Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
ARSYAEQLIDTLEAQGVKRIYGLVGDSLNPIVDAVRQSGIEWVHVRNEEAAAFAAGAESLITGELAVCAASCGPGNTHLI
QGLYDSHRNGAKVLAIASHIPSAQIGSTFFQETHPEILFKECSGYCEMVNGGEQGERILHHAIQSTMAGKGVSVVVIPGD
IAKEDAGDGTYSNSTISSGTPVVFPDPTEAAALVEAINNAKSVTLFCGAGVKNARAQVLELAEKIKSPIGHALGGKQYIQ
HENPFEVGMSGLLGYGACVDASNEADLLILLGTDFPYSDFLPKDNVAQVDINGAHIGRRTTVKYPVTGDVAATIENILPH
VKEKTDRSFLDRMLKAHERKLSSVVETYTHNVEKHVPIHPEYVASILNELADKDAVFTVDTGMCNVWHARYIENPEGTRD
FVGSFRHGTMANALPHAIGAQSVDRNRQVIAMCGDGGLGMLLGELLTVKLHKLPLKAVVFNNSSLGMVKLEMLVEGQPEF
GTDHEEVNFADIAAAAGIKSVRITDPTKVREQLADALAYPGPVLIDIVTDPNALSIPPTITWEQVMGFSKAATRTVFGGG
VGAMIDLARSNIRNIP

The query sequence (length=576) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 9ev3:A 577 576 0.9896 0.9879 0.9896 0.0 9ev5:A, 9ev5:B, 9ev5:C, 9ev5:D, 9ev6:A, 9ev6:B, 9ev6:C, 9ev6:D
2 9ev4:A 553 575 0.9601 1.0000 0.9617 0.0
3 3ey9:A 571 572 0.4618 0.4658 0.4650 1.87e-171 3ey9:B, 3eya:A, 3eya:B, 3eya:C, 3eya:D, 3eya:E, 3eya:F, 3eya:G, 3eya:H, 3eya:I, 3eya:J, 3eya:K, 3eya:L
4 2dji:A 590 523 0.2674 0.2610 0.2945 1.45e-61 1v5e:A, 1v5f:A, 1v5g:A
5 4fee:A 586 531 0.2535 0.2491 0.2750 5.69e-57 2ez4:A, 2ez4:B, 2ez8:A, 2ez8:B, 2ez9:A, 2ez9:B, 2ezt:A, 2ezt:B, 2ezu:A, 2ezu:B, 4fee:B, 4feg:A, 4feg:B, 6haf:A, 6haf:B, 4kgd:A, 4kgd:B, 1pow:A, 1pow:B, 1pox:A, 1pox:B, 1y9d:B
6 5k2o:A 585 564 0.2656 0.2615 0.2713 7.58e-51 3e9y:A, 3ea4:A, 8et4:A, 8et5:A, 5k3s:A, 5k6q:A, 5k6r:A, 5k6t:A, 7stq:A, 7tzz:A, 7u1d:A, 7u1u:A, 7u25:A, 6u9h:A, 6u9h:B, 6u9h:H, 6u9h:I, 6u9h:L, 6u9h:M, 6u9h:P, 6u9h:Q, 6vz8:E, 6vz8:I, 6vz8:M, 6vz8:Q, 5wj1:A, 1ybh:A, 1yhy:A, 1yhz:A, 1yi0:A, 1yi1:A, 1z8n:A
7 1y9d:D 560 526 0.2500 0.2571 0.2738 1.33e-50 1y9d:A, 1y9d:C
8 6lpi:B 539 537 0.2604 0.2783 0.2793 7.30e-50 6lpi:A, 6lpi:C, 6lpi:D
9 6vz8:D 531 538 0.2552 0.2768 0.2732 2.08e-46 6vz8:H, 6vz8:L, 6vz8:P
10 6deq:A 601 551 0.2309 0.2213 0.2414 5.54e-39 6dek:A, 6del:A, 6dem:A, 6den:A, 6deo:A, 6dep:A, 6der:A, 6des:A
11 7egv:A 590 562 0.2587 0.2525 0.2651 2.28e-38 7egv:B, 7ehe:A, 7ehe:B
12 1t9b:A 583 557 0.2257 0.2230 0.2334 2.60e-35 1t9d:B, 1t9d:C
