Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
AQNPNCNIMIFHPTKEEFNDFDKYIAYMESQGAHRAGLAKIIPPKEWKARETYDNISEILIATPLQQVASGRAGVFTQYH
KKKKAMTVGEYRHLANSKKYQTPPHQNFEDLERKYWKNRIYNSPIYGADISGSLFDENTKQWNLGHLGTIQDLLEKECGV
VIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHLGEPKTWYVVPPEHGQRLERLARELFPGSSRGCGAFLRHKVALIS
PTVLKENGIPFNRITQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWIDYGKMASQCSCGEARVTFSMDAFVRILQP
ERYDLWKRGQ

The query sequence (length=330) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3dxt:A 331 330 1.0000 0.9970 1.0000 0.0 4d6q:A, 4d6r:A, 4d6s:A, 3dxu:A, 7dyg:A, 7dyq:A, 6ete:A, 6etg:A, 6ets:A, 6ett:A, 6etu:A, 6etv:A, 6etw:A, 5f5a:A, 5f5c:A, 6f5q:A, 6f5r:A, 6f5s:A, 6f5t:A, 5fp4:A, 5fp7:A, 5fp8:A, 5fp9:A, 5fpa:A, 5fpb:A, 6h0w:A, 6h0x:A, 6h0y:A, 6h0z:A, 6h10:A, 6h11:A, 4hon:A, 4hon:B, 4hoo:A, 4hoo:B, 5ph0:A, 5ph1:A, 5ph2:A, 5ph3:A, 5ph4:A, 5ph5:A, 5ph6:A, 5ph7:A, 5ph8:A, 5ph9:A, 5pha:A, 5phb:A, 5phc:A, 5phd:A, 5phe:A, 5phf:A, 5phg:A, 5phh:A, 5phi:A, 5phj:A, 5phk:A, 5phl:A, 5phm:A, 5phn:A, 5pho:A, 5php:A, 5phq:A, 5phr:A, 5phs:A, 5pht:A, 5phu:A, 5phv:A, 5phw:A, 5phx:A, 5phy:A, 5phz:A, 5pi0:A, 5pi1:A, 5pi2:A, 5pi3:A, 5pi4:A, 5pi5:A, 5pi6:A, 5pi7:A, 5pi8:A, 5pi9:A, 5pia:A, 5pib:A, 5pic:A, 5pid:A, 5pie:A, 5pif:A, 5pig:A, 5pih:A, 5pii:A, 5pij:A, 5pik:A, 5pil:A, 5pim:A, 5pin:A, 5pio:A, 5pip:A, 5piq:A, 5pir:A, 5pis:A, 5pit:A, 5piu:A, 5piv:A, 5piw:A, 5pix:A, 5piy:A, 5piz:A, 5pj0:A, 5pj1:A, 5pj2:A, 5pj3:A, 5pj4:A, 5pj5:A, 5pj6:A, 5pj7:A, 5pj8:A, 5pj9:A, 5pja:A, 5pjb:A, 5pjc:A, 5pjd:A, 5pje:A, 5pjf:A, 5pjg:A, 5pjh:A, 5pji:A, 5pjj:A, 5pjk:A, 5pjl:A, 5pjm:A, 5pjn:A, 5pjo:A, 5pjp:A, 5pjq:A, 5pjr:A, 5pjs:A, 5pjt:A, 5pju:A, 5pjv:A, 5pjw:A, 5pjx:A, 5pjy:A, 5pjz:A, 5pk0:A, 5pk1:A, 5pk2:A, 5pk3:A, 5pk4:A, 5pk5:A, 5pk6:A, 5pk7:A, 5pk8:A, 5pk9:A, 5pka:A, 5pkb:A, 5pkc:A, 5pkd:A, 5pke:A, 5pkf:A, 5pkg:A, 5pkh:A, 5pki:A, 5pkj:A, 5pkk:A, 5pkl:A, 5pkm:A, 5pkn:A, 5pko:A, 5pkp:A, 5pkq:A, 5pkr:A, 5pks:A, 5pkt:A, 5pku:A, 5pkv:A, 5pkw:A, 5pkx:A, 5pky:A, 5pkz:A, 5pl0:A, 5pl1:A, 5pl2:A, 5pl3:A, 5pl4:A, 5pl5:A, 5pl6:A, 5pl7:A, 5pl8:A, 5pl9:A, 5pla:A, 5plb:A, 5plc:A, 5pld:A, 5ple:A, 5plf:A, 5plg:A, 5plh:A, 5pli:A, 5plj:A, 5plk:A, 5pll:A, 5plm:A, 5pln:A, 5plo:A, 5plp:A, 5plq:A, 5plr:A, 5pls:A, 5plt:A, 5plu:A, 5plv:A, 5plw:A, 5plx:A, 5ply:A, 5plz:A, 5pm0:A, 