BioLiP

>protein
APAERCAHPGADLGAAVHAVGQTLAAGGLVPPDEAGTTARHLVRLAVRYGNSPFTPLEEARHDLGVDRDAFRRLLALFGQ
VPELRTAVETGPAGAYWKNTLLPLEQRGVFDAALARKPVFPYSVGLYPGPTCMFRCHFCVRVTGARYDPSALDAGNAMFR
SVIDEIPAGNPSAMYFSGGLEPLTNPGLGSLAAHATDHGLRPTVYTNSFALTERTLERQPGLWGLHAIRTSLYGLNDEEY
EQTTGKKAAFRRVRENLRRFQQLRAERESPINLGFAYIVLPGRASRLLDLVDFIADLNDAGQGRTIDFVNIREDERAELQ
EALNAFEERVRERTPGLHIDYGYALNSLRTGADAELLRIKPATMRPTAHPQVAVQVDLLGDVYLYREAGFPDLDGATRYI
AGRVTPDTSLTEVVRDFVERGGEVAAVDGDEYFMDGFDQVVTARLNQLERDAADGWEEARGFLRLEHHHHHH

The query sequence (length=472) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8hzv:A	479	477	0.9852	0.9708	0.9748	0.0	8hzv:B, 8hzv:C, 8hzv:D, 8hzy:A, 8hzy:B
2	4v61:BD	227	103	0.0551	0.1145	0.2524	0.025
3	4m7t:A	246	164	0.0826	0.1585	0.2378	0.083
4	6c9a:B	723	62	0.0318	0.0207	0.2419	1.0	6c9a:A
5	8beg:A	650	118	0.0593	0.0431	0.2373	1.2	8beg:B
6	8ytx:F	268	73	0.0466	0.0821	0.3014	1.8	6gze:F, 4o4j:F, 5o7a:F, 7zyw:F
7	4tr0:A	92	42	0.0339	0.1739	0.3810	2.0	4tr0:B, 4tr1:A, 4tr1:B
8	3mbf:A	337	83	0.0487	0.0682	0.2771	2.0	3mbd:A, 3qrh:A
9	7zi4:G	682	46	0.0297	0.0205	0.3043	2.5
10	8b1r:B	1170	152	0.0763	0.0308	0.2368	2.5	3k70:B, 3k70:E, 5ld2:B, 7mr4:B, 1w36:B, 1w36:E
11	8b1t:B	1141	152	0.0763	0.0316	0.2368	2.6	8b1u:B, 7mr3:B, 6sjb:B, 6sje:B, 6sjf:B, 6sjg:B, 6t2u:B, 6t2v:B
12	3cjp:A	262	55	0.0318	0.0573	0.2727	2.9	3cjp:B
13	4m7s:A	214	94	0.0487	0.1075	0.2447	3.6
14	7nf4:A	504	24	0.0254	0.0238	0.5000	3.9	8crd:A, 6ev3:A, 6ev4:A, 6ev5:A, 6ev6:A, 6ev7:A, 6ev8:A, 6ev9:A, 6eva:A, 6evb:A, 6evc:A, 6evd:A, 7nf3:A, 7nf4:B, 8oed:A, 8oeh:A, 8oeo:A, 6r2p:A, 6r2r:A, 6r2t:A, 6r2z:A, 6r30:A, 6r32:A, 6r33:A, 6r34:A, 6r3f:A, 6r3g:A, 6r3i:A, 6r3j:A, 6r3l:A, 6r3n:A, 6r3o:A, 6tib:AAA, 6tic:AAA, 6tie:AAA, 6tih:AAA, 6tij:AAA, 6til:AAA, 6tin:AAA, 6tio:AAA, 4za4:A, 4za5:A, 4za7:A, 4za8:A, 4za9:A, 4zaa:A, 4zab:A
15	1sp8:D	393	60	0.0381	0.0458	0.3000	4.1	1sp8:A, 1sp8:B, 1sp8:C, 7x7l:A, 7x7l:B, 7x7l:C, 7x7l:D
16	8hkb:A	302	104	0.0572	0.0894	0.2596	4.3	8hka:A
17	8wev:A	486	22	0.0297	0.0288	0.6364	4.6	8wev:B
18	7me2:A	281	13	0.0212	0.0356	0.7692	5.1	7me1:A, 7me1:B, 7me2:B, 7me3:A, 7me3:B, 6q1d:A, 5uxs:A, 5uxu:A, 5uy0:A, 5uy4:A, 5uy5:A, 5uya:A, 5uyb:A, 5uyc:A, 5uyd:A, 5uye:A, 5uyf:A, 5uyg:A, 5uyh:A, 5uyv:A, 5uyw:A
19	6ln4:A	218	39	0.0233	0.0505	0.2821	5.5	6lit:A, 6lit:B
20	7vob:C	327	59	0.0466	0.0673	0.3729	5.9	7voc:C
21	2fe3:B	143	95	0.0551	0.1818	0.2737	6.0	3f8n:A, 3f8n:B, 2fe3:A, 2rgv:A, 2rgv:B
22	7p61:F	442	75	0.0487	0.0520	0.3067	6.0	7awt:F, 7nyr:F, 7nyu:F, 7nyv:F, 7nz1:F, 7p62:F, 7p63:F, 7p64:F, 7p69:F, 7p7c:F, 7p7e:F, 7p7j:F, 7p7k:F, 7p7l:F, 7p7m:F, 7z7r:F, 7z7s:F, 7z7t:F, 7z7v:F, 7z80:F, 7z83:F, 7z84:F, 7zc5:F, 7zci:F
23	5v1q:B	440	98	0.0466	0.0500	0.2245	6.1	5v1q:A, 5v1s:A, 5v1s:B, 5v1t:A
24	5fvc:D	369	32	0.0339	0.0434	0.5000	7.6	5fvc:A, 5fvc:B, 5fvc:C, 5fvc:E, 5fvc:F, 5fvc:G, 5fvc:H, 5fvc:I, 5fvc:J, 5fvd:A, 5fvd:C, 8pdl:A, 8pdm:A, 8pdn:A, 8pdn:B, 8pdn:C, 8pdn:D, 8pdn:E, 8pdn:F, 8pdn:G, 8pdn:H, 8pdn:I, 8pdn:J, 8pdn:K, 8pdn:L, 8pdo:A, 8pdo:B, 8pdp:A, 8pdq:A, 8pdr:A, 8pdr:B, 8pdr:C, 8pdr:D, 8pdr:E, 8pdr:F, 8pdr:G, 8pdr:H, 8pdr:I, 8pdr:J, 8pdr:K, 8pds:A, 8pds:C
25	3b0g:A	538	63	0.0403	0.0353	0.3016	8.0	3b0j:A, 3b0l:A, 3b0m:A, 3b0n:A, 3vkp:A, 3vkq:A, 3vkr:A, 3vks:A, 3vkt:A, 3vlx:A, 3vly:A, 3vlz:A, 3vm0:A, 3vm1:A
26	3luf:B	246	37	0.0318	0.0610	0.4054	9.2	3luf:A, 3mf4:A, 3mf4:B

[Back]