BioLiP

>protein
ATRPPLPTLDTPSWNANSAVSSIIYETPAPSRQPRKQHVLNCLVQNEPGVLSRVSGTLAARGFNIDSLVVCNTEVKDLSR
MTIVLQGQDGVIEQARRQIEDLVPVYAVLDYTNSEIIKRELVMARISLLGTEYFEDLLLHHHTSTNAGAADSQELVAEIR
EKQFHPANLPASEVLRLKHEHLNDITNLTNNFGGRVVDISETSCIVELSAKPTRISAFLKLVEPFGVLECARSGMMALPR
TPLKTSTEEAADEDE

The query sequence (length=255) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6u9d:L	255	255	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	6u9d:C, 6u9d:O, 6u9d:P, 6u9d:D, 6u9d:G, 6u9d:H, 6u9d:K, 6u9d:S, 6u9d:T, 6u9d:W, 6u9d:X, 6wo1:B
2	2pc6:A	164	204	0.2275	0.3537	0.2843	4.49e-23	2pc6:B, 2pc6:C
3	6vz8:G	159	205	0.2235	0.3585	0.2780	8.23e-21	6vz8:K, 6vz8:O, 6vz8:S
4	6vz8:F	159	208	0.2118	0.3396	0.2596	2.58e-16	6vz8:J, 6vz8:N, 6vz8:R
5	5ypp:E	91	70	0.0863	0.2418	0.3143	5.57e-04	5ypp:A, 5ypp:B, 5ypp:C, 5ypp:D, 5ypp:F, 5ypw:A, 5ypw:B, 5ypw:C, 5ypw:D, 5ypw:E, 5ypw:F, 5ypw:G, 5ypw:H, 5ypy:A, 5ypy:B, 5ypy:C, 5ypy:D, 5yum:A
6	6he3:A	422	87	0.1059	0.0640	0.3103	0.84	6hdz:A, 6hdz:B, 6he1:A, 6he1:B, 6he3:B
7	4dor:A	216	94	0.1137	0.1343	0.3085	0.93
8	3hlf:A	425	56	0.0745	0.0447	0.3393	1.8	3hld:A, 3hle:A, 3hlg:A
9	1g1x:C	46	23	0.0431	0.2391	0.4783	2.3
10	4i6n:A	219	60	0.0431	0.0502	0.1833	2.6	4i6n:C
11	8un9:A	229	53	0.0706	0.0786	0.3396	3.0	8un9:B
12	3tj9:A	155	140	0.1255	0.2065	0.2286	4.2	3ny0:B, 3tj9:B, 3tj9:C, 3tj9:D
13	4ig7:A	231	37	0.0353	0.0390	0.2432	4.5
14	4afp:A	325	56	0.0667	0.0523	0.3036	6.2
15	6llx:B	215	62	0.0824	0.0977	0.3387	7.3	10gs:A, 10gs:B, 20gs:A, 20gs:B, 11gs:A, 11gs:B, 12gs:A, 12gs:B, 13gs:A, 13gs:B, 17gs:A, 17gs:B, 18gs:A, 18gs:B, 19gs:A, 19gs:B, 2a2r:A, 2a2r:B, 2a2s:A, 2a2s:B, 6ap9:A, 6ap9:B, 1aqv:A, 1aqv:B, 1aqw:A, 1aqw:B, 1aqw:C, 1aqw:D, 1aqx:A, 1aqx:B, 1aqx:C, 1aqx:D, 7bia:A, 7bia:B, 3csh:A, 3csh:B, 3csi:A, 3csi:B, 3csi:C, 3csi:D, 3csj:B, 5dal:A, 5dal:B, 5dcg:B, 3dd3:A, 3dd3:B, 5ddl:A, 5ddl:B, 3dgq:A, 3dgq:B, 5djl:A, 5djl:B, 1gss:A, 1gss:B, 2gss:A, 2gss:B, 3gss:A, 3gss:B, 4gss:A, 4gss:B, 5gss:A, 5gss:B, 6gss:A, 6gss:B, 7gss:A, 7gss:B, 8gss:A, 8gss:B, 8gss:C, 9gss:A, 9gss:B, 3gus:A, 3gus:B, 3hjm:A, 3hjm:B, 3hjm:C, 3hjm:D, 3hjo:A, 3hjo:B, 3hkr:A, 3hkr:B, 3ie3:A, 3ie3:B, 5j41:A, 5j41:B, 2j9h:A, 2j9h:B, 5jcw:A, 5jcw:B, 1kbn:A, 1kbn:B, 3km6:A, 3km6:B, 3kmn:A, 3kmn:B, 3kmo:A, 3kmo:B, 5l6x:A, 5l6x:B, 1lbk:A, 1lbk:B, 6llx:A, 1md3:A, 1md3:B, 1md4:A, 1md4:B, 3n9j:A, 3n9j:B, 1pgt:A, 1pgt:B, 2pgt:A, 2pgt:B, 3pgt:A, 3pgt:B, 4pgt:A, 4pgt:B, 1px6:A, 1px6:B, 1px7:A, 1px7:B, 5x79:A, 5x79:B, 7xba:A, 7xba:B, 6y1e:A, 6y1e:B, 6y1e:C, 6y1e:D, 1zgn:A, 1zgn:B
16	2dt9:A	153	88	0.0824	0.1373	0.2386	7.9	2dt9:B
17	7nsh:BC	700	29	0.0431	0.0157	0.3793	9.5	7l20:w

[Back]