Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AVDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQE

The query sequence (length=55) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2mny:A 55 55 1.0000 1.0000 1.0000 1.62e-35 2mnz:A
2 7klo:A 59 54 0.8364 0.7797 0.8519 1.08e-30 7klr:A
3 2e6r:A 92 54 0.5636 0.3370 0.5741 1.04e-21
4 2miq:A 94 51 0.5636 0.3298 0.6078 1.84e-21
5 4q6f:A 56 55 0.4727 0.4643 0.4727 8.75e-14 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
6 5vab:A 54 51 0.4909 0.5000 0.5294 3.80e-13
7 6fhq:A 58 48 0.4364 0.4138 0.5000 3.90e-13 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
8 1f62:A 51 45 0.3818 0.4118 0.4667 1.21e-12
9 6ryr:W 708 45 0.4000 0.0311 0.4889 3.97e-12 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
10 5szb:A 115 50 0.4000 0.1913 0.4400 9.12e-12 5i3l:A, 5i3l:B, 2kwj:A, 2kwk:A, 2kwn:A, 2kwo:A, 5szc:A
11 5b79:A 118 51 0.3818 0.1780 0.4118 5.13e-11 5vdc:A
12 9atn:A 98 49 0.3455 0.1939 0.3878 1.74e-10
13 9atn:A 98 45 0.2545 0.1429 0.3111 0.032
14 2ysm:A 111 46 0.3636 0.1802 0.4348 3.51e-10
15 2ysm:A 111 45 0.2545 0.1261 0.3111 0.024
16 4gy5:A 215 47 0.4364 0.1116 0.5106 4.38e-10 3ask:A, 3ask:B, 3ask:D, 3asl:A, 3db3:A, 7fb7:B, 4gy5:B, 6iiw:A, 2lgg:A, 2lgk:A, 2lgl:A, 4qqd:A, 4qqd:B, 3shb:A, 3sou:A, 3sou:B, 3sow:A, 3sow:B, 3sox:A, 3sox:B, 3t6r:B, 3t6r:A, 8wms:A, 5xpi:A, 5yy9:A, 5yy9:B, 3zvy:A, 3zvy:B, 3zvz:B
17 2ke1:A 66 46 0.3818 0.3182 0.4565 7.42e-10 2kft:A, 1xwh:A
18 1mm3:A 61 48 0.4000 0.3607 0.4583 4.17e-09
19 2puy:B 60 46 0.3818 0.3500 0.4565 5.25e-09 2puy:A
20 8hxx:N 375 45 0.3455 0.0507 0.4222 7.28e-09 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
21 8ihn:M 357 45 0.3455 0.0532 0.4222 1.11e-08 8kd4:E
22 2yql:A 56 46 0.3818 0.3750 0.4565 1.25e-08
23 8kd6:E 301 45 0.3455 0.0631 0.4222 1.90e-08 8kd2:E
24 7yi2:D 321 45 0.3455 0.0592 0.4222 1.98e-08 7yi0:D, 7yi3:D, 7yi4:D, 7yi5:D
25 6q3m:C 219 48 0.4000 0.1005 0.4583 2.07e-08 6q3m:A, 6q3m:B
26 7xga:A 126 47 0.3818 0.1667 0.4468 2.38e-08 6vfo:A
27 6guu:B 204 46 0.4000 0.1078 0.4783 2.62e-08 6guu:A
28 2e6s:A 77 46 0.3818 0.2727 0.4565 2.90e-08
29 2l5u:A 61 45 0.3273 0.2951 0.4000 5.81e-07
