Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
ATRRQLANAIRVLAMDSVQKAKSGHPGAPMGMADIAEVLWRDFLKHNPTNPKWADRDRFVLSNGHGSMLIYSLLHLTGYD
LSIEDLKQFRQLHSKTPGHPEYGYAPGVETTTGPLGQGITNAVGMAIAEKTLAGQFNREGHEIVDHHTYVFLGDGCLMEG
ISHEACSLAGTLGLGKLIAFYDDNNISIDGHVDGWFSDDTAERFEAYGWQVIRNVDGHDAEQIRAATILAQAEKGKPTLI
ICKTIIGFGSPNKSGSHDSHGAPLGDEEIDLTRKALGWEYAPFEIPAEYYAEWSAKEKGAAAEKSWEEKFAAYAKAYPEL
AAEFKRRVSGELPTNWAAESKAFIEKLQANPASIASRKASQNAIEAYAHVLPEFLGGSADLASSNLTLWSGSKPIRAHEN
VGGNYINYGVREFGMSAIMNGIALHGGFIPYGATFLMFYEYAHNAVRMAALMKQRTLFVYTHDSIGLGEDGPTHQPVEQT
ASLRLIPNLETWRPCDQVESAIAWQQAVERQDGPSALIFTRQNLAQMDRTSAQLDAVKRGAYVLKDCDGTPELIFIATGS
EVELAVQAAEALSAEGKKVRVVSMPSTNRFDKQDAAYRESVLPAAVTKRVAIEAGIADFWYKYVGFNGRVIGMNSFGESA
PADQLFKLFGFTVENVVAKAKEILEN

The query sequence (length=666) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8r3o:B 667 666 1.0000 0.9985 1.0000 0.0 8r3o:A, 8r3o:C, 8r3o:D
2 5hht:B 667 666 0.7673 0.7661 0.7673 0.0 5hht:A, 1qgd:A, 1qgd:B, 2r5n:A, 2r5n:B, 2r8o:A, 2r8o:B, 2r8p:A, 2r8p:B, 6rjc:A, 6rjc:B, 6tj8:A, 6tj8:B, 6tj9:A, 6tj9:B, 8wa7:A, 8wa7:B
3 8qmf:A 678 662 0.7763 0.7625 0.7810 0.0 8qmf:B
4 4xeu:A 632 663 0.6697 0.7057 0.6727 0.0
5 5vrb:B 646 660 0.6381 0.6579 0.6439 0.0 5vrb:D
6 3upt:A 671 671 0.6456 0.6408 0.6408 0.0 3upt:B
7 5vrb:A 627 660 0.6081 0.6459 0.6136 0.0 5vrb:C
8 8cip:A 665 660 0.5225 0.5233 0.5273 0.0 8cip:B, 8cip:C, 8cip:D
9 3m49:A 665 662 0.5090 0.5098 0.5121 0.0 3hyl:A, 3hyl:B, 3m49:B
10 8r3p:A 672 664 0.5105 0.5060 0.5120 0.0 8r3p:B, 8r3p:C, 8r3p:D
11 5nd5:A 669 668 0.5090 0.5067 0.5075 0.0 5nd5:B
12 8ci0:AAA 666 660 0.5165 0.5165 0.5212 0.0 8ci0:BBB, 8ci0:CCC, 1itz:A, 1itz:B, 1itz:C
13 8r3r:A 658 659 0.4955 0.5015 0.5008 0.0 8r3r:B, 8r3r:C, 8r3r:D
14 7wrr:A 650 649 0.5000 0.5123 0.5131 0.0 7wrr:B, 7wrr:C, 7wrr:D, 7wrt:A, 7wrt:B, 7wrt:C, 7wrt:D
15 4c7x:A 662 659 0.4790 0.4819 0.4841 0.0
16 8r3s:A 663 660 0.4805 0.4827 0.4848 0.0 8r3s:B, 8r3s:C, 8r3s:D, 8r3s:E, 8r3s:F, 8r3s:G, 8r3s:H, 8r3s:I, 8r3s:J
17 1ay0:A 678 666 0.4910 0.4823 0.4910 0.0 1ay0:B, 1gpu:A, 1gpu:B, 1ngs:A, 1ngs:B, 1tka:A, 1tka:B, 1tkb:A, 1tkb:B, 1tkc:A, 1tkc:B, 1trk:A, 1trk:B