13 6u9d:B 607 564 0.2205 0.2092 0.2252 4.98e-34 6bd3:A, 6bd3:B, 6bd9:A, 6bd9:B, 5fem:A, 5fem:B, 5ims:A, 5ims:B, 1jsc:A, 1jsc:B, 1n0h:A, 1n0h:B, 1t9a:A, 1t9a:B, 1t9b:B, 1t9c:A, 1t9c:B, 1t9d:A, 1t9d:D, 6u9d:A, 6u9d:E, 6u9d:F, 6u9d:I, 6u9d:J, 6u9d:M, 6u9d:N, 6u9d:Q, 6u9d:U, 6u9d:V, 5wkc:A, 5wkc:D, 5wkc:B, 5wkc:E
14 6wo1:A 551 525 0.2361 0.2468 0.2590 3.08e-33
15 4rji:C 555 546 0.2465 0.2559 0.2601 3.25e-32 4rji:A, 4rji:B, 4rji:D, 4rjj:A, 4rjj:B, 4rjj:C, 4rjj:D, 4rjj:E, 4rjj:F, 4rjj:G, 4rjj:H, 4rjk:A, 4rjk:B, 4rjk:C, 4rjk:D, 4rjk:E, 4rjk:F, 4rjk:G, 4rjk:H
16 5dx6:B 557 546 0.2344 0.2424 0.2473 8.13e-31 5d6r:B, 5d6r:M, 5dx6:A, 1ozf:A, 1ozf:B, 1ozg:A, 1ozg:B, 1ozh:A, 1ozh:B, 1ozh:C, 1ozh:D, 5wdg:A, 5wdg:B
17 5ahk:A 555 535 0.2361 0.2450 0.2542 3.99e-30 5ahk:B
18 8i01:A 594 561 0.2257 0.2189 0.2317 8.56e-29 8beo:A, 8beo:B, 8beo:C, 8beo:E, 8beo:D, 8beo:F, 8i01:B, 8i01:C, 8i01:E, 8i01:D, 8i01:F, 8i05:A, 8i05:B, 8i05:C, 8i05:E, 8i05:D, 8i05:F, 8i07:A, 8i07:B, 8i07:C, 8i07:E, 8i07:D, 8i07:F, 8i08:A, 8i08:B, 8i08:C, 8i08:E, 8i08:D, 8i08:F, 2pan:A, 2pan:B, 2pan:C, 2pan:D, 2pan:E, 2pan:F
19 6xn8:A 540 552 0.2344 0.2500 0.2446 1.39e-26 6xn8:B
20 7pt4:B 584 554 0.2326 0.2295 0.2419 9.16e-24 7pt1:A, 7pt1:B, 7pt2:A, 7pt2:B, 7pt3:A, 7pt3:B, 7pt4:A
21 8rph:D 608 570 0.2326 0.2204 0.2351 4.02e-22 8rph:A, 8rph:B, 8rph:C, 8rph:E, 8rpi:A, 8rpi:B, 8rpi:C, 8rpi:D, 8rpi:E, 8rpi:F, 8rpj:A, 8rpj:B, 8rpj:C, 8rpj:E, 8rpj:D, 8rpj:F
22 6a50:A 527 409 0.1719 0.1879 0.2421 1.67e-18 6a50:B, 1bfd:A, 5dei:A, 5dei:C, 5dei:D, 5dei:B, 5dgd:A, 5dgt:A, 3f6b:X, 3f6e:X, 2fn3:A, 3fsj:X, 2fwn:A, 3fzn:A, 3fzn:B, 3fzn:D, 3fzn:C, 4gg1:A, 4gm0:A, 4gm1:A, 4gm4:A, 4gp9:A, 4gpe:A, 4jd5:A, 4ju8:A, 4ju9:A, 4jua:A, 4jub:A, 4jub:D, 4jub:B, 4jub:C, 4juc:A, 4juc:C, 4juc:B, 4juc:D, 4jud:X, 4juf:A, 4juf:C, 4juf:B, 4juf:D, 4k9k:A, 4k9l:A, 4k9m:A, 4k9n:A, 4k9n:C, 4k9n:B, 4k9n:D, 4k9o:A, 4k9o:C, 4k9o:B, 4k9o:D, 4k9p:A, 4k9p:C, 4k9p:B, 4k9p:D, 6m2y:A, 6m2z:A, 1mcz:A, 1mcz:B, 1mcz:C, 1mcz:D, 1mcz:E, 1mcz:F, 1mcz:G, 1mcz:H, 1mcz:I, 1mcz:J, 1mcz:K, 1mcz:L, 1mcz:M, 1mcz:N, 1mcz:O, 1mcz:P, 4mpj:A, 4mpp:A, 4mpr:A, 4mq5:A, 4mzx:A, 1pi3:A, 1po7:A, 1q6z:A, 4qel:A, 2v3w:A, 2v3w:C, 2v3w:B, 2v3w:D, 1yno:A
