BioLiP

>protein
ANFTFSPEEVARFERDGYIGPVKIFEPEEMTRRWNIIRRQLLDRSLAIYPDSNGKANISNYDRHLDIDLLAEHIMRPEIV
DRVGSLIGRNLLCWRSEFFPKYQGDEGTDWHQAATFAHATGKPQIIWPSDRPAFIGTITVWTAFTHSTEQNGCLQLMPGT
NYDAYPMVLKPGEAVIFWSNTMHASLPHTGSKTDYRMGFAARYVPTQVQVYPGTENLTEYGDGINLEKYGAVLTSGVDEY
GHNRIARTSQRGYEFVPRQI

The query sequence (length=260) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3gjb:B	271	269	1.0000	0.9594	0.9665	0.0	3gjb:A
2	2fcu:A	309	304	0.5692	0.4790	0.4868	1.02e-95	2fct:A, 2fct:B, 2fcu:B, 2fcv:A, 2fcv:B
3	5m0t:A	287	91	0.0962	0.0871	0.2747	0.004	5m0t:B
4	2a1x:A	253	203	0.1654	0.1700	0.2118	0.013
5	5ybl:B	273	90	0.0846	0.0806	0.2444	0.022	5ybl:A, 5ybl:C, 5ybl:D
6	7eyr:C	279	82	0.0846	0.0789	0.2683	0.023	7eyr:A, 7eyr:B, 7eyr:D, 7eys:C, 7eyt:C, 7eyt:A, 7eyt:B, 7eyt:D, 7eyu:B, 7eyu:A, 7eyw:C, 7eyw:A, 7eyw:B, 7eyw:D, 7fcb:C
7	7vbq:B	271	91	0.1000	0.0959	0.2857	0.038
8	5erl:D	258	160	0.1346	0.1357	0.2188	0.080	5ep9:A, 5ep9:B, 5ep9:C, 5ep9:D, 5equ:A, 5equ:B, 5equ:C, 5equ:D, 5erl:A, 5erl:B, 5erl:C
9	7dzz:B	268	189	0.1654	0.1604	0.2275	0.20	7dt0:A, 7dt0:B, 7dt0:C, 7dt0:D, 7dt0:E, 7dt0:F, 7dt0:G, 7dzz:A, 7e00:A, 7e00:B, 7e01:A, 7e06:A, 7e06:B, 7e07:A, 7e07:B, 7e08:A, 7e09:A, 8h7v:A, 8h7v:B, 8h7y:A, 8h7y:B, 8h81:A, 8h85:A
10	5ybn:A	296	230	0.2000	0.1757	0.2261	0.30	5ybn:B, 5ybo:A, 5ybo:B, 5ybp:A, 5ybp:B, 5ybq:A, 5ybq:B, 5ybr:A, 5ybr:B, 5ybs:A, 5ybs:B, 5ybt:A, 5ybt:B
11	7dt0:H	241	157	0.1308	0.1411	0.2166	0.65
12	1i5l:C	74	36	0.0538	0.1892	0.3889	0.90	1i5l:E, 1i5l:F, 1i5l:G, 1i5l:J, 1i5l:K, 1i5l:L, 1i5l:A, 1i5l:B, 1i5l:H
13	6rxt:UH	359	83	0.0808	0.0585	0.2530	1.5	6rxu:UH, 6rxv:UH, 6rxx:UH, 6rxy:UH, 6rxz:UH
14	6akz:A	451	81	0.0769	0.0443	0.2469	1.9
15	1h8s:A	218	72	0.0846	0.1009	0.3056	2.1
16	4xac:A	245	22	0.0308	0.0327	0.3636	3.6
17	5epa:A	258	29	0.0385	0.0388	0.3448	4.5	5epa:B, 5epa:C, 5epa:D, 5epa:E, 5epa:F
18	5fqd:E	367	66	0.0615	0.0436	0.2424	4.8	4tz4:C, 8u17:A, 6uml:C
19	8bsd:A	301	59	0.0654	0.0565	0.2881	6.0	8a23:A, 7bq7:A, 8bzv:A, 8c0g:A, 7c2i:A, 7c2j:A, 8c5m:A, 9emj:A, 9eml:A, 9emv:A, 9eun:A, 8f4s:A, 8f4y:A, 9gny:A, 9grp:A, 9grq:A, 7jhe:A, 7jib:A, 7jpe:A, 7jyy:A, 7jyy:C, 7jz0:A, 7jz0:C, 7koa:A, 7l6r:A, 7l6t:A, 7lw3:A, 7lw4:A, 8osx:A, 8ot0:A, 8oto:A, 8otr:A, 8ov1:A, 8ov2:A, 8ov3:A, 8ov4:A, 7r1t:A, 7r1u:A, 3r24:A, 8rv4:A, 8rv5:A, 8rv6:A, 8rv7:A, 8rv8:A, 8rv9:A, 8rva:A, 8rvb:A, 8rzc:A, 8rzd:A, 8rze:A, 8s8w:A, 8s8x:A, 8tyj:A, 6w4h:A, 6w61:A, 6w75:A, 6w75:C, 6wjt:A, 6wjt:C, 6wkq:A, 6wkq:C, 6wks:AAA, 6wq3:A, 6wrz:A, 6wvn:A, 6xkm:A, 2xyq:A, 2xyr:A, 2xyv:A, 6yz1:A
20	3obz:A	290	25	0.0385	0.0345	0.4000	6.9
21	4wd1:A	646	59	0.0731	0.0294	0.3220	8.2
22	8xc1:A	660	72	0.0769	0.0303	0.2778	8.5	8hip:B, 8hip:A, 8hke:A, 8hke:B, 8xbs:A, 8xbs:B, 8xc1:B

[Back]