BioLiP

>protein
ATHEVHMLNKGESGAMVFEPAFVRAEPGDVINFVPTDKSHNVEAIKEILPEGVESFKSKINESYTLTVTEPGLYGVKCTP
HFGMGMVGLVQVGDAPENLDAAKTAKMPAKARERMDAELAQVN

The query sequence (length=123) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1adw:A	123	123	0.9919	0.9919	0.9919	2.79e-88	1adw:B, 4bwt:A, 4bwt:B, 4bwu:A, 4bwu:B, 4bxv:A, 4bxv:B, 3erx:A, 3erx:B
2	6akn:A	124	122	0.6585	0.6532	0.6639	2.29e-59	6akn:B, 1bqk:A, 1bqr:A, 8hm9:A, 8hm9:B, 6ifp:A, 6ifp:C, 2jkw:A, 2jkw:B, 2ux6:A, 2ux7:A, 2uxf:A, 2uxg:A, 5wv4:A, 5wv4:B, 5xmo:A, 5y23:A, 5y23:B, 4yl4:A, 5ysg:A, 5ysg:B, 5ysg:C, 5ysg:D, 5yw3:A, 5yw3:B, 5yw3:C, 5yw3:D, 5z0x:A, 5z0x:B, 1zia:A, 1zib:A, 5ztd:A, 5ztd:B
3	8k9n:A	125	117	0.5854	0.5760	0.6154	1.62e-54	8k9p:A, 3nyk:A, 2p80:D, 1paz:A, 3paz:A, 4paz:A, 5paz:A, 6paz:A, 7paz:A, 8paz:A, 1py0:A, 1pza:A, 1pzb:A, 4rh4:A, 5x31:A, 5x31:B
4	5b1j:C	124	123	0.4959	0.4919	0.4959	2.28e-37	3ef4:A, 3ef4:B, 3ef4:C
5	1pmy:A	123	119	0.4553	0.4553	0.4706	1.06e-36
6	3tu6:A	127	121	0.4553	0.4409	0.4628	7.07e-35
7	1j5c:A	98	92	0.2764	0.3469	0.3696	2.74e-09	1j5d:A, 1jxd:A, 1jxf:A, 1pcs:A
8	2plt:A	98	89	0.2358	0.2959	0.3258	6.15e-09	7zqe:M
9	1ag6:A	99	98	0.2683	0.3333	0.3367	2.73e-08	1oow:A, 2pcf:A, 1tef:A, 1tef:B, 1teg:A, 1teg:B, 1ylb:B
10	1iuz:A	98	84	0.2195	0.2755	0.3214	8.33e-08
11	1bxu:A	91	83	0.2276	0.3077	0.3373	1.89e-07	1bxv:A
12	4r0o:A	106	94	0.2439	0.2830	0.3191	1.13e-06	1baw:A, 1baw:B, 1baw:C, 3bqv:A, 3cvb:A, 3cvb:B, 3cvc:A, 3cvd:A, 3cvd:B, 3cvd:C, 2q5b:A, 2q5b:B, 2q5b:C, 4r0o:B, 4r0o:C, 4r0o:D, 2w88:A, 2w88:B, 2w88:C, 2w8c:A, 2w8c:B
13	7pcy:A	98	84	0.2033	0.2551	0.2976	1.79e-06
14	1pla:A	97	89	0.2276	0.2887	0.3146	3.01e-06	1plb:A
15	1b3i:A	97	87	0.2520	0.3196	0.3563	5.83e-06	2b3i:A, 2jxm:A
16	9pcy:A	99	96	0.2520	0.3131	0.3229	7.24e-06
17	6yez:P	99	98	0.2358	0.2929	0.2959	1.05e-05	6zoo:P
18	1jxg:A	100	98	0.2195	0.2700	0.2755	1.31e-05	4dp7:X, 4dp8:X, 4dp9:X, 4dpa:X, 4dpb:X, 4dpc:X, 1jxg:B, 3pcy:A, 4pcy:A, 5pcy:A, 6pcy:A, 1plc:A, 1pnc:A, 1pnd:A, 1tkw:A
19	1byo:A	99	89	0.2358	0.2929	0.3258	2.15e-05	1byo:B, 1byp:A
20	4dp0:X	99	98	0.2276	0.2828	0.2857	3.21e-04	4dp1:X, 4dp2:X, 4dp4:X, 4dp5:X, 4dp6:X
21	2gim:A	106	94	0.2276	0.2642	0.2979	3.82e-04	2cj3:A, 2cj3:B, 1fa4:A, 2gim:C, 1nin:A, 1tu2:A
22	6kol:A	125	92	0.2195	0.2160	0.2935	5.58e-04	6l9s:A
23	1aac:A	105	68	0.1707	0.2000	0.3088	0.001	1aan:A, 1bxa:A, 2gb2:A, 2gba:A, 2gc4:C, 2gc4:G, 2gc4:K, 2gc4:O, 2idq:A, 2ids:A, 2idt:A, 2idu:A, 3ie9:A, 3iea:A, 2j55:A, 2j55:B, 2j56:A, 2j56:B, 2j57:A, 2j57:B, 2j57:C, 2j57:D, 3l45:A, 1mda:A, 1mda:B, 1mg2:C, 1mg2:G, 1mg2:K, 1mg2:O, 1mg3:C, 1mg3:G, 1mg3:K, 1mg3:O, 2mta:A, 2ov0:A, 4p5r:A, 4p5s:A, 3ply:A, 3ply:B, 3ply:C, 3ply:D, 2qdv:A, 2qdw:A, 2rac:A, 3rym:A, 3rym:C, 3rym:B, 3rym:D, 1sf3:A, 1sf5:A, 1sfd:A, 1sfd:B, 1sfh:A, 1sfh:B, 1t5k:A, 1t5k:B, 1t5k:C, 1t5k:D
24	4kns:A	285	82	0.2033	0.0877	0.3049	0.11	4kns:B, 4kns:C, 4kns:D, 4kns:E, 4kns:F, 4knt:A, 4knt:B, 4knt:C, 4knu:A, 4knu:B, 4knu:C, 4knu:D, 4knu:E, 4knu:F
25	2bz7:A	102	46	0.1382	0.1667	0.3696	0.19	2bzc:A, 1kdi:A, 1kdj:A
26	3c75:A	106	45	0.1301	0.1509	0.3556	0.29	3c75:B, 1id2:A, 1id2:B, 1id2:C
27	8e9h:D	407	84	0.1707	0.0516	0.2500	0.30	8e9g:D
28	4djd:D	323	53	0.1138	0.0433	0.2642	0.55	4djd:F
29	5u93:B	161	96	0.1301	0.0994	0.1667	1.3	5u93:A, 5u9e:A, 5u9e:B
30	5nif:T	232	70	0.1545	0.0819	0.2714	2.0	5nif:F, 4x6z:T, 4x6z:F
31	3uva:C	405	42	0.1138	0.0346	0.3333	2.8	3uu0:A, 3uu0:B, 3uu0:C, 3uu0:D, 3uva:A, 3uva:B, 3uva:D, 3uxi:A
32	4ptv:A	445	56	0.1463	0.0404	0.3214	3.5	4ptv:B, 4ptw:A, 4ptw:B, 4ptx:A, 4ptx:B
33	5b2o:A	1455	61	0.1545	0.0131	0.3115	4.7	5b2p:A, 5b2q:A
34	7pu7:A	1070	34	0.1057	0.0121	0.3824	4.9	5lew:A

[Back]