Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
APRIAVVGGGLGGLALAGMLHRQGIAATVYERDAGRAARTQGGTLDLRPESGQRALDELGLTEAFRGEELRILDPAGRTL
VHRVPEIDRGALRELLLSKVPDEAVSWGRRLTGVEELPDGGHRLEFADGGHADCDILVGADGARSRVRLLLTDARPVHLS
AYLQLAITDADRRRPRIAEFVGPGSLMALGDNLNLGAQRSGDGTIRVSVTTRVDADWVDRQGFGDAEWGDVVARLHELFA
GWDAGLTSLIDACDPGSLVGRNIEALPVGTRWPSRPDVTLLGDAAHLMPPVGEGANQAMLDGVLLARAFAQHRDDPAAAI
AAYETEMFDRAAVIGAKSARIESMGLAPDAAERLASYFNRMTAAS

The query sequence (length=365) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6n04:B 366 368 0.9918 0.9891 0.9837 0.0 6n04:A
2 8aq8:AAA 344 366 0.3973 0.4215 0.3962 1.08e-59 8aq8:BBB, 8aq8:CCC, 8aq8:DDD
3 8er0:A 371 345 0.2904 0.2857 0.3072 2.09e-42 8er0:B, 8er1:A, 6wg9:A, 6wg9:B
4 7epw:A 373 368 0.3096 0.3029 0.3071 2.21e-42 4a6n:A, 4a6n:B, 4a6n:C, 4a6n:D, 4a99:A, 4a99:C, 4a99:B, 4a99:D, 7epv:A, 4guv:A, 4guv:B, 4guv:C, 4guv:D, 3p9u:A, 3p9u:B, 3p9u:C, 3p9u:D, 3v3n:A, 3v3n:B, 3v3n:C, 3v3n:D, 3v3o:A, 3v3o:B, 3v3o:C, 3v3o:D, 2xdo:A, 2xdo:B, 2xdo:C, 2xdo:D, 2xyo:A, 2xyo:B, 2xyo:C, 2xyo:D, 2y6q:A, 2y6q:B, 2y6q:C, 2y6q:D, 2y6r:A, 2y6r:B, 2y6r:C, 2y6r:D
5 3c96:A 381 365 0.3233 0.3097 0.3233 6.99e-18 2rgj:A
6 8rqh:B 382 341 0.3151 0.3010 0.3372 2.37e-17 8rqh:A
7 3rp6:A 392 355 0.2877 0.2679 0.2958 1.05e-15 3rp7:A, 3rp8:A
8 4hb9:A 376 143 0.1288 0.1250 0.3287 8.91e-14
9 8uiv:A 375 260 0.2027 0.1973 0.2846 7.07e-12 5eow:A, 8uiq:A
10 5tum:A 369 173 0.1342 0.1328 0.2832 3.45e-09 5tum:B
11 8twg:B 385 180 0.1397 0.1325 0.2833 7.76e-09
12 8twf:C 385 180 0.1342 0.1273 0.2722 1.11e-08 8twf:D, 8twf:A, 8twf:B
13 8gsm:G 439 394 0.2658 0.2210 0.2462 2.33e-07 8gsm:I
14 8x38:A 430 387 0.2685 0.2279 0.2532 7.27e-07
15 5tuk:B 373 343 0.2055 0.2011 0.2187 8.28e-07 5tuk:A, 5tuk:C, 5tuk:D
16 6nes:A 431 244 0.1781 0.1508 0.2664 1.57e-06 6nes:B, 6net:A, 6net:B, 6neu:A, 6neu:B, 6nev:A, 6nev:B
17 6brd:A 474 383 0.2986 0.2300 0.2846 1.81e-06 6brd:B, 6brd:C, 5vqb:A, 5vqb:B, 5vqb:C
18 7cp7:A 430 379 0.2740 0.2326 0.2639 4.80e-06 7cp6:A, 7cp6:B
19 5kow:A 474 331 0.2521 0.1941 0.2779 5.69e-06 6c7s:A, 5kox:A
20 8jqo:A 391 374 0.2658 0.2481 0.2594 7.45e-05 8jqo:B, 8jqo:C, 8jqp:A, 8jqp:B, 8jqq:A, 8jqq:B
