Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ANATVKMGSDSGALVFEPSTVTIKAGEEVKWVNNKLSPHNIVFAADGVDADTAAKLSHKGLAFAAGESFTSTFTEPGTYT
YYCEPHRGAGMVGKVVVD

The query sequence (length=98) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1j5c:A 98 98 1.0000 1.0000 1.0000 4.19e-69 1j5d:A, 1jxd:A, 1jxf:A, 1pcs:A
2 1bxu:A 91 94 0.6020 0.6484 0.6277 4.19e-42 1bxv:A
3 4r0o:A 106 101 0.6020 0.5566 0.5842 1.62e-36 1baw:A, 1baw:B, 1baw:C, 3bqv:A, 3cvb:A, 3cvb:B, 3cvc:A, 3cvd:A, 3cvd:B, 3cvd:C, 2q5b:A, 2q5b:B, 2q5b:C, 4r0o:B, 4r0o:C, 4r0o:D, 2w88:A, 2w88:B, 2w88:C, 2w8c:A, 2w8c:B
4 2gim:A 106 100 0.5612 0.5189 0.5500 2.37e-33 2cj3:A, 2cj3:B, 1fa4:A, 2gim:C, 1nin:A, 1tu2:A
5 2plt:A 98 100 0.5510 0.5510 0.5400 3.59e-30 7zqe:M
6 1pla:A 97 97 0.5204 0.5258 0.5258 2.36e-28 1plb:A
7 1b3i:A 97 99 0.4694 0.4742 0.4646 2.37e-27 2b3i:A, 2jxm:A
8 1ag6:A 99 98 0.4694 0.4646 0.4694 1.13e-24 1oow:A, 2pcf:A, 1tef:A, 1tef:B, 1teg:A, 1teg:B, 1ylb:B
9 4dp0:X 99 98 0.4388 0.4343 0.4388 4.89e-24 4dp1:X, 4dp2:X, 4dp4:X, 4dp5:X, 4dp6:X
10 1byo:A 99 100 0.4694 0.4646 0.4600 5.65e-23 1byo:B, 1byp:A
11 7pcy:A 98 93 0.4286 0.4286 0.4516 8.99e-23
12 9pcy:A 99 98 0.4490 0.4444 0.4490 1.24e-22
13 1iuz:A 98 91 0.4286 0.4286 0.4615 2.59e-22
14 1jxg:A 100 98 0.4388 0.4300 0.4388 1.42e-21 4dp7:X, 4dp8:X, 4dp9:X, 4dpa:X, 4dpb:X, 4dpc:X, 1jxg:B, 3pcy:A, 4pcy:A, 5pcy:A, 6pcy:A, 1plc:A, 1pnc:A, 1pnd:A, 1tkw:A
15 6yez:P 99 98 0.4184 0.4141 0.4184 5.13e-21 6zoo:P
16 2bz7:A 102 101 0.3878 0.3725 0.3762 9.60e-15 2bzc:A, 1kdi:A, 1kdj:A
17 3c75:A 106 78 0.3265 0.3019 0.4103 2.04e-13 3c75:B, 1id2:A, 1id2:B, 1id2:C
18 1aac:A 105 89 0.3469 0.3238 0.3820 4.34e-13 1aan:A, 1bxa:A, 2gb2:A, 2gba:A, 2gc4:C, 2gc4:G, 2gc4:K, 2gc4:O, 2idq:A, 2ids:A, 2idt:A, 2idu:A, 3ie9:A, 3iea:A, 2j55:A, 2j55:B, 2j56:A, 2j56:B, 2j57:A, 2j57:B, 2j57:C, 2j57:D, 3l45:A, 1mda:A, 1mda:B, 1mg2:C, 1mg2:G, 1mg2:K, 1mg2:O, 1mg3:C, 1mg3:G, 1mg3:K, 1mg3:O, 2mta:A, 2ov0:A, 4p5r:A, 4p5s:A, 3ply:A, 3ply:B, 3ply:C, 3ply:D, 2qdv:A, 2qdw:A, 2rac:A, 3rym:A, 3rym:C, 3rym:B, 3rym:D, 1sf3:A, 1sf5:A, 1sfd:A, 1sfd:B, 1sfh:A, 1sfh:B, 1t5k:A, 1t5k:B, 1t5k:C, 1t5k:D
