Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ASKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGTLTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYATVEEVDAAMNARPHKVD
GRVVEPKRAVSREDSQR

The query sequence (length=97) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 9gpj:A 184 91 0.9381 0.4946 1.0000 1.06e-64 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
2 9gpj:A 184 91 0.2990 0.1576 0.3187 5.17e-14 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
3 5en1:A 184 88 0.7010 0.3696 0.7727 2.35e-48 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
4 5en1:A 184 93 0.3093 0.1630 0.3226 1.02e-14 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
5 2rs2:A 84 78 0.4124 0.4762 0.5128 7.88e-25
6 2cjk:A 167 83 0.3814 0.2216 0.4458 2.38e-23 2km8:C
7 2cjk:A 167 84 0.3196 0.1856 0.3690 1.47e-13 2km8:C
8 5x3z:A 96 82 0.3299 0.3333 0.3902 9.56e-19
9 2mgz:B 105 68 0.2887 0.2667 0.4118 5.47e-14 4ch1:A, 4cio:A, 2ru3:A
10 6jvx:A 87 68 0.3093 0.3448 0.4412 7.01e-14 6jvy:A
11 2mb0:B 95 76 0.2887 0.2947 0.3684 9.71e-14
12 5x8p:v 190 78 0.2887 0.1474 0.3590 5.58e-11 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
13 5x8p:v 190 62 0.2371 0.1211 0.3710 1.39e-07 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
14 2leb:A 101 84 0.2887 0.2772 0.3333 4.52e-10 2lec:A
15 1wtb:A 79 79 0.2784 0.3418 0.3418 4.53e-10 1x0f:A
16 7q33:A 93 84 0.2990 0.3118 0.3452 1.43e-09 6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
17 2rra:A 99 78 0.2577 0.2525 0.3205 5.80e-09 2kxn:B
18 2fy1:A 108 82 0.2577 0.2315 0.3049 7.36e-09
19 2mkc:A 118 85 0.2577 0.2119 0.2941 1.75e-08 2my3:A
20 7zew:A 117 72 0.2577 0.2137 0.3472 2.06e-08 7zex:A
21 7dco:X 128 85 0.2577 0.1953 0.2941 2.14e-08 5gm6:V, 5zwm:X
22 4bs2:A 174 78 0.2680 0.1494 0.3333 4.53e-08 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
23 4bs2:A 174 93 0.2680 0.1494 0.2796 2.77e-05 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
24 7dvq:Y 140 73 0.2474 0.1714 0.3288 6.24e-08 8i0p:Y, 8i0r:Y
25 6r5k:H 394 64 0.2577 0.0635 0.3906 2.99e-07 6r5k:D, 6r5k:F
26 6r5k:H 394 59 0.1959 0.0482 0.3220 0.002 6r5k:D, 6r5k:F
27 8i0v:4 161 61 0.2165 0.1304 0.3443 3.75e-07
28 8i0v:4 161 57 0.1649 0.0994 0.2807 0.016
29 5mqf:o 223 75 0.2577 0.1121 0.3333 4.81e-07 6id1:y, 7w59:y, 7w5a:y, 7w5b:y
30 4lmz:A 176 61 0.2268 0.1250 0.3607 1.69e-06 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
31 4lmz:A 176 62 0.2062 0.1136 0.3226 0.001 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
32 5ith:A 80 57 0.1959 0.2375 0.3333 1.86e-06 5o3j:A
33 5kw6:A 201 85 0.1959 0.0945 0.2235 3.02e-06 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
34 5kw6:A 201 60 0.1443 0.0697 0.2333 0.002 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
35 2n82:B 104 83 0.2784 0.2596 0.3253 3.33e-06 2err:A, 7vrl:B
36 8any:A6 74 69 0.1959 0.2568 0.2754 6.14e-06