5pm1:A, 5pm2:A, 5pm3:A, 5pm4:A, 5pm5:A, 5pm6:A, 5pm7:A, 5pm8:A, 5pm9:A, 5pma:A, 5pmb:A, 5pmc:A, 5pmd:A, 5pme:A, 5pmf:A, 5pmg:A, 5pmh:A, 5pmi:A, 5pmj:A, 5pmk:A, 5pml:A, 5pmm:A, 5pmn:A, 5pmo:A, 5pmp:A, 5pmq:A, 5pmr:A, 5pms:A, 5pmt:A, 5pmu:A, 5pmv:A, 5pmw:A, 5pmx:A, 5pmy:A, 5pmz:A, 5pn0:A, 5pn1:A, 5pn2:A, 5pn3:A, 5pn4:A, 5pn5:A, 5pn6:A, 5pn7:A, 5pn8:A, 5pn9:A, 5pna:A, 5pnb:A, 5pnc:A, 5pnd:A, 5pne:A, 5pnf:A, 5png:A, 5pnh:A, 5pni:A, 5pnj:A, 5pnk:A, 5pnl:A, 5pnm:A, 5pnn:A, 5pno:A, 5pnp:A, 5pnq:A, 5pnr:A, 5pns:A, 5pnu:A, 5pnv:A, 5pnw:A, 8wug:A
2 2w2i:C 314 321 0.8121 0.8535 0.8349 0.0 2w2i:A, 2w2i:B
3 7jm5:A 343 330 0.7212 0.6939 0.7212 0.0 7jm5:B, 4lxl:A
4 5kr7:A 340 328 0.6818 0.6618 0.6860 0.0 5fjh:A, 5fjh:B, 5fjk:A, 5kr7:B, 4xdo:A, 4xdo:B, 4xdp:A, 4xdp:B, 2xml:A, 2xml:B
5 5f37:B 354 328 0.6697 0.6243 0.6738 2.42e-179 5a7n:A, 5a7n:B, 5a7o:A, 5a7o:B, 5a7p:A, 5a7p:B, 5a7q:A, 5a7q:B, 5a7s:A, 5a7s:B, 5a7w:A, 5a7w:B, 5a80:A, 5a80:B, 4ai9:A, 4ai9:B, 5anq:A, 5anq:B, 4bis:A, 4bis:B, 6cg1:A, 6cg1:B, 6cg1:C, 6cg1:D, 6cg2:A, 6cg2:B, 6cg2:C, 6cg2:D, 7eqv:A, 5f2s:A, 5f2s:B, 5f2s:C, 5f2s:D, 5f2w:A, 5f2w:B, 5f2w:C, 5f2w:D, 5f32:A, 5f32:B, 5f32:C, 5f32:D, 5f37:A, 5f37:C, 5f37:D, 5f39:A, 5f39:B, 5f39:C, 5f39:D, 5f3c:A, 5f3c:B, 5f3c:C, 5f3c:D, 5f3e:A, 5f3e:B, 5f3e:C, 5f3e:D, 5f3g:A, 5f3g:B, 5f3g:C, 5f3g:D, 5f3i:A, 5f3i:B, 5f3i:C, 5f3i:D, 5f5i:A, 5f5i:B, 5fpv:A, 5fpv:B, 5fpv:C, 5fpv:D, 5fpv:E, 5fpv:F, 5fpv:G, 5fpv:H, 5fwe:A, 5fwe:B, 5fy8:A, 5fy8:B, 5fyc:A, 5fyc:B, 5fyh:A, 5fyh:B, 5fyi:A, 5fyi:B, 6g5w:A, 6g5w:B, 6g5x:A, 6g5x:B, 4gd4:A, 4gd4:B, 9gle:A, 9gle:B, 2gp3:A, 2gp3:B, 2gp5:A, 2gp5:B, 6h4o:A, 6h4o:B, 6h4o:C, 6h4o:D, 6h4p:A, 6h4p:B, 6h4p:C, 6h4p:D, 6h4q:A, 6h4q:B, 6h4q:C, 6h4q:D, 6h4r:A, 6h4r:B, 6h4r:C, 6h4r:D, 6h4s:A, 6h4s:B, 6h4s:C, 6h4s:D, 6h4t:A, 6h4t:B, 6h4t:C, 6h4t:D, 6h4u:A, 6h4u:B, 6h4u:C, 6h4u:D, 6h4v:A, 6h4v:B, 6h4v:C, 6h4v:D, 6h4w:A, 6h4w:B, 6h4w:C, 6h4w:D, 6h4x:A, 6h4x:B, 6h4x:C, 6h4x:D, 6h4y:A, 6h4y:B, 6h4y:C, 6h4y:D, 6h8p:A, 6h8p:B, 6hgt:A, 6hgt:B, 6hgt:C, 6hgt:D, 5ly1:C, 5ly1:D, 5ly1:A, 5ly1:B, 5ly2:A, 5ly2:B, 5ly2:C, 5ly2:D, 3njy:A, 3njy:B, 2oq6:A, 2oq6:B, 2oq7:A, 2oq7:B, 2os2:A, 2os2:B, 2ot7:A, 2ot7:B, 2ox0:A, 2ox0:B, 2p5b:A, 2p5b:B, 3pdq:A, 3pdq:B, 2pxj:A, 2pxj:B, 2q8c:A, 2q8c:B, 2q8d:A, 2q8d:B, 2q8e:A, 2q8e:B, 3rvh:A, 3rvh:B, 5tvr:A, 5tvr:B, 5tvs:A, 5tvs:B, 3u4s:A, 3u4s:B, 4ura:A, 4ura:B, 4v2v:A, 4v2v:B, 4v2w:A, 4v2w:B, 2vd7:A, 2vd7:B, 5vgi:A, 5vgi:B, 5vgi:C, 5vgi:D, 5vmp:A, 5vmp:B, 5vmp:C, 5vmp:D, 8wd3:A, 8wd3:B, 2wwj:A, 2wwj:B, 2ybk:A, 2ybk:B, 2ybp:A, 2ybp:B, 2ybs:A, 2ybs:B
