Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ATIGRISTGSKSLDKLLGGGIETQAITEVFGEFGSGKTQLAHTLAVMVQLPPEEGGLNGSVMWIDTENTFRPERIREIAQ
NRGLDPDEVLKHIAYARAFNSNHQMLLVQQAEDMIKELLNTDRPVKLLIVDSLTSHFRSEYIGRGALAERQQKLAKHLAD
LHRLANLYDIAVFVTNQVSATLRVYLRKGKGGKRIARLIDAPHLPEGEAVFSITEKGIED

The query sequence (length=220) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4d6p:B 229 229 0.9818 0.9432 0.9432 4.08e-156 4a6x:A, 4a6x:B, 4b2i:A, 4b2l:A, 4b2p:A, 4b32:A, 4b33:A, 4b34:A, 4b35:A, 4b3b:A, 4b3d:A, 4b3d:C, 4d6p:A, 5fos:A, 5fot:A, 5fou:A, 5fov:A, 5fov:C, 5fow:A, 5fow:C, 5fox:A, 5fpk:A, 5j4h:A, 5j4k:A, 5jee:A, 5jfg:A, 5lbi:A, 5qub:A, 5quc:A, 5qud:A, 5que:A, 5quf:A, 5qug:A, 5quh:A, 5qui:A, 5quj:A, 5qur:A, 5qus:A, 5qut:A, 6tuu:A, 6tuu:B, 6tuu:C, 6tuu:D, 6tv3:A, 6tw3:A, 6tw4:A, 6tw9:A, 4uqo:A, 4uqo:B, 6xtw:A, 6xuf:A, 6xuj:A
2 6hqu:B 219 228 0.8636 0.8676 0.8333 1.37e-129 8br9:A, 8c3n:A, 6hqu:C, 6hqu:F, 6hqu:A, 6hqu:D, 6hqu:E
3 6hqu:G 194 220 0.7864 0.8918 0.7864 9.02e-115 6hqu:H
4 7ej6:B 316 241 0.5455 0.3797 0.4979 2.81e-76 7ej6:C, 7ej6:A, 7ej7:B, 7ej7:A, 7ej7:C
5 1xu4:A 318 252 0.5500 0.3805 0.4802 3.15e-75 2b21:A, 2f1h:A, 2f1i:A, 2f1j:A, 2fpk:A, 2fpl:A, 2fpm:A, 2i1q:A, 3ntu:A, 1t4g:A
6 8jnf:L 283 227 0.5318 0.4134 0.5154 3.16e-74 8jnf:M, 8jnf:N, 8jnf:O, 1n0w:A, 8xbt:O, 8xbu:M, 8xbu:R, 8xbu:L
7 3fyh:A 296 233 0.5364 0.3986 0.5064 7.61e-74 2gdj:A
8 3ew9:A 314 244 0.5364 0.3758 0.4836 2.49e-72 3etl:A, 3ewa:A
9 8bsc:D 313 237 0.5364 0.3770 0.4979 1.48e-71 8bq2:A, 8bq2:B, 8bq2:C, 8bq2:D, 8bq2:E, 8bq2:F, 8bq2:G, 8bq2:H, 8bq2:I, 8br2:A, 8br2:B, 8br2:C, 8br2:D, 8br2:E, 8br2:F, 8bsc:A, 8bsc:B, 8bsc:C, 8bsc:E, 8bsc:F, 8bsc:G, 7c9a:A, 7c9a:B, 7c9a:C, 7ejc:A, 7ejc:C, 7ejc:B, 7eje:A, 7eje:B, 7eje:C, 8gyk:A, 8gyk:B, 8gyk:C, 8gyk:D, 8gyk:E, 8gyk:F, 8gyk:G, 8gyk:H, 5h1b:A, 5h1b:B, 5h1b:C, 5h1c:A, 