Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
AWLASLKQTLGLLPADRKIRVLMLGLDNAGKTSILYRLHLGDVVTTNLETLQYKNISFEVWDLGGCYFSDTDAVIYVVDS
TDRDRMGVAKHELYALLDEDELRKSLLLIFANKQDLPDAASEAEIAEQLGVSSIMNRTWTIVKSSSKTGDGLVEGMDWLV
ERLREQ

The query sequence (length=166) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2x77:A 181 180 0.9940 0.9116 0.9167 3.26e-113 2x77:B
2 1upt:G 170 165 0.5361 0.5235 0.5394 3.93e-61 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
3 4y0v:A 165 163 0.5241 0.5273 0.5337 3.39e-58 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
4 5uf8:D 160 160 0.5181 0.5375 0.5375 9.26e-57
5 6pta:A 165 152 0.5000 0.5030 0.5461 2.49e-56 6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
6 1moz:A 178 163 0.4940 0.4607 0.5031 5.08e-56 8ezj:C, 8ezj:D, 1moz:B
7 8d4c:C 180 169 0.5181 0.4778 0.5089 5.18e-56 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
8 2k5u:A 181 167 0.5060 0.4641 0.5030 2.00e-55 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
9 3aq4:A 170 163 0.5060 0.4941 0.5153 9.39e-55 3aq4:B
10 3o47:A 289 161 0.5060 0.2907 0.5217 2.91e-54 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
11 3lrp:A 181 162 0.4699 0.4309 0.4815 4.54e-52
12 1z6x:A 175 166 0.4759 0.4514 0.4759 2.59e-49 1z6x:B
13 2b6h:A 171 160 0.4458 0.4327 0.4625 1.95e-48
14 6a8d:A 181 166 0.4578 0.4199 0.4578 2.69e-48
15 3lvq:E 420 165 0.4639 0.1833 0.4667 3.01e-48 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
16 6bbp:A 520 168 0.4639 0.1481 0.4583 9.58e-47 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
17 1zj6:A 173 156 0.4096 0.3931 0.4359 3.32e-42 2h16:A, 2h16:B, 2h16:C, 2h16:D, 2h17:A, 1z6y:A, 1z6y:B
18 1yzg:A 168 162 0.4036 0.3988 0.4136 5.41e-41
19 7rll:B 177 163 0.4096 0.3842 0.4172 2.00e-39 7rll:A
20 3doe:A 189 161 0.4277 0.3757 0.4410 5.44e-38 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
21 4v0l:A 168 166 0.3976 0.3929 0.3976 3.80e-37 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
22 5de3:A 166 160 0.4036 0.4036 0.4188 3.08e-36 5di3:A
23 4q66:C 134 150 0.4157 0.5149 0.4600 1.35e-34
24 4zi2:A 185 164 0.4036 0.3622 0.4085 3.63e-32 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
25 2h57:B 167 167 0.3554 0.3533 0.3533 2.05e-30 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
26 4bas:A 172 170 0.3675 0.3547 0.3588 2.67e-29
27 8oul:A 185 165 0.3253 0.2919 0.3273 2.29e-23 8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
28 8oun:A 181 170 0.3434 0.3149 0.3353 8.84e-23 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
29 5di3:B 204 166 0.3494 0.2843 0.3494 1.77e-22 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
30 4ile:A 176 163 0.2771 0.2614 0.2822 2.35e-20 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
31 6zga:C 168 164 0.3193 0.3155 0.3232 2.40e-19 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
32 8e0c:A 185 184 0.3253 0.2919 0.2935 3.68e-15 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
33 8e0a:A 168 132 0.2590 0.2560 0.3258 1.36e-14 8e0b:A
34 8e0h:A 179 136 0.2530 0.2346 0.3088 8.69e-12 8dzm:A, 8dzm:B, 8dzn:A, 8dzn:B, 8dzo:A, 8dzo:B, 8dzt:A, 8dzt:B, 8e0h:B, 2gao:A, 2gao:B
35 8xql:A 240 110 0.2229 0.1542 0.3364 6.20e-11
36 8fn0:B 212 118 0.2289 0.1792 0.3220 2.28e-10
37 1ek0:A 170 154 0.2108 0.2059 0.2273 9.89e-06
38 4q66:I 86 134 0.2711 0.5233 0.3358 1.70e-05
39 6vs4:A 223 122 0.1928 0.1435 0.2623 3.81e-05 6vs4:B
40 8unx:A 244 117 0.1928 0.1311 0.2735 9.53e-05 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
