BioLiP

>protein
AVQYFQFYGYLSQQQNMMQDYVRTGTYQRAILQNHTDFKDKIVLDVGCGSGILSFFAAQAGARKIYAVEASTMAQHAEVL
VKSNNLTDRIVVIPGKVEEVSLPEQVDIIISEPMGYMLFNERMLESYLHAKKYLKPSGNMFPTIGDVHLAPFTDEQLYME
QFTKANFWYQPSFHGVDLSALRGAAVDEYFRQPVVDTFDIRILMAKSVKYTVNFLEAKEGDLHRIEIPFKFHMLHSGLVH
GLAFWFDVAFIGSIMTVWLSTAPTEPLTHWYQVRCLFQSPLFAKAGDTLSGTCLLIANKRQSYDISIVAQVDQTGSKSSN
LLDLKNPFFRYT

The query sequence (length=332) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7qrd:C	364	332	1.0000	0.9121	1.0000	0.0	6arj:A, 6arj:B, 6arj:C, 6arj:D, 6arv:A, 6arv:B, 6arv:C, 6arv:D, 3b3f:A, 3b3f:B, 3b3f:C, 3b3f:D, 6d2l:A, 6d2l:B, 6d2l:C, 6d2l:D, 6d2l:E, 6d2l:F, 6dvr:A, 6dvr:B, 5dwq:B, 5dwq:D, 5dwq:A, 5dwq:C, 5dx0:A, 5dx0:B, 5dx0:C, 5dx0:D, 5dx1:A, 5dx1:B, 5dx1:C, 5dx1:D, 5dx8:A, 5dx8:B, 5dx8:C, 5dx8:D, 5dxa:A, 5dxa:B, 5dxa:D, 5dxa:C, 5dxj:A, 5dxj:B, 5dxj:C, 5dxj:D, 7fai:A, 7fai:B, 7fai:C, 7fai:D, 7faj:A, 7faj:B, 7faj:C, 7faj:D, 8g2h:A, 8g2i:A, 5ih3:A, 5ih3:B, 5ih3:C, 5ih3:D, 4ikp:A, 4ikp:B, 4ikp:C, 4ikp:D, 5is6:A, 5is6:B, 5is6:C, 5is6:D, 5is7:A, 5is7:B, 5is7:C, 5is7:D, 5is8:A, 5is8:B, 5is8:D, 5is8:C, 5is9:A, 5is9:B, 5is9:C, 5is9:D, 5isa:C, 5isa:D, 5isa:A, 5isa:B, 5isb:A, 5isb:B, 5isb:C, 5isb:D, 5isc:A, 5isc:B, 5isc:C, 5isc:D, 5isd:A, 5isd:B, 5isd:C, 5isd:D, 5ise:A, 5ise:B, 5ise:C, 5ise:D, 5isf:A, 5isf:B, 5isf:C, 5isf:D, 5isg:A, 5isg:B, 5isg:C, 5isg:D, 5ish:A, 5ish:B, 5ish:C, 5ish:D, 5isi:A, 5isi:B, 5isi:C, 5isi:D, 6izq:A, 5k8v:A, 5k8v:B, 5k8v:C, 5k8v:D, 5k8w:A, 5k8w:B, 5k8w:C, 5k8w:D, 5k8x:A, 5k8x:B, 5k8x:C, 5k8x:D, 5lgp:A, 5lgp:B, 5lgp:C, 5lgp:D, 5lgq:B, 5lgq:A, 5lgq:C, 5lgq:D, 5lgr:A, 5lgr:B, 5lgr:C, 5lgr:D, 5lgs:A, 5lgs:B, 5lgs:C, 5lgs:D, 5lkj:A, 5lkj:B, 5lkj:C, 5lkj:D, 5lv2:A, 5lv2:B, 5lv2:C, 5lv2:D, 5lv2:E, 5lv2:F, 5lv2:G, 5lv2:H, 5lv3:A, 5lv3:B, 5lv3:C, 5lv3:D, 5ntc:A, 5ntc:B, 5ntc:C, 5ntc:D, 7okp:A, 7okp:B, 7okp:C, 7okp:D, 7os4:A, 7os4:B, 7os4:C, 7os4:D, 7ppq:A, 7ppq:B, 7ppq:C, 7ppq:D, 7ppy:A, 7ppy:B, 7ppy:C, 7ppy:D, 7pu8:A, 7pu8:B, 