6 3opt:A 298 309 0.3606 0.3993 0.3851 4.33e-69
7 6dq4:A 312 313 0.3242 0.3429 0.3419 8.50e-46 6bgu:A, 6bgv:A, 6bgw:A, 6bgx:A, 6bgy:A, 6bgz:A, 6bh1:A, 6bh2:A, 6bh3:A, 6bh4:A, 6bh5:A, 6dq5:A, 6dq6:A, 6dq7:A, 6dq8:A, 6dq9:A, 6dqa:A, 6dqb:A, 6dqc:A, 6dqd:A, 6dqe:A, 6dqf:A, 5e6h:A, 5isl:A, 5ivb:A, 5ivc:A, 5ive:A, 5ivf:A, 5ivj:A, 5ivv:A, 5ivy:A, 5iw0:A, 5iwf:A
8 5yko:A 487 324 0.3212 0.2177 0.3272 1.94e-45 5ykn:A
9 6bh0:A 291 303 0.3152 0.3574 0.3432 5.44e-45
10 4igq:A 273 285 0.3061 0.3700 0.3544 6.02e-43 4igo:A, 4igp:A
11 5v9t:B 593 237 0.2727 0.1518 0.3797 2.05e-41 5ceh:A, 5k4l:B, 5k4l:A, 5v9p:A, 5v9t:A
12 5v9t:B 593 45 0.0515 0.0287 0.3778 0.18 5ceh:A, 5k4l:B, 5k4l:A, 5v9p:A, 5v9t:A
13 6ip0:A 472 320 0.3000 0.2097 0.3094 2.63e-41 6ip4:A
14 5fzi:A 461 322 0.3030 0.2169 0.3106 4.73e-41 5a1f:A, 5a3n:A, 5a3p:A, 5a3t:A, 5a3w:A, 6eiu:A, 6eiy:A, 6ej0:A, 6ej1:A, 6ek6:A, 5fpl:A, 5fpu:A, 5fun:A, 5fup:A, 5fv3:A, 5fy4:A, 5fy5:A, 5fy9:A, 5fyb:A, 5fys:A, 5fyt:A, 5fyu:A, 5fyv:A, 5fyy:A, 5fyz:A, 5fz0:A, 5fz1:A, 5fz3:A, 5fz4:A, 5fz6:A, 5fz7:A, 5fz8:A, 5fz9:A, 5fza:A, 5fzb:A, 5fzc:A, 5fzd:A, 5fze:A, 5fzf:A, 5fzg:A, 5fzh:A, 5fzk:A, 5fzl:A, 5fzm:A, 6h4z:A, 6h50:A, 6h51:A, 6h52:A, 5lw9:A, 5lwb:A, 6rbi:A
15 6ein:A 439 316 0.3061 0.2301 0.3196 5.67e-40
16 5fwj:A 435 320 0.3152 0.2391 0.3250 1.89e-39 5fwj:B
17 8hpc:C 303 63 0.0576 0.0627 0.3016 0.26 8hpc:A, 8hpc:B, 8hpc:D, 8hpc:E, 8hpc:F, 8hpc:G, 8hpc:H, 1uf5:A, 1uf5:B, 1uf7:A, 1uf7:B, 1uf8:A, 1uf8:B
18 8ro1:T 389 53 0.0515 0.0437 0.3208 1.3 8ro0:T
19 7al4:D 524 165 0.1091 0.0687 0.2182 2.3 7al4:C, 7al4:B, 7al4:A
20 1kpg:A 285 76 0.0667 0.0772 0.2895 3.3 1kpg:B, 1kpg:C, 1kpg:D, 1kph:A, 1kph:B, 1kph:C, 1kph:D
21 7r86:B 285 49 0.0545 0.0632 0.3673 3.7 7r86:A
22 6tsz:U 287 44 0.0455 0.0523 0.3409 3.8 6u5l:A
23 7p43:B 690 91 0.0636 0.0304 0.2308 6.7 7p43:A
24 3ild:A 148 39 0.0364 0.0811 0.3077 7.2
25 9bh5:Cc 96 65 0.0636 0.2188 0.3231 8.4 9cai:Cc
26 1jdn:A 407 52 0.0455 0.0369 0.2885 9.1 1jdp:A, 1jdp:B, 1yk0:A, 1yk0:B, 1yk1:A, 1yk1:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218