41 2il1:A 163 129 0.2108 0.2147 0.2713 6.84e-04
42 7obq:v 201 131 0.2530 0.2090 0.3206 0.001 2fh5:B, 6frk:v, 7nfx:v
43 2rhd:A 164 112 0.1687 0.1707 0.2500 0.002
44 7ezd:B 175 163 0.2410 0.2286 0.2454 0.016 7ezb:A, 7ezb:B, 7ezd:A, 7eze:A, 7eze:B
45 1z0j:A 169 130 0.2169 0.2130 0.2769 0.019 1yvd:A
46 3a1s:A 255 172 0.2590 0.1686 0.2500 0.028 3a1s:B, 3a1t:A, 3a1u:A, 3a1u:B
47 6s6d:C 284 65 0.1205 0.0704 0.3077 0.031
48 8pjk:A 222 123 0.1687 0.1261 0.2276 0.038 7e2x:A, 7e2z:A
49 6hh2:A 174 176 0.2711 0.2586 0.2557 0.051 8fo2:B
50 6ulg:G 310 88 0.1386 0.0742 0.2614 0.069 8dhb:A, 3llu:A, 6nzd:G, 2q3f:A, 2q3f:B, 6s6a:C, 6s6a:D, 6s6d:D, 6sb0:D, 6sb0:J, 6sb2:D, 6sb2:J, 7t3b:E, 7t3c:E, 6u62:C, 7ux2:C, 7ux2:J, 7uxc:E, 7uxc:L, 7uxh:G, 7uxh:N, 7uxh:W, 7uxh:d, 6wj2:G, 6wj3:G
51 1n6o:A 170 94 0.1325 0.1294 0.2340 0.098 7bl1:DDD, 1huq:A, 4kyi:B, 4kyi:D, 4kyi:F, 4kyi:H, 3mjh:A, 3mjh:C, 1n6h:A, 1n6i:A, 1n6k:A, 1n6l:A, 1n6n:A, 1n6p:A, 1n6r:A, 1r2q:A, 1tu3:A, 1tu3:B, 1tu3:C, 1tu3:D, 1tu3:E, 1tu4:A, 1tu4:B, 1tu4:C, 1tu4:D, 1z07:A, 1z0d:A, 1z0d:C
52 8fac:A 1377 141 0.1988 0.0240 0.2340 0.21 8e04:A
53 6l6o:A 165 121 0.1807 0.1818 0.2479 0.29 8jqu:A
54 6y09:A 176 87 0.1205 0.1136 0.2299 0.35 2g77:B, 6sur:A, 6sur:B, 6sur:C, 6sur:D, 6sur:E, 6sur:F, 6y09:B, 1z06:A, 6zay:A, 6zay:B
55 1x3s:A 177 166 0.2289 0.2147 0.2289 0.52
56 1d5c:A 162 122 0.1807 0.1852 0.2459 0.64
57 2fg5:A 165 122 0.1807 0.1818 0.2459 0.74
58 5szj:A 175 58 0.1024 0.0971 0.2931 0.91 5lpn:A, 5lpn:C
59 8ij9:A 168 158 0.1988 0.1964 0.2089 0.93 3bbp:A, 3bbp:B, 3bbp:C, 3cwz:A, 4dkx:A, 4dkx:B, 2e9s:A, 2e9s:B, 2e9s:C, 2fe4:A, 2ffq:A, 2gil:A, 2gil:B, 2gil:C, 2gil:D, 8ij9:B, 5lef:A, 5lef:B, 2y8e:A, 2y8e:B, 1yzq:A
60 7am2:BU 463 23 0.0783 0.0281 0.5652 0.96
61 8e05:A 1749 150 0.2048 0.0194 0.2267 1.1 8e05:B, 8e06:A
62 2zet:A 181 178 0.2048 0.1878 0.1910 1.4 2f7s:A, 2f7s:B, 2iey:A, 2iey:B, 2iez:A, 2iez:B, 2iez:H, 2iez:I, 2if0:A, 2if0:B, 2zet:B
63 4wnr:A 323 60 0.1265 0.0650 0.3500 1.5
64 3v00:C 353 86 0.1205 0.0567 0.2326 1.6 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
65 1u0l:A 278 93 0.1506 0.0899 0.2688 2.2 1u0l:B, 1u0l:C
66 3x3m:A 397 50 0.0843 0.0353 0.2800 2.3 5ebc:A, 3x3n:A
67 3w5j:A 194 69 0.1145 0.0979 0.2754 2.6
68 1ord:A 730 93 0.1687 0.0384 0.3011 2.7 1c4k:A, 1ord:B
69 3cnl:A 233 33 0.0843 0.0601 0.4242 3.0 3cnn:A, 3cno:A
70 8uhe:K 593 87 0.1566 0.0438 0.2989 3.2
71 1le8:A 53 43 0.0783 0.2453 0.3023 3.5 1akh:A, 1yrn:A
72 5c1s:A 288 22 0.0723 0.0417 0.5455 3.8 5c1s:B, 5c1t:A, 5c1t:B
73 8e3s:A 503 48 0.0904 0.0298 0.3125 3.8 8fzr:A
74 3m6a:A 496 94 0.1566 0.0524 0.2766 4.2 3m6a:B, 3m6a:C, 3m6a:D, 3m6a:E, 3m6a:F
75 6yxx:EA 532 24 0.0663 0.0207 0.4583 4.3 7aoi:XL, 6yxy:EA
76 3pqc:B 194 196 0.2771 0.2371 0.2347 4.4 3pqc:A
77 7szs:A 204 26 0.0843 0.0686 0.5385 4.5 7szs:B
78 4lhv:E 148 136 0.1747 0.1959 0.2132 5.0
79 3ref:B 180 59 0.0904 0.0833 0.2542 5.4 4dvg:A, 3ref:A, 3reg:A, 3reg:B
80 8ux2:B 240 68 0.1084 0.0750 0.2647 6.6 8hte:A, 8htf:A, 8ux2:A, 8ux2:C
81 7oi6:y 331 89 0.1687 0.0846 0.3146 6.8 8pk0:t
82 2zba:A 435 59 0.1024 0.0391 0.2881 7.2 2zba:B, 2zba:C
83 1ck1:A 239 63 0.1205 0.0837 0.3175 7.2 2aq2:B, 3bvg:A, 3bvm:A, 3bvz:A, 1cqv:A, 1i4p:A, 1i4q:A, 1i4r:A, 1i4x:A, 1ste:A, 1uns:A
84 1zbd:A 177 61 0.0964 0.0904 0.2623 9.2 3rab:A
85 7odt:t 316 124 0.2048 0.1076 0.2742 9.3
86 3oyz:A 376 52 0.1205 0.0532 0.3846 9.3
87 2gf9:A 176 67 0.1024 0.0966 0.2537 9.5

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218