5h1c:B, 5h1c:C, 5np7:A, 5np7:B, 5np7:C, 5np7:D, 5np7:E, 5np7:F, 5np7:G, 5nwl:A, 5nwl:B, 5nwl:C, 5nwl:D, 5nwl:E, 5nwl:F, 5nwl:G, 5nwl:H, 5nwl:I, 5nwl:J, 5nwl:K, 5nwl:L, 5nwl:M, 5nwl:N, 8pbc:J, 8pbc:K, 8pbc:I, 8pbc:H, 8pbc:G, 8pbc:F, 8pbc:E, 8pbc:D, 8pbc:C, 8pbc:B, 8pbc:A, 8pbd:I, 8pbd:J, 8pbd:H, 8pbd:G, 8pbd:F, 8pbd:E, 8pbd:D, 8pbd:C, 8pbd:B, 8pbd:A, 8rcd:A, 8rcd:B, 8rcd:C, 8rcd:D, 8rcd:E, 8rcd:F, 8rcd:G, 8rcd:H, 8rcf:A, 8rcf:B, 8rcf:C, 8rcf:D, 8rcf:E, 8rcf:F, 8rcf:G, 8rcf:H
10 7c98:A 309 234 0.5227 0.3722 0.4915 6.15e-71 7c98:B, 7c98:C, 7c99:A, 7c99:B, 7c99:C, 7c9c:A, 7c9c:B, 7c9c:C, 7cgy:A, 7cgy:B, 7cgy:C, 8qqe:B, 8qqe:A, 8r2g:C, 8r2g:G, 8r2g:H, 8r2g:A, 8r2g:D, 8r2g:E, 8r2g:B
11 7qv8:A 208 215 0.5045 0.5337 0.5163 1.58e-70
12 8gja:F 342 177 0.2864 0.1842 0.3559 5.49e-23 8gja:B, 8gja:D
13 8gbj:C 317 253 0.3455 0.2397 0.3004 6.55e-22 8faz:C, 8ouy:B, 8ouz:B
14 8gja:C 274 261 0.3364 0.2701 0.2835 1.46e-19 8gj8:A, 8gja:A, 8gja:E
15 8faz:X 236 174 0.2318 0.2161 0.2931 4.79e-11 8gbj:X, 8ouy:D, 8ouz:D
16 8gbj:D 308 119 0.1864 0.1331 0.3445 3.76e-09 8faz:D, 8ouy:C, 8ouz:C
17 1xp8:A 298 109 0.1864 0.1376 0.3761 3.62e-06
18 3cmv:A 1190 183 0.2455 0.0454 0.2951 1.33e-04 3cmv:C, 3cmv:D, 3cmv:F, 3cmv:H, 1n03:A, 1n03:B, 1n03:C, 1n03:D, 1n03:E, 1n03:F, 1n03:G, 1rea:A, 1u94:A, 1u99:A, 1xms:A
19 3cmv:A 1190 86 0.1500 0.0277 0.3837 0.002 3cmv:C, 3cmv:D, 3cmv:F, 3cmv:H, 1n03:A, 1n03:B, 1n03:C, 1n03:D, 1n03:E, 1n03:F, 1n03:G, 1rea:A, 1u94:A, 1u99:A, 1xms:A
20 3cmv:A 1190 86 0.1500 0.0277 0.3837 0.002 3cmv:C, 3cmv:D, 3cmv:F, 3cmv:H, 1n03:A, 1n03:B, 1n03:C, 1n03:D, 1n03:E, 1n03:F, 1n03:G, 1rea:A, 1u94:A, 1u99:A, 1xms:A
21 3cmv:A 1190 86 0.1500 0.0277 0.3837 0.002 3cmv:C, 3cmv:D, 3cmv:F, 3cmv:H, 1n03:A, 1n03:B, 1n03:C, 1n03:D, 1n03:E, 1n03:F, 1n03:G, 1rea:A, 1u94:A, 1u99:A, 1xms:A
