BioLiP

>protein
AVEAHPMKGGDDSHSYSQNSCYQKGVIDAAKAVIVEAVNEKLDLENNPIFDPIKPFRIADFGCSTGPNTFHAMQNIVESV
ETKYKSLQKTPEFHVFFNDHVNNDFNVLFRSLPPNREFFAAGVPGSFYTRVFPKNSIHFAHCSYALHWLSKVPKEIQDKN
SLAYNKGRIHYTGTEKHVVKAYFGQFQRDFEGFLKARAQEIVVGGLMVIQIPGLPSGEVLFSRTGAGLLHFLLGTSLMEL
VNKGIINEESVDSFNLPQYHPSVEDLEMVIEMNDCFTIERVGTLPHPMKNLPFDVQRTSLQVRAIMECILTEHFGENILD
PLFEIYTKNLQENFHVFDKEIRKDADLYLVLKRKGN

The query sequence (length=356) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6c8r:A	358	355	0.9972	0.9916	1.0000	0.0	6c8r:B, 6c8s:A, 6c8s:B
2	1m6e:X	359	370	0.3736	0.3705	0.3595	3.35e-64
3	6lyh:A	358	361	0.3511	0.3492	0.3463	2.50e-62	6lyh:B, 6lyh:C, 6lyh:D, 6lyh:E, 6lyh:F, 6lyh:G, 6lyh:H
4	8t2g:A	333	316	0.3006	0.3213	0.3386	1.56e-59	8t2g:B, 8uzd:A, 8uzd:B
5	3b5i:A	344	292	0.3090	0.3198	0.3767	4.32e-58	3b5i:B
6	2eg5:E	346	333	0.3174	0.3266	0.3393	9.05e-50	2eg5:A, 2eg5:C, 2eg5:G
7	2efj:A	348	339	0.3287	0.3362	0.3451	9.47e-48
8	5f2k:A	358	290	0.2079	0.2067	0.2552	3.91e-19	5f2k:B, 5f2n:A, 5f2n:B, 5f2o:A, 5f2o:B
9	2ozn:B	131	40	0.0449	0.1221	0.4000	0.55
10	3ke5:A	182	79	0.0674	0.1319	0.3038	1.5	3ke5:C, 3ke5:B
11	3srk:B	405	33	0.0337	0.0296	0.3636	1.7	3qv7:B, 3qv8:A
12	3hqp:A	498	33	0.0337	0.0241	0.3636	2.1	3hqo:K, 3hqo:A, 3hqo:B, 3hqo:C, 3hqp:B, 3hqp:C, 3hqp:D, 3hqp:E, 3hqp:F, 3hqp:G, 3hqp:H, 3hqp:I, 3hqp:J, 3hqp:K, 3hqp:L, 3hqp:M, 3hqp:N, 3hqp:O, 3hqp:P, 3hqq:A, 3hqq:B, 3hqq:C, 3hqq:D, 3hqq:E, 3hqq:F, 3hqq:G, 3hqq:H, 3hqq:I, 3hqq:J, 3hqq:K, 3hqq:L, 3hqq:M, 3hqq:N, 3hqq:O, 3hqq:P, 3hqq:Q, 3hqq:R, 3hqq:S, 3hqq:T, 3hqq:U, 3hqq:V, 3hqq:W, 3hqq:X, 3pp7:B, 3qv6:A, 3qv7:D, 3qv7:A, 3qv8:D, 3srk:A