30 7yi0:F 120 45 0.3455 0.1583 0.4222 6.96e-07
31 6oie:B 111 40 0.3273 0.1622 0.4500 8.40e-07 6oie:A, 5u2j:B, 5u2j:A
32 4tvr:A 222 45 0.3636 0.0901 0.4444 1.33e-06
33 4lk9:A 126 44 0.3273 0.1429 0.4091 1.50e-06 5b75:A, 5b76:A, 5b77:A, 5b78:A, 4ljn:A, 4lka:A, 4llb:A, 4llb:B, 2ln0:A, 6lsb:A, 3v43:A
34 8w9c:F 156 45 0.3455 0.1218 0.4222 1.67e-06 8hxx:P, 8hy0:P, 8jho:P, 8w9d:F, 8w9e:F, 8w9f:F
35 5hh7:A 192 48 0.3455 0.0990 0.3958 2.35e-05
36 3u5m:E 173 45 0.3273 0.1040 0.4000 2.52e-04
37 3u5o:C 195 45 0.3273 0.0923 0.4000 2.96e-04 8bd8:A, 8bd9:A, 8bdy:A, 5mr8:A, 3u5m:A, 3u5m:B, 3u5m:C, 3u5m:D, 3u5m:F, 3u5m:G, 3u5m:H, 3u5m:I, 3u5m:K, 3u5m:J, 3u5m:L, 3u5n:A, 3u5n:B, 3u5o:A, 3u5o:B, 3u5o:D, 3u5o:E, 3u5o:F, 3u5o:G, 3u5o:H, 3u5p:A, 3u5p:B, 3u5p:C, 3u5p:D, 3u5p:E, 3u5p:F, 3u5p:G, 3u5p:H, 7zdd:A
38 8bpb:C 126 47 0.3273 0.1429 0.3830 3.21e-04 8bpc:C
39 8bpa:C 213 49 0.3273 0.0845 0.3673 3.80e-04 8c60:C
40 8bpa:C 213 48 0.3273 0.0845 0.3750 0.005 8c60:C
41 5b73:A 313 47 0.3273 0.0575 0.3830 6.04e-04 4cos:A, 7cwh:B, 5y1z:C, 5y1z:D
42 7ebk:A 183 45 0.3273 0.0984 0.4000 0.001 7ebj:A
43 1fp0:A 88 46 0.2909 0.1818 0.3478 0.001
44 3o36:A 184 45 0.2909 0.0870 0.3556 0.001 7b9x:A, 5h1t:A, 5h1t:B, 5h1t:C, 5h1t:D, 5h1u:B, 5h1u:A, 5h1u:C, 5h1u:D, 5h1v:A, 5h1v:B, 3o33:A, 3o33:B, 3o33:C, 3o33:D, 3o34:A, 3o35:B, 3o35:A, 3o36:B, 3o37:A, 3o37:B, 3o37:C, 3o37:D, 4yab:A, 4yab:B, 4yad:A, 4yad:B, 4yat:A, 4yat:B, 4yax:A, 4yax:B, 4ybm:A, 4ybm:B, 4ybs:A, 4ybt:A, 4yc9:A, 4zql:A, 4zql:B
45 2ro1:A 189 46 0.2909 0.0847 0.3478 0.001
46 2k16:A 75 51 0.2909 0.2133 0.3137 0.001 5c13:A, 5c13:C, 5c13:E, 5c13:G, 2k17:A, 5wxg:A, 5wxh:C, 5wxh:A, 5xmy:A, 5xmy:C
47 6ieu:A 170 48 0.3091 0.1000 0.3542 0.002 6iet:A
48 2l43:A 80 49 0.3091 0.2125 0.3469 0.003 2ku3:A
49 8i02:F 235 35 0.2727 0.0638 0.4286 0.005