22 5jrj:A 306 186 0.2136 0.1536 0.2527 3.70e-04
23 3cmv:G 1167 184 0.2455 0.0463 0.2935 4.82e-04 3cmv:B, 3cmv:E
24 3cmv:G 1167 184 0.2455 0.0463 0.2935 4.82e-04 3cmv:B, 3cmv:E
25 3cmv:G 1167 86 0.1500 0.0283 0.3837 0.002 3cmv:B, 3cmv:E
26 3cmv:G 1167 86 0.1500 0.0283 0.3837 0.002 3cmv:B, 3cmv:E
27 3cmt:D 1609 162 0.2182 0.0298 0.2963 6.81e-04 3cmw:C, 3cmx:A, 3cmx:D
28 3cmt:D 1609 86 0.1500 0.0205 0.3837 0.003 3cmw:C, 3cmx:A, 3cmx:D
29 3cmt:D 1609 86 0.1500 0.0205 0.3837 0.003 3cmw:C, 3cmx:A, 3cmx:D
30 3cmt:D 1609 86 0.1500 0.0205 0.3837 0.003 3cmw:C, 3cmx:A, 3cmx:D
31 3cmt:D 1609 86 0.1500 0.0205 0.3837 0.003 3cmw:C, 3cmx:A, 3cmx:D
32 1xmv:A 293 86 0.1500 0.1126 0.3837 0.001
33 3cmu:A 1937 174 0.2273 0.0258 0.2874 0.002 3cmt:A, 3cmw:A, 8gms:F, 8gms:G, 8gmt:F, 8gmt:G, 8gmu:F, 8gmu:G, 7jy6:A, 7jy6:B, 7jy6:C, 7jy6:D, 7jy6:E, 7jy6:F, 7jy6:G, 7jy6:H, 7jy6:I, 7jy7:A, 7jy7:B, 7jy7:C, 7jy7:D, 7jy7:E, 7jy7:F, 7jy7:G, 7jy7:H, 7jy7:I, 7jy8:A, 7jy8:B, 7jy8:C, 7jy8:D, 7jy8:E, 7jy8:F, 7jy8:G, 7jy8:H, 7jy8:I, 7jy9:A, 7jy9:C, 7jy9:D, 7jy9:G, 7jy9:E, 7jy9:B, 7jy9:F, 7jy9:H, 7jy9:I, 8trg:A, 8trg:B, 8trg:C, 8trg:D, 8trg:E, 8trg:F, 8trg:G, 8trg:H, 4twz:A, 7ywa:F, 7ywa:G
34 3cmu:A 1937 86 0.1500 0.0170 0.3837 0.002 3cmt:A, 3cmw:A, 8gms:F, 8gms:G, 8gmt:F, 8gmt:G, 8gmu:F, 8gmu:G, 7jy6:A, 7jy6:B, 7jy6:C, 7jy6:D, 7jy6:E, 7jy6:F, 7jy6:G, 7jy6:H, 7jy6:I, 7jy7:A, 7jy7:B, 7jy7:C, 7jy7:D, 7jy7:E, 7jy7:F, 7jy7:G, 7jy7:H, 7jy7:I, 7jy8:A, 7jy8:B, 7jy8:C, 7jy8:D, 7jy8:E, 7jy8:F, 7jy8:G, 7jy8:H, 7jy8:I, 7jy9:A, 7jy9:C, 7jy9:D, 7jy9:G, 7jy9:E, 7jy9:B, 7jy9:F, 7jy9:H, 7jy9:I, 8trg:A, 8trg:B, 8trg:C, 8trg:D, 8trg:E, 8trg:F, 8trg:G, 8trg:H, 4twz:A, 7ywa:F, 7ywa:G