23 2q28:A 550 551 0.1962 0.2055 0.2051 1.70e-16 2q27:A, 2q27:B, 2q28:B, 2q29:A, 2q29:B
24 4qq8:C 569 570 0.2240 0.2267 0.2263 1.49e-14 2ag0:A, 2ag0:B, 2ag0:C, 2ag0:D, 2ag1:A, 2ag1:B, 2ag1:C, 2ag1:D, 3d7k:A, 3d7k:B, 3iae:A, 3iae:B, 3iaf:A, 3iaf:B, 3iaf:C, 3iaf:D, 4qpz:A, 4qpz:B, 4qpz:C, 4qpz:D, 4qpz:E, 4qpz:F, 4qpz:G, 4qpz:H, 4qq8:A, 4qq8:B, 4qq8:D, 2uz1:A, 2uz1:B, 2uz1:C, 2uz1:D
25 6qsi:A 525 539 0.2049 0.2248 0.2189 1.65e-13 6qsi:B
26 7orx:CCC 531 563 0.2135 0.2316 0.2185 2.01e-13 7orx:AAA, 7orx:BBB, 7orx:DDD
27 8rph:F 520 176 0.0920 0.1019 0.3011 1.87e-12
28 8rph:F 520 154 0.0712 0.0788 0.2662 0.073
29 2q5l:A 538 543 0.2101 0.2249 0.2228 2.21e-12 2nxw:A, 2nxw:B, 2q5j:A, 2q5j:B, 2q5l:B, 2q5o:A, 2q5o:B, 2q5q:A, 2q5q:B
30 2ihv:A 563 519 0.2188 0.2238 0.2428 3.08e-12 2iht:A, 2iht:B, 2iht:C, 2iht:D, 2ihu:A, 2ihu:B, 2ihu:C, 2ihu:D, 2ihv:B, 2ihv:C, 2ihv:D, 1upa:A, 1upa:B, 1upa:C, 1upa:D, 1upb:A, 1upb:B, 1upb:C, 1upb:D, 1upc:A, 1upc:B, 1upc:C, 1upc:D, 1upc:E, 1upc:F
31 6u9d:R 416 211 0.0885 0.1226 0.2417 1.55e-11
32 4d5e:B 587 560 0.2014 0.1976 0.2071 4.74e-11 4d5e:A, 4d5g:A, 4d5g:B, 2pgn:A, 2pgn:B, 2pgo:A, 2pgo:B
33 2ji6:A 559 554 0.2066 0.2129 0.2148 1.46e-09 2c31:A, 2c31:B, 2ji6:B, 2ji7:A, 2ji7:B, 2ji8:A, 2ji8:B, 2ji9:A, 2ji9:B, 2jib:A, 2jib:B
34 4q9d:B 519 364 0.1406 0.1561 0.2225 3.31e-08 4q9d:A
35 7b2e:A 548 547 0.1858 0.1953 0.1956 4.02e-07 7ayg:A, 7ayg:B, 7ayg:C, 7ayg:D, 7ayg:E, 7ayg:F, 7ayg:G, 7ayg:H, 7b2e:B, 7b2e:C, 7b2e:D, 7b2e:E, 7b2e:F, 7b2e:G, 7b2e:H
36 4k9q:A 531 358 0.1372 0.1488 0.2207 6.53e-07 4k9q:B
37 2vbf:B 546 473 0.1597 0.1685 0.1945 3.58e-06 2vbf:A, 2vbg:A, 2vbg:B
38 1ovm:A 535 540 0.2118 0.2280 0.2259 8.50e-06 1ovm:B, 1ovm:C, 1ovm:D
39 5npu:A 547 574 0.2083 0.2194 0.2091 0.003 5npu:B, 5npu:C, 5npu:D
40 6vgs:BBB 543 460 0.1528 0.1621 0.1913 0.004 6vgs:AAA, 6vgs:CCC, 6vgs:DDD
41 6efg:D 537 486 0.1788 0.1918 0.2119 0.007 6efg:A, 6efg:B
42 2vjy:A 562 496 0.1840 0.1886 0.2137 0.054 6efg:E, 6efh:A, 6efh:B, 2vjy:B, 2vjy:C, 2vjy:D, 2vk4:A, 2vk4:B, 2vk4:C, 2vk4:D
