Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
AQSGQVLAALPRTSRQVQVLQNLTTTYEIVLWQPVTADLIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLI
QQQISNDTVSPRASASYYEQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLKVSGKEQTAKNAIWIDCGIHA
REWISPAFCLWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVMPVVNVDGYDYSWKKNRMWRKNRSFYANNHCIGTDLNRNFASK
HWCEEGASSSSCSETYCGLYPESEPEVKAVASFLRRNINQIKAYISMHSYSQHIVFPYSYTRSKSKDHEELSLVASEAVR
AIEKTSKNTRYTHGHGSETLYLAPGGGDDWIYDLGIKYSFTIELRDTGTYGFLLPERYIKPTCREAFAAVSKIAWHVIRN
V

The query sequence (length=401) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4p10:A 402 399 0.9875 0.9851 0.9925 0.0 3d66:A, 3d66:B, 3d66:C, 3d67:A, 3d67:B, 3d67:C, 3d68:A, 3d68:B, 3d68:C, 5hvg:A, 5hvg:C, 5hvh:A, 3lms:A, 7nee:A, 7neu:A
2 5hvf:A 372 398 0.9152 0.9866 0.9221 0.0
3 3dgv:A 401 400 0.7830 0.7830 0.7850 0.0 3d4u:A, 3dgv:B, 3dgv:C, 3osl:A, 3osl:C
4 1kwm:A 402 385 0.4165 0.4154 0.4338 4.44e-115 1kwm:B, 1zli:A
5 3glj:A 395 383 0.4190 0.4253 0.4386 2.94e-112 5j1q:A, 5jc6:A, 2jew:A, 5lrg:A, 5lrg:B, 5lrg:C, 5lrj:A, 5lrj:B, 5lrj:C, 5lrk:A, 5lrk:B, 5lrk:C, 5lyd:A, 5lyf:A, 5lyi:A, 5lyl:A, 1nsa:A, 2piy:A, 2piy:B, 2piy:C, 2piz:A, 2piz:B, 2piz:C, 2pj0:A, 2pj0:B, 2pj0:C, 2pj1:A, 2pj1:B, 2pj1:C, 2pj2:A, 2pj2:B, 2pj2:C, 2pj3:A, 2pj3:B, 2pj3:C, 2pj4:A, 2pj4:B, 2pj5:A, 2pj5:B, 2pj5:C, 2pj6:A, 2pj7:A, 2pj7:B, 2pj7:C, 2pj8:A, 2pj8:B, 2pj8:C, 2pj9:A, 2pja:A, 2pja:B, 2pja:C, 2pjb:A, 2pjb:B, 2pjb:C, 2pjc:A, 2pjc:B, 2pjc:C, 4uia:A, 4uib:A, 3wab:A, 3wc5:A, 3wc6:A, 3wc7:A, 1z5r:A, 1z5r:B, 1z5r:C, 4z65:A, 5zeq:A, 1zg7:A, 1zg7:B, 1zg7:C, 1zg8:A, 1zg8:B, 1zg8:C, 1zg9:A, 1zg9:B, 1zg9:C
6 5mrv:A 307 293 0.3466 0.4528 0.4744 2.21e-99 5mrv:B
7 1aye:A 401 398 0.3915 0.3915 0.3945 7.93e-88 1dtd:A
8 1pca:A 402 350 0.3616 0.3607 0.4143 3.39e-87
9 1pyt:B 309 304 0.3392 0.4401 0.4474 1.47e-85 2abz:A, 2abz:B, 1arm:A, 1bav:A, 1bav:B, 1bav:C, 1bav:D, 1cbx:A, 1cps:A, 1cpx:A, 3cpa:A, 4cpa:A, 4cpa:B, 5cpa:A, 6cpa:A, 7cpa:A, 8cpa:A, 2ctb:A, 2ctc:A, 1ee3:P, 1ell:P, 1elm:P, 1f57:A, 3fvl:A, 3fvl:C, 3fvl:E, 3fx6:A, 3fx6:C, 3fx6:E, 1hdq:A, 1hdu:A, 1hdu:B, 1hdu:D, 1hdu:E, 1hee:A, 1hee:B, 1hee:D, 1hee:E, 3hlp:A, 3hlp:B, 3huv:A, 3i1u:A, 1iy7:A, 3kgq:A, 1m4l:A, 2rfh:A, 1yme:A, 1zlh:A
