BioLiP

>protein
ASDANINLSSEKQLIKGFGGINHPAWIGDLTAAQRETAFGNGQNQLGFSILRIYVDDNRNNWYREVATAKRAIEQGALVF
ASPWNPPSDMVETFNRNGASAKRLKYDKYAAYAQHLNDFVTFMKNNGVDLYAISVQNEPDYAHDWTWWTPQEILRFMKEN
AGSIQGTRVMAPESFQYLKNISDPILNDPQALANMDILGAHTYGTQIKDFAYPLFKQKGAGKELWMTEVYVPNSDNNSAD
RWPEALDVSYHMHNAMVEGDFQAYVWWYIRRQYGPMKEDGTISKRGYNMAHFSKFVRPGYVRVDATKNPDTNTYVSAYKG
DNKVVIVAINRGTSAASQRFVLQNGNASTVSSYVTDSSRNLASLAPINVSNGAFTAQLPAQSVTTFVANLSGGNSGGGNT
GTTYEAETGTTLTDAVVETLYPGYTGSGYVNFNAYTNSAIEWNAINNMTTGTKNVKFRYALESGTRNLDIYVNGTKVLSN
EPFTETGSWSTWGEKTIQVAMNSGVNTLRIVTTGTEGPNMDNITVTASAKGE