7pu8:C, 7pu8:D, 7puc:A, 7puc:B, 7puc:C, 7puc:D, 7puq:A, 7puq:B, 7puq:C, 7puq:D, 7pv6:A, 7pv6:B, 7pv6:C, 7pv6:D, 7qph:A, 7qph:D, 7qph:C, 7qph:B, 7qrd:A, 7qrd:B, 7qrd:D, 6s70:A, 6s70:B, 6s70:C, 6s70:D, 6s71:A, 6s71:B, 6s71:C, 6s71:D, 6s74:A, 6s74:B, 6s74:C, 6s74:D, 6s77:A, 6s77:B, 6s77:C, 6s77:D, 6s79:A, 6s79:B, 6s79:C, 6s79:D, 6s7a:A, 6s7a:B, 6s7a:C, 6s7a:D, 6s7b:A, 6s7b:B, 6s7b:C, 6s7b:D, 6s7c:A, 6s7c:B, 6s7c:C, 6s7c:D, 8sig:A, 8sih:A, 5tbh:A, 5tbh:B, 5tbh:C, 5tbh:D, 5tbi:A, 5tbi:B, 5tbi:C, 5tbi:D, 5tbj:A, 5tbj:B, 5tbj:C, 5tbj:D, 5u4x:A, 5u4x:B, 5u4x:C, 5u4x:D, 7u9i:A, 7u9i:B, 2v74:B, 2v74:D, 2v74:F, 2v74:H, 2y1w:A, 2y1w:B, 2y1w:C, 2y1w:D, 2y1x:A, 2y1x:D, 2y1x:B, 2y1x:C
2	6nt2:A	330	321	0.3404	0.3424	0.3520	3.11e-59	6nt2:D, 6nt2:B, 6nt2:C, 1or8:A, 1orh:A, 1ori:A, 3q7e:A
3	4y2h:B	352	306	0.3584	0.3381	0.3889	6.13e-59	4c03:A, 4c03:B, 4c04:A, 4c05:A, 4c07:A, 4c08:A, 5e8r:A, 5e8r:B, 5egs:A, 5egs:B, 5egs:C, 5egs:D, 5fqn:A, 5fqo:A, 4hc4:A, 5hzm:A, 5lv4:A, 5lv5:A, 7nr4:A, 7nr4:B, 7nr4:C, 7nr4:D, 7nud:A, 7nud:B, 7nue:A, 7nue:B, 7p2r:A, 7p2r:B, 6p7i:A, 6p7i:B, 6p7i:C, 6p7i:D, 4qpp:B, 4qpp:C, 4qpp:A, 4qqk:A, 6sq3:A, 6sq3:B, 6sq4:A, 6sq4:B, 6sqi:A, 6sqk:B, 6sqk:A, 6w6d:A, 6wad:A, 5wcf:A, 4y2h:A, 4y30:A, 4y30:B
4	5dst:C	317	317	0.3313	0.3470	0.3470	4.34e-57	5dst:A, 5dst:B, 5dst:D, 5dst:E, 5dst:F, 5dst:G, 5dst:H, 5dst:I, 5dst:J, 5dst:K, 5dst:L, 5dst:M, 5dst:N, 5dst:O, 4x41:A
5	6dnz:A	317	314	0.3675	0.3849	0.3885	2.39e-56	6dnz:C
6	3r0q:G	353	325	0.3614	0.3399	0.3692	2.67e-56	3r0q:C, 3r0q:A, 3r0q:E
7	1f3l:A	321	307	0.3464	0.3583	0.3746	3.16e-56	2fyt:A, 8g2f:A, 8g2g:A, 8g2g:B, 4hsg:A, 4qqn:A, 4ryl:A, 8shb:A, 8shr:A, 8sio:A, 8sio:B, 3smq:A
8	8pjd:A	347	306	0.3464	0.3314	0.3758	5.48e-56	8bva:A, 8c1j:A, 5ful:A, 5fwa:A, 5fwd:A, 5jmq:A
9	5fub:A	337	321	0.3163	0.3116	0.3271	2.46e-50	5g02:A
10	6cu5:A	314	301	0.3102	0.3280	0.3422	2.73e-50	6cu5:B, 8ft7:A, 8ft7:B
11	4lwp:B	342	308	0.2620	0.2544	0.2825	4.12e-27	4lwp:A
