02:A 279 287 0.2008 0.3835 0.3728 3.73e-49
29 3d80:A 186 196 0.1163 0.3333 0.3163 1.02e-23 3d84:X, 2fzj:A, 3k45:A, 3k47:A, 1u70:A
30 8dfr:A 186 190 0.1069 0.3065 0.3000 8.13e-23 1dr1:A, 1dr2:A, 1dr3:A, 1dr4:A, 1dr5:A, 1dr6:A, 1dr7:A
31 5sd6:A 187 192 0.1163 0.3316 0.3229 1.24e-21 6a7c:A, 6a7e:A, 1boz:A, 2c2s:A, 2c2s:B, 2c2t:A, 2c2t:B, 6dav:A, 6dav:B, 4ddr:A, 6de4:A, 6de4:B, 2dhf:A, 2dhf:B, 1dlr:A, 1dls:A, 3eig:A, 7ese:A, 3f8y:A, 3f8z:A, 3f91:A, 3fs6:A, 4g95:A, 3ghc:A, 3ghv:A, 3ghw:A, 3gi2:A, 3gyf:A, 1hfp:A, 1hfq:A, 1hfr:A, 5hpb:A, 5hqy:A, 5hqz:A, 5hsr:A, 5hsu:A, 5ht4:A, 5ht5:A, 5hui:A, 5hvb:A, 5hve:A, 4kak:A, 4kak:B, 4kbn:A, 4kbn:B, 4kd7:A, 4kd7:B, 4keb:A, 4keb:B, 4kfj:A, 4kfj:B, 1kms:A, 1kmv:A, 3l3r:A, 4m6j:A, 4m6k:A, 4m6l:A, 1mvs:A, 1mvt:A, 3n0h:A, 3ntz:A, 3nu0:A, 3nxo:A, 3nxr:A, 3nxt:A, 3nxv:A, 3nxx:A, 3nxy:A, 3nzd:A, 3oaf:A, 1ohj:A, 1ohk:A, 1pd8:A, 1pd9:A, 4qhv:A, 4qjc:A, 1s3u:A, 1s3v:A, 1s3w:A, 3s3v:A, 3s7a:A, 5sd7:A, 5sd8:A, 5sd9:A, 5sda:A, 5sdb:A, 5sdb:B, 1u71:A, 1u72:A, 6vcj:A, 6vcj:B, 6vcj:C, 6vcj:D, 2w3a:A, 2w3a:B, 2w3b:A, 2w3b:B, 2w3m:A, 2w3m:B, 8wgn:A, 7xi7:A, 1yho:A
32 1ai9:A 192 153 0.0882 0.2448 0.3072 1.54e-19 1ai9:B, 1aoe:A, 1aoe:B, 4h95:A, 4h95:B, 4h96:A, 4h96:B, 4h97:A, 4h97:B, 4hoe:A, 4hoe:B, 4hof:A, 4hof:B, 1ia1:A, 1ia1:B, 1ia2:A, 1ia2:B, 1ia3:A, 1ia3:B, 1ia4:A, 1ia4:B, 1m78:A, 1m78:B, 1m79:A, 1m79:B, 1m7a:A, 1m7a:B, 3qlr:A, 3qlr:B, 3qls:A, 3qls:B, 3qlw:A, 3qlw:B
33 3qfx:A 219 171 0.1051 0.2557 0.3275 4.71e-19 3qfx:B, 3rg9:A, 3rg9:B
34 8e4f:A 181 122 0.0826 0.2431 0.3607 1.57e-18
35 3cse:A 225 159 0.1051 0.2489 0.3522 1.48e-17 3cse:B, 3eej:A, 3eej:B, 3eek:A, 3eek:B, 3eel:A, 3eel:B, 3eem:A, 3eem:B, 4h98:A, 4h98:B, 4hog:A, 4hog:B, 3qlx:A, 3qlx:B, 3qly:A, 3qly:B, 3qlz:A, 3qlz:B, 3ro9:A, 3ro9:B, 3roa:A, 3roa:B
36 1cd2:A 206 157 0.0882 0.2282 0.2994 2.01e-16 2cd2:A, 3cd2:A, 1daj:A, 1dyr:A, 1e26:A, 2fzh:A, 2fzi:A, 4g8z:X, 4ixe:D, 4ixf:X, 4ixg:X, 1klk:A, 1ly3:A, 1ly4:A, 3nz6:X, 3nz9:X, 3nza:X, 3nzb:X, 3nzc:X, 4qjz:D, 1s3y:A, 3td8:A, 1vj3:A
