Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ASGMTVTDAGADQPIVFVNRAFSTITGYAPNEVLGRNARFLQGPQTDAATVARLREAIAAARPIQERILNYRKDGQPFWN
QLSISPVRDETGNVVAFVGVQTDVTA

The query sequence (length=106) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8pm1:A 109 106 0.9811 0.9541 0.9811 9.04e-73 7ab6:A, 7ab6:B, 7ab7:A, 7ab7:B, 8pky:A, 8pky:B, 8pm1:B, 6rhf:A, 6rhf:B, 6rhg:A, 6rhg:B, 6y7r:A, 6y7r:B, 6y7u:A, 6y7u:B, 6ywg:A, 6ywg:B, 6ywh:A, 6ywh:B, 6ywi:A, 6ywi:B, 6ywq:A, 6ywq:B, 6ywr:B, 6ywr:A, 6yx4:A, 6yx4:B, 6yx6:A, 6yx6:B, 6yxb:A, 6yxb:B, 6yxb:C, 6yxb:D, 6yxc:A, 6yxc:B
2 7oo9:A 106 106 0.8113 0.8113 0.8113 4.58e-52 7oo9:B
3 2z6d:A 118 92 0.4057 0.3644 0.4674 2.01e-34 2z6d:B
4 2z6c:A 121 101 0.4717 0.4132 0.4950 9.40e-34 2z6c:B
5 8qi8:A 110 95 0.4528 0.4364 0.5053 2.59e-33 1n9l:A, 1n9n:A, 1n9o:A, 8qi9:A, 8qia:A, 8qib:A, 8qif:A, 8qig:A, 8qih:A, 8qii:A, 8qik:A, 8qil:A, 8qim:A, 8qin:A, 8qio:A, 8qip:A, 8qiq:A, 8qir:A, 8qis:A, 8qit:A, 8qiu:A, 8qiv:A, 8qiw:A
6 8j68:A 129 100 0.4434 0.3643 0.4700 1.60e-32 8i11:A, 8il9:A, 8iyn:A
7 6i21:A 135 94 0.4623 0.3630 0.5213 7.10e-32 6i20:A, 6i20:B, 6i20:C, 6i20:D, 6i22:A, 6i22:B, 6i22:C, 6i22:D, 6i23:A, 6i23:B, 6i24:A, 6i25:A
8 3ue6:E 138 103 0.4528 0.3478 0.4660 1.93e-30 3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
9 7qf2:AAA 117 92 0.4245 0.3846 0.4891 2.94e-30 8a2v:A, 8a2w:A, 8a2w:B, 8a4e:A, 4eep:A, 4eer:A, 4ees:A, 4eet:B, 6gpu:A, 6gpv:A, 8q5f:A, 8q5f:B, 7qf3:AAA, 7qf4:AAA, 7qf5:AAA, 6qqh:A, 6qqi:A, 6qqj:A, 6qqk:A, 6qsa:A, 6s45:A, 6s46:A
10 6t74:B 141 94 0.4340 0.3262 0.4894 2.49e-29 5a8b:A, 5a8b:B, 5a8b:C, 5a8b:D, 5dkk:A, 5dkk:B, 5dkl:A, 5dkl:B, 6t73:A, 6t73:B, 6t73:C, 6t74:A
11 4eeu:A 109 90 0.4151 0.4037 0.4889 5.27e-29 7aby:A, 4eet:D, 4nxb:A, 4nxb:B, 4nxe:A, 4nxe:B, 4nxf:A, 4nxf:B, 4nxg:A, 4nxg:B
12 6ph4:B 460 94 0.4811 0.1109 0.5426 5.84e-29 5epv:A, 5epv:B, 5epv:C, 5epv:D, 6ph2:A, 6ph2:B, 6ph2:C, 6ph2:D, 6ph3:A, 6ph3:B, 6ph3:C, 6ph3:D, 6ph4:A, 6pps:A, 6pps:B, 6pps:C, 6pps:D, 3t50:A, 3t50:B
13 7r56:A 137 96 0.4151 0.3212 0.4583 8.24e-29 8a33:A, 8a36:A, 8a36:B, 8a36:C, 8a36:D, 8a37:A, 6gg9:A, 6gg9:B, 6gg9:C, 6gg9:D, 5j3w:A, 5j3w:B, 5j3w:C, 5j3w:D, 5j4e:A, 5j4e:B, 5j4e:C, 5j4e:D, 8q5e:A, 8q5e:B, 7r4s:A, 7r4s:B, 7r4s:C, 7r4s:D, 3sw1:A, 3sw1:B
14 2mwg:A 261 104 0.4623 0.1877 0.4712 1.18e-28 2mwg:B, 2pr5:A, 2pr5:B, 2pr6:A, 2pr6:B