12	7rbq:A	614	130	0.1416	0.0765	0.3615	1.17e-13	7t39:A
13	4c4a:A	641	134	0.1446	0.0749	0.3582	8.32e-13	6ogn:A
14	5eku:B	347	147	0.1386	0.1326	0.3129	8.65e-13	5eku:A, 4m37:A, 4m38:A, 4m38:B
15	3wst:I	644	132	0.1235	0.0637	0.3106	7.19e-11	3wst:A, 3wst:D, 3wst:B, 3wst:C, 3wst:F, 3wst:E, 3wst:G, 3wst:H, 3wst:M, 3wst:N, 3wst:O, 3wst:P, 3wst:Q, 3wst:R, 3wst:J, 3wst:K, 3wst:L, 3x0d:A
16	4g56:A	617	155	0.1386	0.0746	0.2968	1.53e-08	4g56:C
17	7bo7:AAA	625	314	0.2139	0.1136	0.2261	4.17e-07	7boc:A, 5c9z:A, 6ckc:A, 8csg:A, 8ctb:A, 8cyi:A, 5emj:A, 5emk:A, 5eml:A, 5emm:A, 9eyu:A, 9eyv:A, 9eyw:A, 9eyx:A, 5fa5:A, 8g1u:A, 8g1u:E, 8g1u:I, 8g1u:M, 4gqb:A, 6k1s:A, 7kib:A, 7kic:A, 7kid:A, 7l1g:A, 7m05:A, 7m05:C, 7m05:E, 7m05:G, 7mx7:A, 7mxa:A, 7mxc:A, 7mxg:A, 7mxg:C, 7mxn:A, 6rll:A, 6rlq:A, 7s0u:A, 7s1p:A, 7s1q:A, 7s1r:A, 7s1s:A, 7ser:A, 7ses:A, 7u30:A, 7uoh:A, 6uxx:A, 6uxy:A, 7uy1:A, 7uyf:A, 6v0n:A, 6v0o:A, 6v0p:A, 8veo:A, 8vet:A, 8veu:A, 8vew:A, 8vex:A, 8vey:A, 4x60:A, 4x61:A, 4x63:A, 7zup:A, 7zuq:A, 7zuu:A, 7zuy:A, 7zv2:A, 7zvl:A, 7zvu:A
18	7wzg:B	243	114	0.0934	0.1276	0.2719	4.70e-06	7wzg:A, 7wzg:C, 7wzg:D, 7wzg:E, 7wzg:F
19	3t7s:A	246	103	0.0934	0.1260	0.3010	4.05e-04	3t7s:B, 3t7s:C, 3t7s:D, 3t7t:A, 3t7t:B, 3t7t:C, 3t7t:D
20	1wy7:D	204	78	0.0783	0.1275	0.3333	4.30e-04	1wy7:A, 1wy7:B, 1wy7:C
21	3sxj:A	245	102	0.0904	0.1224	0.2941	0.006	3sxj:B, 3t0i:A, 3t0i:B
22	3dlc:A	219	100	0.0843	0.1279	0.2800	0.007
23	7cta:A	329	112	0.0843	0.0851	0.2500	0.014	7ct9:A, 7ct9:B, 7cta:B
24	4rfq:A	270	55	0.0602	0.0741	0.3636	0.016
25	4qnu:A	323	137	0.0964	0.0991	0.2336	0.058	4qnu:B, 4qnu:C, 4qnu:D, 4qnu:E, 4qnu:F, 4qnu:G, 4qnu:H, 4qnv:A, 4qnv:B
26	6h2v:A	210	32	0.0422	0.0667	0.4375	0.064	6h2u:A, 6h2v:C
27	6mro:A	194	107	0.0783	0.1340	0.2430	0.084	8gdu:A
28	3kkz:A	256	117	0.0873	0.1133	0.2479	0.10	3kkz:B
29	5fad:A	160	112	0.0964	0.2000	0.2857	0.12	5fa8:A
30	1l3i:A	186	108	0.0873	0.1559	0.2685	0.13	1l3i:B, 1l3i:C, 1l3i:D, 1l3i:E, 1l3i:F