18 1r9j:B 671 667 0.4835 0.4799 0.4828 0.0 1r9j:A
19 5hje:A 676 667 0.4670 0.4601 0.4663 0.0 5hyv:A, 5i51:A, 5i5e:A, 5i5g:A, 5xps:A, 5xqa:A, 5xqk:A, 5xrv:A, 5xry:A, 5xs6:A, 5xsa:A, 5xsb:A, 5xsm:A, 5xt0:A, 5xt4:A, 5xtl:A, 5xtv:A, 5xtx:A, 5xu2:A, 5xu9:A, 5xuf:A, 5xvt:A
20 3m34:A 632 657 0.4459 0.4699 0.4521 1.93e-171 3m6l:A, 3m7i:A
21 3rim:A 694 667 0.4249 0.4078 0.4243 2.69e-171 3rim:C, 3rim:B, 3rim:D
22 8r3q:D 676 676 0.4219 0.4157 0.4157 5.39e-163 8r3q:B, 8r3q:A, 8r3q:C
23 6yak:AAA 282 267 0.1547 0.3652 0.3858 3.63e-46 6yak:CCC
24 6rjb:B 622 671 0.2643 0.2830 0.2623 7.10e-43 6ha3:A, 6had:A, 4kxu:A, 4kxv:A, 4kxw:A, 4kxx:A, 4kxy:A, 4kxy:B, 3mos:A, 3ooy:A, 3ooy:B, 6rjb:A, 8wa8:A, 8wa9:A, 8wa9:B, 8waa:A, 8waa:B
25 6yak:DDD 311 323 0.1246 0.2669 0.2570 9.24e-18 6yak:BBB
26 2o1s:A 536 230 0.0811 0.1007 0.2348 4.66e-07 2o1s:C
27 2o1s:A 536 216 0.0781 0.0970 0.2407 0.012 2o1s:C
28 2o1s:B 493 179 0.0706 0.0953 0.2626 2.17e-06 2o1s:D
29 2o1s:B 493 102 0.0390 0.0527 0.2549 3.0 2o1s:D
30 2g25:B 831 261 0.1066 0.0854 0.2720 4.27e-06 2g25:A
31 2g25:B 831 36 0.0270 0.0217 0.5000 0.12 2g25:A
32 2g28:B 801 261 0.1066 0.0886 0.2720 4.44e-06 2g28:A, 2iea:A, 2iea:B, 1l8a:B, 1l8a:A, 3lpl:A, 3lpl:B, 3lq2:A, 3lq2:B, 3lq4:A, 3lq4:B, 2qta:A, 2qta:B, 2qtc:A, 2qtc:B, 1rp7:A, 1rp7:B
33 2g28:B 801 487 0.1532 0.1273 0.2094 0.008 2g28:A, 2iea:A, 2iea:B, 1l8a:B, 1l8a:A, 3lpl:A, 3lpl:B, 3lq2:A, 3lq2:B, 3lq4:A, 3lq4:B, 2qta:A, 2qta:B, 2qtc:A, 2qtc:B, 1rp7:A, 1rp7:B
34 6xxg:AAA 560 224 0.0826 0.0982 0.2455 1.10e-05 6ouw:A
35 6xxg:AAA 560 173 0.0706 0.0839 0.2717 2.14e-05 6ouw:A
36 6ouv:A 595 173 0.0706 0.0790 0.2717 2.42e-05 2o1x:A, 2o1x:B, 6ouv:B, 8v9i:A, 8v9i:B
37 6ouv:A 595 242 0.0871 0.0975 0.2397 6.78e-05 2o1x:A, 2o1x:B, 6ouv:B, 8v9i:A, 8v9i:B
38 6xxg:BBB 539 173 0.0706 0.0872 0.2717 2.56e-05 2o1x:C, 2o1x:D
39 6xxg:BBB 539 224 0.0781 0.0965 0.2321 0.003 2o1x:C, 2o1x:D
40 8a45:F 573 131 0.0586 0.0681 0.2977 2.68e-05 8a29:A, 8a29:B, 8a29:C, 8a29:D, 8a29:E, 8a29:F, 8a45:A, 8a45:B, 8a45:C, 8a45:D, 8a45:E, 8a4d:A, 8a4d:B, 8a4d:C, 8a4d:D, 8a4d:E, 8a4d:F, 8a5k:A, 8a5k:B, 8a5k:C, 8a5k:D, 8a5k:E, 8a5k:F