50 4ptb:A 178 43 0.2909 0.0899 0.3721 0.007 5fb0:A, 5fb0:C, 5fb1:A, 6g5n:A, 6g5n:B, 6g5p:A, 6g5p:B, 4ptb:B, 5pwc:A, 5pwc:B, 5pwd:A, 5pwd:B, 5pwe:A, 5pwe:B, 5pwf:A, 5pwf:B, 5pwg:A, 5pwg:B, 5pwh:A, 5pwh:B, 5pwi:A, 5pwi:B, 5pwj:A, 5pwj:B, 5pwk:A, 5pwk:B, 5pwl:A, 5pwl:B, 5pwm:A, 5pwm:B, 5pwn:A, 5pwn:B, 5pwo:A, 5pwo:B, 5pwp:A, 5pwp:B, 5pwq:A, 5pwq:B, 5pwr:A, 5pwr:B, 5pws:A, 5pws:B, 5pwt:A, 5pwt:B, 5pwu:A, 5pwu:B, 5pwv:A, 5pwv:B, 5pww:A, 5pww:B, 5pwx:A, 5pwx:B, 5pwy:A, 5pwy:B, 5pwz:A, 5pwz:B, 5px0:A, 5px0:B, 5px1:A, 5px1:B, 5px2:A, 5px2:B, 5px3:A, 5px3:B, 5px4:A, 5px4:B, 5px5:A, 5px5:B, 5px6:A, 5px6:B, 5px7:A, 5px7:B, 5px8:A, 5px8:B, 5px9:A, 5px9:B, 5pxa:A, 5pxa:B, 5pxb:A, 5pxb:B, 5pxc:A, 5pxc:B, 5pxd:A, 5pxd:B, 5pxe:A, 5pxe:B, 5pxf:A, 5pxf:B, 5pxg:A, 5pxg:B, 5pxh:A, 5pxh:B, 5pxi:A, 5pxi:B, 5pxj:A, 5pxj:B, 5pxk:A, 5pxk:B, 5pxl:A, 5pxl:B, 5pxm:A, 5pxm:B, 5pxn:A, 5pxn:B, 5pxo:A, 5pxo:B, 5pxp:A, 5pxp:B, 5pxq:A, 5pxq:B, 5pxr:A, 5pxr:B, 5pxs:A, 5pxs:B, 5pxt:A, 5pxt:B, 5pxu:A, 5pxu:B, 5pxv:A, 5pxv:B, 5pxw:A, 5pxw:B, 5pxx:A, 5pxx:B, 5pxy:A, 5pxy:B, 5pxz:A, 5pxz:B, 5py0:A, 5py0:B, 5py1:A, 5py1:B, 5py2:A, 5py2:B, 5py3:A, 5py3:B, 5py4:A, 5py4:B, 5py5:A, 5py5:B, 5py6:A, 5py6:B, 5py7:A, 5py7:B, 5py8:A, 5py8:B, 5py9:A, 5py9:B, 5pya:A, 5pya:B, 5pyb:A, 5pyb:B, 5pyc:A, 5pyc:B, 5pyd:A, 5pyd:B, 5pye:A, 5pye:B, 5pyf:A, 5pyf:B, 5pyg:A, 5pyg:B, 5pyh:A, 5pyh:B, 5pyi:A, 5pyi:B, 5pyj:A, 5pyj:B, 5pyk:A, 5pyk:B, 5pyl:A, 5pyl:B, 5pym:A, 5pym:B, 5pyn:A, 5pyn:B, 5pyo:A, 5pyo:B, 5pyp:A, 5pyp:B, 5pyq:A, 5pyq:B, 5pyr:A, 5pyr:B, 5pys:A, 5pys:B, 5pyt:A, 5pyt:B, 5pyu:A, 5pyu:B, 5pyv:A, 5pyv:B, 5pyw:A, 5pyw:B, 5pyx:A, 5pyx:B, 5pyy:A, 5pyy:B, 5pyz:A, 5pyz:B, 5pz0:A, 5pz0:B, 5pz1:A, 5pz1:B, 5pz2:A, 5pz2:B, 5pz3:A, 5pz3:B, 5pz4:A, 5pz4:B, 5pz5:A, 5pz5:B, 5pz6:A, 5pz6:B, 5pz7:A, 5pz7:B, 5pz8:A, 5pz8:B, 5pz9:A, 5pz9:B, 5pza:A, 5pza:B, 5pzb:A, 5pzb:B, 5pzc:A, 5pzc:B, 5pzd:A, 5pzd:B, 5pze:A, 5pze:B, 5pzf:A, 5pzf:B, 5pzg:A, 5pzg:B, 5pzh:A, 5pzh:B, 5pzi:A, 5pzi:B, 5pzj:A, 5pzj:B
51 6u04:A 168 48 0.3091 0.1012 0.3542 0.008 5erc:A
52 8i02:G 284 34 0.2545 0.0493 0.4118 0.026 8ifg:P
53 8i02:G 284 40 0.2545 0.0493 0.3500 1.1 8ifg:P
54 8ge0:A 188 48 0.3091 0.0904 0.3542 0.070 8gdx:A, 8ge0:B, 8ge0:C
55 7duf:A 62 47 0.2909 0.2581 0.3404 0.075 7duf:B
56 4gnd:C 107 45 0.3273 0.1682 0.4000 0.079 4gnd:A, 4gne:A, 4gnf:A, 4gng:A, 4gng:D
57 7mju:A 184 45 0.3273 0.0978 0.4000 0.087 5dag:A, 5dah:B, 5dah:A
58 6g8r:B 164 49 0.2909 0.0976 0.3265 0.14 2md7:B, 2md8:C
