BioLiP

>protein
AVKYYTLEEIQKHNNSKSTWLILHHKVYDLTKFLEEHPGGEEVLREQAGGDATENFEDVGHSTDARELSKTFIIGELHPD
DRSKIAK

The query sequence (length=87) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1hko:A	104	87	0.9770	0.8173	0.9770	4.77e-60	1aqa:A, 1cyo:A, 1ehb:A, 1es1:A, 1f03:A, 1f04:A, 1i5u:A, 1ib7:A, 1j0q:A, 1jex:A, 1lqx:A, 1lr6:A, 1m20:A, 1m2i:A, 1m2m:A, 1m59:A, 1nx7:A, 1sh4:A, 1u9m:A, 1u9m:B, 1u9m:C, 1u9m:D, 1u9m:E, 1u9m:F, 1u9u:A, 3x32:A, 3x33:A, 3x34:A, 3x35:A
2	2i96:A	108	87	0.9425	0.7593	0.9425	4.36e-58	4hin:A, 4hin:B, 4hin:C, 4hin:D, 2m33:A
3	1aw3:A	94	86	0.9425	0.8723	0.9535	1.40e-57	1axx:A, 2axx:A, 1b5a:A, 1b5b:A, 1bfx:A, 1blv:A, 1do9:A, 1mny:A
4	3ozz:B	82	82	0.7931	0.8415	0.8415	9.68e-50
5	2i89:A	90	81	0.6782	0.6556	0.7284	9.48e-43	2i89:B, 2i89:C, 2i89:D, 1icc:A, 1icc:B, 1icc:D, 1lj0:A, 1lj0:B, 1lj0:C, 1lj0:D, 3mus:B
6	1awp:A	86	81	0.5747	0.5814	0.6173	2.00e-36	1awp:B, 1b5m:A, 1eue:A, 1eue:B, 4hil:A, 4hil:B, 1icc:C, 3mus:A
7	3ner:B	91	81	0.5862	0.5604	0.6296	1.16e-35	3ner:A
8	2ibj:A	86	82	0.5747	0.5814	0.6098	3.21e-33
9	4b8n:B	90	74	0.3563	0.3444	0.4189	8.48e-14	4b8n:A, 4b8n:C, 4b8n:D
10	3lf5:A	87	72	0.2874	0.2874	0.3472	1.54e-12	3lf5:B
11	1cxy:A	81	80	0.2989	0.3210	0.3250	3.78e-12
12	1kbi:A	504	51	0.2644	0.0456	0.4510	1.03e-11	1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
13	1x3x:A	82	66	0.2989	0.3171	0.3939	9.79e-11	1x3x:B
14	8tgb:A	108	76	0.2644	0.2130	0.3026	1.37e-10	8tgb:B
15	7bwh:A	88	84	0.3103	0.3068	0.3214	2.23e-10
16	1sox:A	463	81	0.3333	0.0626	0.3580	4.99e-07	2a9a:A, 2a9a:B, 2a9b:A, 2a9c:A, 2a9c:B, 2a9d:A, 2a9d:B, 3hbp:A, 3hbq:A, 1sox:B
17	1mj4:A	79	73	0.2759	0.3038	0.3288	3.44e-06
18	3ats:A	352	27	0.1264	0.0312	0.4074	2.9	3att:A
19	2d2c:D	168	24	0.1264	0.0655	0.4583	5.1	2d2c:Q, 2e74:D, 2e75:D, 2e76:D, 4h0l:D, 4h13:D, 4i7z:D, 4pv1:D, 1vf5:D, 1vf5:Q
20	4cc5:A	308	48	0.1839	0.0519	0.3333	6.4	4cc6:A, 5fpo:A, 5fpr:A
21	8dyu:A	2562	29	0.1264	0.0043	0.3793	6.8	8dyv:A
22	8fcy:A	2864	29	0.1264	0.0038	0.3793	7.0	8fd6:A, 8fdt:A
23	8pqw:A	2892	29	0.1264	0.0038	0.3793	7.2	8pqy:A, 8pqz:A, 8pqz:J
24	5nug:A	2920	29	0.1264	0.0038	0.3793	7.4	5nug:B
25	1k6m:A	432	48	0.1379	0.0278	0.2500	7.8	1c7z:A, 1c7z:B, 1c80:A, 1c80:B, 1c81:A, 1fbt:A, 1fbt:B, 1k6m:B, 1tip:A, 1tip:B
26	7z8g:A	3047	29	0.1264	0.0036	0.3793	7.9	8fdu:A, 7z8l:f
27	8ptk:f	4502	29	0.1264	0.0024	0.3793	9.4	8ptk:e
28	1p5j:A	319	27	0.1264	0.0345	0.4074	9.4
29	7z8f:e	4579	29	0.1264	0.0024	0.3793	9.9	5owo:A, 8pr2:f, 8ptk:m, 8ptk:n, 7z8f:f, 7z8f:m, 7z8f:n, 7z8h:A

[Back]