31	5z9o:A	373	104	0.0934	0.0831	0.2981	0.22	5z9o:B
32	1qzz:A	340	103	0.0873	0.0853	0.2816	0.30	1r00:A, 1xds:A, 1xds:B, 1xdu:A
33	1wzn:A	244	97	0.0813	0.1107	0.2784	0.35	1wzn:B, 1wzn:C
34	4qdk:A	219	119	0.1114	0.1689	0.3109	0.39	4qdj:A, 4qdk:B
35	3cjt:A	254	60	0.0572	0.0748	0.3167	0.52	3cjq:A, 3cjq:D, 3cjq:G, 3cjr:A, 3cjt:C, 3cjt:E, 3cjt:G, 3cjt:I, 3cjt:K, 3cjt:M, 3cjt:O, 3egv:A, 2nxe:A, 2nxe:B, 2zbp:A, 2zbq:A, 2zbr:A
36	3grr:A	263	31	0.0422	0.0532	0.4516	0.56	3gru:A, 3grv:A, 3gry:A
37	4kdr:A	208	22	0.0422	0.0673	0.6364	0.87	5dpm:A
38	4dcm:A	360	111	0.0693	0.0639	0.2072	1.2
39	3gcz:A	259	149	0.1175	0.1506	0.2617	1.5
40	5ikm:A	259	108	0.0873	0.1120	0.2685	1.5
41	1zpu:A	529	93	0.0813	0.0510	0.2903	1.8	1zpu:B, 1zpu:C, 1zpu:D, 1zpu:E, 1zpu:F
42	8pvr:B	509	90	0.0723	0.0472	0.2667	2.1	8pvr:A
43	2wa2:A	223	94	0.0753	0.1121	0.2660	2.3
44	5t64:A	406	167	0.1175	0.0961	0.2335	2.5	5t64:B, 5t67:A, 5t67:B, 5t6b:A, 5t6b:B, 5t6b:C, 5t6b:D
45	3per:A	477	66	0.0602	0.0419	0.3030	2.7	3per:B, 3pf7:A, 3pf7:B, 3pm5:A, 3pm5:B, 3pm5:C, 3pm5:D, 3q1g:A, 3q1g:B, 3q1g:C, 3q1g:D
46	8j43:A	285	42	0.0542	0.0632	0.4286	2.7	8j43:B
47	2wa2:B	259	72	0.0602	0.0772	0.2778	2.8
48	8gzp:A	854	72	0.0602	0.0234	0.2778	3.1	4c11:A, 5ccv:B, 5ccv:C, 5ccv:D, 5ccv:F, 5ccv:G, 5dto:A, 5f3t:A, 5f3z:A, 5f41:A, 8gzq:A, 4hhj:A, 5hmw:A, 5hmx:A, 5hmy:A, 5hmz:A, 5hn0:A, 5i3p:A, 5i3q:A, 5iq6:A, 6j00:A, 2j7u:A, 2j7w:A, 5jjr:A, 5jjs:A, 4v0q:A, 4v0r:A, 6xd0:A
49	8gzr:A	880	72	0.0602	0.0227	0.2778	3.5	8bcr:A, 8bcr:B, 4c11:B, 5ccv:E, 4ctj:A, 4ctj:C, 4ctk:A, 4ctk:C, 5cuq:A, 5cuq:B, 5e9q:A, 5e9q:C, 5ec8:A, 5ec8:C, 5ehg:A, 5ehg:C, 5ehi:A, 5ehi:C, 5eif:A, 5eif:C, 5eiw:A, 5eiw:C, 5ekx:A, 5ekx:B, 3p8z:A, 3p8z:C, 3p97:A, 3p97:C, 4r8s:A, 4r8s:B, 3vws:A, 2xbm:B, 2xbm:A, 2xbm:C, 2xbm:D, 6xd1:A
50	5ccv:H	767	72	0.0602	0.0261	0.2778	3.7
51	5ccv:A	849	72	0.0602	0.0236	0.2778	3.9	6h80:A, 6h9r:A, 6izz:A
52	7crc:B	1112	98	0.0873	0.0261	0.2959	3.9	7crc:A, 7crc:C, 7crc:D, 7xoz:A, 7xoz:B