37 8a0n:B 212 162 0.0938 0.2358 0.3086 1.10e-13 8a0z:B, 8a0z:A, 8crh:B, 8crh:A
38 6rul:A 276 111 0.0675 0.1304 0.3243 4.16e-11 6cyv:A, 6rum:A
39 6cxk:A 165 161 0.0844 0.2727 0.2795 1.83e-10 2ano:A, 2anq:A, 5cc9:A, 5ccc:A, 6cqa:A, 6cw7:A, 7d3z:A, 7d49:A, 7d4l:A, 7d4x:A, 7d6g:A, 3dau:A, 8dai:A, 1ddr:A, 1ddr:B, 1dds:A, 1dds:B, 4dfr:A, 4dfr:B, 6dfr:A, 7dfr:A, 1dhi:A, 1dhi:B, 1dhj:A, 1dhj:B, 1dra:A, 1dra:B, 1drb:A, 1drb:B, 1dre:A, 1drh:A, 2drc:A, 2drc:B, 3drc:A, 3drc:B, 1dyh:A, 1dyh:B, 1dyi:B, 1dyj:A, 1dyj:B, 7f3b:A, 4fhb:A, 7fpl:A, 7fpm:A, 7fpn:A, 7fpo:A, 7fpp:A, 7fpq:A, 7fpr:A, 7fps:A, 7fpt:A, 7fpu:A, 7fpv:A, 7fpw:A, 7fpx:A, 7fpy:A, 7fpz:A, 7fq0:A, 7fq1:A, 7fq2:A, 7fq3:A, 7fq4:A, 7fq5:A, 7fq6:A, 7fq7:A, 7fq8:A, 7fq9:A, 7fqa:A, 7fqb:A, 7fqc:A, 7fqd:A, 7fqe:A, 7fqf:A, 7fqg:A, 8g4z:A, 8g50:A, 8g50:B, 4gh8:B, 4gh8:A, 2inq:A, 2inq:B, 1jol:A, 1jol:B, 1jom:A, 3kfy:A, 4kjj:A, 4kjk:A, 4kjl:A, 7lvc:A, 7mqp:A, 6mr9:A, 6mt8:A, 6mth:A, 7mym:A, 7mym:C, 7mym:B, 7nae:A, 4nx6:A, 4nx7:A, 3och:A, 3och:B, 4or7:A, 4osg:A, 4osg:B, 4osg:C, 4osg:D, 4p3q:A, 4p3r:A, 4p66:A, 4p68:A, 4pdj:A, 4pss:A, 4pst:A, 4psy:A, 4pth:A, 4ptj:A, 3ql0:A, 3ql3:A, 4qle:A, 4qle:B, 4qlf:A, 4qlg:A, 4qlg:B, 3qyl:A, 3qyo:A, 3r33:A, 1ra1:A, 1ra2:A, 1ra3:A, 1ra8:A, 1ra9:A, 1rb2:A, 1rb2:B, 1rb3:A, 1rb3:B, 1rc4:A, 7reb:A, 1rf7:A, 1rg7:A, 4rgc:A, 1rh3:A, 1rx1:A, 1rx2:A, 1rx3:A, 1rx4:A, 1rx5:A, 1rx6:A, 1rx8:A, 1rx9:A, 5sss:A, 5sst:A, 5ssu:A, 5ssv:A, 5ssw:A, 1tdr:A, 1tdr:B, 8ucx:A, 5uih:A, 5uii:A, 5uio:A, 5uio:B, 5uio:C, 5uio:D, 5uio:E, 5uip:A, 5uip:B, 8uw0:A, 8vz4:A, 8vz4:B, 5w3q:A, 4x5f:A, 4x5f:B, 4x5g:A, 4x5g:B, 4x5h:A, 4x5i:A, 4x5j:A, 6xg4:A, 6xg5:A, 5z6f:A, 5z6j:A, 5z6k:A, 5z6l:A, 5z6m:A
40 3ia4:A 161 108 0.0675 0.2236 0.3333 3.31e-10 3ia4:B, 3ia4:C, 3ia4:D, 2zza:A, 2zza:B
41 8uvz:A 160 183 0.0769 0.2562 0.2240 5.76e-10
