BioLiP

>protein
ANATGPGGNLKTGKYLYGTDFDSLDVSQSGNTCSMNNANVRTINLNGGTSGSSAYSFTCPENTFKEINGAYSPLNDAHFF
GNVIFNMYNDWLGTAPLSFQLQMRVHYSSNYENAFWDGSAMTFGDGQNTFYPLVSLDVSAHAVSHGFTEQNSGLIYNGKP
GGLNEAFSDMAGEAAEFYMKGSNDWLVGKDIFKGNGALRYMNNPTQDGRSIDNQSNYYSGMDVHYSSGVYNKAFYNLATT
PGWDTQKAFIVMARANQLYWSAGVGWDLAGNGVMDAACDLNYDPNDVKAALAAVGVNSNLSSGSDCA

The query sequence (length=307) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3nqy:B	307	307	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3nqx:A, 3nqz:B
2	7ecc:A	299	299	0.8567	0.8796	0.8796	0.0
3	7ajr:AAA	298	298	0.5863	0.6040	0.6040	1.76e-132	8cc4:A, 8cc4:B, 8cr3:A, 8cr4:A, 8cr7:A, 8cr7:B, 3dbk:A, 1ezm:A, 6f8b:A, 6fzx:A, 4k89:A, 7nlk:A, 7nlk:B, 7nlm:A, 7oc7:A, 7qh1:A, 7qh1:B, 7qh1:C, 7qh1:D, 1u4g:A, 7z68:A
4	6ya1:A	328	317	0.4853	0.4543	0.4700	1.24e-92	6yze:A
5	1esp:A	317	219	0.2834	0.2744	0.3973	1.09e-30	1npc:A
6	5a3y:A	316	252	0.2704	0.2627	0.3294	2.16e-29	2a7g:E, 7akn:A, 6d5n:A, 6d5o:A, 6d5p:A, 6d5q:A, 6d5r:A, 6d5s:A, 6d5t:A, 6d5u:A, 4d91:A, 4d9w:A, 5dlh:A, 3dnz:A, 3do0:A, 3do1:A, 3do2:A, 5dpe:E, 5dpf:E, 3eim:A, 3f28:A, 3f2p:A, 3fb0:A, 3fbo:A, 3fcq:A, 3fgd:A, 1fj3:A, 1fjo:A, 1fjq:A, 1fjt:A, 1fju:A, 1fjv:A, 1fjw:A, 6fj2:A, 3flf:A, 3for:A, 5fsj:A, 5fsp:A, 5fss:A, 6fsm:A, 3fv4:A, 3fvp:A, 3fxp:A, 3fxs:A, 5fxn:A, 2g4z:A, 6ghx:A, 1gxw:A, 4h57:A, 5hqd:A, 1hyt:A, 6ig7:A, 5js3:E, 5jss:E, 5jt9:E, 5jvi:E, 5jxn:E, 5k7t:A, 1kei:A, 1kjo:A, 1kjp:A, 1kkk:A, 1kl6:A, 1kr6:A, 1kro:A, 1ks7:A, 1kto:A, 1l3f:E, 5l3u:E, 5l41:E, 5l8p:E, 5lif:E, 1lna:E, 1lnb:E, 1lnc:E, 1lnd:E, 1lne:E, 1lnf:E, 3ls7:A, 5lvd:E, 5lwd:E, 6lzn:A, 6lzo:A, 5m5f:E, 4m65:A, 5m69:E, 5m9w:A, 5ma7:E, 5mnr:E, 3ms3:A, 3msa:A, 3msf:A, 3msn:A, 4mtw:E, 4mwp:E, 4mxj:E, 4mzn:E, 3n21:A, 5n2t:E, 5n2x:E, 5n2z:E, 5n31:E, 5n34:E, 5n3v:E, 5n3y:E, 4n4e:E, 6n4w:A, 6n4z:A, 4n5p:E, 4n66:E, 3nn7:A, 5o8n:A, 4oi5:E, 5onp:A, 5onq:A, 5onr:A, 1os0:A, 4ow3:A, 3p7p:E, 3p7q:E, 3p7r:E, 3p7s:E, 3p7t:E, 3p7u:E, 3p7v:E, 3p7w:E, 1pe5:A, 1pe7:A, 1pe8:A, 6qar:A, 1qf0:A, 1qf1:A, 1qf2:A, 6qf2:A, 6qf3:A, 3qgo:A, 3qh1:A, 3qh5:A, 6sb9:E, 6sbk:E, 6sc0:E, 6sc1:E, 6sc3:E, 6sck:E, 6scu:E, 6sel:A, 3ssb:B, 3ssb:A, 3t2h:E, 3t2i:E, 3t2j:E, 3t73:A, 3t74:A, 3t87:A, 3t8c:A, 3t8d:A, 3t8f:A, 3t8g:A, 3t8h:A, 5t9i:A, 5t9k:A, 5t9q:A, 5tac:A, 5tad:A, 5tae:A, 5tai:A, 5taj:A, 5tak:A, 1thl:A, 1tli:A, 1tlp:E, 1tlx:A, 2tli:A, 2tlx:A, 3tli:A, 4tli:A, 4tln:A, 5tli:A, 5tln:A, 6tli:A, 7tli:A, 7tln:A, 8tli:A, 8tln:E, 1tmn:E, 2tmn:E, 3tmn:E, 4tmn:E, 5tmn:E, 6tmn:E, 4tnl:A, 5un3:A, 5uu7:A, 5uu8:A, 5uu9:A, 5uua:A, 5uub:A, 5uuc:A, 5uud:A, 5uue:A, 2whz:A, 2wi0:A, 5wr2:A, 5wr3:A, 5wr4:A, 5wr5:A, 5wr6:A, 1y3g:E, 6y4i:E, 6yi6:E, 6ymr:E, 6yms:E, 1z9g:E, 1zdp:E, 6zhj:A, 3zi6:A, 8zm4:A, 8zm5:A, 8zm6:A
7	4b52:A	304	175	0.2378	0.2401	0.4171	5.75e-28	4b52:B, 4ger:A, 4ger:B
8	2vqx:A	322	196	0.2182	0.2081	0.3418	1.43e-20
9	1bqb:A	301	222	0.2345	0.2392	0.3243	1.96e-19	7skl:C, 7skl:A, 7skm:C, 7skm:A
10	5if9:A	251	62	0.0554	0.0677	0.2742	0.88	5if9:B, 5ihp:A, 5ihp:B
11	3hpv:A	297	52	0.0554	0.0572	0.3269	5.0	3hpv:B, 3hpv:C, 3hpv:D, 3hpy:A, 3hpy:B, 3hpy:C, 3hpy:D, 3hq0:A, 3hq0:B, 3hq0:C, 3hq0:D
12	1s49:A	588	78	0.0554	0.0289	0.2179	5.2
13	4l5j:A	308	42	0.0456	0.0455	0.3333	6.6	4l4z:A, 4l4z:B, 4l50:A, 4l50:B, 4l51:A, 4l51:B, 4l5j:B, 4l5j:C, 4l5j:D
14	2vsq:A	1273	45	0.0489	0.0118	0.3333	7.8
15	7pg7:D	329	72	0.0684	0.0638	0.2917	9.0
16	3ufm:A	230	75	0.0619	0.0826	0.2533	9.9	4uqm:A

[Back]