Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ANVEIDGKQYNTFTEPPKALAGERAKVKFPIKDMTEFLHGGEENVTMIERLMTELERDPVLNVSGDYDMPKEQLRETAVA
RIAALSGHWKKDTEKEALLRSQLHGIVDMGTRIRLGVHTGLFMGAIRGSGTKEQYDYWVRKGAADVKGFYGCFAMTELGH
GSNVAGLETTATYIQDTDEFIINTPNTGATKWWIGGAAHSATHTACFARLLVDGKDYGVKIFVVQLRDVSSHSLMPGIAL
GDIGKKMGRDAIDNGWIQFTNVRIPRQNMLMKYAKVSSTGKVSQPPLAQLTYGALIGGRVTMIADSFFVSQRFITIALRY
ACVRRQFGTTPGQPETKIIDYPYHQRRLLPLLAFTYAMKMAADQSQIQYDQTTDLLQTIDPKDKGALGKAIVDLKELFAS
SAGLKAFTTWTCANIIDQCRQACGGHGYSGYNGFGQAYADWVVQCTWEGDNNVLCLSMGRGLIQSCLGHRKGKPLGSSVG
YLANKGLEQATLSGRDLKDPKVLIEAWEKVANGAIQRATDKFVELTKGGLSPDQAFEELSQQRFQCAKIHTRKHLVTAFY
ERINASAKADVKPYLINLANLFTLWSIEEDSGLFLREGFLQPKDIDQVTELVNHYCKEVRDQVAGYTDAFGLSDWFINAP
IGNYDGDVYKHYFAKVNQQNPAQNPRPPYYESTLRPFLFREDEDDDICELDE

The query sequence (length=692) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5ys9:A 692 692 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 5ys9:B
2 5y9d:A 687 687 0.6618 0.6667 0.6667 0.0 5y9d:B
3 1w07:B 658 676 0.3439 0.3617 0.3521 9.96e-119 1w07:A
4 2fon:B 656 680 0.3338 0.3521 0.3397 3.60e-111 2fon:A, 2fon:C
5 1is2:A 637 640 0.2919 0.3171 0.3156 1.85e-100 2ddh:A, 1is2:B
6 7q86:A 612 646 0.2905 0.3284 0.3111 1.71e-98 7q86:B
7 5k3j:A 662 667 0.2919 0.3051 0.3028 3.13e-96 5k3j:B
8 5k3i:A 661 668 0.2717 0.2844 0.2814 2.55e-90 5k3i:B, 5k3i:C, 5k3i:D, 5k3i:E, 5k3i:F, 5k3i:G, 5k3i:H
9 2z1q:B 549 349 0.1228 0.1548 0.2436 4.67e-15 2z1q:A
10 7s7g:A 571 449 0.1618 0.1961 0.2494 5.78e-13 3b96:A, 2uxw:A
11 7y0a:C 387 357 0.1272 0.2274 0.2465 1.45e-11 1jqi:A, 1jqi:B, 8sgs:A, 8sgs:B, 8sgs:C, 8sgs:D, 2vig:A, 2vig:B, 2vig:C, 2vig:D, 2vig:E, 2vig:F, 2vig:G, 2vig:H, 7y0a:A, 7y0a:B, 7y0a:D, 7y0b:A, 7y0b:B, 7y0b:C, 7y0b:D
12 3owa:C 587 345 0.1185 0.1397 0.2377 1.48e-11 3owa:A, 3owa:B, 3owa:D
13 8ca1:B 589 446 0.1503 0.1766 0.2332 1.99e-11 8ca1:A
14 8phe:A 551 366 0.1272 0.1597 0.2404 3.96e-11 8phe:B, 8phf:A, 8phf:B
15 3sf6:A 387 220 0.0910 0.1628 0.2864 1.60e-09
16 5ol2:F 378 218 0.0867 0.1587 0.2752 2.72e-09 5ol2:C
17 7w0j:E 382 314 0.1142 0.2068 0.2516 3.21e-09 8i4p:A, 8i4r:A, 7w0j:B, 7w0j:C, 7w0j:H
18 4n5f:A 378 221 0.0925 0.1693 0.2896 8.51e-09 4n5f:B
19 3mpi:C 395 184 0.0723 0.1266 0.2717 1.89e-08 3mpi:A, 3mpi:B, 3mpi:D, 3mpj:B, 3mpj:A, 3mpj:D, 3mpj:E, 3mpj:F, 3mpj:G
20 4l1f:A 380 222 0.0795 0.1447 0.2477 3.27e-08 4l1f:B
21 1ukw:A 379 344 0.1185 0.2164 0.2384 8.15e-08 1ukw:B
22 2ix6:A 416 356 0.1272 0.2115 0.2472 1.65e-07 2ix5:A, 2ix5:B, 2ix5:C, 2ix5:D, 2ix6:C, 2ix6:F, 2ix6:B, 2ix6:E, 2ix6:D