13	6i1s:A	322	33	0.0365	0.0404	0.3939	4.4	7a21:A, 7a21:B, 6acr:A, 6acr:B, 4bgg:A, 4bgg:B, 4bgg:C, 4bgg:D, 4c02:A, 7c3g:A, 7c3g:B, 8c7w:A, 8c7z:A, 4dym:A, 6eix:A, 6gi6:A, 6gin:A, 6gin:B, 6gip:A, 3h9r:A, 6jux:A, 3mtf:A, 3mtf:B, 7nns:B, 3oom:A, 5oxg:A, 5oxg:B, 5oxg:C, 5oxg:D, 5oy6:A, 5oy6:B, 5oy6:C, 5oy6:D, 8pod:A, 3q4u:A, 3q4u:B, 3q4u:C, 3q4u:D, 8r7g:A, 8r7g:B, 8r7g:C, 8r7g:D, 5s75:A, 5s75:B, 5s76:A, 5s76:B, 5s77:A, 5s77:B, 5s78:A, 5s78:B, 5s79:A, 5s79:B, 5s7a:A, 5s7a:B, 5s7b:A, 5s7b:B, 5s7c:A, 5s7c:B, 5s7d:A, 5s7d:B, 5s7e:A, 5s7e:B, 5s7f:A, 5s7f:B, 5s7g:A, 5s7g:B, 5s7h:A, 5s7h:B, 5s7i:A, 5s7i:B, 5s7j:A, 5s7j:B, 5s7k:A, 5s7k:B, 5s7l:A, 5s7l:B, 5s7m:A, 5s7m:B, 5s7n:A, 5s7n:B, 5s7o:A, 5s7o:B, 5s7p:A, 5s7p:B, 5s7q:A, 5s7q:B, 5s7r:A, 5s7r:B, 5s7s:A, 5s7s:B, 5s7t:A, 5s7t:B, 5s7u:A, 5s7u:B, 5s7v:A, 5s7v:B, 5s7w:A, 5s7w:B, 5s7x:A, 5s7x:B, 5s7y:A, 5s7y:B, 5s7z:A, 5s7z:B, 5s80:A, 5s80:B, 5s81:A, 5s81:B, 5s82:A, 5s82:B, 5s83:A, 5s83:B, 5s84:A, 5s84:B, 5s85:A, 5s85:B, 5s86:A, 5s86:B, 5s87:A, 5s87:B, 5s88:A, 5s88:B, 5s89:A, 5s89:B, 5s8a:A, 5s8a:B, 5s8b:A, 5s8b:B, 5s9k:A, 5s9k:B, 6srh:A, 6srh:B, 6szm:A, 6szm:B, 6t6d:A, 6t6d:B, 6t6d:C, 6t6d:D, 6t8n:A, 6t8n:B, 6tn8:A, 6unq:A, 6unr:A, 6uns:A, 6uns:B, 6z36:A, 6z36:B, 6zgc:A, 6zgc:B, 6zgc:C, 6zgc:D
14	7mqa:SP	2485	86	0.0562	0.0080	0.2326	5.0
15	2nnu:A	201	67	0.0449	0.0796	0.2388	5.2
16	7mq8:SP	1993	86	0.0562	0.0100	0.2326	5.4	7mq9:SP
17	6egu:C	444	55	0.0393	0.0315	0.2545	6.2	6egu:A, 6egu:B, 4hj1:A
18	7wb0:A	797	48	0.0393	0.0176	0.2917	7.3
19	2io9:B	603	38	0.0449	0.0265	0.4211	7.5	3a2y:A, 2io7:A, 2io7:B, 2io8:A, 2io8:B, 2io9:A, 2ioa:A, 2ioa:B, 3o98:A, 3o98:B
20	7yb2:D	264	137	0.0871	0.1174	0.2263	8.7	8hfj:A, 8hfj:B, 8hfj:C, 8hfj:D, 8hfk:A, 8hfk:B, 8hfk:C, 8hfk:D, 7yb1:D, 7yb1:A, 7yb1:B, 7yb1:C, 7yb2:A, 7yb2:B, 7yb2:C
21	7kl6:A	147	151	0.1096	0.2653	0.2583	8.8
22	8fja:E	214	34	0.0309	0.0514	0.3235	8.9
23	8fia:A	1772	73	0.0590	0.0119	0.2877	9.0

[Back]