10 5om9:A 396 351 0.3591 0.3636 0.4103 1.12e-83 3fju:A, 6i6z:A, 6i6z:B, 5om9:B, 4uee:A, 4uee:B, 4uez:A, 4uez:B, 2v77:A, 2v77:B
11 2boa:A 404 403 0.3741 0.3713 0.3722 5.72e-83 4a94:A, 4a94:B, 4bd9:A, 2bo9:A, 2bo9:C, 2boa:B, 2pcu:A
12 7eqx:C 299 296 0.2494 0.3344 0.3378 1.28e-48 7eqx:D, 7eqz:A
13 2c1c:A 312 305 0.2569 0.3301 0.3377 1.12e-47 2c1c:B
14 1jqg:A 409 389 0.2519 0.2469 0.2596 2.36e-36
15 7aqp:A 323 306 0.2394 0.2972 0.3137 2.88e-30 7aru:A, 4djl:A, 4duk:A, 6f6q:A, 6f75:A, 6f79:A, 4f8z:A, 4gm5:A, 6go2:A, 4iav:A, 4ihm:A, 4ik2:A, 1obr:A, 3prt:A, 7q87:A, 3qnv:A, 8qvo:A, 6sn6:A, 6t9y:A, 6tnk:A, 3v38:A, 3v7z:A, 6z28:A
16 1h8l:A 380 285 0.1646 0.1737 0.2316 5.35e-09 1qmu:A
17 3mn8:B 386 149 0.0798 0.0829 0.2148 0.003 3mn8:A, 3mn8:C, 3mn8:D
18 1uwy:A 393 144 0.0848 0.0865 0.2361 0.067
19 3l2n:A 376 151 0.0848 0.0904 0.2252 0.077 3l2n:B
20 5hxd:A 237 89 0.0698 0.1181 0.3146 0.55 5hxd:B
21 8ciw:A 555 26 0.0324 0.0234 0.5000 3.5 8ciw:B
22 4zvf:A 164 64 0.0474 0.1159 0.2969 6.7
23 6hnd:B 470 35 0.0399 0.0340 0.4571 7.0 6hnd:A, 6hnv:A, 6hnv:B
24 8d3d:A 1314 60 0.0474 0.0145 0.3167 7.7 8d3c:A, 8d3c:B, 8d3c:C, 8d3c:D, 8d3c:E, 8d3c:F, 8d3c:G, 8d3c:H, 8d3c:I, 8d3c:J, 8d3c:K, 8d3c:L, 8d3c:M, 8d3c:N, 8d3c:O, 8d3c:P, 8d3d:B, 8d3d:C, 8d3d:D, 8d3d:E, 8d3d:F, 8d3d:G, 8d3d:H, 8d3d:I, 8d3d:J, 8d3d:K, 8d3d:L, 8d3d:M, 8d3d:N, 8d3d:O, 8d3d:P, 7f49:A, 3hxo:A, 3hxq:A, 7wn3:A, 7wn3:B, 7wn3:E, 7wn3:G, 7wn4:E, 7wn4:G, 7wn6:A, 7wn6:B, 7wn6:E, 7wn6:G, 7wpp:E, 7wpp:G, 7wpq:A, 7wpq:B, 7wpq:E, 7wpq:G, 7wpr:A, 7wpr:B, 7wpr:E, 7wpr:F, 7wpr:G, 7wpr:H, 7wpr:I, 7wpr:J, 7wpr:K, 7wpr:L, 7wpr:M, 7wpr:N, 7wpr:O, 7wpr:P, 7wpr:Q, 7wpr:R, 7wps:A, 7wps:B, 7wps:E, 7wps:G, 7wps:I, 7wps:K, 7wps:M, 7wps:O, 7wps:Q, 7wps:S, 7wps:U, 7wps:W, 7wps:Y, 7wps:a, 7wqt:A, 7wqt:B, 7wqt:E, 7wqt:F, 7wqt:G, 7wqt:H, 7wqt:I, 7wqt:J, 7wqt:K, 7wqt:L, 7wqt:M, 7wqt:N, 7wqt:O, 7wqt:P, 7wqt:Q, 7wqt:R
25 3qgv:A 435 56 0.0424 0.0391 0.3036 8.9

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218