21 5tue:A 388 180 0.1233 0.1160 0.2500 7.96e-05 5tue:B, 5tuf:A, 5tuf:B, 5tui:A, 5tui:B
22 5evy:X 411 249 0.1808 0.1606 0.2651 1.86e-04
23 3ihg:A 535 391 0.3068 0.2093 0.2864 6.25e-04 3ihg:B, 3ihg:C
24 5x68:B 354 165 0.1315 0.1356 0.2909 6.33e-04 5x68:A
25 8weq:C 394 374 0.2521 0.2335 0.2460 0.001 8weq:A, 8weq:B
26 6dll:B 398 339 0.2438 0.2236 0.2625 0.002 6dll:A, 6dll:C, 6dll:D
27 6c6r:A 451 73 0.0685 0.0554 0.3425 0.004 6c6n:A, 6c6n:B, 6c6p:A, 6c6p:B, 6c6r:B
28 2vou:A 393 169 0.1233 0.1145 0.2663 0.006 2vou:B, 2vou:C
29 5fn0:A 455 344 0.2329 0.1868 0.2471 0.009 5fn0:B, 5fn0:C, 5fn0:D, 6fox:A, 6fox:B, 6foy:A, 6foy:B, 6foz:A, 6foz:B, 6fp0:A, 6fp0:B, 6fp1:A, 6fp1:B, 6fph:A, 6fph:B, 5mzc:A, 5mzc:B, 5mzi:A, 5mzi:B, 5mzk:A, 5mzk:B, 5n7t:A, 5n7t:B, 5na5:A, 5na5:B, 5nab:A, 5nab:B, 5nae:A, 5nae:B, 5nag:A, 5nag:B, 5nah:A, 5nah:B, 5nak:A, 5nak:B, 5x6p:A, 5x6p:B, 5x6q:A, 5y66:A, 5y77:A, 5y77:B, 5y7a:A
30 7kpt:A 412 344 0.1973 0.1748 0.2093 0.011 7kpq:A
31 7lo1:A 422 158 0.1068 0.0924 0.2468 0.017 7lo1:B
32 8jqo:D 309 69 0.0685 0.0809 0.3623 0.018
33 4j34:B 390 372 0.2274 0.2128 0.2231 0.029 4j2w:A, 4j2w:B, 4j31:A, 4j31:B, 4j33:A, 4j33:B, 4j34:A, 4j36:A, 4j36:B, 5x6r:A, 5x6r:B
34 1d7l:A 394 347 0.2329 0.2157 0.2450 0.088 1bf3:A, 1bgj:A, 1bgn:A, 1bkw:A, 1cc4:A, 1cc6:A, 1cj2:A, 1cj3:A, 1cj4:A, 1dob:A, 1doc:A, 1dod:A, 1doe:A, 1ius:A, 1iut:A, 1iuu:A, 1iuv:A, 1iuw:A, 1iux:A, 6ju1:A, 1k0i:A, 1k0j:A, 1k0l:A, 1pbb:A, 1pbc:A, 1pbd:A, 1pbe:A, 1pbf:A, 1pdh:A, 1phh:A, 2phh:A, 1pxa:A, 1pxb:A, 1pxc:A, 8y2s:A, 1ykj:A, 1ykj:B
35 7yj0:D 622 404 0.2466 0.1447 0.2228 0.095 7yj0:A, 7yj0:B, 7yj0:C
36 6ui5:A 497 168 0.1452 0.1066 0.3155 0.25 6ui5:B
37 5ocm:A 290 83 0.0740 0.0931 0.3253 0.43 5ocm:F, 5ocm:B, 5ocm:C, 5ocm:D, 5ocm:E
38 6fho:A 368 324 0.2274 0.2255 0.2562 0.47 6sw1:A, 6sw2:A, 2x3n:A
39 1sez:A 465 31 0.0411 0.0323 0.4839 0.53 1sez:B
40 5k0a:D 322 47 0.0548 0.0621 0.4255 0.64 5jri:A, 5jri:B, 5k0a:A, 5k0a:B, 5k0a:C
41 5yxn:B 241 78 0.0603 0.0913 0.2821 0.69
42 6lke:A 428 362 0.2301 0.1963 0.2320 0.99 6lkd:A, 6lkd:B, 6lke:B
43 7mfm:I 490 30 0.0384 0.0286 0.4667 1.1 7mfm:J, 7mft:I
44 7qkr:A 1199 28 0.0411 0.0125 0.5357 1.2 7qks:A
