BioLiP

>protein
ATQGVFTLPANTRFGVTAFANSSGTQTVNVLVNNETAATFSGQSTNNAVIGTQVLNSGSSGKVQVQVSVNGRPSDLVSAQ
VILTNELNFALVGSEDGTDNDYNDAVVVINWPLG

The query sequence (length=114) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5a3o:A	114	114	1.0000	1.0000	1.0000	2.20e-76	5a3o:B, 5a3o:C, 5a3o:D, 8aij:AAA, 8aij:BBB, 8aij:CCC, 8aij:DDD, 8aiy:AAA, 8aiy:BBB, 8aiy:CCC, 8aiy:DDD, 8an9:A, 8an9:B, 8an9:C, 8an9:D, 8ano:A, 8ano:D, 8ano:B, 8ano:C, 8anr:A, 8anr:B, 8aoo:A, 8aoo:B, 8aoo:C, 8aoo:D, 2boj:A, 2boj:B, 2boj:C, 2boj:D, 2bp6:A, 2bp6:B, 2bp6:C, 2bp6:D, 4ce8:A, 4ce8:B, 4ce8:C, 4ce8:D, 5d2a:A, 5d2a:B, 3dcq:A, 3dcq:B, 3dcq:C, 3dcq:D, 1gzt:A, 1gzt:B, 1gzt:C, 1gzt:D, 5hch:A, 5i8m:A, 5i8m:C, 5i8m:D, 5i8m:B, 5i8x:A, 5i8x:D, 5i8x:B, 5i8x:C, 2jdh:B, 2jdh:C, 2jdh:D, 2jdh:A, 2jdk:B, 2jdk:C, 2jdk:D, 2jdk:A, 2jdm:A, 2jdm:B, 2jdm:C, 2jdm:D, 2jdn:A, 2jdn:B, 2jdn:C, 2jdn:D, 2jdp:A, 2jdp:B, 2jdp:C, 2jdp:D, 2jdu:C, 2jdu:D, 2jdy:A, 2jdy:B, 2jdy:C, 2jdy:D, 5nes:A, 5nes:C, 5nes:B, 5nes:D, 5ney:B, 5ney:A, 5ney:C, 5ney:D, 7nef:C, 7nef:A, 7nef:B, 7nef:D, 7nef:E, 7nef:F, 7nef:G, 7nef:H, 7new:C, 7new:A, 7new:B, 7new:D, 5nf0:B, 5nf0:D, 5nf0:C, 5nf0:A, 5ngq:A, 5ngq:D, 5ngq:B, 5ngq:C, 1our:A, 1oux:A, 1oux:B, 1oux:C, 1oux:D, 1ovp:A, 1ovs:A, 1ovs:B, 1ovs:C, 1ovs:D, 1oxc:A, 1oxc:B, 1oxc:C, 1oxc:D, 7prg:A, 7prg:B, 7prg:C, 7prg:D, 7psy:A, 7psy:B, 7psy:C, 7psy:D, 6q6w:A, 6q6x:C, 6q6x:A, 6q6x:B, 6q6x:D, 6q77:A, 6q79:C, 6q79:A, 6q79:D, 6q79:B, 6q85:A, 6q85:B, 6q85:C, 6q85:D, 6q86:A, 6q86:B, 6q87:A, 6q8d:A, 6q8g:A, 6q8g:B, 6q8g:C, 6q8g:D, 6q8h:A, 6r35:D, 6r35:C, 6r35:A, 6r35:B, 6s5p:A, 6s5p:B, 6s5p:C, 6s5p:D, 6s5r:A, 6s5r:B, 6s5r:C, 6s5r:D, 6s5s:A, 6s7g:C, 6s7g:A, 6s7g:B, 6s7g:D, 1uzv:A, 1uzv:B, 1uzv:C, 1uzv:D, 2vuc:A, 2vuc:B, 2vuc:C, 2vuc:D, 2vud:A, 2vud:B, 2vud:C, 2vud:D, 1w8f:A, 1w8f:B, 1w8f:C, 1w8f:D, 1w8h:A, 1w8h:B, 1w8h:C, 1w8h:D, 6y0u:A, 6y0u:B, 6y0u:C, 6y0u:D, 6y0v:A, 6y0v:B, 6y0v:C, 6y0v:D, 6y0w:B, 6y0w:A, 3zdv:A, 3zdv:B, 3zdv:C, 3zdv:D
2	5a6q:A	114	114	0.8684	0.8684	0.8684	4.58e-66	5a6q:B, 5a6q:C, 5a6q:D, 5a6x:A, 5a6x:B, 5a6x:C, 5a6x:D, 5a6y:B, 5a6y:C, 5a6y:D, 5a6y:A, 5a6z:A, 5a6z:B, 5a6z:C, 5a6z:D, 5a70:A, 5a70:B, 5a70:C, 5a70:D, 5may:A, 5may:B, 5may:C, 5may:D, 5maz:A, 5maz:B, 5maz:C, 5maz:D, 5mb1:A, 5mb1:B, 5mb1:C, 5mb1:D, 4ut5:A, 4ut5:B, 4ut5:C, 4ut5:D
