BioLiP

>protein
AVAGAAGGARRFLCGVVEGFYGRPWVMEQRKELFRRLQKWELNTYLYAPKDDYKHRMFWREMYSVEEAEQLMTLISAARE
YEIEFIYAISPGLDITFSNPKEVSTLKRKLDQVSQFGCRSFALLFDMCAADKEVFSSFAHAQVSITNEIYQYLGEPETFL
FCPTEYCGTFCYPNVSQSPYLRTVGEKLLPGIEVLWTGPKVVSKEIPVESIEEVSKIIKRAPVIWDNIHANDYDQKRLFL
GPYKGRSTELIPRLKGVLTNPNCEFEANYVAIHTLATWYKSNMNGVRTDVLYSPQMALKLALTEWLQEFG

The query sequence (length=310) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5m7t:A	451	305	0.9548	0.6563	0.9705	0.0	5m7s:A, 5m7s:B, 5m7t:B, 5m7u:A, 5m7u:B, 7ou6:AAA, 7ou6:BBB, 6pm9:A, 6pm9:B, 6pm9:C, 6pm9:D, 5uhl:A, 5uhl:C, 5uho:A, 5uho:C
2	5vvx:C	431	305	0.9387	0.6752	0.9541	0.0	5un8:A, 5un8:C, 5un8:B, 5un8:D, 5un9:A, 5un9:B, 5vvt:A, 5vvt:C, 5vvu:A, 5vvu:C, 5vvv:A, 5vvv:C
3	7yeh:C	344	305	0.9290	0.8372	0.9443	0.0
4	7khs:A	449	303	0.3806	0.2628	0.3894	5.56e-75	7khs:B, 7khs:D, 2xsb:A
5	7khs:C	427	298	0.3613	0.2623	0.3758	1.30e-66
6	5diy:A	463	305	0.3452	0.2311	0.3508	9.41e-54	5diy:B
7	7ou8:AAA	714	265	0.3129	0.1359	0.3660	1.58e-48	5abe:A, 5abe:B, 5abf:A, 5abf:B, 5abg:A, 5abg:B, 5abh:A, 5abh:B, 4ais:A, 4ais:B, 4aiu:A, 2chn:A, 2chn:B, 2cho:A, 2cho:B, 5fky:A, 5fky:B, 5fl0:A, 5fl0:B, 5fl1:A, 5fl1:B, 2j47:A, 2j4g:A, 2j4g:B, 2jiw:A, 2jiw:B, 7k41:A, 5mi4:A, 5mi5:A, 5mi6:A, 5mi7:A, 7ou8:BBB, 4ur9:A, 4ur9:B, 2vvn:A, 2vvn:B, 2vvs:A, 2w4x:A, 2w66:A, 2w66:B, 2w67:A, 2w67:B, 2wca:A, 2wzh:A, 2wzi:A, 2wzi:B, 2x0h:A, 2x0h:B, 2xj7:A, 2xj7:B, 2xm1:A, 2xm1:B, 2xm2:A, 2xm2:B
8	2v5d:A	722	280	0.3129	0.1343	0.3464	2.72e-43	2cbi:A, 2cbi:B, 2cbj:A, 2cbj:B, 2j1a:A, 2j1e:A, 2j62:A, 2j62:B, 2j7m:A, 7khv:A, 7khv:B, 7khv:C, 7khv:D, 7khv:E, 7khv:F, 5oxd:A, 6rhe:A, 2v5c:A, 2v5c:B, 2vur:A, 2vur:B, 2wb5:A, 2wb5:B, 2x0y:A, 2x0y:B, 2xpk:A, 2xpk:B, 2ydq:A, 2ydr:A, 2yds:A, 4zxl:A
9	6pv4:C	608	288	0.2419	0.1234	0.2604	1.95e-24	6pv4:A, 6pv4:B, 6pv4:D
10	2a0i:A	293	164	0.1387	0.1468	0.2622	0.21
11	3rf7:A	362	40	0.0387	0.0331	0.3000	0.43
12	4ged:A	268	59	0.0645	0.0746	0.3390	0.98	5al9:A, 5ala:A, 5ala:B, 5amm:A, 5amm:B, 3riv:A, 3riv:B, 3riw:A, 3riw:B
13	7f4v:aF	151	57	0.0548	0.1126	0.2982	1.1	7f4v:bF, 7f4v:cF
14	5l22:B	540	65	0.0613	0.0352	0.2923	1.4	5l22:A
15	5zzo:F	199	109	0.0774	0.1206	0.2202	1.8	5zzo:A, 5zzo:B, 5zzo:C, 5zzo:D, 5zzo:E
16	8dmu:A	476	87	0.0871	0.0567	0.3103	2.6	8dmu:B, 8dmu:C, 8dmu:D
17	7x2u:A	541	39	0.0419	0.0240	0.3333	3.9	7x2u:B
18	6ji2:A	432	67	0.0548	0.0394	0.2537	6.6	4cxg:A, 4cxh:A, 6ji2:E, 3vmf:A, 3wxm:A, 3wxm:C, 3wxm:E, 3wxm:G
19	8iqu:A	545	87	0.0871	0.0495	0.3103	9.3	8hd4:A, 8hdf:A
20	7pp8:A	402	77	0.0613	0.0473	0.2468	9.5	7pp8:B, 7pp8:C, 7pp8:D, 7pp8:E, 7pp8:F, 7pp8:G, 7pp8:H, 7pu6:A, 7pu6:B, 7pu6:C, 7pu6:D, 7pu6:E, 7pu6:F, 7pu6:G, 7pu6:H
21	5jy7:B	571	110	0.0839	0.0455	0.2364	9.7	5jy7:A, 5jy7:C, 5jy7:D, 5jy7:E, 5jy7:F, 5jy7:G, 5jy7:H, 3zo9:A, 3zo9:B, 3zoa:B, 3zoa:A
22	4uer:b	572	83	0.0613	0.0332	0.2289	9.8

[Back]