35 3cmu:A 1937 86 0.1500 0.0170 0.3837 0.002 3cmt:A, 3cmw:A, 8gms:F, 8gms:G, 8gmt:F, 8gmt:G, 8gmu:F, 8gmu:G, 7jy6:A, 7jy6:B, 7jy6:C, 7jy6:D, 7jy6:E, 7jy6:F, 7jy6:G, 7jy6:H, 7jy6:I, 7jy7:A, 7jy7:B, 7jy7:C, 7jy7:D, 7jy7:E, 7jy7:F, 7jy7:G, 7jy7:H, 7jy7:I, 7jy8:A, 7jy8:B, 7jy8:C, 7jy8:D, 7jy8:E, 7jy8:F, 7jy8:G, 7jy8:H, 7jy8:I, 7jy9:A, 7jy9:C, 7jy9:D, 7jy9:G, 7jy9:E, 7jy9:B, 7jy9:F, 7jy9:H, 7jy9:I, 8trg:A, 8trg:B, 8trg:C, 8trg:D, 8trg:E, 8trg:F, 8trg:G, 8trg:H, 4twz:A, 7ywa:F, 7ywa:G
36 3cmu:A 1937 86 0.1500 0.0170 0.3837 0.002 3cmt:A, 3cmw:A, 8gms:F, 8gms:G, 8gmt:F, 8gmt:G, 8gmu:F, 8gmu:G, 7jy6:A, 7jy6:B, 7jy6:C, 7jy6:D, 7jy6:E, 7jy6:F, 7jy6:G, 7jy6:H, 7jy6:I, 7jy7:A, 7jy7:B, 7jy7:C, 7jy7:D, 7jy7:E, 7jy7:F, 7jy7:G, 7jy7:H, 7jy7:I, 7jy8:A, 7jy8:B, 7jy8:C, 7jy8:D, 7jy8:E, 7jy8:F, 7jy8:G, 7jy8:H, 7jy8:I, 7jy9:A, 7jy9:C, 7jy9:D, 7jy9:G, 7jy9:E, 7jy9:B, 7jy9:F, 7jy9:H, 7jy9:I, 8trg:A, 8trg:B, 8trg:C, 8trg:D, 8trg:E, 8trg:F, 8trg:G, 8trg:H, 4twz:A, 7ywa:F, 7ywa:G
37 3cmu:A 1937 86 0.1500 0.0170 0.3837 0.002 3cmt:A, 3cmw:A, 8gms:F, 8gms:G, 8gmt:F, 8gmt:G, 8gmu:F, 8gmu:G, 7jy6:A, 7jy6:B, 7jy6:C, 7jy6:D, 7jy6:E, 7jy6:F, 7jy6:G, 7jy6:H, 7jy6:I, 7jy7:A, 7jy7:B, 7jy7:C, 7jy7:D, 7jy7:E, 7jy7:F, 7jy7:G, 7jy7:H, 7jy7:I, 7jy8:A, 7jy8:B, 7jy8:C, 7jy8:D, 7jy8:E, 7jy8:F, 7jy8:G, 7jy8:H, 7jy8:I, 7jy9:A, 7jy9:C, 7jy9:D, 7jy9:G, 7jy9:E, 7jy9:B, 7jy9:F, 7jy9:H, 7jy9:I, 8trg:A, 8trg:B, 8trg:C, 8trg:D, 8trg:E, 8trg:F, 8trg:G, 8trg:H, 4twz:A, 7ywa:F, 7ywa:G
38 3cmu:A 1937 86 0.1500 0.0170 0.3837 0.002 3cmt:A, 3cmw:A, 8gms:F, 8gms:G, 8gmt:F, 8gmt:G, 8gmu:F, 8gmu:G, 7jy6:A, 7jy6:B, 7jy6:C, 7jy6:D, 7jy6:E, 7jy6:F, 7jy6:G, 7jy6:H, 7jy6:I, 7jy7:A, 7jy7:B, 7jy7:C, 7jy7:D, 7jy7:E, 7jy7:F, 7jy7:G, 7jy7:H, 7jy7:I, 7jy8:A, 7jy8:B, 7jy8:C, 7jy8:D, 7jy8:E, 7jy8:F, 7jy8:G, 7jy8:H, 7jy8:I, 7jy9:A, 7jy9:C, 7jy9:D, 7jy9:G, 7jy9:E, 7jy9:B, 7jy9:F, 7jy9:H, 7jy9:I, 8trg:A, 8trg:B, 8trg:C, 8trg:D, 8trg:E, 8trg:F, 8trg:G, 8trg:H, 4twz:A, 7ywa:F, 7ywa:G