19 1adw:A 123 92 0.3469 0.2764 0.3696 2.07e-09 1adw:B, 4bwt:A, 4bwt:B, 4bwu:A, 4bwu:B, 4bxv:A, 4bxv:B, 3erx:A, 3erx:B
20 6akn:A 124 86 0.3367 0.2661 0.3837 3.51e-09 6akn:B, 1bqk:A, 1bqr:A, 8hm9:A, 8hm9:B, 6ifp:A, 6ifp:C, 2jkw:A, 2jkw:B, 2ux6:A, 2ux7:A, 2uxf:A, 2uxg:A, 5wv4:A, 5wv4:B, 5xmo:A, 5y23:A, 5y23:B, 4yl4:A, 5ysg:A, 5ysg:B, 5ysg:C, 5ysg:D, 5yw3:A, 5yw3:B, 5yw3:C, 5yw3:D, 5z0x:A, 5z0x:B, 1zia:A, 1zib:A, 5ztd:A, 5ztd:B
21 3tu6:A 127 89 0.3163 0.2441 0.3483 7.41e-08
22 5fc9:A 95 76 0.2347 0.2421 0.3026 8.15e-07 5fc9:B, 5fc9:C, 5fc9:D
23 8k9n:A 125 86 0.2653 0.2080 0.3023 4.49e-06 8k9p:A, 3nyk:A, 2p80:D, 1paz:A, 3paz:A, 4paz:A, 5paz:A, 6paz:A, 7paz:A, 8paz:A, 1py0:A, 1pza:A, 1pzb:A, 4rh4:A, 5x31:A, 5x31:B
24 1pmy:A 123 90 0.2755 0.2195 0.3000 6.36e-06
25 6hbe:C 427 93 0.2857 0.0656 0.3011 6.08e-04 6hbe:A, 6hbe:B
26 6hbe:C 427 38 0.1429 0.0328 0.3684 7.7 6hbe:A, 6hbe:B
27 2aan:A 123 121 0.3571 0.2846 0.2893 0.002
28 5b1j:C 124 88 0.2755 0.2177 0.3068 0.003 3ef4:A, 3ef4:B, 3ef4:C
29 6jp9:A 298 64 0.2143 0.0705 0.3281 0.022 6jp9:B, 6jp9:C, 6jp9:D
30 6kol:A 125 124 0.3367 0.2640 0.2661 0.053 6l9s:A
31 1fwx:A 591 85 0.2653 0.0440 0.3059 0.17 1fwx:B, 1fwx:C, 1fwx:D, 2iwf:A, 2iwf:B, 2iwk:A, 2iwk:B
32 4hcf:B 96 84 0.2245 0.2292 0.2619 0.29 4hcf:A, 4hcg:A, 4hcg:B
33 5akr:A 337 40 0.1531 0.0445 0.3750 3.7 2avf:A, 2avf:B, 2avf:C, 2avf:D, 2avf:E, 2avf:F, 2bw4:A, 2bw5:A, 2bwd:A, 2bwi:A, 6gb8:A, 6gbb:A, 6gby:A, 6gcg:A, 6gsq:A, 6gt0:A, 6gt2:A, 6gti:A, 6gtj:A, 6gtk:A, 6gtl:A, 6gtn:A, 5i6k:A, 5i6l:A, 5i6m:A, 5i6n:A, 5i6o:A, 5i6p:A, 1kcb:A, 6knf:A, 6knf:B, 6knf:C, 6kng:A, 6kng:B, 6kng:C, 5n8f:A, 5n8g:A, 5n8h:A, 5n8i:A, 1nia:A, 1nia:B, 1nia:C, 1nib:A, 1nib:B, 1nib:C, 1nic:A, 1nid:A, 1nie:A, 1nif:A, 2nrd:A, 5of5:A, 5of6:A, 5of7:A, 5of8:A, 5ofc:A, 5ofd:A, 5ofe:A, 5off:A, 5ofg:A, 5ofh:A, 5og2:A, 5og3:A, 5og4:A, 5og5:A, 5og6:A, 5ogf:A, 5ogg:A, 6qwg:A, 1rzp:A, 1rzp:B, 1rzp:C, 1rzq:A, 1rzq:B, 1rzq:C, 2y1a:A, 6zu6:A, 6zua:A, 6zub:A, 6zud:A, 6zut:A
34 3dm5:A 416 37 0.1224 0.0288 0.3243 4.1 3dm5:B
35 5fhz:F 449 57 0.1531 0.0334 0.2632 6.0
36 4ozt:U 195 30 0.0918 0.0462 0.3000 8.0

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218