BioLiP

>protein
ARSTNTFNYATYHTLDEIYDFMDLLVAEHPQLVSKLQIGRSYEGRPIYVLKFSTGGSNRPAIWIDLGIHSREWITQATGV
WFAKKFTEDYGQDPSFTAILDSMDIFLEIVTNPDGFAFTHSQNRLWRKTRSVTSSSLCVGVDANRNWDAGFGKAGASSSP
CSETYHGKYANSEVEVKSIVDFVKDHGNFKAFLSIHSYSQLLLYPYGYTTQSIPDKTELNQVAKSAVEALKSLYGTSYKY
GSIITTIYQASGGSIDWSYNQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAQETWLGVLTIMEHTVNN

The query sequence (length=307) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1pyt:B	309	307	0.9967	0.9903	0.9967	0.0	2abz:A, 2abz:B, 1arm:A, 1bav:A, 1bav:B, 1bav:C, 1bav:D, 1cbx:A, 1cps:A, 1cpx:A, 3cpa:A, 4cpa:A, 4cpa:B, 5cpa:A, 6cpa:A, 7cpa:A, 8cpa:A, 2ctb:A, 2ctc:A, 1ee3:P, 1ell:P, 1elm:P, 1f57:A, 3fvl:A, 3fvl:C, 3fvl:E, 3fx6:A, 3fx6:C, 3fx6:E, 1hdq:A, 1hdu:A, 1hdu:B, 1hdu:D, 1hdu:E, 1hee:A, 1hee:B, 1hee:D, 1hee:E, 3hlp:A, 3hlp:B, 3huv:A, 3i1u:A, 1iy7:A, 3kgq:A, 1m4l:A, 2rfh:A, 1yme:A, 1zlh:A
2	1pca:A	402	307	0.8697	0.6642	0.8697	0.0
3	5om9:A	396	306	0.8078	0.6263	0.8105	0.0	3fju:A, 6i6z:A, 6i6z:B, 5om9:B, 4uee:A, 4uee:B, 4uez:A, 4uez:B, 2v77:A, 2v77:B
4	1aye:A	401	303	0.6645	0.5087	0.6733	4.84e-155	1dtd:A
5	2boa:A	404	307	0.6124	0.4653	0.6124	1.11e-148	4a94:A, 4a94:B, 4bd9:A, 2bo9:A, 2bo9:C, 2boa:B, 2pcu:A
6	1kwm:A	402	291	0.4560	0.3483	0.4811	1.28e-99	1kwm:B, 1zli:A
7	3glj:A	395	295	0.4560	0.3544	0.4746	1.73e-98	5j1q:A, 5jc6:A, 2jew:A, 5lrg:A, 5lrg:B, 5lrg:C, 5lrj:A, 5lrj:B, 5lrj:C, 5lrk:A, 5lrk:B, 5lrk:C, 5lyd:A, 5lyf:A, 5lyi:A, 5lyl:A, 1nsa:A, 2piy:A, 2piy:B, 2piy:C, 2piz:A, 2piz:B, 2piz:C, 2pj0:A, 2pj0:B, 2pj0:C, 2pj1:A, 2pj1:B, 2pj1:C, 2pj2:A, 2pj2:B, 2pj2:C, 2pj3:A, 2pj3:B, 2pj3:C, 2pj4:A, 2pj4:B, 2pj5:A, 2pj5:B, 2pj5:C, 2pj6:A, 2pj7:A, 2pj7:B, 2pj7:C, 2pj8:A, 2pj8:B, 2pj8:C, 2pj9:A, 2pja:A, 2pja:B, 2pja:C, 2pjb:A, 2pjb:B, 2pjb:C, 2pjc:A, 2pjc:B, 2pjc:C, 4uia:A, 4uib:A, 3wab:A, 3wc5:A, 3wc6:A, 3wc7:A, 1z5r:A, 1z5r:B, 1z5r:C, 4z65:A, 5zeq:A, 1zg7:A, 1zg7:B, 1zg7:C, 1zg8:A, 1zg8:B, 1zg8:C, 1zg9:A, 1zg9:B, 1zg9:C
8	3dgv:A	401	310	0.4495	0.3441	0.4452	1.31e-89	3d4u:A, 3dgv:B, 3dgv:C, 3osl:A, 3osl:C
9	4p10:A	402	303	0.4463	0.3408	0.4521	2.06e-86	3d66:A, 3d66:B, 3d66:C, 3d67:A, 3d67:B, 3d67:C, 3d68:A, 3d68:B, 3d68:C, 5hvg:A, 5hvg:C, 5hvh:A, 3lms:A, 7nee:A, 7neu:A
10	5hvf:A	372	300	0.4169	0.3441	0.4267	1.02e-78
11	5mrv:A	307	299	0.3876	0.3876	0.3980	1.12e-78	5mrv:B
12	7eqx:C	299	290	0.3485	0.3579	0.3690	4.32e-56	7eqx:D, 7eqz:A
13	2c1c:A	312	304	0.3257	0.3205	0.3289	2.79e-52	2c1c:B
14	1jqg:A	409	314	0.3225	0.2421	0.3153	1.20e-42
15	7aqp:A	323	289	0.2866	0.2724	0.3045	1.40e-33	7aru:A, 4djl:A, 4duk:A, 6f6q:A, 6f75:A, 6f79:A, 4f8z:A, 4gm5:A, 6go2:A, 4iav:A, 4ihm:A, 4ik2:A, 1obr:A, 3prt:A, 7q87:A, 3qnv:A, 8qvo:A, 6sn6:A, 6t9y:A, 6tnk:A, 3v38:A, 3v7z:A, 6z28:A
16	1h8l:A	380	281	0.1987	0.1605	0.2171	1.22e-08	1qmu:A
17	3mn8:B	386	116	0.0912	0.0725	0.2414	1.76e-05	3mn8:A, 3mn8:C, 3mn8:D
18	4b6z:B	382	216	0.1726	0.1387	0.2454	0.002	4b6z:A, 4b6z:C, 4b6z:D
19	3l2n:A	376	130	0.1042	0.0851	0.2462	0.004	3l2n:B
20	1uwy:A	393	154	0.1042	0.0814	0.2078	0.013
21	4a37:B	376	117	0.1010	0.0824	0.2650	0.017	4a37:A, 4a38:A, 4a38:B, 4a39:A, 4a39:B
22	3qgv:A	435	68	0.0586	0.0414	0.2647	4.3
23	3jru:B	490	50	0.0521	0.0327	0.3200	8.6	3jru:A
24	8ia0:CW	540	106	0.0814	0.0463	0.2358	9.4	8i9z:CW
25	1f0p:A	284	40	0.0456	0.0493	0.3500	9.5

[Back]