39 2g88:A 331 90 0.1455 0.0967 0.3556 0.003 2odn:A, 2odw:A, 2oep:A, 1ube:A, 1ubf:A, 1ubg:A, 2zr9:A, 2zra:A, 2zrd:A, 2zre:A, 2zrf:A, 2zrg:A, 2zri:A, 2zrj:A, 2zrk:A, 2zrl:A, 2zrm:A, 2zro:A, 2zrp:A
40 8amd:A 333 137 0.1864 0.1231 0.2993 0.009 8amd:B, 8amd:F, 8amd:G, 8amf:A, 8amf:B, 8amf:F, 8amf:G
41 4yds:A 226 210 0.2182 0.2124 0.2286 0.015
42 1mo4:A 324 186 0.2364 0.1605 0.2796 0.016 1g18:A, 1mo3:A, 1mo5:A, 1mo6:A
43 2w0m:A 220 181 0.1909 0.1909 0.2320 0.047
44 7dy1:D 458 37 0.0727 0.0349 0.4324 0.11 7dy1:A, 7dy1:B, 7dy1:C, 7dy1:E, 7dy1:F
45 4o0m:A 494 36 0.0727 0.0324 0.4444 0.12 5jwo:A, 4o0m:B, 4o0m:C
46 3qi8:A 424 57 0.1045 0.0542 0.4035 0.35
47 8dme:A 1034 62 0.1091 0.0232 0.3871 0.47 5b2u:A, 5b2u:B, 5b2v:A, 5b2v:B, 5b2w:A, 5b2w:B, 5b2x:A, 5b2x:B, 5b2y:A, 5b2y:B, 3ben:A, 3ben:B, 2bmh:A, 2bmh:B, 1bu7:A, 1bu7:B, 1bvy:A, 1bvy:F, 1bvy:B, 3cbd:A, 3cbd:B, 7ckn:A, 7ckn:B, 7con:A, 7con:B, 7coo:A, 7coo:B, 7cp8:A, 7cp8:B, 7cvr:A, 7cvr:B, 7cx6:A, 7cx6:B, 7cx8:A, 7cx8:B, 7czi:A, 7czi:B, 7d0t:A, 7d0t:B, 7d0u:A, 7d0u:B, 7d1f:A, 7d1f:B, 3dgi:A, 8dme:B, 8dmg:A, 8dmg:B, 4dqk:A, 4dqk:B, 4dql:A, 4dql:B, 8dsg:A, 8dsg:B, 8dsg:C, 8dsg:D, 4dtw:B, 4dtw:A, 4dty:B, 4dty:A, 4dtz:A, 4dtz:B, 4du2:B, 4du2:A, 4dua:A, 4dua:B, 4dub:A, 4dub:B, 4duc:A, 4duc:B, 4dud:A, 4dud:B, 4due:A, 4due:B, 4duf:A, 4duf:B, 4duf:C, 4duf:D, 5dyp:A, 5dyp:C, 5dyz:A, 5dyz:C, 7e46:A, 7e46:B, 5e78:A, 5e78:B, 5e7y:A, 5e7y:B, 5e9z:A, 5e9z:B, 5e9z:C, 5e9z:D, 7egn:A, 7egn:B, 3ekb:A, 3ekb:B, 3ekd:A, 3ekd:B, 3ekf:A, 3ekf:B, 1fag:A, 1fag:B, 1fag:C, 1fag:D, 1fah:A, 1fah:B, 6h1l:A, 6h1l:B, 6h1o:A, 6h1o:B, 6h1s:A, 6h1s:B, 6h1t:A, 6h1t:B, 6h1t:C, 6h1t:D, 4h23:A, 4h23:B, 4h24:A, 4h24:B, 4h24:C, 4h24:D, 4hgf:A, 4hgf:B, 4hgg:A, 4hgg:B, 4hgh:A, 4hgh:B, 4hgi:A, 4hgi:B, 4hgj:A, 4hgj:B, 6hn8:A, 6hn8:B, 8hon:A, 8hon:B, 8hoo:A, 8hoo:B, 8hop:A, 8hop:B, 8hoq:A, 8hoq:B, 8hor:A, 