3	2chh:A	113	114	0.6930	0.6991	0.6930	2.77e-53	1uqx:A
4	2boi:A	113	114	0.6053	0.6106	0.6053	3.42e-44	2boi:B, 2bv4:A, 2bv4:B
5	2vnv:B	128	120	0.3772	0.3359	0.3583	2.23e-18	4aoc:A, 4aoc:B, 4aoc:C, 4aoc:D, 4aoc:E, 2vnv:A, 2vnv:C, 2vnv:D, 2vnv:E, 2wr9:A, 2wr9:D, 2wr9:B, 2wr9:C, 2wra:A
6	2rio:A	396	65	0.1930	0.0556	0.3385	0.017	2rio:B
7	3fbv:D	425	65	0.1930	0.0518	0.3385	0.017	3fbv:A, 3fbv:B, 3fbv:C, 3fbv:E, 3fbv:F, 3fbv:G, 3fbv:H, 3fbv:I, 3fbv:J, 3fbv:K, 3fbv:L, 3fbv:M, 3fbv:N, 3lj0:A, 3lj0:B, 3lj1:A, 3lj1:B, 3lj2:A, 3lj2:B, 3sdj:A, 3sdj:B, 3sdj:C, 3sdj:D, 3sdj:E, 3sdj:F, 3sdj:G, 3sdj:H, 3sdj:I, 3sdj:J, 3sdj:K, 3sdj:L, 3sdj:M, 3sdj:N
8	8t2v:A	946	56	0.1579	0.0190	0.3214	1.2	4cak:A, 3fcs:A, 3fcs:C, 3fcu:A, 3fcu:C, 3fcu:E, 8gcd:A, 8gce:A, 5hdb:A, 5hdb:C, 7l8p:A, 7l8p:C, 7la4:A, 3nid:A, 3nid:C, 3nif:A, 3nif:C, 3nig:A, 3nig:C, 8t2u:A, 3t3m:A, 3t3m:C, 3t3p:A, 3t3p:C, 7tct:A, 7tct:C, 7td8:A, 7td8:C, 7tho:A, 7tho:C, 7tmz:A, 7tmz:C, 7tpd:A, 7tpd:C, 1tye:A, 1tye:C, 1tye:E, 7u60:A, 7u60:C, 7u9f:A, 7u9f:C, 7u9v:A, 7u9v:C, 7ubr:A, 7ubr:C, 7ucy:A, 7ucy:C, 7udg:A, 7udg:C, 7udh:A, 7udh:C, 7ue0:A, 7ue0:C, 7ufh:A, 7ufh:C, 7uh8:A, 7uh8:C, 7uje:A, 7uje:C, 7ujk:A, 7ujk:C, 7uk9:A, 7uk9:C, 7uko:A, 7uko:C, 7ukp:A, 7ukp:C, 7ukt:A, 7ukt:C, 6v4p:A, 2vc2:A, 2vdk:A, 2vdl:A, 2vdm:A, 2vdn:A, 2vdo:A, 2vdp:A, 2vdq:A, 2vdr:A, 4z7n:A, 4z7n:C, 4z7o:A, 4z7o:C, 4z7q:A, 4z7q:C, 3zdx:A, 3zdx:C, 3zdy:A, 3zdy:C, 3zdz:A, 3zdz:C, 3ze0:A, 3ze0:C, 3ze1:A, 3ze1:C, 3ze2:A, 3ze2:C
9	8pfh:C	289	32	0.1140	0.0450	0.4062	4.7
10	1ud2:A	480	41	0.1316	0.0312	0.3659	6.9	1ud3:A, 1ud4:A, 1ud5:A, 1ud8:A
11	7mq8:LR	773	55	0.1579	0.0233	0.3273	7.4	7mq9:LR, 7mqa:LR
12	9fdv:B	419	39	0.1316	0.0358	0.3846	8.9	9fdj:B, 9fdj:D, 9fdk:B, 9fdk:D, 9fdv:D, 9fe0:B, 9fe0:D, 9fe5:B, 9fe5:D, 9fe7:B, 9fe7:D, 9fe8:B, 9fe8:D, 9fea:B, 9fea:D, 9fif:B, 9fif:D, 9fih:B, 9fih:D, 9fii:B, 9fii:D, 9fij:B, 9fij:D, 9fil:B, 9fil:D, 6hl2:B, 6hl2:D, 6hl3:B, 6hl3:D, 6hl4:B, 6hl4:D, 6hla:B, 6hla:D, 6hli:B, 6hli:D, 6hlj:B, 6hlj:D, 6hlm:B, 6hlm:D, 7q5y:C, 7q5y:I, 7q5y:O, 7q5y:U, 6q9c:B, 6q9c:D, 6q9g:B, 6q9g:D, 6q9j:B, 6q9j:D, 6q9k:B, 6q9k:D, 8qg1:B, 8qg1:D, 8qgw:B, 8qgw:D, 8qh4:B, 8qh4:D, 8qh7:B, 8qh7:D, 8qhk:B, 8qhk:D, 6r7p:B, 6r7p:D, 6saq:B, 6saq:D

[Back]