59 2yt5:A 66 52 0.2909 0.2424 0.3077 0.22
60 5z8l:A 204 39 0.2364 0.0637 0.3333 0.22 5z8n:A, 5z8n:B, 5z8n:C
61 1wee:A 72 44 0.2727 0.2083 0.3409 0.25
62 1x4i:A 70 36 0.2545 0.2000 0.3889 0.30 7zmx:A, 7zmx:B
63 8f8y:B 433 48 0.2727 0.0346 0.3125 0.33 8f8y:A, 8f8z:A, 8f8z:B, 3kqi:A, 7m10:A, 3pu3:A, 3pu3:B, 3pu8:B, 3pu8:A, 3pua:A, 3pus:A, 3pus:B
64 6knb:B 1120 47 0.2545 0.0125 0.2979 0.43 6knc:B
65 5wlf:A 60 51 0.2364 0.2167 0.2549 0.44 5wle:A
66 2lri:C 66 45 0.2727 0.2273 0.3333 0.49
67 3kv6:D 448 48 0.2727 0.0335 0.3125 0.54 3kv5:D, 3kv5:A, 3kv6:A, 3kv9:A, 3kva:A, 3u78:A
68 6j2p:A 98 46 0.2909 0.1633 0.3478 0.95 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
69 5xfr:A 309 35 0.2000 0.0356 0.3143 1.1 5xfr:B
70 5y20:A 52 48 0.2727 0.2885 0.3125 1.3
71 2qic:A 51 17 0.1636 0.1765 0.5294 1.3
72 2mum:A 50 37 0.2545 0.2800 0.3784 1.6
73 6asb:I 121 65 0.3455 0.1570 0.2923 1.7 6asb:C, 6asb:L
74 4o64:A 116 62 0.3455 0.1638 0.3065 1.7 4o64:B, 4o64:C
75 5znp:B 186 21 0.1455 0.0430 0.3810 2.5 5znp:A, 5znr:A, 5znr:B
76 7mq8:NJ 827 26 0.2000 0.0133 0.4231 3.3 7mq8:NK, 7mq9:NJ, 7mq9:NK
77 6y2x:A 231 27 0.1455 0.0346 0.2963 3.3 6ir0:A, 6y22:A, 6y3j:A
78 6i52:C 178 10 0.1273 0.0393 0.7000 3.4
79 8ia0:CZ 576 28 0.1818 0.0174 0.3571 3.6
80 1zbd:B 124 50 0.2727 0.1210 0.3000 4.0
81 1wes:A 71 36 0.2545 0.1972 0.3889 4.4 2g6q:A
82 6ukj:A 350 25 0.2000 0.0314 0.4400 4.6
83 8pm4:A 604 27 0.2364 0.0215 0.4815 4.7
84 5oyj:A 161 25 0.1818 0.0621 0.4000 5.8 5oyj:B
85 6mk2:A 407 36 0.2545 0.0344 0.3889 5.8
86 1lbg:A 357 24 0.2000 0.0308 0.4583 7.0 2bjc:A, 2bjc:B, 1cjg:A, 1cjg:B, 1efa:A, 1efa:B, 1efa:C, 1jwl:B, 1jwl:A, 1jwl:C, 2kei:A, 2kei:B, 2kej:A, 2kej:B, 2kek:A, 2kek:B, 1l1m:A, 1l1m:B, 1lbg:D, 1lbh:A, 1lbh:B, 1lbh:C, 1lbh:D, 1lcc:A, 1lcd:A, 1osl:A, 1osl:B, 2p9h:A, 2p9h:B, 2paf:A, 2paf:B, 2pe5:A, 2pe5:B, 2pe5:C, 4rzt:A, 4rzt:B, 4rzt:C, 4rzt:D, 1tlf:A, 1tlf:B, 1tlf:C, 1tlf:D
87 5zb8:A 400 33 0.2000 0.0275 0.3333 7.3 7k30:A, 7k31:A, 7k32:A, 7k33:A, 5zb8:B, 5zb8:C, 5zb8:D, 5zb8:E
88 7dng:A 161 26 0.1818 0.0621 0.3846 8.4 7dnf:A, 7dnf:C, 7dnf:D, 7dnf:F

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218