8hor:B, 8hos:A, 8hos:B, 8hot:A, 8hot:B, 8hou:A, 8hou:B, 2hpd:A, 2hpd:B, 6iao:A, 6iao:B, 6iao:C, 6iao:D, 2ij2:A, 2ij2:B, 2ij3:A, 2ij3:B, 2ij4:A, 2ij4:B, 2j1m:A, 2j1m:B, 2j4s:A, 2j4s:B, 8jc3:B, 8jc3:A, 8jc4:A, 8jc4:B, 6jlv:A, 6jlv:B, 1jme:A, 1jme:B, 6jmh:A, 6jmh:B, 6jmw:A, 6jmw:B, 6jo1:A, 6jo1:B, 1jpz:A, 1jpz:B, 5jq2:A, 5jq2:B, 5jqu:A, 5jqu:B, 5jqu:C, 5jqu:D, 5jqu:E, 5jqu:F, 5jqu:G, 5jqu:H, 5jqv:A, 5jqv:B, 5jqv:C, 5jqv:D, 5jqv:E, 5jqv:F, 5jqv:G, 5jqv:H, 6js8:A, 6js8:B, 5jtd:A, 5jtd:B, 6jvc:A, 6jvc:C, 6jzs:A, 6jzs:C, 6k24:A, 6k24:B, 6k3q:A, 6k3q:B, 6k58:A, 6k58:B, 6k9s:A, 6k9s:B, 4kew:A, 4kew:B, 4key:A, 4key:B, 4kf0:A, 4kf0:B, 4kf2:A, 4kf2:B, 4kpa:A, 4kpb:A, 4kpb:B, 3kx3:A, 3kx3:B, 3kx4:A, 3kx4:B, 3kx5:A, 3kx5:B, 6l1a:A, 6l1a:B, 6l1b:A, 6l1b:B, 6ly4:A, 3m4v:A, 3m4v:B, 2nnb:A, 2nnb:B, 3npl:A, 3npl:B, 4o4p:A, 4o4p:B, 5og9:A, 5og9:B, 1p0v:A, 1p0v:B, 1p0w:A, 1p0w:B, 1p0x:A, 1p0x:B, 3qi8:B, 8qze:A, 8qze:B, 8qzf:A, 8qzf:B, 4rsn:A, 4rsn:B, 1smi:A, 1smi:B, 1smj:A, 1smj:B, 1smj:C, 1smj:D, 5ucw:A, 5ucw:B, 2uwh:A, 2uwh:B, 2uwh:C, 2uwh:D, 2uwh:E, 2uwh:F, 7w97:A, 7w97:B, 7w9d:A, 7w9d:B, 7w9j:A, 7w9j:B, 7wdd:A, 7wdd:B, 7wde:A, 7wde:B, 7wdg:A, 7wdg:B, 7wdh:A, 7wdh:B, 7wdi:A, 7wdi:B, 4wg2:A, 4wg2:B, 4wg2:C, 7wg0:A, 7wg0:B, 3wsp:A, 3wsp:B, 7wy1:A, 7wy1:B, 7wy2:A, 7wy2:B, 7wy3:A, 7wy3:B, 7wy4:A, 7wy4:B, 2x7y:A, 2x7y:B, 2x80:A, 2x80:B, 5xa3:A, 5xa3:B, 5xa3:C, 5xa3:D, 5xhj:A, 5xhj:B, 7xzk:A, 7xzk:B, 7y0p:B, 7y0p:A, 7y0q:A, 7y0q:B, 7y0r:A, 7y0r:B, 7y0s:B, 7y0s:A, 7y0t:B, 7y0t:A, 7y0u:A, 7y0u:B, 7y9j:A, 7y9j:B, 7y9k:A, 7y9k:B, 7y9l:A, 7y9l:B, 7y9m:A, 7yd9:A, 7yd9:B, 7yda:A, 7yda:B, 7ydb:A, 7ydb:B, 7ydc:A, 7ydc:B, 7ydd:A, 7ydd:B, 7yde:A, 7yde:B, 7ydl:A, 7ydl:B, 7yft:A, 7yft:B, 7yjd:A, 7yjd:B, 7yje:A, 7yje:B, 7yjf:A, 7yjf:B, 7yjg:A, 7yjg:B, 7yjh:A, 7yjh:B, 1yqo:A, 1yqo:B, 1yqp:A, 1yqp:B, 4zf6:A, 4zf8:A, 4zfa:A, 4zfb:A, 5zis:A, 5zis:B, 5zis:C, 5zis:D, 5zlh:A, 5zlh:B, 5zlh:C, 5zlh:D, 1zo4:A, 1zo4:B, 1zo9:A, 1zo9:B, 1zoa:A, 1zoa:B