The query sequence (length=532) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4qaw:A	537	534	1.0000	0.9907	0.9963	0.0	4qaw:B, 4qaw:C, 4qaw:D, 4qaw:E, 4qaw:F, 4qaw:G, 4qaw:H, 4qb1:A, 4qb2:A, 4qb6:A
2	3kl0:A	397	390	0.5959	0.7985	0.8128	0.0	3kl3:A, 3kl3:B, 3kl5:A, 3kl5:B, 3kl5:C
3	4uqa:A	391	389	0.5188	0.7059	0.7095	0.0	5a6l:A, 5a6m:A, 4ckq:A, 4uqc:A
4	2y24:A	383	390	0.2970	0.4125	0.4051	1.46e-91
5	7n6o:A	433	346	0.2124	0.2610	0.3266	2.49e-42	7n6o:B
6	2vzp:B	127	124	0.0959	0.4016	0.4113	1.38e-18	2vzp:A, 2vzq:A, 2vzq:B, 2vzr:A, 2vzr:B
7	2w47:A	135	124	0.0883	0.3481	0.3790	4.74e-16	2w1w:A, 2w1w:B
8	6krn:A	456	316	0.1523	0.1776	0.2563	4.84e-14
9	2w87:A	139	128	0.0846	0.3237	0.3516	8.82e-12	2w46:A, 2w46:B, 2w87:B
10	8idp:A	446	335	0.1523	0.1816	0.2418	1.84e-11	8idp:C, 8idp:B, 8idp:D, 8idq:A, 8idq:B, 8idq:C, 8idq:D
11	6m5z:A	433	359	0.1711	0.2102	0.2535	4.10e-11	6m5z:B
12	8cbc:A	455	372	0.1673	0.1956	0.2392	3.35e-09	8c48:A, 8c48:B, 8cbc:B, 7o0e:A, 7o0e:G, 8p67:A, 8p67:B
13	3wnk:A	712	131	0.0846	0.0632	0.3435	4.92e-08	3wnl:A, 3wnm:A, 3wnn:A, 3wnn:B, 3wno:A, 3wno:B, 3wnp:A, 3wnp:B
14	5x7o:A	1247	159	0.0959	0.0409	0.3208	6.60e-08	5x7o:B, 5x7p:B, 5x7p:A, 5x7q:A, 5x7q:B, 5x7r:A, 5x7r:B, 5x7s:A, 5x7s:B
15	5x7o:A	1247	220	0.1165	0.0497	0.2818	1.49e-04	5x7o:B, 5x7p:B, 5x7p:A, 5x7q:A, 5x7q:B, 5x7r:A, 5x7r:B, 5x7s:A, 5x7s:B
16	5ngl:B	454	342	0.1598	0.1872	0.2485	2.10e-07	5ngl:A, 5ngl:C
17	5x7g:A	700	133	0.0865	0.0657	0.3459	4.13e-06	5x7h:A
18	5hxm:A	1060	127	0.0733	0.0368	0.3071	8.29e-06	5f7u:A, 5hpo:A, 5i0d:A, 5i0d:B, 4kmq:A, 4kwu:A
19	2w3j:A	137	125	0.0545	0.2117	0.2320	8.04e-05
20	2wnw:B	445	67	0.0414	0.0494	0.3284	1.22e-04	2wnw:A
21	5nxb:A	644	268	0.1053	0.0870	0.2090	7.71e-04	4ccc:A, 4ccd:A, 4cce:A, 5nxb:B, 4ufh:A, 4ufi:A, 4ufj:A, 4ufk:A, 4ufl:A, 4ufm:A, 6y6s:A, 6y6t:A, 3zr5:A, 3zr6:A
22	3zm8:A	444	128	0.0827	0.0991	0.3438	0.002
23	2wz8:A	135	136	0.0733	0.2889	0.2868	0.009
24	9fa6:A	501	313	0.1184	0.1257	0.2013	0.085	8awk:AAA, 8awr:AAA, 8ax3:A, 8ax3:B, 9f9z:A, 9fa3:A, 9fad:A, 9fal:A, 9fay:A, 9faz:A, 9fb2:A, 9fdi:A, 3gxf:B, 3gxf:D, 5lvx:C, 5lvx:B, 5lvx:A, 5lvx:D, 6moz:A, 2nsx:A, 2nsx:B, 2nsx:C, 2nsx:D, 2nt0:A, 2nt0:B, 2nt0:C, 2nt0:D, 7nwv:AAA, 7nwv:BBB, 8p3e:B, 8p41:A, 8p41:B, 6q1n:A, 6q1n:B, 6q1p:A, 6q1p:B, 6q6k:A, 6q6k:B, 6q6l:A, 6q6l:B, 6q6n:A, 6q6n:B, 3rik:B, 3rik:D, 3ril:A, 3ril:B, 3ril:C, 3ril:D, 6t13:B, 6t13:C, 6t13:A, 6t13:D, 6tjq:BBB, 6tn1:AAA, 2v3d:A, 2v3d:B, 2v3e:A, 2v3e:B, 2vt0:A, 2vt0:B, 2wcg:A, 2wcg:B, 2xwd:A, 2xwd:B, 2xwe:A, 2xwe:B, 1y7v:A, 1y7v:B, 6ytp:AAA, 6ytp:BBB, 6ytr:AAA, 6ytr:BBB, 6yut:AAA, 6yut:BBB, 6yv3:AAA, 6yv3:BBB, 6z39:AAA, 6z39:BBB, 6z3i:BBB
25	1pso:E	326	48	0.0357	0.0583	0.3958	1.8	1qrp:E
26	8gy2:A	723	49	0.0357	0.0263	0.3878	3.3
27	8qch:H	350	44	0.0301	0.0457	0.3636	5.9	8qch:A, 8qch:B, 8qch:C, 8qch:D, 8qch:E, 8qch:F, 8qch:G
28	5awp:A	596	108	0.0526	0.0470	0.2593	6.1	5awq:A
29	1g85:A	159	51	0.0338	0.1132	0.3529	8.8	1g85:B, 1gt1:A, 1gt1:B, 1gt3:A, 1gt3:B, 1gt4:A, 1gt4:B, 1gt5:B, 2hlv:A, 1hn2:A, 1hn2:B, 1pbo:A, 1pbo:B
30	7oyw:A	348	100	0.0432	0.0661	0.2300	9.0	1a99:A, 1a99:B, 1a99:C, 1a99:D, 8asz:A, 8at0:A, 8at0:B, 7oys:A, 7oyt:A, 7oyu:A, 7oyv:A, 7oyv:B, 7oyw:B, 7oyx:A, 7oyx:B, 7oyy:A, 7oyz:A, 6ye0:B, 6ye0:A, 6ye6:A, 6ye6:B, 6ye7:A, 6ye7:B, 6ye8:A, 6ye8:B

[Back]