15 4r3a:A 318 102 0.4340 0.1447 0.4510 1.19e-28 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
16 7a6p:A 149 106 0.4245 0.3020 0.4245 2.53e-28 7a6p:B
17 4hhd:A 152 92 0.3962 0.2763 0.4565 3.13e-28 4hhd:B
18 7tbq:A 375 94 0.4245 0.1200 0.4787 5.80e-28 7tal:A, 7tbn:A, 7tbq:B, 7tbq:C, 7tbq:D, 7tbq:E
19 5hzh:A 320 94 0.4245 0.1406 0.4787 7.37e-28
20 4gcz:B 378 104 0.4623 0.1296 0.4712 2.26e-27 4gcz:A
21 2wkp:A 320 94 0.4151 0.1375 0.4681 3.57e-27 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
22 5hzi:A 476 94 0.4151 0.0924 0.4681 3.73e-27 5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
23 7tcd:A 436 94 0.4245 0.1032 0.4787 4.99e-27 4wf0:A, 4wf0:B
24 7r5n:B 151 96 0.3962 0.2781 0.4375 1.24e-26 7r5n:A
25 8c05:A 305 105 0.4057 0.1410 0.4095 2.74e-26
26 6hmj:A 359 103 0.4623 0.1365 0.4757 6.65e-26 6hmj:B, 6hmj:C, 6hmj:D
27 4r3a:B 278 102 0.4245 0.1619 0.4412 8.35e-26
28 8a6x:B 368 96 0.3962 0.1141 0.4375 1.16e-25 8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
29 7yx0:A 166 96 0.3962 0.2530 0.4375 1.92e-25 7yx0:C
30 7wa4:B 107 102 0.4057 0.4019 0.4216 3.86e-25
31 6gb3:A 120 93 0.4151 0.3667 0.4731 7.62e-24 6gay:A, 6gay:B, 6gba:A, 6gbv:A, 4kuk:A, 4kuo:A, 7zqu:A
32 1g28:A 104 93 0.3774 0.3846 0.4301 1.09e-23 1g28:B, 1g28:C, 1g28:D, 1jnu:A, 1jnu:B, 1jnu:C, 1jnu:D
33 5svu:B 135 110 0.4057 0.3185 0.3909 1.12e-23 5svg:B, 5svg:A, 5svg:C, 5svg:D, 5svu:A, 5svu:C, 5svu:D, 5svv:D, 5svv:A, 5svv:B, 5svv:C, 5svw:B, 5svw:A, 5svw:C, 5svw:D, 6wle:B, 6wle:A, 6wle:C, 6wle:D, 6wle:E, 6wle:F, 6wle:G, 6wlp:B, 6wlp:A, 6wlp:C, 6wlp:D, 6wlp:E, 6wlp:F, 6wlp:G
34 8a5r:AAA 206 94 0.3396 0.1748 0.3830 4.16e-23 8a5s:AAA, 3p7n:A, 3p7n:B
35 3hjk:A 150 103 0.3962 0.2800 0.4078 7.65e-21 6cny:A, 6cny:B, 6cny:C, 6cny:D, 3d72:A, 3d72:B, 3hji:A, 3hji:B, 3hjk:B, 3is2:A, 3is2:B, 2pd7:A, 2pd7:B, 2pd8:A, 2pd8:B, 2pdr:A, 2pdr:B, 2pdr:C, 2pdr:D, 3rh8:B, 3rh8:D
36 4wuj:C 145 108 0.3962 0.2897 0.3889 6.57e-17 4wuj:A, 4wuj:B, 4wuj:D
37 2gj3:A 119 102 0.3208 0.2857 0.3333 1.83e-15 2gj3:B
38 4hj6:B 178 102 0.3302 0.1966 0.3431 2.20e-13 4hia:A, 4hia:B, 4hj3:A, 4hj3:B, 4hj4:A, 4hj4:B, 4hj6:A, 4hnb:A, 4hnb:B, 7ob0:A, 7ob0:B, 7ob0:C, 7ob0:D, 7obz:A, 7obz:B, 7obz:C, 7obz:D, 7obz:E, 7obz:F
39 3ewk:A 227 95 0.2736 0.1278 0.3053 4.59e-13
40 3ewk:A 227 92 0.2170 0.1013 0.2500 4.21e-08
41 7yid:A 660 96 0.2642 0.0424 0.2917 1.12e-10 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
