Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ANLWERFCDWITSTENRLYIGWFGVIMIPTLLAATICFVIAFIAAPPVDIDGIREPVSGSLLYGNNIITAAVVPSSNAIG
LHLYPIWDAASLDEWLYNGGPYQLIIFHFLIGIFCYMGREWELSYRLGMRPWIPVAFSAPVAAATAVLLIYPIGQGSFSD
GLMLGISGTFNFMIVFQAEHNILMHPFHMLGVAGVFGGALFAAMHGSLVTSSLIRETTETESTNYGYKFGQEEETYNIVA
AHGYFGRLIFQYASFNNSRSLHFFLAAWPVVGIWFAALGISTMAFNLNGFNFNHSVVDAQGNVINTWADIINRANIGIEV
MHERNAHNFPLDLA

The query sequence (length=334) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7yq7:a 342 333 0.9251 0.9035 0.9279 0.0 3a0b:A, 3a0b:a, 3a0h:A, 3a0h:a, 2axt:A, 2axt:a, 5b5e:A, 5b5e:a, 5b66:A, 5b66:a, 7cji:A, 7cji:a, 7cjj:A, 7cjj:a, 7cou:A, 7cou:a, 7czl:A, 7czl:a, 7d1t:A, 7d1t:a, 7d1u:A, 7d1u:a, 6dhe:A, 6dhe:a, 6dhf:A, 6dhf:a, 6dhg:A, 6dhg:a, 6dhh:A, 6dhh:a, 6dho:A, 6dho:a, 6dhp:A, 6dhp:a, 5e79:A, 5e79:a, 5e7c:A, 5e7c:a, 7eda:A, 9evx:A, 9evx:a, 8ez5:A, 8ez5:a, 8f4c:A, 8f4c:a, 8f4d:A, 8f4d:a, 8f4e:A, 8f4e:a, 8f4f:A, 8f4f:a, 8f4g:A, 8f4g:a, 8f4h:A, 8f4h:a, 8f4i:A, 8f4i:a, 8f4j:A, 8f4j:a, 8f4k:A, 8f4k:a, 4fby:A, 4fby:G, 8gn0:A, 8gn0:a, 8gn1:A, 8gn1:a, 8gn2:A, 8gn2:a, 5gth:A, 5gth:a, 5gti:A, 5gti:a, 5h2f:A, 5h2f:a, 4il6:A, 4il6:a, 8ir5:A, 8ir5:a, 8ir6:A, 8ir6:a, 8ir7:A, 8ir7:a, 8ir8:A, 8ir8:a, 8ir9:A, 8ir9:a, 8ira:A, 8ira:a, 8irb:A, 8irb:a, 8irc:A, 8irc:a, 8ird:A, 8ird:a, 8ire:A, 8ire:a, 8irf:A, 8irf:a, 8irg:A, 8irg:a, 8irh:A, 8irh:a, 8iri:A, 8iri:a, 4ixq:A, 4ixq:a, 4ixr:A, 4ixr:a, 1izl:A, 1izl:J, 6jlj:A, 6jlj:a, 6jlk:A, 6jlk:a, 6jll:A, 6jll:a, 6jlm:A, 6jlm:a, 6jln:A, 6jln:a, 6jlo:A, 6jlo:a, 6jlp:A, 6jlp:a, 5kaf:A, 5kaf:a, 5kai:A, 5kai:a, 3kzi:A, 5mdx:A, 5mx2:A, 5mx2:a, 7nho:A, 7nhp:A, 7nhq:A, 4pbu:A, 4pbu:a, 4pj0:A, 4pj0:a, 7rf1:A, 7rf1:a, 7rf2:A, 7rf2:a, 7rf3:A, 7rf3:a, 7rf4:A, 7rf4:a, 7rf5:A, 7rf5:a, 7rf6:A, 7rf6:a, 7rf7:A, 7rf7:a, 7rf8:A, 7rf8:a, 4rvy:A, 4rvy:a, 1s5l:A, 1s5l:a, 5tis:A, 5tis:a, 4tnh:A, 4tnh:a, 4tni:A, 4tni:a, 4tnj:A, 4tnj:a, 4tnk:A, 4tnk:a, 4ub6:A, 4ub6:a, 4ub8:A, 4ub8:a, 5v2c:A, 5v2c:a, 4v62:AA, 4v62:BA, 4v82:AA, 4v82:BA, 6w1o:A, 6w1o:a, 6w1p:A, 6w1p:a, 6w1q:A, 6w1q:a, 6w1r:A, 6w1r:a, 6w1t:A, 6w1t:a, 6w1u:A, 6w1u:a, 6w1v:A, 6w1v:a, 1w5c:A, 1w5c:G, 5ws5:A, 5ws5:a, 5ws6:A, 5ws6:a, 3wu2:A, 3wu2:a, 7yq2:A, 7yq2:a, 7yq7:A, 5zzn:A, 5zzn:a