43 5tma:A 567 285 0.1094 0.1111 0.2211 0.064 3oe1:A, 3oe1:B, 3oe1:C, 3oe1:D, 5tma:B, 2wva:A, 2wva:B, 2wva:E, 2wva:F, 2wva:V, 2wva:Z, 2wva:X, 2wva:Y, 2wvg:A, 2wvg:B, 2wvg:E, 2wvg:F, 1zpd:A, 1zpd:B, 1zpd:E, 1zpd:F, 4zp1:A, 4zp1:B, 4zp1:C, 4zp1:D
44 2vbi:A 554 171 0.0712 0.0740 0.2398 0.064 2vbi:B, 2vbi:C, 2vbi:D, 2vbi:E, 2vbi:F, 2vbi:G, 2vbi:H
45 5b47:B 275 126 0.0556 0.1164 0.2540 0.23
46 4cok:B 549 158 0.0625 0.0656 0.2278 0.29 4cok:A
47 8j4u:O 585 42 0.0347 0.0342 0.4762 0.61 8j4u:M, 8j4u:N, 8su9:M, 8su9:N, 8su9:O, 8sub:M, 8sub:N, 8sub:O, 8suw:M, 8suw:N, 8suw:O, 8uae:M, 8uae:N, 8uae:O, 8uaf:M, 8uaf:N, 8uaf:O
48 8j4u:P 559 42 0.0347 0.0358 0.4762 0.63 8j4u:Q, 8su9:P, 8su9:Q, 8sub:P, 8sub:Q, 8uae:P, 8uae:Q, 8uaf:P, 8uaf:Q
49 5euj:E 556 111 0.0451 0.0468 0.2342 0.82 5euj:A, 5euj:B, 5euj:C, 5euj:D, 5euj:F, 5euj:G, 5euj:H, 5euj:I, 5euj:J, 5euj:K, 5euj:L, 5euj:M, 5euj:N, 5euj:O, 5euj:P, 5euj:Q, 5euj:R, 5euj:S, 5euj:T, 5euj:U, 5euj:V, 5euj:W, 5euj:X
50 2vk1:A 562 121 0.0486 0.0498 0.2314 0.95 1pvd:A, 1pvd:B, 1pyd:A, 1pyd:B, 1qpb:A, 1qpb:B, 2vk1:B, 2vk1:C, 2vk1:D, 2vk8:A, 2vk8:B, 2vk8:C, 2vk8:D, 2w93:A, 2w93:B, 2w93:C, 2w93:D
51 8r2j:B 275 56 0.0330 0.0691 0.3393 1.0 8r2j:A
52 2gpy:B 192 134 0.0538 0.1615 0.2313 1.1 2gpy:A
53 1bul:A 265 66 0.0382 0.0830 0.3333 2.2
54 7bly:A 216 139 0.0521 0.1389 0.2158 2.4
55 5b46:B 301 133 0.0573 0.1096 0.2481 2.8
56 2gge:D 376 52 0.0312 0.0479 0.3462 3.5 2gge:A, 2gge:B, 2gge:C, 2gge:E, 2gge:F, 2gge:G, 2gge:H
57 7msw:A 635 122 0.0434 0.0394 0.2049 3.6 7exm:A, 7exm:B, 7exm:C, 7exm:D, 7msx:A
58 4q57:B 244 44 0.0243 0.0574 0.3182 3.8
59 6bcu:W 1052 136 0.0608 0.0333 0.2574 4.3 6bcu:Y, 6bcx:W, 6bcx:Y, 9f42:E, 9f43:E, 9f44:E, 9f44:F, 9f45:E, 9f45:F, 8rch:W, 8rch:Y, 8rck:Y, 8rcn:Y
60 6mkq:A 262 62 0.0312 0.0687 0.2903 6.0
61 5dky:A 928 96 0.0451 0.0280 0.2708 6.1 5dkz:A, 5dl0:A
62 2ych:A 336 76 0.0330 0.0565 0.2500 7.0
63 4nft:D 178 60 0.0278 0.0899 0.2667 7.3 9b3p:C, 4cay:A, 7m1x:G, 6m4d:C, 6m4d:G, 4nft:C
64 4a6a:A 189 96 0.0312 0.0952 0.1875 8.4 4a6a:E, 4a6a:B, 4a6a:D, 4a6a:C, 4a6a:F, 4a6a:G, 4a6a:K, 4a6a:H, 4a6a:J, 4a6a:I, 4a6a:L, 2qxx:A, 2qxx:B
65 8h9d:A 1114 68 0.0312 0.0162 0.2647 9.9

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218