41 8a45:F 573 132 0.0526 0.0611 0.2652 0.056 8a29:A, 8a29:B, 8a29:C, 8a29:D, 8a29:E, 8a29:F, 8a45:A, 8a45:B, 8a45:C, 8a45:D, 8a45:E, 8a4d:A, 8a4d:B, 8a4d:C, 8a4d:D, 8a4d:E, 8a4d:F, 8a5k:A, 8a5k:B, 8a5k:C, 8a5k:D, 8a5k:E, 8a5k:F
42 8bzx:B 568 182 0.0616 0.0722 0.2253 8.99e-05
43 8bzx:B 568 71 0.0360 0.0423 0.3380 0.31
44 7a9g:AAA 549 167 0.0661 0.0801 0.2635 3.20e-04 7a9g:BBB, 7a9h:AAA, 7a9h:BBB, 8ogh:A, 8ogh:B
45 8bzx:A 546 169 0.0586 0.0714 0.2308 4.46e-04
46 8bzx:A 546 69 0.0375 0.0458 0.3623 0.15
47 8a9c:B 520 135 0.0526 0.0673 0.2593 4.64e-04
48 1biy:A 689 227 0.0841 0.0813 0.2467 0.50 2alu:A, 2ays:A, 2b65:A, 1blf:A, 1ce2:A, 3cfl:A, 3ci8:A, 3crb:A, 5cry:A, 5cry:B, 4dig:A, 2doj:A, 2dp8:A, 2dqv:A, 2ds9:A, 2dsf:A, 2dvc:A, 2dwa:A, 2dwh:A, 2dwi:A, 2dwj:A, 2dxr:A, 2dxy:A, 4dxu:A, 2dyx:A, 2e0s:A, 2e1s:A, 3e9x:A, 7enu:A, 7enu:B, 7equ:A, 7equ:B, 7ev0:A, 7ev0:P, 7evq:A, 7evq:B, 2fa7:A, 7fdw:A, 7fdw:B, 4fim:A, 4fjp:A, 4for:A, 4g2z:A, 4g77:A, 4g8h:A, 2g93:A, 4grk:A, 2h4i:A, 5hbc:A, 5hbc:B, 2hca:A, 3iaz:A, 3ib0:A, 3ib1:A, 3ib2:A, 1jw1:A, 3k0v:A, 3kj7:A, 3mjn:A, 4n6p:A, 4ned:A, 1nkx:A, 2nuv:A, 2nwj:A, 2o1l:A, 2o51:A, 3o97:A, 2ocu:A, 2p1s:A, 2px1:A, 2q8j:A, 2qje:A, 2r71:A, 2r9j:A, 3rgy:A, 1sdx:A, 3sdf:A, 3taj:A, 3tod:A, 3ttr:A, 3tus:A, 3u72:A, 3u8q:A, 3ugw:A, 3uk4:A, 3usd:A, 3v5a:A, 3vdf:A, 2zmb:A
49 6os0:A 395 51 0.0225 0.0380 0.2941 3.3 6os1:A, 6os2:A, 8th3:A, 8th4:A
50 3lmw:A 472 127 0.0435 0.0614 0.2283 3.5 1ktw:A, 1ktw:B
51 6jla:C 184 119 0.0511 0.1848 0.2857 3.7
52 8r2h:B 701 58 0.0255 0.0243 0.2931 4.0 8r2h:A
53 1ons:A 278 189 0.0751 0.1799 0.2646 4.9
54 5hq4:A 662 116 0.0526 0.0529 0.3017 6.3 5hqa:A, 5hqb:A, 5hqc:A
55 4bts:AZ 97 46 0.0255 0.1753 0.3696 6.5 4bts:BZ, 4bts:CZ, 4bts:DZ, 4v5o:AZ, 4v5o:BZ
56 3ivd:A 499 103 0.0390 0.0521 0.2524 6.7 3ivd:B, 3ive:A
57 6sgf:B 132 44 0.0225 0.1136 0.3409 7.0 6sgf:A, 6sgf:C, 6sgf:D, 6sgf:E, 6sgf:F
58 7n09:A 259 102 0.0435 0.1120 0.2843 7.7 7n09:B
59 5yy2:A 569 77 0.0330 0.0387 0.2857 9.5

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218