2 7n8o:A 334 334 0.8653 0.8653 0.8653 0.0 7n8o:a, 7rcv:A, 7rcv:a, 8tow:A, 8tow:a
3 8wql:AD 334 333 0.8593 0.8593 0.8619 0.0 8wql:AE, 8wql:A1, 8wql:a1, 8wql:aD, 8wql:aE
4 4yuu:A1 344 334 0.8743 0.8488 0.8743 0.0 8bd3:A, 8bd3:a, 6j3y:A, 6j3y:a, 6j3z:A, 6j3z:a, 6j40:A, 6j40:a, 3jcu:A, 3jcu:a, 7pi0:A, 7pi0:a, 7pi5:A, 7pi5:a, 7pin:A, 7pin:a, 7pin:A1, 7pin:a1, 7piw:A, 7piw:a, 7piw:A1, 7piw:a1, 7pnk:A, 7pnk:a, 7vd5:A, 7vd5:a, 7y5e:aL, 7y5e:a6, 7y5e:AL, 7y5e:A6, 7y7a:a9, 7y7a:aO, 7y7a:aZ, 7y7a:am, 7y7a:A9, 7y7a:AE, 7y7a:aE, 7y7a:AO, 7y7a:AZ, 7y7a:Am, 4yuu:a1, 4yuu:a2, 4yuu:A2
5 8wb4:A 334 333 0.8383 0.8383 0.8408 0.0 8wb4:a, 8xlp:a, 8xlp:A, 8xr6:A, 8xr6:a
6 6kac:A 336 334 0.8743 0.8690 0.8743 0.0 8c29:A, 8c29:a, 8iwh:A, 8iwh:a, 8j5k:A, 8j5k:a, 6jlu:A, 6jlu:a, 6kac:a, 6kad:A, 6kad:a, 6kaf:a, 6kaf:A, 5mdx:a, 7oui:A, 7oui:a, 5xnl:A, 5xnl:a, 5xnm:A, 5xnm:a, 6yp7:a, 6yp7:A
7 8eqm:A 333 331 0.8114 0.8138 0.8187 0.0 8eqm:a
8 7dxa:a 298 322 0.8114 0.9094 0.8416 0.0 7dxh:a
9 6wj6:A 302 325 0.7754 0.8576 0.7969 0.0 8am5:A, 8asl:A
10 8kde:A 309 328 0.8084 0.8738 0.8232 0.0 8r2i:A, 8zee:A
11 7sa3:A 303 327 0.7365 0.8119 0.7523 0.0
12 7ymi:A 284 326 0.7036 0.8275 0.7209 7.68e-172 7ymi:a, 7ymm:1A, 7ymm:2A, 7ymm:3A, 7ymm:4A
13 8eqm:D 338 298 0.3144 0.3107 0.3523 2.83e-51 8eqm:d, 7sa3:D
14 1w5c:D 350 294 0.2994 0.2857 0.3401 1.22e-48 1w5c:J
15 6wj6:D 342 287 0.2934 0.2865 0.3415 1.20e-47 7n8o:D, 7n8o:d, 7rcv:D, 7rcv:d, 8tow:D, 8tow:d, 8wql:DD, 8wql:DE, 8wql:D1, 8wql:d1, 8wql:dD, 8wql:dE
16 4yuu:d2 340 294 0.2934 0.2882 0.3333 3.79e-46 4yuu:D1, 4yuu:d1, 4yuu:D2