37 6gd2:A 84 57 0.2165 0.2500 0.3684 9.53e-06 6g2k:A, 6g2k:B, 6gc5:A, 6gc5:B, 6gc5:C, 6gc5:D, 6gd2:B, 6gd3:B, 6gd3:C
38 6xlv:A 203 63 0.1959 0.0936 0.3016 1.76e-05 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
39 6xlv:A 203 68 0.1959 0.0936 0.2794 0.84 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
40 6qx9:1K 201 75 0.2062 0.0995 0.2667 2.05e-05 7b0y:b, 4pjo:K, 4pjo:k, 4pjo:N, 4pjo:n, 8r08:1K, 7vpx:O
41 1fnx:H 174 58 0.1959 0.1092 0.3276 2.06e-05 1fxl:A, 1g2e:A
42 1fnx:H 174 47 0.1340 0.0747 0.2766 0.035 1fxl:A, 1g2e:A
43 8by6:B 152 81 0.2577 0.1645 0.3086 2.60e-05 7abg:A1, 6d0y:A, 1h2t:Z, 1h2u:X, 1h2u:Y, 1n52:B, 5oo6:B, 5oo6:E, 5oo6:H, 5oo6:K, 5oo6:N, 5oo6:Q, 5oo6:T, 5oo6:W, 5oob:D, 5oob:J, 5oob:B, 5oob:G, 8pmp:B, 8pnt:B, 8srr:B, 8suy:B
44 4pkd:B 240 75 0.2062 0.0833 0.2667 3.46e-05 1aud:A, 7b0y:c, 3bo2:A, 3bo3:A, 3bo4:A, 4c4w:A, 4c4w:E, 3cul:A, 3cul:B, 3cun:A, 3cun:B, 7d7v:C, 5ddo:G, 5ddo:C, 5ddp:D, 5ddp:C, 5ddq:D, 5ddq:C, 5ddr:D, 5ddr:C, 7dlz:A, 7dlz:B, 1drz:A, 7dwh:A, 7dwh:B, 1dz5:A, 1dz5:B, 3egz:A, 5fj4:A, 5fj4:E, 3g8s:A, 3g8s:B, 3g8s:C, 3g8s:D, 3g8t:A, 3g8t:B, 3g8t:C, 3g8t:D, 3g96:A, 3g96:B, 3g96:C, 3g96:D, 3g9c:A, 3g9c:B, 3g9c:C, 3g9c:D, 8gxb:C, 8gxb:D, 8gxb:F, 8gxc:C, 8gxc:D, 8gxc:F, 3hhn:B, 3hhn:D, 3iin:A, 3irw:P, 3iwn:C, 3iwn:D, 8jy0:A, 8jy0:C, 8jy0:E, 3k0j:A, 3k0j:B, 3l3c:A, 3l3c:B, 3l3c:C, 3l3c:D, 6las:E, 6las:D, 6las:C, 6lau:E, 6lau:D, 6lau:C, 6lax:D, 6lax:E, 6lax:C, 6laz:D, 6laz:E, 6laz:C, 1m5k:C, 1m5k:F, 1m5o:C, 1m5o:F, 1m5p:C, 1m5p:F, 1m5v:C, 1m5v:F, 3mum:P, 3mur:P, 3mut:P, 3muv:P, 3mxh:P, 2nz4:A, 2nz4:B, 2nz4:C, 2nz4:D, 2oih:A, 2oj3:A, 3p49:B, 4pr6:A, 4prf:A, 7qr3:A, 7qr3:B, 7qr4:A, 6qx9:1A, 3r1h:A, 3r1h:D, 3r1l:A, 3r1l:D, 1sj3:P, 1sj4:P, 1sjf:A, 6sqn:A, 6sqn:B, 6sqn:C, 6sqq:AAA, 6sqq:BBB, 6sqq:CCC, 1u6b:A, 3ucu:P, 3ucz:P, 3ud3:P, 3ud4:P, 1urn:A, 1urn:B, 1urn:C, 1vbx:A, 1vby:A, 1vbz:A, 1vc0:A, 1vc5:A, 1vc6:A, 7vpx:M, 4w90:B, 4w92:B, 1zzn:A
45 4qqb:A 169 60 0.2062 0.1183 0.3333 4.39e-05 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
46 4qqb:A 169 75 0.2577 0.1479 0.3333 0.004 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
47 6n7p:A 186 55 0.1443 0.0753 0.2545 6.27e-05 6n7r:A, 6n7x:A, 7oqc:B, 7oqe:B, 8w2o:A, 5zwn:Q
48 6g90:B 193 55 0.1443 0.0725 0.2545 1.02e-04
49 4ed5:B 169 59 0.1959 0.1124 0.3220 1.20e-04 4ed5:A
50 4ed5:B 169 60 0.1649 0.0947 0.2667 0.036 4ed5:A
51 8ch6:V 285 81 0.2577 0.0877 0.3086 1.20e-04 7qtt:V
52 2x1f:A 94 73 0.1753 0.1809 0.2329 1.39e-04 2km8:B, 2x1a:A
53 7csz:A 175 87 0.2371 0.1314 0.2644 1.39e-04
54 7csz:A 175 52 0.1959 0.1086 0.3654 4.82e-04
55 8i0s:Y 320 81 0.2577 0.0781 0.3086 2.22e-04 8i0t:Y, 8i0u:Y, 8i0v:Y
56 8h6e:4R 106 58 0.1753 0.1604 0.2931 2.33e-04 8h6j:4R, 8qp8:R, 8qp9:R, 8qpk:R, 6qw6:R, 6qx9:R, 8qxd:R, 8r08:R, 8r0a:R
57 2xb2:D 89 57 0.1856 0.2022 0.3158 2.40e-04 2xb2:Z
58 2mgz:A 94 87 0.2577 0.2660 0.2874 3.59e-04