48 8dba:J 510 44 0.0773 0.0333 0.3864 0.61 8dba:C, 8dba:B, 8dba:F, 8dba:I, 8dba:L
49 3hf2:A 428 62 0.1091 0.0561 0.3871 0.64 3dgi:B, 3hf2:B, 3psx:A, 3psx:B, 7y9m:B
50 8fwj:A 552 44 0.0773 0.0308 0.3864 0.64 8db3:A, 8db3:B, 8db3:C, 8dba:A, 8dba:E, 8dba:D, 8dba:G, 8dba:H, 8dba:K, 8fwi:A, 8fwi:D, 8fwi:B, 8fwi:K, 8fwi:C, 8fwi:F, 8fwi:E, 8fwi:H, 8fwi:G, 8fwi:J, 8fwi:I, 8fwi:L, 8fwj:B, 8fwj:C, 8fwj:D, 8fwj:E, 8fwj:F, 8fwj:G, 8fwj:H, 8fwj:I, 8fwj:J, 8fwj:K, 8fwj:L
51 7v3x:T 415 158 0.1727 0.0916 0.2405 1.1
52 7v3x:V 437 37 0.0682 0.0343 0.4054 1.1 7v3x:U
53 7v3x:O 461 36 0.0682 0.0325 0.4167 1.2 7dy2:D, 7dy2:G, 7dy2:H, 7dy2:L, 7dye:A, 7dye:B, 7dyi:A, 7dyi:B, 7dyj:A, 7dyj:B, 7dyk:A, 7dyk:B, 7v3x:N, 7v3x:P, 7v3x:X, 7v3x:S, 7wdc:A, 7wdc:B, 8wv8:A, 8wv8:B, 8wve:A, 8wve:B
54 9asj:A 741 91 0.1000 0.0297 0.2418 1.3 9asj:B, 9bp9:A, 9bp9:C, 9bpa:A, 9bpa:C, 9bpa:E, 9bpa:G
55 4dug:A 506 36 0.0682 0.0296 0.4167 1.4 4dug:B, 4dug:C, 4dug:D, 4dug:E, 4dug:F, 3dvl:A, 3dvl:B, 3dvl:C, 3dvl:D, 3dvl:E, 3dvl:F, 7dxq:A, 7dxq:B, 7dxq:C, 7dxq:E, 7dxq:F, 7dxq:D, 7dy2:A, 7dy2:B, 7dy2:C, 7dy2:E, 7dy2:F, 7dy2:I, 7dy2:K, 7dy2:J, 2gbl:A, 2gbl:B, 2gbl:C, 2gbl:D, 2gbl:E, 2gbl:F, 4ijm:A, 4ijm:B, 4ijm:F, 4ijm:C, 4ijm:D, 4ijm:E, 8jon:A, 8jon:B, 8jon:C, 8jon:D, 8jon:E, 8jon:F, 3jzm:A, 3jzm:B, 3jzm:C, 3jzm:D, 3jzm:E, 3jzm:F, 3k09:A, 3k09:B, 3k09:C, 3k09:D, 3k09:E, 3k09:F, 3k0a:A, 3k0a:B, 3k0a:F, 3k0a:C, 3k0a:D, 3k0a:E, 3k0c:A, 3k0c:B, 3k0c:C, 3k0c:D, 3k0c:E, 3k0c:F, 3k0e:A, 3k0e:B, 3k0e:C, 3k0e:D, 3k0e:E, 3k0e:F, 3k0f:A, 3k0f:B, 3k0f:C, 3k0f:D, 3k0f:E, 3k0f:F, 3s1a:A, 3s1a:B, 3s1a:C, 3s1a:D, 3s1a:E, 3s1a:F, 7s65:A, 7s65:B, 7s65:C, 7s65:D, 7s65:E, 7s65:F, 7s66:A, 7s66:B, 7s66:C, 7s66:D, 