BioLiP

>protein
AVEKLTVSGNQILAGGENTSFAGPSLFWSNTGWGAEKFYTAETVAKAKTEFNATLIRAAIGHGTSTGGSLNFDWEGNMSR
LDTVVNAAIAEDMYVIIDFHSHEAHTDQATAVRFFEDVATKYGQYDNVIYEIYNEPLQISWVNDIKPYAETVIDKIRAID
PDNLIVVGTPTWSQDVDVASQNPIDRANIAYTLHFYAGTHGQSYRNKAQTALDNGIALFATEWGTVNADGNGGVNINETD
AWMAFFKTNNISHANWALNDKNEGASLFTPGGSWNSLTSSGSKVKEIIQGW

The query sequence (length=291) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1tvp:B	291	291	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	1egz:A	291	291	0.6495	0.6495	0.6495	2.30e-133	1egz:B, 1egz:C
3	8c10:A	297	296	0.6289	0.6162	0.6182	4.59e-124
4	8bqa:AAA	298	297	0.6289	0.6141	0.6162	1.93e-122
5	1e5j:A	302	264	0.3814	0.3675	0.4205	1.33e-59	2a3h:A, 3a3h:A, 4a3h:A, 5a3h:A, 6a3h:A, 8a3h:A, 1h11:A, 1h2j:A, 1h5v:A, 1hf6:A, 1ocq:A, 1qhz:A, 1qi0:A, 1qi2:A, 2v38:A, 1w3k:A, 1w3l:A
6	3pzt:B	296	298	0.4055	0.3986	0.3960	1.59e-59	3pzt:A
7	5i2u:B	297	290	0.3746	0.3670	0.3759	1.47e-58	5i2u:A
8	4xzw:A	305	259	0.3643	0.3475	0.4093	2.10e-58
9	1g0c:A	358	254	0.3265	0.2654	0.3740	6.03e-43
10	5ecu:A	350	202	0.2543	0.2114	0.3663	2.69e-39
11	2cks:B	306	233	0.2680	0.2549	0.3348	2.58e-33	2ckr:B, 2ckr:A, 2cks:A
12	4hu0:A	330	227	0.2234	0.1970	0.2863	5.11e-12
13	8bqb:A	331	181	0.1787	0.1571	0.2873	1.79e-10	8bqb:B, 8bqb:C
14	3nco:A	313	129	0.1271	0.1182	0.2868	1.01e-09	3nco:B, 3rjy:A
15	6ujf:A	301	129	0.1134	0.1096	0.2558	2.78e-09
16	5a8m:A	337	185	0.1684	0.1454	0.2649	2.57e-06	5a8m:B, 5a8m:C, 5a8n:A, 5a8o:A, 5a8p:A, 5a8q:A, 5a94:A, 5a94:B, 5a94:C, 5a94:D, 5a94:E, 5a94:F, 5a95:A, 5a95:B, 5a95:C
17	6wqp:B	354	185	0.1615	0.1328	0.2541	7.76e-06	6wqv:A, 6wqv:B, 6wqv:C, 6wqv:D
18	3amg:A	311	128	0.1100	0.1029	0.2500	5.60e-05	3aof:B, 3aof:A, 3azr:A, 3azr:B, 3azs:A, 3azs:B, 3azt:A, 3azt:D, 3mmw:A, 3mmw:B, 3mmw:C, 3mmw:D
19	3amg:B	291	128	0.1100	0.1100	0.2500	6.16e-05
20	5h4r:A	375	179	0.1615	0.1253	0.2626	6.71e-04
21	3ndz:A	345	147	0.1271	0.1072	0.2517	7.66e-04	3ndz:C, 3ndz:B, 3ndz:D
22	4yzt:A	512	149	0.1168	0.0664	0.2282	0.003
23	7vt5:A	311	132	0.1065	0.0997	0.2348	0.005	7vt6:A, 7vt7:A
24	4w88:B	340	247	0.2096	0.1794	0.2470	0.006	4w86:A, 4w86:B, 4w87:A, 4w87:B, 4w88:A, 4w89:A, 4w89:B
25	2whl:A	294	205	0.1718	0.1701	0.2439	0.009
26	5d8z:A	324	95	0.0859	0.0772	0.2632	0.064	5d8z:B
27	4u5k:A	304	125	0.0825	0.0789	0.1920	0.16	4u5i:A, 4u5i:B, 4u5k:B
28	4v2x:A	534	119	0.1031	0.0562	0.2521	0.19
29	2man:A	298	175	0.1340	0.1309	0.2229	0.21	3man:A
30	4w7v:A	313	105	0.0859	0.0799	0.2381	0.38	4w7w:A
31	6gl0:A	331	69	0.0619	0.0544	0.2609	0.57	6gl0:B, 6gl0:C
32	5g56:A	707	85	0.0687	0.0283	0.2353	0.69	5la0:A, 5la1:A, 5la2:A, 5la2:B, 2y8k:A
33	4tuf:A	346	81	0.0790	0.0665	0.2840	0.76	4tuf:B, 4tuf:C, 4tuf:D
34	7aor:e	810	72	0.0653	0.0235	0.2639	1.8
35	4fk9:A	314	219	0.1787	0.1656	0.2374	2.3
36	5d9n:A	349	123	0.1031	0.0860	0.2439	2.6	5d9m:A, 5d9m:B, 5d9n:B, 5d9o:A, 5d9o:B, 5d9p:A, 5d9p:B
37	4y7e:A	302	135	0.1134	0.1093	0.2444	3.7	4y7e:B
38	1wky:A	446	170	0.1306	0.0852	0.2235	4.2
39	7ec9:A	323	162	0.1306	0.1176	0.2346	5.2	7ec9:B
40	1cen:A	334	134	0.0962	0.0838	0.2090	6.3
41	5uly:C	221	52	0.0550	0.0724	0.3077	8.4	5uly:B
42	4rya:A	417	97	0.0928	0.0647	0.2784	8.5
43	3nx3:A	388	30	0.0344	0.0258	0.3333	9.6

[Back]