BioLiP

>protein
AVTYYRLEEVAKRNTAEETWMVIHGRVYDITRFLSEHPGGEEVLLEQAGADATESFEDVGHSPDAREMLKQYYIGDVHPN
DLKP

The query sequence (length=84) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1awp:A	86	84	0.9762	0.9535	0.9762	2.08e-58	1awp:B, 1b5m:A, 1eue:A, 1eue:B, 4hil:A, 4hil:B, 1icc:C, 3mus:A
2	2i89:A	90	84	0.9167	0.8556	0.9167	8.77e-55	2i89:B, 2i89:C, 2i89:D, 1icc:A, 1icc:B, 1icc:D, 1lj0:A, 1lj0:B, 1lj0:C, 1lj0:D, 3mus:B
3	3ner:B	91	84	0.8452	0.7802	0.8452	3.59e-52	3ner:A
4	3ozz:B	82	81	0.7619	0.7805	0.7901	5.18e-45
5	2i96:A	108	81	0.6310	0.4907	0.6543	1.57e-37	4hin:A, 4hin:B, 4hin:C, 4hin:D, 2m33:A
6	1hko:A	104	81	0.6190	0.5000	0.6420	1.83e-37	1aqa:A, 1cyo:A, 1ehb:A, 1es1:A, 1f03:A, 1f04:A, 1i5u:A, 1ib7:A, 1j0q:A, 1jex:A, 1lqx:A, 1lr6:A, 1m20:A, 1m2i:A, 1m2m:A, 1m59:A, 1nx7:A, 1sh4:A, 1u9m:A, 1u9m:B, 1u9m:C, 1u9m:D, 1u9m:E, 1u9m:F, 1u9u:A, 3x32:A, 3x33:A, 3x34:A, 3x35:A
7	1aw3:A	94	80	0.6071	0.5426	0.6375	9.40e-36	1axx:A, 2axx:A, 1b5a:A, 1b5b:A, 1bfx:A, 1blv:A, 1do9:A, 1mny:A
8	2ibj:A	86	76	0.5952	0.5814	0.6579	4.31e-35
9	4b8n:B	90	71	0.3929	0.3667	0.4648	1.12e-16	4b8n:A, 4b8n:C, 4b8n:D
10	1cxy:A	81	77	0.3333	0.3457	0.3636	1.25e-14
11	1kbi:A	504	57	0.3452	0.0575	0.5088	9.15e-14	1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
12	3lf5:A	87	68	0.3095	0.2989	0.3824	1.31e-13	3lf5:B
13	1x3x:A	82	77	0.3929	0.4024	0.4286	1.33e-13	1x3x:B
14	7bwh:A	88	79	0.3333	0.3182	0.3544	2.15e-13
15	8tgb:A	108	75	0.3095	0.2407	0.3467	1.37e-12	8tgb:B
16	1sox:A	463	81	0.3690	0.0670	0.3827	4.33e-08	2a9a:A, 2a9a:B, 2a9b:A, 2a9c:A, 2a9c:B, 2a9d:A, 2a9d:B, 3hbp:A, 3hbq:A, 1sox:B
17	1mj4:A	79	78	0.2857	0.3038	0.3077	1.65e-06
18	6nzx:A	76	67	0.2619	0.2895	0.3284	0.002
19	6vz6:A	77	69	0.2619	0.2857	0.3188	0.026
20	4z71:B	163	66	0.2381	0.1227	0.3030	0.43	5kde:A, 5kdf:A, 1wcf:A, 4z70:A, 4z70:B, 4z70:C, 4z71:A, 4z71:C, 4z72:A, 4z73:A, 4z73:B, 4z73:C, 4z73:D, 4z73:F, 4z73:G, 4z73:E, 4z73:H, 4z73:I, 4z73:J, 4z73:K, 4z73:L, 4z74:A, 4z74:B, 4z74:C, 4z74:D, 4z74:F, 4z74:G, 4z74:E, 4z74:H, 4z74:I, 4z74:J, 4z74:K, 4z74:L
21	2is4:B	632	23	0.1310	0.0174	0.4783	1.2
22	2is6:A	654	23	0.1310	0.0168	0.4783	1.2	2is1:A, 2is1:B, 2is2:A, 2is2:B, 2is4:A, 2is6:B
23	6hyp:A	2272	45	0.1905	0.0070	0.3556	1.3
24	5jyx:B	109	36	0.1429	0.1101	0.3333	1.6	5jyx:A, 5jyx:E, 5jyx:C, 5jyx:J, 5jyx:D, 5jyx:H, 5jyx:F, 5jyx:O, 5jyx:G, 5jyx:L, 5jyx:I, 5jyx:K, 5jyx:M, 5jyx:N
25	7sc6:A	349	18	0.1071	0.0258	0.5000	3.2	7scq:A, 7scq:B
26	5t0w:A	229	28	0.1190	0.0437	0.3571	5.9	5t0w:B, 5t0w:C, 5t0w:D
27	5eqc:A	426	44	0.1905	0.0376	0.3636	6.5	5dj9:A, 5dj9:B, 5e3k:A, 5e3k:B, 5e5i:A, 5e5i:B, 5eqc:B, 4nog:A, 4nog:B, 4zlv:A, 4zlv:B, 4zwm:A, 4zwm:B
28	8ova:AC	208	50	0.1667	0.0673	0.2800	6.7	7ase:F, 5opt:f, 8ove:AC, 4v8m:AC
29	4jz6:A	484	55	0.2024	0.0351	0.3091	7.0

[Back]