59 5ifm:C 256 53 0.1753 0.0664 0.3208 6.60e-04 5ifm:A
60 5m8i:A 114 71 0.2371 0.2018 0.3239 6.77e-04
61 2xs2:A 87 47 0.1443 0.1609 0.2979 7.73e-04 2xs5:A, 2xs5:B, 2xs7:A
62 2rqc:A 115 69 0.2371 0.2000 0.3333 8.89e-04
63 6m75:A 167 59 0.1753 0.1018 0.2881 0.001
64 7s7b:C 79 77 0.2474 0.3038 0.3117 0.002 7s7b:G, 7s7c:C
65 4f02:A 175 74 0.2062 0.1143 0.2703 0.002 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
66 4f02:A 175 61 0.1649 0.0914 0.2623 0.033 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
67 8y6o:W 167 50 0.1546 0.0898 0.3000 0.002
68 3lqv:B 115 68 0.2268 0.1913 0.3235 0.006 2f9j:B, 3lqv:A, 7q4o:F, 8qo9:B6, 8qxd:B6, 8qzs:B6, 8r08:B6, 8r09:B6, 8r0a:B6, 8r0b:B6, 8rm5:B6
69 8ch6:U 295 83 0.2371 0.0780 0.2771 0.006 7a5p:P, 8c6j:M, 6ff4:P, 6ff7:P, 9fmd:O, 8i0p:O, 8i0r:O, 8i0s:O, 8i0t:O, 8i0u:O, 8i0v:O, 8i0w:O, 6icz:O, 6id0:O, 6id1:O, 5mqf:P, 6qdv:M, 7qtt:U, 8ro2:O, 7w59:O, 7w5a:O, 7w5b:O, 5xjc:O, 5yzg:O, 5z56:O, 5z57:O, 6zym:P
70 3jb9:Y 261 64 0.1856 0.0690 0.2812 0.013
71 8wg3:A 548 49 0.1649 0.0292 0.3265 0.024
72 3d2w:A 72 49 0.1753 0.2361 0.3469 0.030
73 7abi:P 237 75 0.2474 0.1013 0.3200 0.039 7aav:P, 7abg:P
74 7ohx:o 112 56 0.1443 0.1250 0.2500 0.040
75 6c0f:o 133 56 0.1443 0.1053 0.2500 0.054 7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
76 8xxm:3G 84 55 0.1443 0.1667 0.2545 0.073 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
77 6fec:u 76 47 0.1443 0.1842 0.2979 0.085
78 1i8q:A 814 76 0.1856 0.0221 0.2368 0.19 1lxm:A
79 8esq:o 137 56 0.1443 0.1022 0.2500 0.33 8esr:o, 8etg:o, 8eth:o, 8eti:o, 8eup:o, 8euy:o, 8ev3:o
80 8wg4:A 688 78 0.2268 0.0320 0.2821 0.60
81 8fkp:SH 150 31 0.1237 0.0800 0.3871 0.78 8fkq:SH, 8fkr:SH, 8fks:SH, 8fkt:SH, 8fku:SH, 8fkv:SH, 8fkw:SH, 8fkx:SH, 8fky:SH, 8fkz:SH, 8fl2:SH, 8fl6:SH, 8fla:SH, 8fld:SH, 8ine:t, 8inf:t, 8ipx:t, 8ipy:t, 8ir3:t
82 2mki:A 203 67 0.1649 0.0788 0.2388 0.86
83 1rk8:A 87 59 0.1546 0.1724 0.2542 0.94
84 2mkk:A 213 72 0.1753 0.0798 0.2361 0.98
85 8fnk:13 127 55 0.1959 0.1496 0.3455 1.0 6e4p:C, 6e4p:I, 6e4p:B
86 3smz:A 280 61 0.1856 0.0643 0.2951 1.1
87 3smz:A 280 47 0.1237 0.0429 0.2553 1.4
88 1m33:A 256 56 0.2062 0.0781 0.3571 1.6 4etw:C, 4etw:A
89 5m5w:B 1183 22 0.1134 0.0093 0.5000 2.2 4c2m:B, 4c2m:Q, 4c3h:B, 4c3i:B, 4c3j:B, 5g5l:B, 6h67:B, 6h68:B, 6hko:B, 6hlq:B, 6hlr:B, 5m3f:B, 5m3m:B, 5m5x:B, 5m5y:B, 5m64:B, 5n5y:B, 5n5z:B, 5n60:B, 5n61:B, 5oa1:B, 6rqh:B, 6rql:B, 6rqt:B, 6rrd:B, 6rui:B, 6ruo:B, 6rwe:B, 6tps:B, 5w5y:B, 5w64:B, 5w65:B, 5w66:B, 4ym7:AB, 4ym7:BB, 4ym7:CB, 4ym7:DB, 4ym7:EB, 4ym7:FB
90 1fje:B 175 74 0.2268 0.1257 0.2973 2.4 1rkj:A
91 3jb9:a 255 25 0.1134 0.0431 0.4400 3.2
92 7mqa:LW 452 35 0.1443 0.0310 0.4000 4.1
93 7mq8:LW 453 35 0.1443 0.0309 0.4000 4.2 7mq9:LW
94 3ksm:A 276 36 0.1340 0.0471 0.3611 6.3 3ksm:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218