Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDGYSLEECLEFIAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHM
ADTIEEGTMPKEMSDIIQRLWKDSGIQACFDRASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSRVKTTGIIETQFS
FKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDDEVNRMHESLHLFNSICNHRYFATTSIVLFLNK
KDVFSEKIKKAHLSICFPDYNGPNTYEDAGNYIKVQFLELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKE

The query sequence (length=316) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3v00:C 353 316 0.9177 0.8215 0.9177 0.0 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
2 1agr:A 350 315 0.6930 0.6257 0.6952 1.76e-173 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
3 3ffb:A 327 315 0.6234 0.6024 0.6254 1.79e-147 1bof:A, 1gdd:A, 4pan:A
4 3c7k:C 311 312 0.6329 0.6431 0.6410 9.22e-146 3c7k:A
5 1shz:D 327 322 0.5696 0.5505 0.5590 1.69e-128 1shz:A
6 7rkf:A 350 315 0.5158 0.4657 0.5175 1.16e-109
7 8iys:A 355 303 0.4968 0.4423 0.5182 6.33e-105 3ah8:A, 2bcj:Q, 5do9:A, 5do9:C, 5do9:E, 4ekc:A, 4ekc:C, 4ekd:A, 4gnk:A, 4gnk:C, 8jpb:Q, 8jpc:Q, 8jpe:Q, 4qj3:A, 4qj4:A, 4qj5:A, 2rgn:A, 2rgn:D, 7sq2:A, 8uqn:A, 8uqo:A
8 8pjk:A 222 164 0.3639 0.5180 0.7012 1.43e-86 7e2x:A, 7e2z:A
9 8pjk:A 222 35 0.0696 0.0991 0.6286 1.82e-05 7e2x:A, 7e2z:A
10 1zca:A 318 322 0.4272 0.4245 0.4193 6.39e-86 1zca:B
11 8htg:B 334 330 0.4589 0.4341 0.4394 8.95e-86 8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
12 3ab3:A 322 323 0.4209 0.4130 0.4118 3.79e-82 3ab3:C, 3cx6:A, 3cx7:A, 3cx8:A, 1zcb:A
13 6eg8:I 372 331 0.4335 0.3683 0.4139 2.25e-81 6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
14 8fn0:B 212 223 0.3703 0.5519 0.5247 3.80e-71
15 8fn0:B 212 26 0.0696 0.1038 0.8462 3.66e-05
16 2xtz:A 343 327 0.4082 0.3761 0.3945 7.33e-70
17 8uo1:A 334 328 0.4209 0.3982 0.4055 1.41e-69 8gga:A
18 8ggb:A 310 327 0.3987 0.4065 0.3853 6.99e-66 8gg9:A, 8ggc:A
19 4fid:A 318 320 0.3608 0.3585 0.3563 1.90e-64 4fid:B
20 2xtz:B 291 320 0.3987 0.4330 0.3937 6.18e-64
21 2xtz:C 270 320 0.3892 0.4556 0.3844 6.22e-57
22 8uo4:A 292 326 0.3544 0.3836 0.3436 8.70e-50 8uo2:A
23 8unx:A 244 178 0.2468 0.3197 0.4382 9.26e-44 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
24 8unx:A 244 23 0.0633 0.0820 0.8696 9.18e-05 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
25 8xql:A 240 182 0.2627 0.3458 0.4560 3.29e-42
26 8xql:A 240 25 0.0601 0.0792 0.7600 2.97e-04
27 3lvq:E 420 95 0.0823 0.0619 0.2737 1.17e-05 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
28 7rll:B 177 95 0.0823 0.1469 0.2737 3.49e-05 7rll:A
29 6a8d:A 181 97 0.0791 0.1381 0.2577 3.61e-05
30 6bbp:A 520 95 0.0791 0.0481 0.2632 1.52e-04 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
31 2k5u:A 181 95 0.0696 0.1215 0.2316 1.81e-04 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
32 3lrp:A 181 111 0.0823 0.1436 0.2342 6.01e-04
33 5de3:A 166 98 0.0759 0.1446 0.2449 0.002 5di3:A
34 8d4c:C 180 95 0.0759 0.1333 0.2526 0.002 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
35 3doe:A 189 90 0.0791 0.1323 0.2778 0.004 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