42 8dik:A 127 91 0.1981 0.1654 0.2308 6.28e-05 8dik:B
43 6pl0:B 608 84 0.2170 0.0378 0.2738 0.001 5akp:A, 5akp:B, 7l59:A, 6ndo:A, 6ndo:B, 6ndp:A, 6ndp:B, 6pl0:A, 5uyr:A, 5uyr:B
44 1d06:A 130 109 0.3113 0.2538 0.3028 0.037 1ew0:A
45 4xt2:A 116 33 0.0849 0.0776 0.2727 0.56
46 3bwl:A 125 27 0.1226 0.1040 0.4815 1.1 3bwl:B, 3bwl:C, 3bwl:D
47 1s66:L 119 80 0.1887 0.1681 0.2500 1.6 1s66:U, 1s67:L, 1s67:U, 1v9y:A, 1v9y:B, 1v9z:A, 1v9z:B, 1vb6:A, 1vb6:B
48 7ava:A 138 52 0.1509 0.1159 0.3077 3.6 8ao0:A, 9az7:A, 1kou:A, 6mhi:A, 6mhn:A, 6umz:A, 6un0:A
49 1taq:A 807 25 0.1132 0.0149 0.4800 3.9 4bwj:A, 4bwm:A, 4c8k:A, 4c8l:A, 4c8m:A, 4c8n:A, 4c8o:A, 4cch:A, 4df4:A, 4df8:A, 4dfj:A, 4dfk:A, 4dfm:A, 4dfp:A, 4dle:A, 4dlg:A, 5e41:A, 4elt:A, 4elu:A, 4elv:A, 6fbc:A, 6fbd:A, 6fbe:A, 6fbf:A, 6fbg:A, 6fbh:A, 6fbi:A, 2ktq:A, 3ktq:A, 4ktq:A, 5ktq:A, 3lwl:A, 3lwm:A, 3m8r:A, 3m8s:A, 4n5s:A, 5nkl:A, 5o7t:A, 3ojs:A, 3oju:A, 7owf:A, 5oxj:A, 3po4:A, 3po5:A, 3py8:A, 6q4u:A, 6q4v:A, 1qss:A, 1qsy:A, 1qtm:A, 3rr7:A, 3rr8:A, 3rrg:A, 3rrh:A, 3rtv:A, 3sv3:A, 3sv4:A, 3syz:A, 3sz2:A, 5szt:A, 3t3f:A, 1tau:A, 5w6k:A, 5w6q:C, 5w6q:G, 4xiu:A, 5ytc:A, 5ytd:A, 5yte:A, 5ytf:A, 5ytg:A, 5yth:A, 5z3n:A
50 7xi3:A 287 65 0.1321 0.0488 0.2154 4.4
51 6vsu:E 318 25 0.1321 0.0440 0.5600 4.5 6vsu:A, 6vsu:B, 6vsu:C, 6vsu:D, 6vsu:F, 6vsu:G, 6vsu:I, 6vsu:H, 6vsu:J, 6vsu:K, 6vsu:L, 6vsu:M, 6vsu:N, 6vsu:O, 6vsu:P, 6vsu:Q, 6vsu:R, 6vsu:S, 6vsu:T, 6vsu:U, 6vsu:V, 6vsu:W, 6vsu:X
52 4a5l:A 313 26 0.1038 0.0351 0.4231 5.0 4a5l:B, 4a65:A, 4a65:B, 4cbq:A, 4cbq:B, 4ccq:A, 4ccq:B, 4ccr:A, 4ccr:B, 4ccr:C, 4up3:A, 4up3:B
53 4n56:A 494 25 0.1132 0.0243 0.4800 5.1
54 7dv5:U 1189 23 0.1038 0.0093 0.4783 5.4 7e1a:U
55 8pmj:A 1133 23 0.1038 0.0097 0.4783 5.6 8pmd:A
56 8xku:C 921 51 0.1509 0.0174 0.3137 5.8 8xkv:C
57 8pm6:A 872 23 0.1038 0.0126 0.4783 6.1
58 8osl:N 290 57 0.1415 0.0517 0.2632 6.4 4h10:A, 8osk:N, 8osl:P
59 3s3s:A 620 27 0.1226 0.0210 0.4815 7.8 3s3p:A
60 3gue:A 468 35 0.1226 0.0278 0.3714 7.9 3gue:B
61 6kzb:C 649 27 0.1226 0.0200 0.4815 8.2
62 4pyg:A 685 27 0.1226 0.0190 0.4815 8.3 6a8p:A, 6a8p:B, 6a8p:C, 9bc3:A, 9bc3:B, 9bc4:A, 1kv3:A, 1kv3:B, 1kv3:C, 1kv3:D, 1kv3:E, 1kv3:F, 6kzb:A, 6kzb:B, 3ly6:A, 3ly6:B, 3ly6:C, 4pyg:B, 4pyg:E, 8tr9:A
63 2q3z:A 655 27 0.1226 0.0198 0.4815 8.6 9bc2:A, 3s3j:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218