23 3mdd:A 385 177 0.0751 0.1351 0.2938 1.86e-07 3mdd:B, 3mde:A, 3mde:B, 1udy:A, 1udy:B, 1udy:C, 1udy:D
24 6fah:D 379 326 0.1084 0.1979 0.2301 1.95e-07 6fah:C
25 4iv6:B 383 326 0.1098 0.1984 0.2331 2.13e-07 4iv6:A
26 7p9a:A 380 367 0.1301 0.2368 0.2452 2.61e-07 7p98:A, 7p98:B, 7p9a:B, 7p9x:A, 7p9x:B, 7p9x:C, 7p9x:D
27 2a1t:C 388 177 0.0723 0.1289 0.2825 2.89e-07 2a1t:A, 2a1t:B, 2a1t:D, 1egc:A, 1egc:B, 1egc:C, 1egc:D, 1egd:A, 1egd:B, 1egd:C, 1egd:D, 1ege:A, 1ege:B, 1ege:C, 1ege:D, 4p13:A, 4p13:B, 4p13:C, 4p13:D, 8sgp:A, 8sgp:B, 8sgp:C, 8sgp:D, 1t9g:A, 1t9g:B, 1t9g:C, 1t9g:D
28 8w0t:A 398 350 0.1084 0.1884 0.2143 6.64e-07 8w0t:B, 8w0t:C, 8w0t:D, 8w0u:A, 8w0u:B, 8w0u:C, 8w0u:D, 8w0z:A, 8w0z:B, 8w0z:C, 8w0z:D, 8w0z:E, 8w0z:F, 8w0z:G, 8w0z:H
29 2pg0:A 380 158 0.0650 0.1184 0.2848 8.60e-07 2pg0:B
30 3swo:A 388 198 0.0824 0.1469 0.2879 1.24e-06 3swo:D, 3swo:B, 3swo:C
31 5lnx:D 374 354 0.1199 0.2219 0.2345 1.51e-06 5lnx:A, 5lnx:B, 5lnx:C, 5lnx:E, 5lnx:F, 5lnx:G, 5lnx:H
32 2r0m:A 390 224 0.0867 0.1538 0.2679 2.33e-06 2r0n:A, 1siq:A, 1sir:A
33 1rx0:A 384 315 0.1055 0.1901 0.2317 2.38e-06 1rx0:C, 1rx0:B, 1rx0:D
34 1buc:A 383 360 0.1214 0.2193 0.2333 3.98e-06 1buc:B
35 2jif:A 381 222 0.0795 0.1444 0.2477 4.97e-06 2jif:C, 2jif:B, 2jif:D
36 4m9a:B 376 158 0.0708 0.1303 0.3101 7.27e-06 4m9a:A
37 2dvl:A 370 315 0.1069 0.2000 0.2349 1.22e-05 2dvl:B
38 3pfd:C 369 312 0.1012 0.1897 0.2244 6.53e-05 3pfd:A, 3pfd:B, 3pfd:D
39 3oib:A 381 218 0.0867 0.1575 0.2752 4.33e-04 3oib:B, 3p4t:A, 3p4t:B
40 7szv:A 372 233 0.0838 0.1559 0.2489 0.001 7szv:B
41 4y9j:B 593 343 0.1185 0.1383 0.2391 0.002 4y9j:A, 4y9l:A, 4y9l:B
42 8ciw:A 555 361 0.1156 0.1441 0.2216 0.002 8ciw:B
43 3gqt:C 385 355 0.1142 0.2052 0.2225 0.007 3d6b:C, 3eon:C, 3gnc:A, 3gnc:B, 3gnc:C, 3gnc:D, 3gqt:A, 3gqt:B
44 6sd8:X 503 325 0.1055 0.1451 0.2246 0.008 6sd8:A, 6sda:A, 6sda:B
45 3r7k:A 378 152 0.0607 0.1111 0.2763 0.009 3r7k:B, 3r7k:C, 3r7k:D
46 5idu:C 405 386 0.1301 0.2222 0.2332 0.034 5idu:A, 5idu:B, 5idu:D
47 5ez3:B 541 59 0.0246 0.0314 0.2881 0.072 5ez3:A, 5ez3:C, 5ez3:D
48 5jsc:A 388 377 0.1214 0.2165 0.2228 0.077 5jsc:B, 5jsc:C, 5jsc:D
49 7xp7:B 376 363 0.1257 0.2314 0.2397 0.10 7xp7:A, 7xp7:C, 7xp7:D
50 6es9:A 545 370 0.1301 0.1651 0.2432 0.11 6es9:B
51 2eba:A 380 170 0.0679 0.1237 0.2765 0.17 2eba:D, 2eba:C, 2eba:E, 2eba:F, 2eba:G, 2eba:H, 2eba:I
52 3nf4:A 369 195 0.0723 0.1355 0.2564 0.18 3nf4:B
53 8hk0:C 346 150 0.0621 0.1243 0.2867 0.26 8hk0:D