17 8kde:D 351 294 0.2844 0.2707 0.3231 4.28e-45 3a0b:D, 3a0b:d, 3a0h:D, 3a0h:d, 2axt:D, 2axt:d, 5b5e:D, 5b5e:d, 5b66:D, 5b66:d, 8bd3:D, 8bd3:d, 8c29:D, 8c29:d, 7cji:D, 7cji:d, 7cjj:D, 7cjj:d, 7cou:D, 7cou:d, 7czl:d, 7czl:D, 7d1t:D, 7d1t:d, 7d1u:D, 7d1u:d, 6dhe:D, 6dhe:d, 6dhf:D, 6dhf:d, 6dhg:D, 6dhg:d, 6dhh:D, 6dhh:d, 6dho:D, 6dho:d, 6dhp:D, 6dhp:d, 7dxa:d, 7dxh:d, 5e79:D, 5e79:d, 5e7c:D, 5e7c:d, 7eda:D, 9evx:D, 9evx:d, 8ez5:D, 8ez5:d, 8f4c:D, 8f4c:d, 8f4d:D, 8f4d:d, 8f4e:D, 8f4e:d, 8f4f:D, 8f4f:d, 8f4g:D, 8f4g:d, 8f4h:D, 8f4h:d, 8f4i:D, 8f4i:d, 8f4j:D, 8f4j:d, 8f4k:D, 8f4k:d, 4fby:D, 4fby:Q, 8gn0:D, 8gn0:d, 8gn1:D, 8gn1:d, 8gn2:D, 8gn2:d, 5gth:D, 5gth:d, 5gti:D, 5gti:d, 5h2f:D, 5h2f:d, 4il6:D, 4il6:d, 8ir5:D, 8ir5:d, 8ir6:D, 8ir6:d, 8ir7:D, 8ir7:d, 8ir8:D, 8ir8:d, 8ir9:D, 8ir9:d, 8ira:D, 8ira:d, 8irb:D, 8irb:d, 8irc:D, 8irc:d, 8ird:D, 8ird:d, 8ire:D, 8ire:d, 8irf:D, 8irf:d, 8irg:D, 8irg:d, 8irh:D, 8irh:d, 8iri:D, 8iri:d, 4ixq:D, 4ixq:d, 4ixr:D, 4ixr:d, 3jcu:D, 3jcu:d, 6jlj:D, 6jlj:d, 6jlk:D, 6jlk:d, 6jll:D, 6jll:d, 6jlm:D, 6jlm:d, 6jln:D, 6jln:d, 6jlo:D, 6jlo:d, 6jlp:D, 6jlp:d, 5kaf:D, 5kaf:d, 5kai:D, 5kai:d, 6kac:D, 6kac:d, 6kad:D, 6kad:d, 6kaf:d, 6kaf:D, 3kzi:D, 5mdx:D, 5mdx:d, 5mx2:D, 5mx2:d, 7nho:D, 7nhp:D, 7nhq:D, 7oui:D, 7oui:d, 4pbu:D, 4pbu:d, 7pi0:D, 7pi0:d, 7pi5:D, 7pi5:d, 7pin:D, 7pin:d, 7pin:D1, 7pin:d1, 7piw:d, 7piw:d1, 7piw:D, 7piw:D1, 4pj0:D, 4pj0:d, 7pnk:D, 7pnk:d, 8r2i:D, 7rf1:D, 7rf1:d, 7rf2:D, 7rf2:d, 7rf3:D, 7rf3:d, 7rf4:D, 7rf4:d, 7rf5:D, 7rf5:d, 7rf6:D, 7rf6:d, 7rf7:D, 7rf7:d, 7rf8:D, 7rf8:d, 4rvy:D, 4rvy:d, 1s5l:D, 1s5l:d, 5tis:D, 5tis:d, 4tnh:D, 4tnh:d, 4tni:D, 4tni:d, 4tnj:D, 4tnj:d, 4tnk:D, 4tnk:d, 4ub6:D, 4ub6:d, 4ub8:D, 4ub8:d, 5v2c:D, 5v2c:d, 4v62:AD, 4v62:BD, 4v82:AD, 4v82:BD, 6w1o:D, 6w1o:d, 6w1p:D, 6w1p:d, 6w1q:D, 6w1q:d, 6w1r:D, 6w1r:d, 6w1t:D, 6w1t:d, 6w1u:D, 6w1u:d, 6w1v:D, 6w1v:d, 5ws5:D, 5ws5:d, 5ws6:D, 5ws6:d, 3wu2:D, 3wu2:d, 5xnl:D, 5xnl:d, 5xnm:D, 5xnm:d, 6yp7:d, 6yp7:D, 7yq2:D, 7yq2:d, 7yq7:D, 7yq7:d, 8zee:D, 5zzn:D, 5zzn:d