45 7mq9:LM 2005 29 0.0301 0.0055 0.3793 1.3
46 7mqa:LM 2041 29 0.0301 0.0054 0.3793 1.3
47 6wpu:A 439 49 0.0438 0.0364 0.3265 1.9
48 4nmy:A 299 49 0.0521 0.0635 0.3878 2.0 4nmy:B
49 7al4:D 524 33 0.0356 0.0248 0.3939 2.1 7al4:C, 7al4:B, 7al4:A
50 5xgv:A 461 157 0.1205 0.0954 0.2803 2.3 5xgv:B
51 8j43:A 285 36 0.0438 0.0561 0.4444 2.3 8j43:B
52 3all:B 371 159 0.1205 0.1186 0.2767 2.4 3alj:A, 3all:A, 3alm:A, 3alm:B, 4gf7:A, 3gmb:A, 3gmb:B, 3gmc:A, 3gmc:B, 4h2n:A, 4h2p:A, 4h2p:B, 4h2p:C, 4h2p:D, 4h2q:A, 4h2r:A, 4h2r:B, 5hxi:A, 4jy2:A, 4jy2:B, 4jy3:A, 4jy3:B
53 3all:B 371 55 0.0521 0.0512 0.3455 5.5 3alj:A, 3all:A, 3alm:A, 3alm:B, 4gf7:A, 3gmb:A, 3gmb:B, 3gmc:A, 3gmc:B, 4h2n:A, 4h2p:A, 4h2p:B, 4h2p:C, 4h2p:D, 4h2q:A, 4h2r:A, 4h2r:B, 5hxi:A, 4jy2:A, 4jy2:B, 4jy3:A, 4jy3:B
54 3i3l:A 550 32 0.0356 0.0236 0.4062 2.6
55 7on9:A 393 370 0.2438 0.2265 0.2405 3.2 7on9:B, 7on9:C, 7on9:D
56 4qvh:A 596 79 0.0521 0.0319 0.2405 5.6 6ct5:A, 6ct5:B, 7ed0:A, 8gkf:A, 8gkf:B, 8gkf:C, 8gkf:D, 8gkf:E, 8gkf:H, 8gkf:I, 7n8e:A, 7n8e:B, 7n8l:A, 7n8l:B, 7n8m:A, 7n8m:B, 4qjk:A, 4qvh:B, 8qzi:A, 8qzi:B, 8qzi:C, 8qzi:D, 8qzj:A, 8qzj:B, 8qzj:C, 8qzj:D, 4u89:A
57 2z5x:A 513 48 0.0493 0.0351 0.3750 7.1 2bxr:A, 2bxr:B, 2bxs:A, 2bxs:B, 2z5y:A
58 7f9h:A 76 42 0.0466 0.2237 0.4048 7.1 7f9h:B
59 5ez7:A 363 42 0.0438 0.0441 0.3810 7.3
60 7rk0:B 262 63 0.0493 0.0687 0.2857 7.6 7rk0:A, 7rk0:C, 7rk0:D
61 7ouj:AAA 540 34 0.0466 0.0315 0.5000 8.2
62 7ouj:AAA 540 32 0.0384 0.0259 0.4375 9.8
63 4v8l:D 2822 78 0.0712 0.0092 0.3333 8.3 4ce4:o, 6hiv:US, 6hiv:UT, 6hiw:US, 6hiw:UT, 6hiy:US, 6hiy:UT, 4v8l:E, 4v8l:F, 4v8l:A, 4v8l:B, 4v8l:C, 4v8v:A, 4v8v:B, 4v8v:C, 4v8v:D, 4v8v:E, 4v8v:F, 4v8w:D, 4v8w:E, 4v8w:F, 4v8w:A, 4v8w:B, 4v8w:C
64 7og3:A 290 117 0.0959 0.1207 0.2991 8.4 7og3:B
65 1uj5:A 225 138 0.1096 0.1778 0.2899 8.6 1uj6:A
66 4iv9:A 552 32 0.0411 0.0272 0.4688 9.1 4iv9:B
67 2yg3:B 450 91 0.0822 0.0667 0.3297 9.1 2yg3:A, 2yg4:A, 2yg4:B, 2yg5:A, 2yg6:A, 2yg6:B, 2yg7:A, 2yg7:B
68 7osn:B 291 38 0.0438 0.0550 0.4211 9.7 7osn:A, 7osn:C, 7osn:D, 7osn:E, 7osn:F
69 1d3u:B 201 60 0.0521 0.0945 0.3167 9.9 1ais:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218