BioLiP

>protein
ASWFTALTQHGKEDLKFPRGQGVPINTNSSPDDQIGYYRRAPRWYFYYLGTGPEAGLPYGANKDGIIWVATEGALNTPKD
HIGTRAIVLQLPQGTTLPKGFYA

The query sequence (length=103) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6wkp:A	103	103	1.0000	1.0000	1.0000	1.37e-73
2	7acs:A	140	124	1.0000	0.7357	0.8306	3.00e-67	7act:A, 8iv3:D, 8j6x:A, 8j6x:D, 6vyo:A, 6vyo:B, 6vyo:C, 6vyo:D, 6wkp:B, 6wkp:C, 6wkp:D, 7xwz:A, 7xwz:B, 7xx1:A, 7xx1:B, 7xx1:C, 7xx1:D
3	6lz8:D	112	109	0.6214	0.5714	0.5872	1.13e-36	7dyd:D, 6kl5:C, 6kl6:D, 6lnn:D, 6lz6:D
4	6lz8:B	130	122	0.6214	0.4923	0.5246	1.52e-34	6kl5:A, 6kl6:B
5	4kxj:A	135	123	0.4854	0.3704	0.4065	1.08e-20	4li4:A, 4lm7:A, 4lm9:A, 4lmc:A, 4lmt:A
6	8pme:C	343	31	0.1262	0.0379	0.4194	0.51	8pme:B
7	2owo:A	586	24	0.1165	0.0205	0.5000	1.1	4glx:A, 5tt5:A
8	6omp:A	356	84	0.2330	0.0674	0.2857	1.2	6omp:B, 6omq:A, 6omq:B, 6omr:A, 6omr:B
9	3crl:B	383	53	0.1748	0.0470	0.3396	2.6	2bu2:A, 2bu5:A, 2bu6:A, 2bu7:A, 2bu8:A, 3crk:A, 3crk:B, 3crl:A, 7ea0:A, 7eas:A, 7ebh:A, 5j6a:A, 1jm6:A, 1jm6:B, 6lil:A, 6lil:B, 6lin:A, 6lin:B, 6lin:C, 6lin:D, 6lio:A, 6lio:B, 5m4k:A, 5m4m:A, 5m4n:A, 5m4p:A, 4mp2:A, 4mp7:A, 4mpc:A, 4mpe:A, 4mpn:A, 6tmp:AAA, 6tmq:AAA, 6tmz:AAA, 6tn0:AAA, 6tn2:AAA, 4v25:A, 4v26:A, 7vbu:A, 7vbv:A, 7vbv:B, 7vbx:A, 8zm1:A, 8zm2:A
10	6u05:A	413	14	0.0874	0.0218	0.6429	7.8	6tzm:A, 6tzo:A, 6tzx:A, 6u00:B, 6u03:A, 5u32:A
11	6mf2:A	1222	49	0.1456	0.0123	0.3061	8.9	4bdv:A, 4bdv:B, 3cdz:B, 3j2q:B, 5k8d:A, 5k8d:B, 2r7e:B

[Back]