18 8wb4:D 342 287 0.2754 0.2690 0.3206 6.49e-43 8iwh:D, 8iwh:d, 6j3y:D, 6j3y:d, 6j3z:D, 6j3z:d, 6j40:D, 6j40:d, 8j5k:D, 8j5k:d, 6jlu:D, 6jlu:d, 7vd5:D, 7vd5:d, 8wb4:d, 8xlp:d, 8xlp:D, 8xr6:D, 8xr6:d, 7y5e:DL, 7y5e:D6, 7y5e:d6, 7y5e:dL, 7y7a:D9, 7y7a:d9, 7y7a:DE, 7y7a:dE, 7y7a:DO, 7y7a:dO, 7y7a:DZ, 7y7a:dZ, 7y7a:Dm, 7y7a:dm
19 7ymi:D 323 294 0.2695 0.2786 0.3061 5.47e-42 7ymi:d, 7ymm:1D, 7ymm:2D, 7ymm:3D, 7ymm:4D
20 8am5:D 278 239 0.2485 0.2986 0.3473 2.37e-38 8asl:D
21 1izl:N 277 243 0.2515 0.3032 0.3457 3.70e-34 1izl:D
22 5yq7:L 309 130 0.1198 0.1294 0.3077 1.96e-08 8hju:L, 8hjv:L, 8iug:L, 8iun:L, 8j5o:L, 8j5p:L
23 8b64:L 281 221 0.1916 0.2278 0.2896 2.90e-08 7yml:L
24 5b5m:L 280 208 0.1557 0.1857 0.2500 8.33e-07 5b5m:x, 5b5n:L, 5b5n:x, 7c52:L, 1eys:L, 4v8k:AL, 4v8k:BL, 7vrj:L, 8wdu:L, 8wdv:L, 3wmm:L, 5y5s:L
25 2j8d:M 307 117 0.1018 0.1107 0.2906 1.86e-06 1aig:M, 1aig:O, 1aij:M, 1aij:S, 2bnp:B, 2bns:B, 2boz:M, 8c3f:M, 8c5x:M, 8c6k:M, 8c7c:M, 8c87:M, 8c88:M, 1ds8:M, 1ds8:S, 3dsy:M, 3dta:M, 3dtr:M, 3dts:M, 3du2:M, 3du3:M, 3duq:M, 1dv3:M, 1dv3:S, 1dv6:M, 1dv6:S, 1e14:M, 1e6d:M, 7f0l:M, 1f6n:M, 1fnp:M, 1fnq:M, 2gmr:M, 2gnu:M, 4h99:M, 4h9l:M, 4hbh:M, 4hbj:M, 2hg3:M, 2hg9:M, 2hh1:M, 2hhk:M, 2hit:M, 2hj6:M, 3i4d:M, 4in5:M, 4in6:M, 4in7:M, 2j8c:M, 1jgw:M, 1jgx:M, 1jgy:M, 1jgz:M, 1jh0:M, 2jiy:M, 2jj0:M, 1k6l:M, 1k6n:M, 1kby:M, 1l9b:M, 1l9j:M, 1l9j:S, 5lri:M, 5lse:M, 4lwy:M, 1m3x:M, 7mh3:M, 7mh4:M, 7mh5:M, 7mh8:M, 7mh9:M, 7mha:M, 1mps:M, 4n7k:M, 4n7l:M, 7od5:M, 1ogv:M, 7p0q:M, 7p17:M, 7p2c:M, 1pcr:M, 7pil:M, 7pqd:M, 7pqd:m, 1pss:M, 1pst:M, 7q7f:M, 7q7g:M, 7q7h:M, 7q7j:M, 7q7m:M, 7q7n:M, 7q7o:M, 1qov:M, 2rcr:M, 4rcr:M, 1rg5:M, 1rgn:M, 1rqk:M, 1rvj:M, 1ry5:M, 1rzh:M, 1rzz:M, 1rzz:S, 1s00:M, 1s00:S, 4tqq:M, 1umx:M, 2uws:M, 2uwt:M, 2uwu:M, 2uwv:M, 2uww:M, 2ux3:M, 2ux4:M, 2ux5:M, 2uxj:M, 2uxk:M, 2uxl:M, 2uxm:M, 3v3y:M, 3v3z:M, 5v33:M, 4v9g:AM, 4v9g:BM, 7va9:M, 7va9:m, 7vb9:M, 7vb9:m, 7vnm:M, 7vny:M, 7vor:M, 7vor:m, 7vot:M, 7vot:m, 7voy:M, 8vtj:M, 8vtk:M, 8vtl:M, 8vtm:M, 8vtn:M, 8vto:M, 7vy2:M, 7vy2:m, 7vy3:M, 2wx5:M, 1yf6:M, 1yst:M, 6z02:M, 6z1j:M, 6z27:M, 7z8d:M, 1z9j:B, 1z9k:B, 3zum:M, 3zuw:M