36 1z6x:A 175 97 0.0759 0.1371 0.2474 0.004 1z6x:B
37 2x77:A 181 85 0.0570 0.0994 0.2118 0.008 2x77:B
38 5lhk:A 455 69 0.0696 0.0484 0.3188 0.015
39 5di3:B 204 124 0.0854 0.1324 0.2177 0.044 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
40 1yzg:A 168 84 0.0696 0.1310 0.2619 0.053
41 6pta:A 165 97 0.0665 0.1273 0.2165 0.061 6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
42 8e0c:A 185 119 0.0918 0.1568 0.2437 0.061 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
43 2h57:B 167 95 0.0823 0.1557 0.2737 0.061 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
44 3aq4:A 170 95 0.0728 0.1353 0.2421 0.083 3aq4:B
45 4y0v:A 165 97 0.0665 0.1273 0.2165 0.15 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
46 2b6h:A 171 95 0.0696 0.1287 0.2316 0.26
47 8oun:A 181 46 0.0443 0.0773 0.3043 0.37 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
48 4ile:A 176 111 0.0759 0.1364 0.2162 0.89 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
49 5irm:C 770 81 0.0728 0.0299 0.2840 1.0 5irl:A, 5irm:A, 5irn:A
50 3o47:A 289 95 0.0696 0.0761 0.2316 1.0 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
51 4zi2:A 185 80 0.0506 0.0865 0.2000 1.0 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
52 4v0l:A 168 93 0.0665 0.1250 0.2258 1.1 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
53 5t50:A 229 69 0.0728 0.1004 0.3333 1.7 5t50:B, 5t52:A, 5t52:B, 5t54:A, 5t54:B, 5t55:A, 5t55:B, 5t5j:A, 5t5j:B, 5t5l:A, 5t5l:B, 5t5o:A, 5t5o:B, 5t5o:F, 5t5o:C, 5t5o:I, 5t5o:D, 5t5o:E, 5t5o:G, 5t5o:J, 5t5o:H, 5t5p:A, 5t5p:B
54 3cnl:A 233 58 0.0570 0.0773 0.3103 1.9 3cnn:A, 3cno:A
55 6zga:C 168 37 0.0348 0.0655 0.2973 2.5 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
56 3b6n:A 150 71 0.0601 0.1267 0.2676 2.7
57 2vma:A 122 51 0.0538 0.1393 0.3333 2.8 3c1q:A, 3c1q:B, 2vma:B, 2vmb:A, 2vmb:B
58 5xc3:A 168 85 0.0665 0.1250 0.2471 4.3 5xc5:A
59 4bas:A 172 54 0.0475 0.0872 0.2778 4.7
60 9fdv:B 419 59 0.0538 0.0406 0.2881 6.6 9fdj:B, 9fdj:D, 9fdk:B, 9fdk:D, 9fdv:D, 9fe0:B, 9fe0:D, 9fe5:B, 9fe5:D, 9fe7:B, 9fe7:D, 9fe8:B, 9fe8:D, 9fea:B, 9fea:D, 9fif:B, 9fif:D, 9fih:B, 9fih:D, 9fii:B, 9fii:D, 9fij:B, 9fij:D, 9fil:B, 9fil:D, 6hl2:B, 6hl2:D, 6hl3:B, 6hl3:D, 6hl4:B, 6hl4:D, 6hla:B, 6hla:D, 6hli:B, 6hli:D, 6hlj:B, 6hlj:D, 6hlm:B, 6hlm:D, 7q5y:C, 7q5y:I, 7q5y:O, 7q5y:U, 6q9c:B, 6q9c:D, 6q9g:B, 6q9g:D, 6q9j:B, 6q9j:D, 6q9k:B, 6q9k:D, 8qg1:B, 8qg1:D, 8qgw:B, 8qgw:D, 8qh4:B, 8qh4:D, 8qh7:B, 8qh7:D, 8qhk:B, 8qhk:D, 6r7p:B, 6r7p:D, 6saq:B, 6saq:D
61 8oul:A 185 96 0.0665 0.1135 0.2188 6.7 8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
62 4ewv:B 492 63 0.0633 0.0407 0.3175 7.8 4ewv:A
63 5qgg:A 186 97 0.0759 0.1290 0.2474 8.0 5qgh:A, 5qgi:A, 5qgj:A, 5qgk:A, 5qgl:A, 5qgm:A, 5qgn:A, 5qgo:A, 5qgp:A, 5qgq:A, 5qgr:A, 5qgs:A, 5qgt:A, 5qgu:A, 5qgv:A, 5qgw:A, 5qgx:A, 5qgy:A, 5qgz:A, 5qh0:A, 5qh1:A, 5qh2:A, 5qh3:A, 5qh4:A, 5qh5:A, 5qh6:A, 5qh7:A, 5qh8:A, 5qh9:A, 5qha:A, 5qhb:A, 5qhc:A, 5qhe:A, 5qhf:A, 5qhg:A, 5qhh:A
64 4epm:A 554 63 0.0633 0.0361 0.3175 9.4 4eq4:A, 4eq4:B, 4eql:A, 4eql:B, 4l39:A, 4l39:B, 6oms:A, 6oms:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218