7s66:E, 7s66:F, 7s67:A, 7s67:B, 7s67:F, 7s67:C, 7s67:D, 7s67:E, 1tf7:A, 1tf7:B, 1tf7:C, 1tf7:D, 1tf7:E, 1tf7:F, 4tl6:A, 4tl6:B, 4tl6:C, 4tl7:A, 4tl7:B, 4tl7:C, 4tl7:D, 4tl7:E, 4tl7:F, 4tl8:A, 4tl8:B, 4tl8:C, 4tl8:D, 4tl8:E, 4tl8:F, 4tl9:A, 4tl9:B, 4tl9:C, 4tl9:D, 4tl9:E, 4tl9:F, 4tla:A, 4tla:B, 4tla:C, 4tla:D, 4tla:E, 4tla:F, 4tlb:A, 4tlb:B, 4tlb:C, 4tlb:D, 4tlb:E, 4tlb:F, 4tlc:A, 4tlc:B, 4tlc:C, 4tlc:D, 4tlc:E, 4tlc:F, 4tld:A, 4tld:B, 4tld:C, 4tld:D, 4tld:E, 4tld:F, 4tle:A, 4tle:B, 4tle:C, 4tle:D, 4tle:E, 4tle:F, 1u9i:A, 1u9i:B, 1u9i:C, 1u9i:D, 1u9i:E, 1u9i:F, 7v3x:A, 7v3x:B, 7v3x:C, 7v3x:E, 7v3x:F, 7v3x:D, 7v3x:G, 7v3x:H, 7v3x:I, 7v3x:K, 7v3x:L, 7v3x:J, 7v3x:R, 7v3x:M, 7v3x:Q, 7v3x:W, 7x1y:A, 7x1y:B, 7x1y:C, 7x1y:D, 7x1y:E, 7x1y:F, 7x1z:A, 7x1z:B, 7x1z:C, 7x1z:D, 7x1z:E, 7x1z:F, 5yz8:A, 5yz8:B, 5yz8:C, 5yz8:D, 5yz8:E, 5yz8:F
56 3iam:2 179 81 0.1182 0.1453 0.3210 1.4 2fug:2, 2fug:B, 2fug:K, 2fug:T, 4hea:2, 4hea:C, 6i0d:2, 6i0d:C, 6i1p:2, 6i1p:C, 3i9v:2, 3i9v:B, 3iam:B, 3ias:2, 3ias:B, 3ias:K, 3ias:T, 3m9s:2, 3m9s:B, 6q8o:2, 6q8o:C, 6q8w:2, 6q8w:C, 6q8x:2, 6q8x:C, 6y11:2, 6y11:C, 2ybb:2, 6ziy:2, 6zjl:2, 6zjn:2, 6zjy:2
57 2xpy:A 628 176 0.1818 0.0637 0.2273 1.4 2xpz:A, 2xq0:A
58 5lkm:A 390 206 0.2227 0.1256 0.2379 2.0 5lkm:C
59 6pod:A 329 83 0.1091 0.0729 0.2892 3.1 3hws:A, 6po1:F, 6pp5:F, 6pp7:A
60 3rva:A 445 41 0.0545 0.0270 0.2927 3.3
61 3ufx:B 378 24 0.0455 0.0265 0.4167 5.9 3ufx:E, 3ufx:G, 3ufx:I
62 6zu5:SS0 144 28 0.0591 0.0903 0.4643 6.7
63 2dr3:D 242 158 0.1818 0.1653 0.2532 7.4 2dr3:A, 2dr3:B, 2dr3:C, 2dr3:E, 2dr3:F
64 6an0:A 433 75 0.0727 0.0370 0.2133 7.9
65 8w0a:C 636 88 0.1045 0.0362 0.2614 9.1 8w0a:A
66 4ekn:B 304 39 0.0636 0.0461 0.3590 9.4
67 3g8q:A 278 62 0.0909 0.0719 0.3226 10.0 3g8q:B, 3g8q:C, 3g8q:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218