42 4fgg:A 163 120 0.0769 0.2515 0.3417 7.62e-10 6e4e:A, 3f0b:X, 3f0q:X, 3f0s:X, 3f0u:X, 3f0v:X, 3f0x:X, 4fgh:A, 3fq0:A, 3fqc:A, 3fqc:B, 3fqf:A, 3fqo:A, 3fqv:A, 3fqz:A, 3fra:X, 3frb:X, 3frd:X, 3fre:X, 3frf:X, 3fy8:X, 3fy9:X, 3fyv:X, 3fyw:X, 5hf0:X, 5hf2:X, 3i8a:X, 5isp:X, 5isq:X, 5ist:X, 5jg0:X, 4lae:X, 4lag:X, 4lah:X, 4lek:X, 3lg4:A, 3lg4:B, 3m08:A, 3m09:A, 6nd2:X, 6p9z:X, 6pbo:X, 6pr6:A, 6pr7:A, 6pr8:A, 6pr9:A, 6pra:A, 6prb:A, 6prd:A, 4q67:A, 4q6a:A, 3sgy:A, 3sgy:B, 3sh2:A, 3sh2:B, 3sqy:X, 3sr5:X, 3srq:X, 3srr:X, 3srs:X, 3sru:X, 3srw:X, 7t7q:X, 7t7s:X, 4tu5:X, 2w9g:A, 2w9h:A, 4xe6:X, 4xec:X
43 3e0b:A 166 143 0.0807 0.2590 0.3007 1.17e-09 3dat:A, 3e0b:B, 4elb:A, 4elb:H, 4elb:C, 4elb:B, 4elb:G, 4elb:F, 4elb:D, 4elb:E, 4ele:A, 4ele:B, 4ele:C, 4ele:D, 4ele:E, 4ele:F, 4ele:G, 4ele:H, 4elf:A, 4elf:B, 4elf:C, 4elf:D, 4elf:E, 4elf:F, 4elf:G, 4elf:H, 4elg:A, 4elg:B, 4elg:C, 4elg:D, 4elg:E, 4elg:F, 4elg:G, 4elg:H, 4elh:A, 4elh:H, 4elh:C, 4elh:B, 4elh:G, 4elh:F, 4elh:D, 4elh:E, 3fl8:A, 3fl8:B, 3fl8:C, 3fl8:D, 3fl8:E, 3fl8:F, 3fl8:G, 3fl8:H, 3fl9:A, 3fl9:B, 3fl9:C, 3fl9:D, 3fl9:E, 3fl9:F, 3fl9:G, 3fl9:H, 3jvx:A, 3jvx:B, 3jw3:A, 3jw3:B, 3jw5:A, 3jw5:B, 3jwc:A, 3jwc:B, 3jwf:A, 3jwf:B, 3jwk:A, 3jwk:B, 3jwm:A, 3jwm:B, 2kgk:A, 2qk8:A, 3s9u:A, 3s9u:B, 3sa1:A, 3sa1:B, 3sa2:A, 3sa2:B, 3sai:A, 3sai:B
44 6drs:A 244 196 0.0919 0.2008 0.2500 1.25e-09 6dtc:A
45 3tq8:A 171 162 0.0882 0.2749 0.2901 2.33e-09 3tq9:A, 3tqa:A, 3tqb:A
46 4m7u:A 170 161 0.0807 0.2529 0.2671 3.22e-09 4m7v:A
47 5hi6:B 162 161 0.0769 0.2531 0.2547 1.21e-08 5hi6:A, 4qi9:A, 4qi9:B, 4qi9:C, 8szd:A, 8sze:A, 8sze:B
48 5b6e:A 319 148 0.0694 0.1160 0.2500 1.43e-08 5b6d:A, 5b6d:B, 5b6e:B, 5jp9:A, 5jp9:B
49 2w9s:A 157 162 0.0826 0.2803 0.2716 3.01e-08 2w9s:B, 2w9s:C, 2w9s:D, 2w9s:E, 2w9s:F
50 1d1g:A 164 84 0.0525 0.1707 0.3333 6.86e-08 1d1g:B
51 5dxv:A 149 92 0.0600 0.2148 0.3478 5.66e-07
