BioLiP

>protein
AVTPSLKNFLGSLIAGATVLGGIALAITAVSKFDK

The query sequence (length=35) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6kaf:x	35	35	1.0000	1.0000	1.0000	9.95e-18	6kaf:X, 8kde:X, 8zee:X
2	7pi0:X	30	30	0.6286	0.7333	0.7333	2.48e-07	7pi0:x, 7pi5:X, 7pi5:x, 7pin:X, 7pin:X1, 7pin:x1, 7piw:X, 7piw:x, 7piw:x1, 7pnk:X, 7pnk:x
3	7vd5:X	37	34	0.5143	0.4865	0.5294	3.98e-06	6jlu:X, 6jlu:x, 7vd5:x
4	5xnl:X	39	33	0.4857	0.4359	0.5152	9.64e-05	5xnl:x
5	4il6:X	40	34	0.4571	0.4000	0.4706	0.001	3a0b:X, 3a0b:x, 5b5e:X, 5b5e:x, 5b66:X, 5b66:x, 7d1t:X, 7d1t:x, 7d1u:X, 7d1u:x, 6dhe:X, 6dhf:X, 6dhh:X, 6dho:X, 6dhp:X, 5e79:X, 5e7c:X, 5e7c:x, 7eda:X, 8ez5:X, 8ez5:x, 8f4d:X, 8f4d:x, 8f4e:X, 8f4f:X, 8f4f:x, 8f4g:X, 8f4h:X, 8f4i:X, 8f4i:x, 8f4j:X, 8f4j:x, 8f4k:X, 8gn0:x, 8gn1:x, 8gn2:x, 5h2f:X, 5h2f:x, 4il6:x, 8ir5:X, 8ir6:x, 8ir8:x, 8ira:X, 8irc:x, 8ird:x, 8ire:x, 8irf:x, 8iri:X, 8iri:x, 4ixr:X, 6jlj:X, 6jlj:x, 6jlk:X, 6jlk:x, 6jll:x, 6jlm:x, 6jln:X, 6jln:x, 6jlp:X, 6jlp:x, 5kaf:X, 5kai:X, 5kai:x, 3kzi:X, 5mx2:x, 4pbu:X, 4pbu:x, 7rf1:x, 7rf2:X, 7rf3:X, 7rf4:X, 7rf4:x, 7rf5:X, 7rf6:X, 7rf7:X, 7rf8:X, 7rf8:x, 4rvy:X, 4rvy:x, 5tis:x, 4ub6:X, 4ub8:X, 5v2c:X, 5v2c:x, 4v62:AX, 4v62:BX, 6w1o:X, 6w1o:x, 6w1p:X, 6w1r:X, 6w1t:X, 6w1u:X, 6w1v:X, 6w1v:x, 3wu2:X, 3wu2:x, 7yq2:X, 7yq2:x, 7yq7:x, 5zzn:x
6	7oui:X	36	34	0.4571	0.4444	0.4706	0.063	7oui:x
7	7n8o:X	38	19	0.3143	0.2895	0.5789	0.13	7n8o:x, 7rcv:X, 7rcv:x, 8tow:X, 8tow:x, 6wj6:X
8	3m83:A	325	20	0.3429	0.0369	0.6000	0.17	5jib:A, 5jib:B, 5jib:C, 5jib:D, 5jib:E, 5jib:F, 3m81:A, 3m81:C, 3m81:B, 3m81:D, 3m81:E, 3m81:F, 3m82:A, 3m82:C, 3m82:B, 3m82:D, 3m82:E, 3m82:F, 3m83:B, 3m83:C, 3m83:D, 3m83:E, 3m83:F
9	8wql:XD	40	19	0.2857	0.2500	0.5263	0.69	8wql:XE, 8wql:X1, 8wql:x1, 8wql:xD, 8wql:xE
10	6en3:A	934	28	0.3429	0.0128	0.4286	2.2	8a49:C, 4nuy:A, 4nuz:A
11	4esa:A	142	15	0.2571	0.0634	0.6000	2.5	4esa:C, 6rp5:A
12	6e67:B	476	24	0.3429	0.0252	0.5000	2.8	3d4s:A, 5d5a:A, 5d5b:A, 5d6l:A, 6e67:A, 3ny8:A, 3ny9:A, 3nya:A, 6oba:A, 3pds:A, 6prz:A, 6ps0:A, 6ps1:A, 6ps2:A, 6ps3:A, 6ps4:A, 6ps5:A, 6ps6:A, 2rh1:A, 5x7d:A
13	8xlp:x	36	35	0.4000	0.3889	0.4000	3.8	8xlp:X
14	8w1v:A	441	24	0.3429	0.0272	0.5000	4.2	8w1v:B
15	4lde:A	454	24	0.3429	0.0264	0.5000	4.7	7bz2:R, 7dhi:R, 7dhr:R, 4ekp:A, 4ekp:B, 4ekq:A, 4ekq:B, 4ekr:A, 4ekr:B, 4eks:A, 4eks:B, 4gbr:A, 8gdz:R, 8ge1:R, 8ge2:R, 8ge3:R, 8ge4:R, 8ge5:R, 8ge6:R, 8ge7:R, 8ge8:R, 8ge9:R, 8gea:R, 8geb:R, 8gec:R, 8ged:R, 8gee:R, 8gef:R, 8geg:R, 8geh:R, 8gei:R, 8gfv:R, 8gfw:R, 8gfx:R, 8gfy:R, 8gfz:R, 8gg0:R, 8gg1:R, 8gg2:R, 8gg3:R, 8gg4:R, 8gg5:R, 8gg6:R, 8gg7:R, 8gg8:R, 8gg9:R, 8gga:R, 8ggb:R, 8ggc:R, 8ggi:R, 8ggj:R, 8ggk:R, 8ggl:R, 8ggm:R, 8ggn:R, 8ggo:R, 8ggp:R, 8ggq:R, 8ggr:R, 8ggs:R, 8ggt:R, 8ggu:R, 8ggv:R, 8ggw:R, 8ggx:R, 8ggy:R, 8ggz:R, 8gh0:R, 8gh1:R, 4i7m:A, 4i7m:B, 4i7n:A, 4i7n:B, 4i7o:A, 4i7o:B, 4i7p:B, 4i7q:A, 4i7q:B, 4i7r:A, 4i7r:B, 4i7s:A, 4i7s:B, 4i7t:A, 4i7t:B, 5jqh:A, 5jqh:B, 4ldl:A, 4ldo:A, 6mxt:A, 6n48:A, 6ni3:R, 3p0g:A, 4qkx:A, 7sj6:A, 7sj6:B, 3sn6:R, 8unl:R, 8unm:R, 8unn:R, 8uno:R, 8unp:R, 8unq:R, 8unr:R, 8uns:R, 8unt:R, 8unu:R, 8unv:R, 8unw:R, 8unx:R, 8uny:R, 8unz:R, 8uo0:R, 8uo1:R, 8uo2:R, 7xk9:A, 7xka:A
16	8jj8:F	375	24	0.3429	0.0320	0.5000	4.8	8jjl:A, 8jjo:F
17	6wgc:D	436	31	0.3143	0.0252	0.3548	5.4	7tjf:D, 7tjh:D, 7tji:D, 7tjj:D, 7tjk:D, 6wgg:D, 6wgi:D
18	5v8f:D	456	31	0.3143	0.0241	0.3548	5.4	7mca:D, 6rqc:D, 5zr1:D
19	3x1b:A	500	38	0.4000	0.0280	0.3684	8.1	3x1b:B

[Back]