53	7pd7:B	250	111	0.0843	0.1120	0.2523	4.1	7pd7:A, 7pd7:C, 7pd7:D
54	1ve3:B	226	128	0.0934	0.1372	0.2422	4.6	1ve3:A
55	7qcb:A	240	119	0.0843	0.1167	0.2353	5.2
56	6i7p:A	883	44	0.0572	0.0215	0.4318	5.3	5goz:A, 5goz:B, 5goz:C, 5gp1:A, 5gp1:B, 5gp1:C, 6i7p:B, 6i7p:C, 6i7p:D, 6i7p:E, 6i7p:F, 5kqr:A, 5kqs:A, 5m2x:A, 5m2x:B, 5m2x:C, 5m2x:D, 5m2x:E, 5m2x:F, 5m2z:A, 5m2z:C, 5m2z:B, 5m2z:D, 5m2z:E, 5m2z:F, 5m5b:A, 5m5b:B, 5mrk:A, 5mrk:B, 5nju:A, 5nju:B, 5njv:A, 5njv:B, 5njv:C, 5njv:D, 8pem:A, 5tfr:A, 5tfr:B, 5tmh:A, 5tmh:B, 5u0b:A, 5u0b:B, 5u0c:A, 5u0c:B, 5u0c:C, 5u0c:D, 5u0c:E, 5u0c:F, 5u0c:G, 5u0c:H, 5ulp:A, 5ulp:B, 6ux2:B, 5vim:A, 5vim:B, 6wcz:B, 5wxb:A, 5wz1:A, 5wz1:B, 5wz1:C, 5wz1:D, 5wz1:E, 5wz1:F, 5wz1:G, 5wz1:H, 5wz2:A, 5wz2:B, 5wz2:C
57	5djs:A	520	35	0.0361	0.0231	0.3429	5.3	5djs:B, 5djs:C, 5djs:D
58	4qpn:A	203	28	0.0331	0.0542	0.3929	5.3
59	6gkv:A	351	71	0.0693	0.0655	0.3239	5.5	6gkv:B, 6gky:A, 6gky:B, 6gkz:A, 6gkz:B, 6gkz:C, 6gkz:D
60	3gwz:A	339	68	0.0602	0.0590	0.2941	6.0	3gwz:D, 3gwz:C, 3gwz:B, 3gxo:A, 3gxo:D, 3gxo:C, 3gxo:B
61	3njr:A	184	72	0.0512	0.0924	0.2361	6.3	3njr:B
62	3ay0:B	314	78	0.0753	0.0796	0.3205	6.6	2yx1:B
63	2avn:A	247	180	0.1054	0.1417	0.1944	6.8	2avn:B
64	3dtn:A	220	134	0.0994	0.1500	0.2463	6.9	3dtn:B
65	2zzn:A	336	78	0.0753	0.0744	0.3205	6.9	3ay0:A, 2yx1:A, 2zzm:A, 2zzn:B
66	4lms:A	80	25	0.0331	0.1375	0.4400	7.4
67	1ecf:B	500	56	0.0542	0.0360	0.3214	7.6	6czf:A, 6czf:C, 6czf:B, 6czf:D, 1ecb:A, 1ecb:B, 1ecb:C, 1ecb:D, 1ecc:A, 1ecc:B, 1ecf:A, 1ecg:A, 1ecg:B, 1ecj:A, 1ecj:C, 6ott:A, 6ott:B, 8w7d:A, 8w7d:B, 8w7d:C, 8w7d:D
68	6sg9:F4	541	29	0.0331	0.0203	0.3793	8.1	6sgb:F4
69	4xhf:B	225	84	0.0572	0.0844	0.2262	8.4	4xhf:A, 4xhf:C, 4xhf:D
70	5iky:A	1048	41	0.0482	0.0153	0.3902	8.8	5ikz:A
71	3eld:A	277	32	0.0361	0.0433	0.3750	8.8	3elu:A, 3elw:A, 3ely:A, 3emb:A, 3emd:A
72	4mtl:B	219	35	0.0361	0.0548	0.3429	9.0	4mtl:A
73	6m1c:A	184	99	0.0843	0.1522	0.2828	9.9

[Back]