52 5sct:A 173 149 0.0769 0.2370 0.2752 4.71e-06 2cig:A, 8cop:A, 8cop:B, 8coq:A, 8coq:B, 8cow:A, 8cow:B, 8cox:A, 8cox:B, 8cq8:A, 8cq8:B, 8cq9:A, 8cq9:B, 8cqa:A, 8cqa:B, 6ddp:A, 6ddp:B, 6ddp:C, 6ddp:D, 6dds:A, 6dds:B, 6dds:C, 6dds:D, 6ddw:A, 1df7:A, 1dg5:A, 1dg7:A, 1dg8:A, 5ja3:A, 5ja3:B, 5ja3:C, 5ja3:D, 4kl9:A, 4klx:A, 4klx:B, 4km0:A, 4km0:B, 4km2:A, 4km2:B, 4kne:A, 4kne:B, 4m2x:A, 4m2x:C, 4m2x:E, 4m2x:G, 6nnc:A, 6nnc:B, 6nnd:A, 6nnd:B, 6nne:A, 6nne:B, 6nnh:A, 6nnh:B, 6nni:A, 6nni:B, 5scm:A, 5scn:A, 5sco:A, 5scp:A, 5scp:B, 5scq:A, 5scr:A, 5scs:A, 5scu:A, 5scv:A, 5scv:B, 5scw:A, 5scx:A, 5scy:A, 5scz:A, 5sd0:A, 5sd1:A, 5sd2:A, 5sd3:A, 5sd4:A, 5sd5:A, 5u26:A, 5u27:A, 5ujf:A, 6vs5:A, 6vs5:B, 6vs6:A, 6vs6:B, 6vs8:A, 6vs8:B, 6vs9:A, 6vs9:B, 6vsd:A, 6vsd:B, 6vse:A, 6vse:B, 6vsf:A, 6vsf:B, 6vsg:A, 6vsg:B, 6vv6:A, 6vv6:B, 6vv7:A, 6vv7:B, 6vv8:A, 6vv8:B, 6vv9:A, 6vv9:B, 6vvb:A
53 7k6c:B 160 182 0.0769 0.2562 0.2253 1.81e-05 7k6c:A, 7k6c:E, 7k6c:C, 7k6c:D, 7k6c:F, 7k6c:G
54 2w3v:A 165 80 0.0450 0.1455 0.3000 5.91e-05 2w3w:A
55 7k62:A 165 121 0.0582 0.1879 0.2562 6.26e-05 7k62:B
56 7tj3:A 164 162 0.0694 0.2256 0.2284 1.99e-04
57 1ao8:A 162 169 0.0750 0.2469 0.2367 2.27e-04 1bzf:A, 3dfr:A, 1dis:A, 1diu:A, 2hm9:A, 2hqp:A, 2lf1:A, 1lud:A
58 7myl:B 158 127 0.0600 0.2025 0.2520 4.94e-04 5ecc:A, 5ecc:B, 5ecx:A, 5ecx:B, 7myl:A, 7myl:C, 7myl:D, 7myl:E, 7myl:F, 7reg:A, 7reg:B, 7rgj:A, 7rgj:B
59 7ki9:A 166 80 0.0394 0.1265 0.2625 0.001 8f80:A, 8f81:A, 8f82:A, 8f83:A, 8f84:A, 8f85:A, 7k68:A, 7k69:A, 7k6a:A, 7ki8:A, 7km7:A, 7km8:A, 7km8:B, 7km9:A, 8ta0:A, 8ta1:A, 8tbr:A, 6uwq:A, 6uww:A
60 7l9t:A 156 28 0.0263 0.0897 0.5000 0.002 6cxm:A, 6cxm:B
61 8jto:A 343 192 0.0807 0.1254 0.2240 0.87
62 4p4o:A 306 75 0.0356 0.0621 0.2533 3.9 4p4m:A, 4p4p:A
63 7qe7:K 531 97 0.0525 0.0527 0.2887 5.2 5a31:J, 5a31:K, 5g04:J, 5g04:K, 5g05:J, 5g05:K, 9gaw:Q, 9gaw:K, 3hym:B, 3hym:D, 3hym:F, 3hym:H, 3hym:J, 3hym:L, 5lcw:J, 5lcw:K, 8pkp:Q, 8pkp:K, 6q6g:Q, 6q6g:K, 6q6h:Q, 6q6h:K, 7qe7:Q, 8s4g:Q, 8s4g:K, 6tlj:J, 6tlj:K, 6tm5:J, 6tm5:K, 6tnt:J, 6tnt:K, 4ui9:J, 4ui9:K
64 6sh3:A 376 130 0.0544 0.0771 0.2231 6.3 6sh3:B, 6sh3:C, 6sh3:D, 6sh3:E, 6sh3:F, 6sh3:G
65 8enl:C 382 98 0.0432 0.0602 0.2347 9.4

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218