26 7ddq:M 305 202 0.1467 0.1607 0.2426 1.90e-06
27 7eqd:L 275 148 0.1198 0.1455 0.2703 2.56e-06 7oy8:L
28 7ddq:L 275 145 0.1108 0.1345 0.2552 2.60e-06
29 4v8k:AM 319 117 0.0988 0.1034 0.2821 2.92e-06 5b5m:M, 5b5m:y, 5b5n:M, 5b5n:y, 7c52:M, 1eys:M, 4v8k:BM, 7vrj:M, 8wdu:M, 8wdv:M, 3wmm:M, 5y5s:M
30 7o0u:L 273 148 0.1287 0.1575 0.2905 4.53e-06 7o0v:L, 7o0w:L, 7o0x:L
31 7c9r:L 272 160 0.1228 0.1507 0.2562 5.07e-06
32 8b64:M 304 145 0.1168 0.1283 0.2690 5.30e-06 7yml:M
33 6z5r:M 306 140 0.1138 0.1242 0.2714 8.16e-06 6z5s:M
34 7oy8:M 305 167 0.1287 0.1410 0.2575 1.54e-05 7eqd:M
35 4ac5:L 273 181 0.1377 0.1685 0.2541 3.46e-05 4cas:B, 3d38:L, 1dxr:L, 6et5:L, 3g7f:L, 2i5n:L, 2jbl:L, 5m7j:B, 5m7k:B, 5m7l:B, 5nj4:L, 5o4c:L, 5o64:L, 1prc:L, 2prc:L, 3prc:L, 5prc:L, 6prc:L, 7prc:L, 7q7p:LLL, 7q7q:LLL, 1r2c:L, 3t6d:L, 3t6e:L, 1vrn:L, 2wjm:L, 2wjn:L, 2x5u:L, 2x5v:L, 6zhw:L, 6zi4:L, 6zi5:L, 6zi6:L, 6zi9:L, 6zia:L, 6zid:L
36 7xxf:L 274 149 0.1257 0.1533 0.2819 4.20e-05
37 8hju:M 306 193 0.1347 0.1471 0.2332 5.95e-05 8hjv:M, 8iug:M, 8iun:M, 8j5o:M, 8j5p:M, 5yq7:M
38 7xxf:M 320 170 0.1257 0.1313 0.2471 8.02e-05
39 8k5o:M 318 76 0.0689 0.0723 0.3026 1.44e-04
40 6z5r:L 276 155 0.1228 0.1486 0.2645 1.83e-04 6z5s:L
41 7o0w:M 336 200 0.1437 0.1429 0.2400 7.41e-04 7o0u:M, 7o0v:M, 7o0x:M
42 8k5o:L 275 226 0.1707 0.2073 0.2522 0.002
43 8by2:A 548 88 0.0778 0.0474 0.2955 0.044 8bxg:A, 8bxg:B, 8by2:B, 9emb:A, 9emb:B
44 7c9r:M 318 139 0.0958 0.1006 0.2302 0.077
45 4ac5:M 323 115 0.0778 0.0805 0.2261 0.19 4cas:C, 3d38:M, 1dxr:M, 6et5:M, 3g7f:M, 2i5n:M, 2jbl:M, 5m7j:C, 5m7k:C, 5m7l:C, 5nj4:M, 5o4c:M, 5o64:M, 1prc:M, 2prc:M, 3prc:M, 5prc:M, 6prc:M, 7prc:M, 7q7p:MMM, 7q7q:MMM, 1r2c:M, 3t6d:M, 3t6e:M, 1vrn:M, 2wjm:M, 2wjn:M, 2x5u:M, 2x5v:M, 6zhw:M, 6zi4:M, 6zi5:M, 6zi6:M, 6zi9:M, 6zia:M, 6zid:M
46 6dt1:A 464 45 0.0389 0.0280 0.2889 4.4 6dt1:E

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218