54 1e3a:B 560 74 0.0332 0.0411 0.3108 0.31 1ai4:B, 1ai5:B, 1ai6:B, 1ai7:B, 1ajn:B, 1ajp:B, 1ajq:B, 1fxh:B, 1fxv:B, 1gk9:B, 1gkf:B, 1gm7:B, 1gm8:B, 1gm9:B, 1h2g:B, 1jx9:B, 1k5q:B, 1k5s:B, 1k7d:B, 1kec:B, 1pnk:B, 1pnl:B, 1pnm:B
55 8aya:B 298 132 0.0434 0.1007 0.2273 0.52 4ds8:B, 5jo2:B, 3kb3:B, 4lg5:B, 4lgb:B, 5mn0:B, 7mwn:B, 3nmt:B, 5or2:B, 5or6:B, 3qn1:B, 5vs5:B, 4wvo:B, 3zvu:B
56 3u33:A 540 48 0.0202 0.0259 0.2917 1.7 3djl:A, 3u33:B, 3u33:C, 3u33:D, 3u33:E, 3u33:F, 3u33:G, 3u33:H, 3u33:I, 3u33:J, 3u33:K, 3u33:L
57 7y7q:A 951 60 0.0260 0.0189 0.3000 2.3 2j7n:A, 2j7n:B, 2j7o:A, 7y7p:A, 7y7p:B, 7y7r:A, 7y7r:B, 7y7s:A, 7y7s:B, 7y7t:A, 7y7t:B
58 8cen:A 1508 103 0.0376 0.0172 0.2524 2.7 4a3b:A, 4a3c:A, 4a3d:A, 4a3e:A, 4a3f:A, 4a3g:A, 4a3i:A, 4a3j:A, 4a3k:A, 4a3l:A, 4a3m:A, 4a93:A, 2b63:A, 2b8k:A, 4bbr:A, 4bbs:A, 4bxx:A, 4bxz:A, 4by1:A, 4by7:A, 5c3e:A, 5c44:A, 5c4a:A, 5c4x:A, 8ceo:A, 2e2h:A, 2e2i:A, 2e2j:A, 3fki:A, 5fmf:A, 5fyw:A, 5fz5:A, 3gtj:A, 3gtl:A, 3gtm:A, 3gto:A, 3gtp:A, 3gtq:A, 6gyk:A, 6gyl:A, 6gym:A, 3h3v:B, 3hou:A, 3hou:M, 3hov:A, 3how:A, 3hox:A, 3hoy:A, 3hoz:A, 1i3q:A, 3i4m:A, 3i4n:A, 1i50:A, 6i84:A, 5ip7:A, 5ip9:A, 3j0k:A, 2ja5:A, 2ja6:A, 2ja7:A, 2ja7:M, 2ja8:A, 8jch:A, 3k1f:A, 8k5p:A, 3k7a:A, 7kee:A, 7kef:A, 3m3y:A, 3m4o:A, 7mei:a, 7mei:A, 7mk9:A, 7mka:a, 7ml0:A, 7ml1:A, 7ml2:A, 7ml4:A, 7nkx:A, 7nky:A, 2nvq:A, 2nvt:A, 2nvx:A, 2nvy:A, 2nvz:A, 7o4i:A, 7o4j:A, 6o6c:A, 7o72:A, 7o73:A, 7o75:A, 5oqj:A, 5oqm:A, 5ot2:A, 3po2:A, 3po3:A, 3qt1:A, 2r7z:A, 1r9t:A, 2r92:A, 2r93:A, 7riq:A, 3rzd:A, 3rzo:A, 3s14:A, 3s15:A, 3s16:A, 3s17:A, 3s1m:A, 3s1n:A, 3s1q:A, 3s1r:A, 3s2d:A, 3s2h:A, 1sfo:A, 5sva:A, 1twf:A, 5u5q:A, 4v1m:A, 4v1n:A, 4v1o:A, 2vum:A, 1wcm:A, 4x67:A, 4x6a:A, 1y1v:A, 1y1w:A, 4y52:A, 1y77:A, 4y7n:A, 2yu9:A, 7zs9:A, 7zsa:A, 7zsb:A
59 4c2x:A 388 57 0.0275 0.0490 0.3333 3.0 6pau:A
60 6dk7:G 225 50 0.0303 0.0933 0.4200 4.8 6dk7:D, 6dk7:B, 6dk7:F, 6dk7:H
61 6wjm:A 269 76 0.0361 0.0929 0.3289 5.5
62 8dh4:I 821 181 0.0564 0.0475 0.2155 5.5 8dh0:J
63 4kto:A 377 222 0.0679 0.1247 0.2117 6.2 4kto:C, 4kto:B, 4kto:D
64 5vvs:A 1455 43 0.0202 0.0096 0.3256 6.2 5c4j:A, 3gtg:A, 3gtk:A, 8tvy:A, 5vvr:A
65 7ksf:A 742 124 0.0405 0.0377 0.2258 6.9
66 4irn:A 378 226 0.0723 0.1323 0.2212 7.6 4irn:B, 4irn:C, 4irn:D, 4irn:E, 4irn:F, 4irn:G, 4irn:H
67 6cu5:A 314 33 0.0202 0.0446 0.4242 8.9 6cu5:B, 8ft7:A, 8ft7:B
68 4fx9:B 443 81 0.0347 0.0542 0.2963 8.9 4fx9:A, 5l1n:A, 5l1n:B
69 6j76:A 477 113 0.0462 0.0671 0.2832 8.9 6j76:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218