BioLiP

>protein
AVKYYTLEEIQKHNNSKSTWLILHYKVYDLTKFLEEHPGGEEVLRAQAGGDATANFEAVGHSTDARELSKTFIIGELHPD
DR

The query sequence (length=82) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1hko:A	104	82	0.9634	0.7596	0.9634	1.43e-55	1aqa:A, 1cyo:A, 1ehb:A, 1es1:A, 1f03:A, 1f04:A, 1i5u:A, 1ib7:A, 1j0q:A, 1jex:A, 1lqx:A, 1lr6:A, 1m20:A, 1m2i:A, 1m2m:A, 1m59:A, 1nx7:A, 1sh4:A, 1u9m:A, 1u9m:B, 1u9m:C, 1u9m:D, 1u9m:E, 1u9m:F, 1u9u:A, 3x32:A, 3x33:A, 3x34:A, 3x35:A
2	2i96:A	108	82	0.9268	0.7037	0.9268	2.09e-53	4hin:A, 4hin:B, 4hin:C, 4hin:D, 2m33:A
3	1aw3:A	94	81	0.8902	0.7766	0.9012	4.18e-51	1axx:A, 2axx:A, 1b5a:A, 1b5b:A, 1bfx:A, 1blv:A, 1do9:A, 1mny:A
4	3ozz:B	82	82	0.8171	0.8171	0.8171	9.54e-48
5	2i89:A	90	81	0.6829	0.6222	0.6914	9.77e-40	2i89:B, 2i89:C, 2i89:D, 1icc:A, 1icc:B, 1icc:D, 1lj0:A, 1lj0:B, 1lj0:C, 1lj0:D, 3mus:B
6	1awp:A	86	81	0.5732	0.5465	0.5802	2.48e-33	1awp:B, 1b5m:A, 1eue:A, 1eue:B, 4hil:A, 4hil:B, 1icc:C, 3mus:A
7	3ner:B	91	81	0.5854	0.5275	0.5926	1.15e-32	3ner:A
8	2ibj:A	86	81	0.5610	0.5349	0.5679	1.95e-29
9	4b8n:B	90	54	0.3171	0.2889	0.4815	6.73e-13	4b8n:A, 4b8n:C, 4b8n:D
10	1kbi:A	504	49	0.2927	0.0476	0.4898	6.97e-12	1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
11	1cxy:A	81	80	0.3049	0.3086	0.3125	1.97e-11
12	3lf5:A	87	72	0.2927	0.2759	0.3333	2.04e-11	3lf5:B
13	1x3x:A	82	66	0.3171	0.3171	0.3939	4.82e-11	1x3x:B
14	8tgb:A	108	76	0.2927	0.2222	0.3158	8.65e-11	8tgb:B
15	7bwh:A	88	79	0.3171	0.2955	0.3291	2.65e-10
16	1sox:A	463	80	0.3293	0.0583	0.3375	2.10e-07	2a9a:A, 2a9a:B, 2a9b:A, 2a9c:A, 2a9c:B, 2a9d:A, 2a9d:B, 3hbp:A, 3hbq:A, 1sox:B
17	1mj4:A	79	73	0.3049	0.3165	0.3425	3.38e-07
18	4cc5:A	308	48	0.2073	0.0552	0.3542	0.31	4cc6:A, 5fpo:A, 5fpr:A
19	1k6m:A	432	48	0.1463	0.0278	0.2500	1.5	1c7z:A, 1c7z:B, 1c80:A, 1c80:B, 1c81:A, 1fbt:A, 1fbt:B, 1k6m:B, 1tip:A, 1tip:B
20	6gyf:B	366	31	0.1829	0.0410	0.4839	2.3	6gye:A, 6gye:B, 6gyf:A, 6gzo:A, 6gzo:B
21	3t58:B	504	33	0.1341	0.0218	0.3333	2.3	4p2l:A, 4p2l:B, 3t58:A, 3t58:C, 3t58:D, 3t59:A, 3t59:B, 3t59:C, 3t59:D
22	2axn:A	451	50	0.1463	0.0266	0.2400	3.1	5ajv:B, 5ajw:A, 5ajx:A, 5ajy:A, 5ajz:A, 5ak0:A, 4d4j:A, 4d4k:A, 4d4l:A, 4d4m:A, 2dwo:A, 2dwp:A, 6etj:A, 6hvh:A, 6hvi:A, 6hvj:A, 2i1v:B, 6ibx:A, 6iby:A, 6ibz:A, 6ic0:A, 4ma4:A, 3qpu:A, 3qpv:A, 3qpw:A
23	5lvf:A	142	24	0.1341	0.0775	0.4583	3.9	2l0i:A, 5m9d:A
24	2vu4:A	148	35	0.1463	0.0811	0.3429	7.5
25	8jzd:A	166	36	0.1829	0.0904	0.4167	8.1	8jzd:C
26	4mby:A	277	22	0.1341	0.0397	0.5000	8.3	4mby:B, 4mby:C, 4mby:D, 4mby:E, 4mby:G, 4mby:I, 4mby:H, 4mby:J, 4mby:F, 4mbz:B, 4mbz:A, 4mbz:C, 4mbz:E, 4mbz:D, 4mbz:I, 4mbz:H, 4mbz:J, 4mbz:F
27	2dkc:A	536	42	0.1341	0.0205	0.2619	8.6	2dkc:B, 2dkd:A, 2dkd:B
28	7unj:A	218	17	0.0976	0.0367	0.4706	9.1	7unj:B
29	6y66:GGG	268	22	0.1341	0.0410	0.5000	10.0	6y66:AAA, 6y66:BBB, 6y66:CCC, 6y66:DDD, 6y66:EEE, 6y66:FFF, 6y66:HHH, 6y66:III, 6y66:JJJ

[Back]