Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
ATHRLLLLGAGESGKSTIVKQMRILHVNGTKVQDIKNNLKEAIETIVAAMSNLVPPVELANPENQFRVDYILSVMNVPDF
DFPPEFYEHAKALWEDEGVRACYERSNEYQLIDCAQYFLDKIDVIKQADYVPSDQDLLRCRVLTSGIFETKFQVDKVNFH
MFDVGGQRDERRKWIQCFNDVTAIIFVVASSSYNMVIREDNQTNRLQEALNLFKSIWNNRWLRTISVILFLNKQDLLAEK
VLAGKSKIEDYFPEFARYTTPEDATPEPGEDPRVTRAKYFIRDEFLRISTYCYPHFTCAVDTENIRRVFNDCRDIIQ

The query sequence (length=317) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6eg8:I 372 332 1.0000 0.8522 0.9548 0.0 6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
2 8uo1:A 334 324 0.9054 0.8593 0.8858 0.0 8gga:A
3 8htg:B 334 331 0.8139 0.7725 0.7795 0.0 8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
4 8ggb:A 310 324 0.8360 0.8548 0.8179 0.0 8gg9:A, 8ggc:A
5 8uo4:A 292 321 0.7823 0.8493 0.7726 3.32e-164 8uo2:A
6 8unx:A 244 179 0.5426 0.7049 0.9609 7.50e-126 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
7 8unx:A 244 24 0.0757 0.0984 1.0000 1.00e-07 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
8 8xql:A 240 179 0.4763 0.6292 0.8436 2.14e-104
9 8xql:A 240 26 0.0757 0.1000 0.9231 1.46e-07
10 3c7k:C 311 322 0.4543 0.4630 0.4472 1.50e-83 3c7k:A
11 1agr:A 350 325 0.4448 0.4029 0.4338 4.18e-82 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
12 3v00:C 353 328 0.4322 0.3881 0.4177 5.68e-82 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
13 7rkf:A 350 322 0.4290 0.3886 0.4224 9.22e-78
14 8iys:A 355 314 0.4101 0.3662 0.4140 3.40e-75 3ah8:A, 2bcj:Q, 5do9:A, 5do9:C, 5do9:E, 4ekc:A, 4ekc:C, 4ekd:A, 4gnk:A, 4gnk:C, 8jpb:Q, 8jpc:Q, 8jpe:Q, 4qj3:A, 4qj4:A, 4qj5:A, 2rgn:A, 2rgn:D, 7sq2:A, 8uqn:A, 8uqo:A
15 1shz:D 327 333 0.4164 0.4037 0.3964 3.38e-73 1shz:A
16 1zca:A 318 324 0.4101 0.4088 0.4012 6.70e-72 1zca:B
17 3ab3:A 322 330 0.4132 0.4068 0.3970 4.64e-71 3ab3:C, 3cx6:A, 3cx7:A, 3cx8:A, 1zcb:A
18 3ffb:A 327 325 0.3975 0.3853 0.3877 4.65e-62 1bof:A, 1gdd:A, 4pan:A
19 4fid:A 318 320 0.3596 0.3585 0.3563 3.18e-58 4fid:B
20 2xtz:A 343 257 0.2871 0.2653 0.3541 2.62e-43
21 8pjk:A 222 177 0.2366 0.3378 0.4237 6.31e-41 7e2x:A, 7e2z:A
22 8pjk:A 222 19 0.0536 0.0766 0.8947 0.002 7e2x:A, 7e2z:A
23 2xtz:B 291 242 0.2618 0.2852 0.3430 1.81e-37
24 2xtz:C 270 282 0.2650 0.3111 0.2979 8.22e-33
25 8fn0:B 212 174 0.2303 0.3443 0.4195 1.06e-32
26 8fn0:B 212 22 0.0536 0.0802 0.7727 0.003
27 2k5u:A 181 84 0.0852 0.1492 0.3214 4.10e-05 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
28 5di3:B 204 93 0.0789 0.1225 0.2688 4.34e-05 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
29 6a8d:A 181 95 0.0946 0.1657 0.3158 4.59e-05
30 3lvq:E 420 80 0.0820 0.0619 0.3250 1.14e-04 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
31 5de3:A 166 95 0.0757 0.1446 0.2526 0.001 5di3:A
32 2x77:A 181 85 0.0789 0.1381 0.2941 0.001 2x77:B
33 6bbp:A 520 80 0.0789 0.0481 0.3125 0.001 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
34 1z6x:A 175 78 0.0852 0.1543 0.3462 0.002 1z6x:B
35 4v0l:A 168 91 0.0820 0.1548 0.2857 0.003 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
36 3lrp:A 181 80 0.0757 0.1326 0.3000 0.004
37 8d4c:C 180 80 0.0820 0.1444 0.3250 0.005 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
38 4bas:A 172 42 0.0505 0.0930 0.3810 0.008
39 2h57:B 167 93 0.0820 0.1557 0.2796 0.009 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
40 3doe:A 189 78 0.0757 0.1270 0.3077 0.017 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
41 1yzg:A 168 94 0.0820 0.1548 0.2766 0.024
42 8oul:A 185 94 0.0852 0.1459 0.2872 0.032 8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
43 6zga:C 168 85 0.0662 0.1250 0.2471 0.034 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
44 7rll:B 177 80 0.0757 0.1356 0.3000 0.038 7rll:A
45 4zi2:A 185 94 0.0789 0.1351 0.2660 0.086 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
46 4zi2:A 185 37 0.0473 0.0811 0.4054 6.2 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
47 5uf8:D 160 80 0.0820 0.1625 0.3250 0.11
48 4q66:C 134 85 0.0915 0.2164 0.3412 0.12
49 8oun:A 181 48 0.0536 0.0939 0.3542 0.13 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
50 4y0v:A 165 80 0.0757 0.1455 0.3000 0.23 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
51 4ile:A 176 113 0.0978 0.1761 0.2743 0.34 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
52 2b6h:A 171 78 0.0726 0.1345 0.2949 0.43
53 8e0c:A 185 85 0.0568 0.0973 0.2118 0.56 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
54 3aq4:A 170 80 0.0757 0.1412 0.3000 0.83 3aq4:B
55 1upt:G 170 80 0.0631 0.1176 0.2500 1.4 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
56 1qkz:H 219 58 0.0505 0.0731 0.2759 1.6
57 3zid:A 360 101 0.0946 0.0833 0.2970 2.7 3zid:B
58 3o47:A 289 80 0.0757 0.0830 0.3000 2.8 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
59 3wrx:C 434 43 0.0536 0.0392 0.3953 3.3 3wrx:D, 3wry:C, 3wry:D
60 4kmn:A 103 20 0.0379 0.1165 0.6000 4.5 7trl:A
61 6vs4:A 223 84 0.0568 0.0807 0.2143 6.3 6vs4:B
62 8izl:A 2067 131 0.0978 0.0150 0.2366 7.2 8izm:A, 8x01:A, 8yxm:A, 8yxp:A
63 4u60:C 274 16 0.0315 0.0365 0.6250 7.9 6hku:B, 6hku:C, 6hku:F, 6hku:I, 6hku:J, 6hku:D, 6hkv:A, 6hkv:B, 6hkv:C, 6hkv:D, 6hkv:E, 6hkv:F, 6hkv:G, 6hkv:H, 6hkv:I, 6hkv:J, 4u60:A, 4u60:D, 4u60:E, 4u60:B, 4u61:A, 4u61:B, 4u61:C, 4u61:E, 4u61:H, 4u61:I, 4u61:J, 4u62:B, 4u62:C, 4u62:J
64 6can:A 616 25 0.0315 0.0162 0.4000 8.0 6can:B, 5t88:A, 5t88:B
65 3dtn:A 220 28 0.0410 0.0591 0.4643 9.9 3dtn:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218